Doublet Group distance statistics: 53244

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.002, 0.025, 0.048, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.025 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.005, 0.030, 0.055, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.030 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.007, 0.040, 0.073, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.040 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.002, 0.044, 0.087, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.044 std_dev=0.043
C4	B	0, 0.130, 0.248, 0.365, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.248 std_dev=0.118
O4'	A	0, 0.054, 0.191, 0.328, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.191 std_dev=0.137
C2'	A	0, 0.072, 0.217, 0.362, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.217 std_dev=0.145
O2'	A	0, 0.099, 0.250, 0.401, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.250 std_dev=0.151
N9	B	0, 0.131, 0.301, 0.471, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.301 std_dev=0.170
C5	B	0, 0.147, 0.340, 0.533, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.340 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.112, 0.309, 0.506, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.309 std_dev=0.197
C4'	A	0, 0.101, 0.322, 0.544, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.322 std_dev=0.221
C1'	B	0, 0.151, 0.384, 0.617, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.384 std_dev=0.233
C3'	A	0, 0.106, 0.347, 0.587, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.347 std_dev=0.241
C8	B	0, 0.149, 0.428, 0.707, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.428 std_dev=0.279
N7	B	0, 0.172, 0.452, 0.732, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.452 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.148, 0.436, 0.725, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.436 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.102, 0.405, 0.708, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.405 std_dev=0.303
O3'	A	0, 0.174, 0.516, 0.858, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.516 std_dev=0.342
C2	B	0, 0.037, 0.384, 0.730, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.384 std_dev=0.347
C5'	A	0, 0.174, 0.531, 0.888, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.531 std_dev=0.357
N1	B	0, 0.027, 0.416, 0.804, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.416 std_dev=0.389
N6	B	0, 0.133, 0.536, 0.938, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.536 std_dev=0.402
C4'	B	0, 0.174, 0.649, 1.123, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.649 std_dev=0.475
C2'	B	0, 0.080, 0.606, 1.133, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.606 std_dev=0.527
O3'	B	0, 0.174, 0.707, 1.241, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.707 std_dev=0.533
O5'	B	0, 0.180, 0.744, 1.309, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.744 std_dev=0.564
O5'	A	0, 0.114, 0.694, 1.273, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.694 std_dev=0.580
C3'	B	0, 0.134, 0.715, 1.296, 1.911 max_d=1.911 avg_d=0.715 std_dev=0.581
P	A	0, 0.124, 0.800, 1.476, 2.397 max_d=2.397 avg_d=0.800 std_dev=0.676
P	B	0, 0.711, 1.396, 2.082, 2.515 max_d=2.515 avg_d=1.396 std_dev=0.686
OP2	A	0, 0.169, 0.870, 1.571, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.870 std_dev=0.701
O2'	B	0, 0.026, 0.729, 1.431, 2.256 max_d=2.256 avg_d=0.729 std_dev=0.702
C5'	B	0, 0.127, 0.885, 1.643, 2.421 max_d=2.421 avg_d=0.885 std_dev=0.758
OP1	A	0, 0.189, 1.008, 1.828, 2.849 max_d=2.849 avg_d=1.008 std_dev=0.819
OP2	B	0, 1.056, 2.092, 3.128, 3.379 max_d=3.379 avg_d=2.092 std_dev=1.036
OP1	B	0, 1.572, 3.299, 5.025, 4.723 max_d=4.723 avg_d=3.299 std_dev=1.726

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.01	0.19	0.41	0.21
C2	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.23	0.03	0.34	0.02	0.38	0.53	0.37
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.01	0.08	0.06	0.11	0.16	0.13	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.25	0.08	0.29	0.33	0.24
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.13	0.08	0.16	0.20	0.16	0.07	0.04	0.01	0.01	0.02	0.33	0.13	0.36	0.29	0.29
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.02	0.34	0.01	0.36	0.51	0.36
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.07	0.08	0.06	0.07	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.07	0.09	0.27	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.41	0.01	0.43	0.55	0.42
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.12	0.12	0.10	0.09	0.07	0.13	0.06	0.08	0.06	0.02	0.01	0.13	0.09	0.26	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.42	0.00	0.45	0.56	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.39	0.01	0.38	0.50	0.38
N1	0.01	0.01	0.11	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.21	0.03	0.39	0.01	0.43	0.56	0.41
N2	0.02	0.01	0.16	0.20	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.27	0.03	0.31	0.03	0.36	0.52	0.35
N3	0.01	0.00	0.13	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.19	0.02	0.30	0.01	0.33	0.50	0.33
N7	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.44	0.02	0.44	0.54	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.30	0.01	0.31	0.48	0.32
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.08	0.07	0.04	0.09	0.13	0.10	0.04	0.01	0.00	0.04	0.04	0.12	0.07	0.21	0.32	0.16
O3'	0.01	0.23	0.01	0.01	0.11	0.02	0.10	0.06	0.16	0.09	0.21	0.27	0.19	0.07	0.04	0.04	0.00	0.02	0.29	0.16	0.40	0.27	0.29
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.03	0.13	0.41	0.19
O5'	0.15	0.34	0.25	0.33	0.34	0.02	0.41	0.01	0.42	0.39	0.39	0.31	0.30	0.44	0.30	0.12	0.29	0.11	0.00	0.44	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.16	0.03	0.44	0.00	0.49	0.57	0.47
OP1	0.19	0.38	0.29	0.36	0.36	0.09	0.43	0.09	0.45	0.38	0.43	0.36	0.33	0.44	0.31	0.21	0.40	0.13	0.02	0.49	0.00	0.00	0.01
OP2	0.41	0.53	0.33	0.29	0.51	0.27	0.55	0.26	0.56	0.50	0.56	0.52	0.50	0.54	0.48	0.32	0.27	0.41	0.01	0.57	0.00	0.00	0.01
P	0.21	0.37	0.24	0.29	0.36	0.06	0.42	0.02	0.44	0.38	0.41	0.35	0.33	0.44	0.32	0.16	0.29	0.19	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.16	0.16	0.31	0.15	0.44	0.27	0.68	0.26	0.36	0.19	0.14	0.34	0.40	0.17	0.08	0.21	0.23	0.20	0.76	0.49	0.33
C2	0.12	0.18	0.14	0.15	0.10	0.29	0.20	0.37	0.23	0.23	0.21	0.13	0.29	0.28	0.13	0.29	0.17	0.29	0.26	1.03	0.50	0.44
C2'	0.12	0.18	0.16	0.30	0.20	0.44	0.33	0.74	0.33	0.40	0.24	0.15	0.42	0.46	0.21	0.13	0.18	0.25	0.21	0.84	0.52	0.32
C3'	0.09	0.20	0.11	0.29	0.20	0.42	0.32	0.74	0.32	0.38	0.25	0.17	0.42	0.44	0.20	0.08	0.20	0.20	0.27	0.62	0.60	0.29
C4	0.10	0.20	0.10	0.13	0.17	0.29	0.26	0.40	0.25	0.35	0.21	0.17	0.30	0.36	0.20	0.26	0.14	0.23	0.18	0.86	0.46	0.39
C4'	0.10	0.18	0.21	0.38	0.15	0.46	0.25	0.77	0.25	0.32	0.19	0.16	0.33	0.36	0.16	0.11	0.28	0.20	0.35	0.43	0.65	0.30
C5	0.16	0.26	0.22	0.13	0.19	0.19	0.24	0.26	0.24	0.32	0.25	0.22	0.27	0.31	0.22	0.40	0.19	0.15	0.17	0.73	0.50	0.37
C5'	0.21	0.23	0.28	0.43	0.21	0.46	0.27	0.72	0.27	0.34	0.23	0.23	0.33	0.37	0.23	0.23	0.37	0.25	0.45	0.34	0.69	0.35
C6	0.14	0.33	0.27	0.17	0.18	0.17	0.22	0.21	0.26	0.24	0.31	0.26	0.27	0.24	0.17	0.48	0.23	0.16	0.17	0.78	0.53	0.38
C8	0.20	0.21	0.15	0.11	0.20	0.21	0.27	0.33	0.24	0.40	0.21	0.18	0.28	0.38	0.27	0.28	0.14	0.10	0.22	0.54	0.50	0.32
N1	0.11	0.28	0.21	0.15	0.14	0.22	0.21	0.27	0.26	0.21	0.29	0.20	0.28	0.23	0.13	0.41	0.20	0.23	0.21	0.92	0.53	0.41
N2	0.15	0.11	0.16	0.18	0.08	0.31	0.16	0.39	0.19	0.22	0.15	0.09	0.29	0.25	0.14	0.27	0.19	0.31	0.32	1.13	0.52	0.46
N3	0.10	0.16	0.11	0.18	0.11	0.34	0.24	0.46	0.25	0.30	0.19	0.12	0.32	0.35	0.14	0.21	0.16	0.30	0.25	1.03	0.46	0.43
N7	0.23	0.25	0.26	0.17	0.20	0.15	0.25	0.22	0.23	0.36	0.23	0.22	0.25	0.33	0.26	0.42	0.23	0.09	0.21	0.56	0.51	0.34
N9	0.12	0.18	0.07	0.17	0.18	0.33	0.27	0.48	0.25	0.39	0.20	0.16	0.31	0.39	0.22	0.18	0.14	0.18	0.17	0.73	0.46	0.34
O2'	0.16	0.16	0.28	0.41	0.17	0.52	0.31	0.84	0.32	0.36	0.23	0.13	0.43	0.43	0.19	0.19	0.28	0.31	0.29	0.92	0.58	0.35
O3'	0.08	0.21	0.14	0.33	0.20	0.45	0.33	0.79	0.35	0.36	0.27	0.17	0.46	0.44	0.19	0.06	0.22	0.21	0.30	0.63	0.65	0.30
O4'	0.10	0.18	0.22	0.37	0.16	0.46	0.25	0.74	0.25	0.33	0.19	0.17	0.31	0.36	0.17	0.12	0.27	0.20	0.32	0.49	0.60	0.32
O5'	0.22	0.46	0.22	0.28	0.30	0.27	0.29	0.41	0.33	0.33	0.40	0.43	0.33	0.33	0.24	0.19	0.30	0.20	0.37	0.38	0.54	0.29
O6	0.15	0.40	0.34	0.25	0.19	0.14	0.22	0.15	0.29	0.21	0.37	0.30	0.29	0.21	0.16	0.57	0.29	0.13	0.17	0.72	0.56	0.37
OP1	0.23	0.50	0.21	0.26	0.32	0.23	0.30	0.34	0.35	0.34	0.44	0.45	0.35	0.35	0.25	0.18	0.28	0.21	0.46	0.47	0.62	0.36
OP2	0.34	0.64	0.24	0.19	0.47	0.25	0.46	0.36	0.52	0.46	0.60	0.58	0.51	0.47	0.40	0.21	0.16	0.33	0.42	0.48	0.51	0.36
P	0.22	0.50	0.19	0.23	0.31	0.20	0.29	0.31	0.34	0.33	0.43	0.45	0.34	0.33	0.25	0.17	0.26	0.20	0.43	0.48	0.57	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.18	0.55	0.45	0.25
C2	0.02	0.00	0.27	0.18	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.07	0.10	0.16	0.82	0.67	0.40
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.14	0.02	0.06	0.10	0.12	0.14	0.21	0.28	0.08	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01	0.42	0.68	0.42	0.33
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.06	0.08	0.09	0.14	0.17	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.32	0.73	0.22	0.31
C4	0.01	0.00	0.14	0.08	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.06	0.18	0.86	0.61	0.41
C4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.29	0.36	0.07
C5	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.03	0.20	1.05	0.62	0.50
C5'	0.05	0.16	0.10	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.11	0.11	0.14	0.14	0.10	0.09	0.07	0.10	0.05	0.02	0.02	0.22	0.48	0.03
C6	0.01	0.00	0.12	0.08	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.05	0.18	1.08	0.65	0.52
C8	0.01	0.01	0.14	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.06	0.05	0.24	1.06	0.58	0.51
N1	0.02	0.00	0.21	0.14	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.06	0.08	0.17	0.96	0.67	0.47
N3	0.02	0.00	0.28	0.17	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.35	0.07	0.10	0.16	0.74	0.63	0.35
N6	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.04	0.18	1.19	0.64	0.56
N7	0.01	0.01	0.09	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.03	0.22	1.19	0.60	0.56
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.21	0.81	0.55	0.39
O2'	0.01	0.34	0.00	0.02	0.15	0.01	0.08	0.10	0.13	0.15	0.24	0.35	0.09	0.11	0.04	0.00	0.08	0.01	0.45	0.79	0.50	0.39
O3'	0.04	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.00	0.03	0.18	0.70	0.20	0.24
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.14	0.46	0.46	0.30
O5'	0.18	0.16	0.42	0.32	0.18	0.03	0.20	0.02	0.18	0.24	0.17	0.16	0.18	0.22	0.21	0.45	0.18	0.14	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.55	0.82	0.68	0.73	0.86	0.29	1.05	0.22	1.08	1.06	0.96	0.74	1.19	1.19	0.81	0.79	0.70	0.46	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.45	0.67	0.42	0.22	0.61	0.36	0.62	0.48	0.65	0.58	0.67	0.63	0.64	0.60	0.55	0.50	0.20	0.46	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.25	0.40	0.33	0.31	0.41	0.07	0.50	0.03	0.52	0.51	0.47	0.35	0.56	0.56	0.39	0.39	0.24	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00