Doublet Group distance statistics: 53249

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.014, 0.035, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.035 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.014, 0.042, 0.070, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.006, 0.037, 0.069, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.037 std_dev=0.032
N7	A	0, 0.012, 0.052, 0.091, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.052 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.019, 0.063, 0.107, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.063 std_dev=0.044
OP2	A	0, 0.180, 0.437, 0.693, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.437 std_dev=0.257
O4'	A	0, 0.007, 0.284, 0.560, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.284 std_dev=0.277
C2'	A	0, 0.061, 0.355, 0.649, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.355 std_dev=0.294
N1	B	0, 0.137, 0.462, 0.787, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.462 std_dev=0.325
N6	B	0, 0.197, 0.529, 0.861, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.529 std_dev=0.332
C6	B	0, 0.137, 0.476, 0.815, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.476 std_dev=0.339
C3'	B	0, 0.067, 0.419, 0.771, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.419 std_dev=0.352
C2	B	0, 0.105, 0.465, 0.824, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.465 std_dev=0.359
C4'	A	0, 0.239, 0.605, 0.970, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.605 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.094, 0.495, 0.896, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.495 std_dev=0.401
N3	B	0, 0.069, 0.492, 0.914, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.492 std_dev=0.423
C4	B	0, 0.069, 0.506, 0.943, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.506 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.129, 0.572, 1.014, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.572 std_dev=0.442
P	A	0, 0.195, 0.639, 1.083, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.639 std_dev=0.444
N7	B	0, 0.101, 0.558, 1.016, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.558 std_dev=0.457
O2'	A	0, 0.319, 0.806, 1.293, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.806 std_dev=0.487
O4'	B	0, 0.140, 0.634, 1.129, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.634 std_dev=0.494
N9	B	0, 0.081, 0.582, 1.083, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.582 std_dev=0.501
C8	B	0, 0.101, 0.613, 1.125, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.613 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.367, 0.879, 1.392, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.879 std_dev=0.513
C4'	B	0, 0.058, 0.578, 1.098, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.578 std_dev=0.520
C3'	A	0, 0.328, 0.854, 1.381, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.854 std_dev=0.526
C1'	B	0, 0.083, 0.653, 1.223, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.653 std_dev=0.570
OP1	A	0, 0.433, 1.041, 1.650, 1.835 max_d=1.835 avg_d=1.041 std_dev=0.609
OP1	B	0, 0.045, 0.673, 1.301, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.673 std_dev=0.628
P	B	0, 0.170, 0.832, 1.493, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.832 std_dev=0.662
C5'	A	0, 0.190, 0.872, 1.553, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.872 std_dev=0.682
C5'	B	0, 0.086, 0.786, 1.486, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.786 std_dev=0.700
C2'	B	0, 0.007, 0.747, 1.487, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.747 std_dev=0.740
O5'	B	0, 0.191, 1.204, 2.217, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.204 std_dev=1.013
O3'	A	0, 0.456, 1.471, 2.487, 2.675 max_d=2.675 avg_d=1.471 std_dev=1.016
O2'	B	0, -0.052, 1.168, 2.387, 2.934 max_d=2.934 avg_d=1.168 std_dev=1.220
OP2	B	0, 0.339, 1.581, 2.823, 2.953 max_d=2.953 avg_d=1.581 std_dev=1.242

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.28	0.00	0.28	0.01	0.36	0.12	0.21
C2	0.04	0.00	0.19	0.04	0.02	0.18	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.22	0.44	0.23	0.25	0.01	0.24	0.22	0.19
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.02	0.06	0.25	0.09	0.08	0.15	0.23	0.18	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.49	0.07	0.63	0.46	0.50
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.11	0.00	0.21	0.02	0.18	0.32	0.10	0.05	0.03	0.32	0.16	0.00	0.01	0.02	0.36	0.22	0.57	0.28	0.40
C4	0.02	0.02	0.10	0.11	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.12	0.28	0.01	0.27	0.19	0.18
C4'	0.02	0.18	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.22	0.13	0.24	0.18	0.17	0.07	0.24	0.03	0.00	0.02	0.07	0.22	0.21	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.21	0.00	0.06	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.13	0.05	0.30	0.01	0.26	0.21	0.19
C5'	0.11	0.27	0.25	0.02	0.19	0.01	0.24	0.00	0.24	0.37	0.24	0.33	0.25	0.35	0.20	0.09	0.22	0.02	0.01	0.27	0.24	0.39	0.02
C6	0.02	0.00	0.09	0.18	0.01	0.07	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.11	0.29	0.01	0.25	0.25	0.21
C8	0.01	0.02	0.08	0.32	0.01	0.22	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.36	0.15	0.15	0.35	0.02	0.35	0.16	0.23
N1	0.03	0.00	0.15	0.10	0.02	0.13	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.32	0.18	0.27	0.01	0.24	0.24	0.21
N2	0.05	0.01	0.23	0.05	0.02	0.24	0.01	0.33	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.35	0.54	0.27	0.23	0.01	0.23	0.22	0.19
N3	0.03	0.01	0.18	0.03	0.01	0.18	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.22	0.45	0.24	0.25	0.01	0.25	0.20	0.18
N7	0.02	0.01	0.04	0.32	0.01	0.17	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.32	0.13	0.09	0.33	0.02	0.30	0.19	0.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.16	0.01	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.02	0.31	0.01	0.33	0.15	0.20
O2'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.05	0.24	0.15	0.09	0.10	0.36	0.10	0.35	0.22	0.32	0.15	0.00	0.07	0.15	0.40	0.16	0.61	0.41	0.42
O3'	0.28	0.44	0.02	0.01	0.26	0.03	0.13	0.22	0.18	0.15	0.32	0.54	0.45	0.13	0.14	0.07	0.00	0.24	0.34	0.13	0.70	0.46	0.48
O4'	0.00	0.23	0.02	0.02	0.12	0.00	0.05	0.02	0.11	0.15	0.18	0.27	0.24	0.09	0.02	0.15	0.24	0.00	0.23	0.09	0.28	0.17	0.17
O5'	0.28	0.25	0.49	0.36	0.28	0.02	0.30	0.01	0.29	0.35	0.27	0.23	0.25	0.33	0.31	0.40	0.34	0.23	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.07	0.22	0.01	0.07	0.01	0.27	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.13	0.09	0.30	0.00	0.26	0.27	0.23
OP1	0.36	0.24	0.63	0.57	0.27	0.22	0.26	0.24	0.25	0.35	0.24	0.23	0.25	0.30	0.33	0.61	0.70	0.28	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.22	0.46	0.28	0.19	0.21	0.21	0.39	0.25	0.16	0.24	0.22	0.20	0.19	0.15	0.41	0.46	0.17	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.19	0.50	0.40	0.18	0.03	0.19	0.02	0.21	0.23	0.21	0.19	0.18	0.21	0.20	0.42	0.48	0.17	0.01	0.23	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.42	0.20	0.36	0.27	0.36	0.29	0.36	0.44	0.29	0.46	0.22	0.28	0.29	0.42	0.42	0.60	0.15	0.38	0.46	0.38	1.00	0.57
C2	0.07	0.14	0.06	0.05	0.16	0.17	0.23	0.25	0.21	0.22	0.16	0.15	0.25	0.26	0.14	0.04	0.22	0.09	0.44	0.23	0.83	0.26
C2'	0.41	0.19	0.36	0.29	0.34	0.34	0.37	0.58	0.30	0.50	0.22	0.24	0.31	0.46	0.43	0.58	0.19	0.40	0.69	0.64	1.07	0.79
C3'	0.24	0.25	0.21	0.24	0.27	0.20	0.27	0.30	0.27	0.28	0.25	0.26	0.27	0.29	0.26	0.46	0.46	0.22	0.32	0.35	0.73	0.33
C4	0.28	0.21	0.20	0.16	0.31	0.11	0.31	0.18	0.27	0.35	0.22	0.26	0.27	0.34	0.32	0.35	0.20	0.18	0.26	0.21	0.94	0.39
C4'	0.33	0.20	0.37	0.42	0.27	0.41	0.27	0.56	0.24	0.35	0.21	0.22	0.24	0.32	0.32	0.54	0.54	0.37	0.54	0.36	0.95	0.56
C5	0.25	0.23	0.19	0.14	0.28	0.10	0.28	0.17	0.26	0.29	0.23	0.27	0.26	0.29	0.28	0.33	0.24	0.14	0.27	0.19	0.90	0.35
C5'	0.60	0.34	0.71	0.73	0.43	0.71	0.42	0.78	0.36	0.55	0.34	0.37	0.35	0.49	0.53	0.90	0.84	0.61	0.76	0.51	1.14	0.75
C6	0.13	0.18	0.09	0.08	0.18	0.11	0.21	0.17	0.22	0.20	0.19	0.17	0.24	0.22	0.16	0.16	0.28	0.07	0.37	0.20	0.83	0.28
C8	0.40	0.27	0.36	0.24	0.36	0.24	0.33	0.32	0.29	0.39	0.26	0.34	0.28	0.36	0.39	0.59	0.19	0.30	0.30	0.29	0.97	0.47
N1	0.05	0.14	0.06	0.05	0.12	0.16	0.18	0.24	0.19	0.15	0.16	0.13	0.22	0.20	0.09	0.06	0.27	0.10	0.46	0.24	0.78	0.25
N2	0.15	0.17	0.21	0.07	0.13	0.27	0.18	0.39	0.19	0.14	0.15	0.18	0.24	0.22	0.09	0.23	0.21	0.22	0.59	0.31	0.73	0.25
N3	0.18	0.15	0.09	0.11	0.25	0.09	0.29	0.16	0.25	0.33	0.18	0.18	0.27	0.34	0.27	0.18	0.18	0.08	0.30	0.19	0.92	0.34
N7	0.33	0.28	0.29	0.19	0.32	0.17	0.30	0.23	0.28	0.33	0.26	0.32	0.27	0.31	0.33	0.48	0.23	0.22	0.25	0.23	0.93	0.40
N9	0.38	0.23	0.32	0.23	0.36	0.21	0.34	0.31	0.29	0.41	0.24	0.31	0.28	0.38	0.39	0.53	0.17	0.30	0.32	0.28	0.98	0.48
O2'	0.70	0.19	0.72	0.74	0.49	0.74	0.50	1.01	0.36	0.76	0.22	0.32	0.36	0.66	0.67	0.92	0.56	0.71	1.14	1.15	1.40	1.24
O3'	0.27	0.20	0.39	0.56	0.21	0.46	0.21	0.32	0.21	0.23	0.20	0.21	0.20	0.23	0.24	0.19	0.70	0.31	0.21	0.72	0.30	0.25
O4'	0.30	0.16	0.30	0.27	0.25	0.30	0.26	0.45	0.23	0.33	0.18	0.19	0.24	0.31	0.30	0.53	0.34	0.32	0.36	0.27	0.97	0.50
O5'	0.35	0.28	0.40	0.15	0.27	0.30	0.27	0.48	0.28	0.32	0.29	0.26	0.28	0.29	0.31	0.78	0.28	0.31	0.45	0.31	0.93	0.49
O6	0.10	0.15	0.09	0.08	0.14	0.13	0.17	0.19	0.19	0.16	0.17	0.14	0.22	0.18	0.12	0.14	0.32	0.09	0.40	0.21	0.80	0.26
OP1	0.36	0.20	0.48	0.25	0.19	0.42	0.18	0.64	0.18	0.30	0.22	0.16	0.18	0.24	0.28	0.88	0.23	0.35	0.66	0.44	0.98	0.63
OP2	0.28	0.23	0.40	0.11	0.15	0.25	0.16	0.40	0.21	0.20	0.26	0.15	0.23	0.16	0.20	0.82	0.30	0.22	0.33	0.26	0.90	0.42
P	0.31	0.20	0.44	0.16	0.15	0.33	0.15	0.50	0.16	0.25	0.22	0.14	0.17	0.19	0.23	0.85	0.25	0.28	0.47	0.33	0.92	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.00	0.30	0.17	0.64	0.17
C2	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.44	0.12	0.35	0.17	0.83	0.27
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.19	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.39	0.40	0.49	0.32
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.08	0.21	0.03	0.05	0.12	0.20	0.09	0.02	0.01	0.02	0.11	0.14	0.57	0.21
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.27	0.07	0.37	0.18	0.78	0.24
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.08	0.09	0.08	0.06	0.07	0.04	0.19	0.05	0.01	0.01	0.26	0.56	0.12
C5	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.16	0.06	0.42	0.27	0.73	0.24
C5'	0.06	0.14	0.19	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.14	0.09	0.15	0.11	0.14	0.11	0.07	0.04	0.13	0.02	0.00	0.39	0.33	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.23	0.08	0.42	0.29	0.75	0.26
C8	0.01	0.00	0.03	0.21	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.07	0.06	0.41	0.24	0.61	0.19
N1	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.36	0.11	0.40	0.24	0.80	0.27
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.44	0.11	0.33	0.14	0.82	0.25
N6	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.16	0.07	0.44	0.36	0.70	0.27
N7	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.28	0.04	0.05	0.44	0.32	0.62	0.21
N9	0.01	0.00	0.01	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.16	0.03	0.37	0.15	0.71	0.20
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.09	0.19	0.17	0.04	0.14	0.31	0.09	0.10	0.18	0.28	0.15	0.00	0.08	0.09	0.29	0.43	0.52	0.34
O3'	0.26	0.44	0.03	0.01	0.27	0.05	0.16	0.13	0.23	0.07	0.36	0.44	0.16	0.04	0.16	0.08	0.00	0.20	0.38	0.23	0.63	0.39
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.11	0.11	0.07	0.05	0.03	0.09	0.20	0.00	0.23	0.10	0.72	0.19
O5'	0.30	0.35	0.39	0.11	0.37	0.01	0.42	0.00	0.42	0.41	0.40	0.33	0.44	0.44	0.37	0.29	0.38	0.23	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.17	0.17	0.40	0.14	0.18	0.26	0.27	0.39	0.29	0.24	0.24	0.14	0.36	0.32	0.15	0.43	0.23	0.10	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.64	0.83	0.49	0.57	0.78	0.56	0.73	0.33	0.75	0.61	0.80	0.82	0.70	0.62	0.71	0.52	0.63	0.72	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.27	0.32	0.21	0.24	0.12	0.24	0.01	0.26	0.19	0.27	0.25	0.27	0.21	0.20	0.34	0.39	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00