Doublet Group distance statistics: 53241

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N2	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.009, 0.027, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.034 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.022, 0.156, 0.289, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.156 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.057, 0.220, 0.384, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.220 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.048, 0.244, 0.440, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.244 std_dev=0.196
O2'	A	0, 0.091, 0.308, 0.526, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.308 std_dev=0.218
C3'	A	0, 0.070, 0.314, 0.557, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.314 std_dev=0.243
N7	B	0, 0.250, 0.585, 0.920, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.585 std_dev=0.335
C8	B	0, 0.202, 0.545, 0.888, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.545 std_dev=0.343
O3'	A	0, 0.114, 0.459, 0.805, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.459 std_dev=0.346
C5'	A	0, 0.089, 0.436, 0.783, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.436 std_dev=0.347
N9	B	0, 0.160, 0.507, 0.854, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.507 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.226, 0.573, 0.921, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.573 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.170, 0.521, 0.872, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.521 std_dev=0.351
C1'	B	0, 0.164, 0.531, 0.897, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.531 std_dev=0.367
N3	B	0, 0.160, 0.535, 0.910, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.535 std_dev=0.375
C6	B	0, 0.241, 0.631, 1.020, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.631 std_dev=0.389
O4'	B	0, 0.146, 0.548, 0.951, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.548 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.283, 0.689, 1.095, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.689 std_dev=0.406
N6	B	0, 0.295, 0.705, 1.115, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.705 std_dev=0.410
O5'	A	0, 0.147, 0.565, 0.983, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.565 std_dev=0.418
C2	B	0, 0.159, 0.584, 1.009, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.584 std_dev=0.425
C2'	B	0, 0.259, 0.697, 1.135, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.697 std_dev=0.438
N1	B	0, 0.193, 0.631, 1.069, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.631 std_dev=0.438
C4'	B	0, 0.223, 0.713, 1.204, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.713 std_dev=0.490
O3'	B	0, 0.333, 0.829, 1.324, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.829 std_dev=0.496
C3'	B	0, 0.304, 0.809, 1.315, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.809 std_dev=0.505
P	A	0, 0.293, 0.827, 1.362, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.827 std_dev=0.534
O5'	B	0, 0.359, 0.907, 1.455, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.907 std_dev=0.548
OP1	A	0, 0.286, 0.836, 1.385, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.836 std_dev=0.549
C5'	B	0, 0.281, 0.839, 1.397, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.839 std_dev=0.558
OP1	B	0, 0.395, 1.003, 1.611, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.003 std_dev=0.608
P	B	0, 0.348, 0.964, 1.581, 2.105 max_d=2.105 avg_d=0.964 std_dev=0.617
OP2	A	0, 0.365, 1.026, 1.687, 2.311 max_d=2.311 avg_d=1.026 std_dev=0.661
OP2	B	0, 0.325, 1.053, 1.781, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.053 std_dev=0.728

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02
C2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.10	0.13	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.09	0.13	0.04
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.09	0.07	0.12	0.09	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.10	0.15	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.09	0.06
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.09	0.02
C5	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.08	0.01	0.11	0.15	0.10
C5'	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.08	0.00	0.13	0.18	0.11
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.02	0.10	0.01	0.11	0.15	0.10
N1	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.15	0.11
N2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02	0.08	0.01	0.11	0.14	0.10
N3	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.10	0.07
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.11	0.01	0.13	0.21	0.12
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.04
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.06	0.11	0.08	0.03	0.01	0.00	0.05	0.03	0.05	0.04	0.11	0.15	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.10	0.09	0.15	0.10	0.10	0.03	0.05	0.00	0.02	0.09	0.07	0.14	0.18	0.08
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02
O5'	0.02	0.07	0.03	0.06	0.05	0.01	0.08	0.01	0.08	0.10	0.08	0.08	0.06	0.11	0.04	0.05	0.09	0.02	0.00	0.10	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.10	0.00	0.16	0.22	0.14
OP1	0.05	0.10	0.09	0.10	0.07	0.06	0.11	0.05	0.13	0.11	0.12	0.11	0.07	0.13	0.06	0.11	0.14	0.05	0.02	0.16	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.13	0.13	0.15	0.09	0.09	0.15	0.04	0.18	0.15	0.15	0.14	0.10	0.21	0.07	0.15	0.18	0.04	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.09	0.04	0.06	0.06	0.02	0.10	0.01	0.11	0.10	0.11	0.10	0.07	0.12	0.04	0.06	0.08	0.02	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.25	0.13	0.11	0.20	0.10	0.23	0.13	0.25	0.20	0.25	0.24	0.28	0.26	0.15	0.18	0.18	0.08	0.21	0.20	0.63	0.19
C2	0.17	0.33	0.18	0.17	0.20	0.18	0.15	0.18	0.21	0.14	0.29	0.30	0.22	0.17	0.15	0.21	0.17	0.18	0.17	0.31	0.55	0.24
C2'	0.12	0.27	0.12	0.11	0.19	0.10	0.23	0.13	0.26	0.20	0.26	0.25	0.31	0.27	0.14	0.19	0.17	0.07	0.21	0.20	0.64	0.20
C3'	0.14	0.27	0.13	0.12	0.20	0.10	0.22	0.16	0.25	0.20	0.26	0.25	0.29	0.26	0.15	0.20	0.18	0.08	0.21	0.22	0.63	0.21
C4	0.11	0.26	0.12	0.12	0.16	0.14	0.16	0.15	0.20	0.15	0.23	0.25	0.22	0.21	0.07	0.19	0.16	0.13	0.13	0.23	0.56	0.18
C4'	0.14	0.24	0.11	0.10	0.19	0.09	0.22	0.16	0.23	0.20	0.23	0.23	0.27	0.26	0.15	0.18	0.18	0.08	0.23	0.23	0.63	0.22
C5	0.09	0.21	0.09	0.11	0.08	0.16	0.15	0.18	0.16	0.22	0.17	0.20	0.21	0.25	0.07	0.16	0.13	0.17	0.11	0.24	0.51	0.18
C5'	0.15	0.23	0.13	0.12	0.18	0.11	0.20	0.20	0.21	0.20	0.22	0.23	0.24	0.24	0.16	0.19	0.19	0.10	0.24	0.25	0.59	0.23
C6	0.14	0.20	0.13	0.13	0.05	0.18	0.13	0.19	0.13	0.22	0.13	0.19	0.20	0.25	0.12	0.17	0.14	0.20	0.12	0.27	0.47	0.19
C8	0.09	0.20	0.09	0.09	0.17	0.14	0.21	0.21	0.21	0.27	0.20	0.19	0.24	0.28	0.15	0.16	0.14	0.13	0.18	0.23	0.55	0.21
N1	0.17	0.29	0.16	0.16	0.15	0.18	0.12	0.18	0.13	0.18	0.21	0.27	0.18	0.21	0.14	0.20	0.16	0.19	0.14	0.31	0.50	0.22
N2	0.19	0.36	0.20	0.19	0.24	0.19	0.20	0.20	0.26	0.16	0.34	0.32	0.26	0.18	0.18	0.23	0.18	0.19	0.20	0.35	0.56	0.28
N3	0.16	0.31	0.16	0.15	0.20	0.16	0.18	0.16	0.23	0.12	0.28	0.29	0.25	0.17	0.13	0.21	0.18	0.15	0.17	0.28	0.58	0.22
N7	0.10	0.18	0.09	0.09	0.14	0.18	0.20	0.22	0.19	0.28	0.17	0.16	0.23	0.29	0.16	0.15	0.12	0.20	0.17	0.25	0.50	0.21
N9	0.10	0.24	0.10	0.10	0.17	0.11	0.20	0.15	0.22	0.20	0.22	0.23	0.25	0.25	0.11	0.18	0.16	0.08	0.16	0.21	0.58	0.18
O2'	0.13	0.26	0.13	0.12	0.20	0.10	0.24	0.14	0.27	0.21	0.26	0.24	0.32	0.28	0.15	0.18	0.17	0.10	0.24	0.22	0.69	0.25
O3'	0.14	0.28	0.13	0.12	0.20	0.10	0.22	0.17	0.25	0.20	0.26	0.26	0.30	0.26	0.14	0.21	0.19	0.08	0.23	0.23	0.64	0.22
O4'	0.14	0.23	0.12	0.11	0.19	0.09	0.21	0.14	0.23	0.20	0.22	0.22	0.25	0.25	0.16	0.17	0.18	0.08	0.23	0.23	0.63	0.21
O5'	0.15	0.23	0.15	0.16	0.17	0.21	0.18	0.30	0.19	0.21	0.20	0.22	0.22	0.23	0.15	0.21	0.18	0.16	0.26	0.31	0.59	0.28
O6	0.18	0.11	0.14	0.14	0.12	0.20	0.20	0.20	0.17	0.26	0.10	0.12	0.23	0.27	0.19	0.16	0.13	0.23	0.16	0.28	0.43	0.20
OP1	0.11	0.23	0.11	0.12	0.15	0.16	0.17	0.29	0.18	0.20	0.20	0.22	0.22	0.22	0.12	0.21	0.17	0.11	0.26	0.30	0.58	0.29
OP2	0.25	0.33	0.30	0.30	0.24	0.23	0.19	0.23	0.21	0.17	0.27	0.34	0.20	0.19	0.19	0.41	0.38	0.18	0.24	0.24	0.42	0.18
P	0.14	0.23	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.24	0.18	0.17	0.20	0.23	0.20	0.20	0.13	0.25	0.22	0.12	0.23	0.24	0.49	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.17	0.30	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.09	0.01	0.17	0.28	0.33	0.16
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.18	0.18	0.16	0.08
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.14	0.10	0.08
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.07	0.00	0.11	0.26	0.37	0.16
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.17	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.10	0.29	0.41	0.20
C5'	0.02	0.08	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.12	0.30	0.40	0.20
C8	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.11	0.27	0.44	0.20
N1	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.01	0.15	0.30	0.36	0.18
N3	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.09	0.01	0.16	0.25	0.32	0.14
N6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.12	0.31	0.41	0.23
N7	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.11	0.30	0.45	0.23
N9	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.07	0.23	0.37	0.15
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.11	0.12	0.08	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.20	0.21	0.16	0.08
O3'	0.05	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.07	0.05	0.08	0.09	0.06	0.05	0.05	0.04	0.00	0.04	0.11	0.13	0.11	0.06
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.12	0.32	0.08
O5'	0.05	0.17	0.18	0.15	0.11	0.01	0.10	0.00	0.12	0.11	0.15	0.16	0.12	0.11	0.07	0.20	0.11	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.28	0.18	0.14	0.26	0.08	0.29	0.03	0.30	0.27	0.30	0.25	0.31	0.30	0.23	0.21	0.13	0.12	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.33	0.16	0.10	0.37	0.17	0.41	0.09	0.40	0.44	0.36	0.32	0.41	0.45	0.37	0.16	0.11	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.08	0.08	0.16	0.03	0.20	0.01	0.20	0.20	0.18	0.14	0.23	0.23	0.15	0.08	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00