Doublet Group distance statistics: 53235

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 1, 1, 2, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.009, 0.017, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.009, 0.026, 0.042, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.020, 0.042, 0.064, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.042 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.031, 0.056, 0.082, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.056 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.009, 0.034, 0.060, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.034 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.013, 0.039, 0.065, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.039 std_dev=0.026
C2	B	0, 0.239, 0.500, 0.761, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.500 std_dev=0.261
N1	B	0, 0.176, 0.452, 0.728, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.452 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.214, 0.495, 0.776, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.495 std_dev=0.281
N6	B	0, 0.274, 0.559, 0.843, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.559 std_dev=0.285
N3	B	0, 0.262, 0.567, 0.872, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.567 std_dev=0.305
C5	B	0, 0.249, 0.556, 0.863, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.556 std_dev=0.307
C4	B	0, 0.226, 0.560, 0.895, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.560 std_dev=0.334
N7	B	0, 0.309, 0.664, 1.020, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.664 std_dev=0.356
N9	B	0, 0.235, 0.638, 1.041, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.638 std_dev=0.403
C8	B	0, 0.292, 0.696, 1.099, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.696 std_dev=0.403
C2'	B	0, 0.260, 0.681, 1.103, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.681 std_dev=0.421
O4'	A	0, -0.162, 0.288, 0.737, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.288 std_dev=0.449
C1'	B	0, 0.246, 0.720, 1.193, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.720 std_dev=0.474
C3'	B	0, 0.182, 0.676, 1.170, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.676 std_dev=0.494
O2'	B	0, 0.433, 0.932, 1.431, 1.927 max_d=1.927 avg_d=0.932 std_dev=0.499
C4'	B	0, 0.280, 0.803, 1.326, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.803 std_dev=0.523
O4'	B	0, 0.287, 0.831, 1.376, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.831 std_dev=0.545
O3'	B	0, 0.147, 0.703, 1.260, 2.200 max_d=2.200 avg_d=0.703 std_dev=0.557
C2'	A	0, -0.253, 0.313, 0.879, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.313 std_dev=0.566
C5'	B	0, 0.333, 0.909, 1.484, 2.007 max_d=2.007 avg_d=0.909 std_dev=0.575
C4'	A	0, -0.093, 0.502, 1.096, 2.294 max_d=2.294 avg_d=0.502 std_dev=0.594
O5'	B	0, 0.315, 0.916, 1.516, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.916 std_dev=0.601
P	B	0, 0.390, 1.029, 1.668, 2.353 max_d=2.353 avg_d=1.029 std_dev=0.639
OP1	B	0, 0.485, 1.301, 2.117, 2.864 max_d=2.864 avg_d=1.301 std_dev=0.816
C3'	A	0, -0.208, 0.629, 1.467, 3.261 max_d=3.261 avg_d=0.629 std_dev=0.837
O2'	A	0, -0.343, 0.556, 1.456, 3.478 max_d=3.478 avg_d=0.556 std_dev=0.900
OP2	B	0, 0.301, 1.288, 2.274, 3.611 max_d=3.611 avg_d=1.288 std_dev=0.987
O3'	A	0, -0.234, 0.914, 2.061, 4.504 max_d=4.504 avg_d=0.914 std_dev=1.147
C5'	A	0, -0.427, 0.859, 2.144, 4.941 max_d=4.941 avg_d=0.859 std_dev=1.286
O5'	A	0, -0.673, 1.046, 2.765, 6.527 max_d=6.527 avg_d=1.046 std_dev=1.719
P	A	0, -1.117, 1.392, 3.901, 9.561 max_d=9.561 avg_d=1.392 std_dev=2.509
OP2	A	0, -1.265, 1.554, 4.372, 10.685 max_d=10.685 avg_d=1.554 std_dev=2.819
OP1	A	0, -1.324, 1.573, 4.471, 11.037 max_d=11.037 avg_d=1.573 std_dev=2.898

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.01	0.12	0.02	0.21	0.25	0.08
C2	0.03	0.00	0.19	0.20	0.01	0.22	0.01	0.51	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.23	0.22	0.13	0.74	0.01	1.33	0.41	0.84
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.02	0.06	0.12	0.10	0.10	0.15	0.23	0.19	0.08	0.04	0.00	0.03	0.01	0.26	0.09	0.43	0.29	0.29
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.14	0.00	0.23	0.02	0.22	0.35	0.18	0.29	0.19	0.35	0.17	0.02	0.00	0.01	0.07	0.27	0.18	0.20	0.10
C4	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.15	0.06	0.35	0.01	0.60	0.25	0.26
C4'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.23	0.14	0.30	0.21	0.20	0.08	0.19	0.02	0.00	0.02	0.11	0.20	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.23	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.22	0.19	0.02	0.35	0.01	0.37	0.63	0.24
C5'	0.06	0.51	0.12	0.02	0.23	0.01	0.16	0.00	0.22	0.36	0.38	0.68	0.48	0.32	0.11	0.08	0.13	0.02	0.01	0.20	0.29	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.22	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.25	0.22	0.04	0.38	0.01	0.61	0.51	0.26
C8	0.01	0.02	0.10	0.35	0.01	0.23	0.01	0.36	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.14	0.18	0.09	0.65	0.02	0.46	1.06	0.70
N1	0.02	0.00	0.15	0.18	0.01	0.14	0.01	0.38	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.25	0.22	0.09	0.55	0.01	1.06	0.19	0.57
N2	0.04	0.01	0.23	0.29	0.02	0.30	0.02	0.68	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.22	0.27	0.16	0.99	0.02	1.77	0.79	1.21
N3	0.02	0.01	0.19	0.19	0.01	0.21	0.01	0.48	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.21	0.13	0.69	0.01	1.14	0.38	0.74
N7	0.01	0.01	0.08	0.35	0.01	0.20	0.01	0.32	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.22	0.06	0.61	0.02	0.40	1.13	0.67
N9	0.01	0.02	0.04	0.17	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.25	0.02	0.21	0.47	0.17
O2'	0.01	0.23	0.00	0.02	0.19	0.19	0.22	0.08	0.25	0.14	0.25	0.22	0.20	0.19	0.13	0.00	0.06	0.13	0.18	0.27	0.40	0.27	0.23
O3'	0.15	0.22	0.03	0.00	0.15	0.02	0.19	0.13	0.22	0.18	0.22	0.27	0.21	0.22	0.10	0.06	0.00	0.12	0.20	0.25	0.34	0.20	0.19
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.04	0.09	0.09	0.16	0.13	0.06	0.01	0.13	0.12	0.00	0.12	0.03	0.15	0.28	0.15
O5'	0.12	0.74	0.26	0.07	0.35	0.02	0.35	0.01	0.38	0.65	0.55	0.99	0.69	0.61	0.25	0.18	0.20	0.12	0.00	0.41	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.27	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.27	0.25	0.03	0.41	0.00	0.49	0.74	0.30
OP1	0.21	1.33	0.43	0.18	0.60	0.20	0.37	0.29	0.61	0.46	1.06	1.77	1.14	0.40	0.21	0.40	0.34	0.15	0.02	0.49	0.00	0.03	0.02
OP2	0.25	0.41	0.29	0.20	0.25	0.19	0.63	0.21	0.51	1.06	0.19	0.79	0.38	1.13	0.47	0.27	0.20	0.28	0.03	0.74	0.03	0.00	0.02
P	0.08	0.84	0.29	0.10	0.26	0.04	0.24	0.01	0.26	0.70	0.57	1.21	0.74	0.67	0.17	0.23	0.19	0.15	0.01	0.30	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.23	0.31	0.30	0.23	0.33	0.21	0.41	0.20	0.24	0.20	0.26	0.22	0.23	0.26	0.37	0.32	0.36	0.32	0.43	0.36	0.25
C2	0.19	0.18	0.21	0.18	0.11	0.23	0.14	0.37	0.14	0.19	0.14	0.16	0.19	0.20	0.15	0.30	0.18	0.24	0.23	0.35	0.34	0.16
C2'	0.63	0.50	0.77	0.74	0.51	0.66	0.40	0.66	0.33	0.47	0.36	0.58	0.26	0.40	0.54	0.85	0.81	0.60	0.65	0.66	0.65	0.57
C3'	0.71	0.39	0.87	0.85	0.46	0.79	0.31	0.77	0.20	0.44	0.22	0.54	0.15	0.33	0.54	1.02	0.96	0.69	0.71	0.74	0.67	0.62
C4	0.21	0.16	0.22	0.20	0.16	0.24	0.18	0.36	0.16	0.21	0.13	0.17	0.19	0.21	0.19	0.29	0.21	0.26	0.25	0.40	0.39	0.19
C4'	0.55	0.31	0.60	0.59	0.35	0.61	0.27	0.63	0.23	0.36	0.25	0.40	0.25	0.28	0.42	0.71	0.64	0.59	0.56	0.65	0.47	0.48
C5	0.19	0.14	0.20	0.17	0.15	0.21	0.18	0.34	0.16	0.22	0.09	0.14	0.21	0.24	0.18	0.27	0.18	0.22	0.25	0.44	0.47	0.19
C5'	0.81	0.33	0.82	0.83	0.47	0.92	0.31	0.92	0.20	0.51	0.23	0.50	0.23	0.36	0.61	0.98	0.88	0.88	0.82	0.90	0.70	0.75
C6	0.20	0.16	0.21	0.17	0.13	0.20	0.16	0.34	0.11	0.24	0.11	0.14	0.19	0.24	0.19	0.28	0.18	0.21	0.25	0.46	0.51	0.21
C8	0.21	0.16	0.22	0.19	0.18	0.23	0.20	0.35	0.21	0.22	0.15	0.18	0.26	0.24	0.20	0.28	0.21	0.25	0.25	0.44	0.46	0.20
N1	0.20	0.18	0.21	0.16	0.10	0.20	0.11	0.35	0.12	0.20	0.15	0.15	0.20	0.20	0.16	0.29	0.17	0.21	0.23	0.40	0.43	0.17
N2	0.18	0.20	0.21	0.18	0.11	0.23	0.16	0.38	0.17	0.20	0.17	0.18	0.21	0.22	0.13	0.31	0.18	0.25	0.22	0.30	0.27	0.15
N3	0.23	0.18	0.24	0.22	0.16	0.26	0.17	0.38	0.15	0.21	0.14	0.18	0.17	0.21	0.20	0.31	0.22	0.29	0.25	0.36	0.34	0.19
N7	0.19	0.14	0.20	0.17	0.16	0.21	0.21	0.33	0.20	0.23	0.11	0.15	0.26	0.26	0.19	0.27	0.19	0.22	0.26	0.47	0.51	0.21
N9	0.24	0.18	0.25	0.23	0.19	0.26	0.19	0.37	0.19	0.22	0.17	0.20	0.22	0.22	0.21	0.31	0.24	0.29	0.27	0.41	0.40	0.21
O2'	0.76	0.81	0.92	0.90	0.76	0.76	0.70	0.77	0.67	0.70	0.71	0.84	0.61	0.68	0.75	0.93	0.95	0.70	0.81	0.83	0.81	0.75
O3'	0.77	0.58	1.01	0.99	0.59	0.84	0.46	0.81	0.36	0.54	0.41	0.69	0.26	0.45	0.64	1.14	1.13	0.71	0.79	0.80	0.76	0.70
O4'	0.37	0.31	0.34	0.34	0.29	0.39	0.28	0.46	0.30	0.29	0.31	0.32	0.33	0.27	0.31	0.40	0.33	0.43	0.36	0.51	0.33	0.29
O5'	1.11	0.37	1.13	1.14	0.64	1.26	0.43	1.24	0.23	0.73	0.21	0.65	0.28	0.51	0.84	1.32	1.21	1.20	1.12	1.13	1.04	1.05
O6	0.23	0.17	0.23	0.19	0.16	0.22	0.18	0.34	0.11	0.28	0.15	0.15	0.18	0.28	0.22	0.28	0.19	0.23	0.29	0.52	0.59	0.26
OP1	1.97	0.77	1.93	2.01	1.28	2.23	1.02	2.24	0.62	1.51	0.47	1.20	0.39	1.20	1.62	2.14	2.08	2.16	2.08	2.14	1.86	2.01
OP2	1.09	0.46	1.17	1.20	0.49	1.36	0.35	1.31	0.55	0.55	0.62	0.55	0.80	0.34	0.71	1.48	1.34	1.23	1.08	1.17	0.82	0.95
P	1.34	0.37	1.34	1.38	0.72	1.57	0.45	1.56	0.19	0.86	0.22	0.71	0.28	0.57	1.00	1.58	1.46	1.49	1.38	1.44	1.18	1.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.20	0.21	0.16
C2	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.02	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.16	0.03	0.23	0.32	0.49	0.18
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.04	0.07	0.05	0.11	0.13	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.14	0.18	0.07
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.12	0.08	0.10	0.06	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.16	0.22	0.11
C4	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.07	0.02	0.23	0.30	0.47	0.18
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.14	0.06	0.04	0.11	0.14	0.07	0.07	0.02	0.01	0.03	0.21	0.17	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.06	0.00	0.09	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.03	0.24	0.39	0.58	0.19
C5'	0.07	0.18	0.04	0.03	0.20	0.01	0.27	0.00	0.27	0.30	0.23	0.15	0.31	0.33	0.19	0.08	0.05	0.03	0.01	0.33	0.28	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.09	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.07	0.03	0.24	0.43	0.63	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.14	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.25	0.33	0.50	0.19
N1	0.02	0.01	0.11	0.08	0.01	0.06	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.03	0.24	0.39	0.58	0.19
N3	0.02	0.00	0.13	0.10	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.15	0.03	0.23	0.28	0.42	0.17
N6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.11	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.03	0.24	0.50	0.69	0.21
N7	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.14	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.24	0.42	0.62	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.23	0.26	0.39	0.17
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.10	0.07	0.08	0.08	0.12	0.03	0.17	0.18	0.10	0.02	0.03	0.00	0.05	0.07	0.07	0.18	0.16	0.08
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.07	0.02	0.05	0.05	0.07	0.13	0.13	0.15	0.06	0.10	0.04	0.05	0.00	0.02	0.20	0.27	0.38	0.23
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.24	0.28	0.17	0.23
O5'	0.20	0.23	0.10	0.07	0.23	0.03	0.24	0.01	0.24	0.25	0.24	0.23	0.24	0.24	0.23	0.07	0.20	0.24	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.20	0.32	0.14	0.16	0.30	0.21	0.39	0.33	0.43	0.33	0.39	0.28	0.50	0.42	0.26	0.18	0.27	0.28	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.49	0.18	0.22	0.47	0.17	0.58	0.28	0.63	0.50	0.58	0.42	0.69	0.62	0.39	0.16	0.38	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.18	0.07	0.11	0.18	0.03	0.19	0.02	0.20	0.19	0.19	0.17	0.21	0.20	0.17	0.08	0.23	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00