Doublet Group distance statistics: 53246

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.012, 0.023, 0.033, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.017, 0.040, 0.064, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.021, 0.045, 0.069, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.045 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.026, 0.051, 0.077, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.051 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.032 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.016, 0.043, 0.070, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N3	A	0, 0.027, 0.056, 0.084, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.056 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.012, 0.042, 0.072, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.031, 0.063, 0.094, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.063 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.040, 0.106, 0.171, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.106 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.122, 0.296, 0.470, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.296 std_dev=0.174
C4'	A	0, 0.178, 0.356, 0.533, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.356 std_dev=0.177
O4'	A	0, 0.112, 0.294, 0.476, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.294 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.204, 0.419, 0.633, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.419 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.224, 0.440, 0.657, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.440 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.222, 0.445, 0.668, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.445 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.219, 0.461, 0.702, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.461 std_dev=0.241
N9	B	0, 0.291, 0.562, 0.832, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.562 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.305, 0.600, 0.895, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.600 std_dev=0.295
C2'	B	0, 0.360, 0.661, 0.961, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.661 std_dev=0.301
C1'	B	0, 0.364, 0.693, 1.022, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.693 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.372, 0.713, 1.054, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.713 std_dev=0.341
C3'	B	0, 0.274, 0.633, 0.991, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.633 std_dev=0.358
C5'	A	0, 0.334, 0.704, 1.075, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.704 std_dev=0.371
C5	B	0, 0.388, 0.769, 1.150, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.769 std_dev=0.381
C8	B	0, 0.467, 0.908, 1.350, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.908 std_dev=0.442
C4'	B	0, 0.498, 0.955, 1.412, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.955 std_dev=0.457
C5'	B	0, 0.504, 0.964, 1.423, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.964 std_dev=0.460
N1	B	0, 0.420, 0.902, 1.384, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.902 std_dev=0.482
O3'	B	0, 0.517, 1.004, 1.491, 1.468 max_d=1.468 avg_d=1.004 std_dev=0.487
C6	B	0, 0.426, 0.943, 1.459, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.943 std_dev=0.516
N7	B	0, 0.482, 1.014, 1.546, 1.482 max_d=1.482 avg_d=1.014 std_dev=0.532
O4'	B	0, 0.646, 1.187, 1.727, 1.605 max_d=1.605 avg_d=1.187 std_dev=0.541
P	B	0, 0.583, 1.272, 1.961, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.272 std_dev=0.689
O5'	B	0, 0.818, 1.562, 2.307, 2.091 max_d=2.091 avg_d=1.562 std_dev=0.744
N6	B	0, 0.513, 1.265, 2.017, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.265 std_dev=0.752
O2'	B	0, 1.016, 1.845, 2.674, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.845 std_dev=0.829
OP1	B	0, 1.143, 2.161, 3.179, 2.846 max_d=2.846 avg_d=2.161 std_dev=1.018
OP2	B	0, 0.931, 1.958, 2.984, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.958 std_dev=1.026
O5'	A	0, 0.721, 1.773, 2.825, 2.537 max_d=2.537 avg_d=1.773 std_dev=1.052
P	A	0, 1.066, 2.494, 3.921, 3.528 max_d=3.528 avg_d=2.494 std_dev=1.428
OP2	A	0, 1.294, 2.807, 4.321, 3.920 max_d=3.920 avg_d=2.807 std_dev=1.514
OP1	A	0, 1.196, 2.745, 4.294, 3.890 max_d=3.890 avg_d=2.745 std_dev=1.549

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.31	0.02	0.31	0.51	0.43
C2	0.05	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.13	0.05	0.54	0.01	0.57	1.05	0.76
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.10	0.09	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.17	0.03	0.06	0.36	0.23
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.13	0.05	0.11	0.09	0.11	0.04	0.01	0.01	0.02	0.11	0.04	0.04	0.19	0.13
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.54	0.01	0.62	0.99	0.78
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.63	0.01	0.82	1.19	0.95
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.07	0.15	0.04	0.04	0.03	0.14	0.08	0.04	0.05	0.01	0.01	0.09	0.22	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.66	0.00	0.87	1.29	1.01
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.57	0.01	0.79	0.99	0.89
N1	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.62	0.01	0.74	1.21	0.91
N2	0.08	0.01	0.10	0.11	0.02	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.14	0.17	0.08	0.49	0.01	0.47	0.99	0.68
N3	0.05	0.01	0.09	0.09	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.05	0.49	0.01	0.48	0.92	0.67
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.63	0.02	0.92	1.20	1.02
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.49	0.01	0.57	0.84	0.71
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.09	0.14	0.10	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06	0.25	0.11	0.07
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.13	0.08	0.17	0.13	0.11	0.03	0.04	0.00	0.02	0.18	0.04	0.37	0.16	0.21
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.28	0.01	0.35	0.34	0.38
O5'	0.31	0.54	0.17	0.11	0.54	0.01	0.63	0.01	0.66	0.57	0.62	0.49	0.49	0.63	0.49	0.06	0.18	0.28	0.00	0.70	0.04	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.70	0.00	0.99	1.39	1.10
OP1	0.31	0.57	0.06	0.04	0.62	0.04	0.82	0.22	0.87	0.79	0.74	0.47	0.48	0.92	0.57	0.25	0.37	0.35	0.04	0.99	0.00	0.01	0.01
OP2	0.51	1.05	0.36	0.19	0.99	0.06	1.19	0.27	1.29	0.99	1.21	0.99	0.92	1.20	0.84	0.11	0.16	0.34	0.03	1.39	0.01	0.00	0.01
P	0.43	0.76	0.23	0.13	0.78	0.03	0.95	0.01	1.01	0.89	0.91	0.68	0.67	1.02	0.71	0.07	0.21	0.38	0.00	1.10	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.16	0.10	0.07	0.21	0.10	0.28	0.31	0.28	0.33	0.21	0.15	0.32	0.35	0.22	0.26	0.09	0.10	0.37	0.40	0.13	0.23
C2	0.12	0.33	0.10	0.19	0.25	0.26	0.36	0.34	0.45	0.17	0.42	0.24	0.53	0.32	0.15	0.16	0.09	0.18	0.46	0.88	0.54	0.23
C2'	0.13	0.12	0.11	0.07	0.21	0.08	0.33	0.25	0.32	0.41	0.21	0.11	0.39	0.45	0.24	0.26	0.09	0.11	0.32	0.40	0.17	0.19
C3'	0.05	0.09	0.13	0.14	0.05	0.14	0.17	0.30	0.15	0.27	0.03	0.10	0.23	0.31	0.10	0.35	0.16	0.10	0.35	0.23	0.19	0.23
C4	0.10	0.22	0.10	0.14	0.20	0.22	0.27	0.33	0.31	0.18	0.27	0.18	0.34	0.27	0.13	0.21	0.07	0.13	0.40	0.79	0.36	0.16
C4'	0.07	0.11	0.17	0.18	0.03	0.17	0.11	0.33	0.09	0.20	0.03	0.12	0.16	0.22	0.06	0.39	0.20	0.11	0.37	0.15	0.17	0.29
C5	0.09	0.19	0.11	0.13	0.10	0.22	0.14	0.31	0.21	0.03	0.22	0.13	0.22	0.09	0.03	0.20	0.06	0.19	0.34	0.87	0.38	0.09
C5'	0.25	0.32	0.34	0.32	0.21	0.29	0.12	0.40	0.14	0.10	0.23	0.33	0.09	0.10	0.16	0.57	0.34	0.20	0.42	0.22	0.13	0.34
C6	0.10	0.25	0.11	0.15	0.10	0.24	0.12	0.31	0.25	0.10	0.29	0.16	0.26	0.04	0.07	0.15	0.05	0.21	0.36	0.95	0.48	0.11
C8	0.05	0.07	0.13	0.08	0.07	0.18	0.11	0.29	0.11	0.12	0.08	0.06	0.13	0.14	0.06	0.28	0.09	0.16	0.27	0.66	0.21	0.07
N1	0.11	0.32	0.10	0.18	0.18	0.25	0.26	0.32	0.39	0.06	0.40	0.22	0.46	0.15	0.08	0.14	0.06	0.20	0.41	0.95	0.55	0.17
N2	0.14	0.37	0.10	0.22	0.27	0.27	0.40	0.35	0.51	0.20	0.47	0.27	0.63	0.37	0.17	0.15	0.13	0.19	0.50	0.83	0.61	0.30
N3	0.13	0.28	0.10	0.18	0.26	0.23	0.36	0.34	0.41	0.25	0.36	0.22	0.48	0.38	0.18	0.19	0.10	0.14	0.47	0.79	0.44	0.25
N7	0.08	0.06	0.13	0.10	0.03	0.20	0.05	0.28	0.06	0.08	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.23	0.09	0.20	0.28	0.79	0.29	0.03
N9	0.08	0.15	0.11	0.11	0.16	0.18	0.23	0.32	0.24	0.22	0.19	0.13	0.27	0.26	0.14	0.26	0.07	0.09	0.36	0.63	0.23	0.15
O2'	0.23	0.22	0.19	0.10	0.33	0.11	0.45	0.19	0.43	0.54	0.32	0.21	0.51	0.58	0.36	0.25	0.11	0.21	0.26	0.28	0.31	0.18
O3'	0.04	0.09	0.11	0.11	0.07	0.09	0.22	0.23	0.19	0.33	0.04	0.09	0.29	0.37	0.13	0.34	0.17	0.10	0.31	0.16	0.29	0.21
O4'	0.05	0.05	0.15	0.18	0.07	0.21	0.14	0.42	0.14	0.18	0.08	0.05	0.18	0.20	0.08	0.34	0.14	0.11	0.43	0.19	0.12	0.33
O5'	0.25	0.41	0.10	0.09	0.44	0.11	0.55	0.33	0.58	0.51	0.51	0.36	0.64	0.59	0.41	0.27	0.12	0.29	0.30	0.23	0.11	0.28
O6	0.11	0.22	0.12	0.14	0.05	0.23	0.07	0.29	0.11	0.21	0.24	0.13	0.09	0.20	0.13	0.12	0.07	0.23	0.32	0.98	0.50	0.10
OP1	0.54	0.82	0.35	0.25	0.75	0.25	0.80	0.29	0.86	0.68	0.87	0.75	0.90	0.76	0.66	0.34	0.28	0.51	0.20	0.43	0.06	0.34
OP2	0.42	0.83	0.13	0.13	0.78	0.18	0.91	0.34	1.00	0.76	0.96	0.72	1.09	0.90	0.66	0.20	0.19	0.43	0.17	0.30	0.15	0.13
P	0.50	0.79	0.25	0.14	0.75	0.20	0.84	0.32	0.90	0.72	0.88	0.72	0.95	0.82	0.67	0.24	0.10	0.49	0.19	0.31	0.10	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.00	0.18	0.82	0.28	0.36
C2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.14	0.15	0.05	0.26	1.25	0.26	0.53
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.13	0.02	0.08	0.07	0.11	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.34	0.64	0.15	0.41
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.08	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.19	0.13	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.26	1.27	0.26	0.54
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.19	0.23	0.08
C5	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.03	0.28	1.47	0.23	0.62
C5'	0.06	0.07	0.13	0.03	0.10	0.00	0.13	0.00	0.12	0.17	0.09	0.06	0.14	0.17	0.11	0.08	0.08	0.01	0.01	0.13	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.03	0.29	1.50	0.22	0.63
C8	0.00	0.01	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.07	0.02	0.28	1.46	0.23	0.62
N1	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.05	0.28	1.40	0.24	0.59
N3	0.03	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.15	0.05	0.24	1.14	0.27	0.49
N6	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.30	1.59	0.20	0.67
N7	0.00	0.02	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.30	1.58	0.21	0.66
N9	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.25	1.20	0.27	0.51
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.09	0.10	0.13	0.07	0.08	0.04	0.00	0.06	0.03	0.31	0.61	0.17	0.41
O3'	0.10	0.15	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.08	0.10	0.07	0.13	0.15	0.09	0.07	0.09	0.06	0.00	0.09	0.05	0.14	0.15	0.03
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.01	0.64	0.33	0.21
O5'	0.18	0.26	0.34	0.16	0.26	0.01	0.28	0.01	0.29	0.28	0.28	0.24	0.30	0.30	0.25	0.31	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.82	1.25	0.64	0.19	1.27	0.19	1.47	0.13	1.50	1.46	1.40	1.14	1.59	1.58	1.20	0.61	0.14	0.64	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.26	0.15	0.13	0.26	0.23	0.23	0.28	0.22	0.23	0.24	0.27	0.20	0.21	0.27	0.17	0.15	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.36	0.53	0.41	0.12	0.54	0.08	0.62	0.01	0.63	0.62	0.59	0.49	0.67	0.66	0.51	0.41	0.03	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00