Doublet Group distance statistics: 53250

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.016, 0.032, 0.049, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.014, 0.032, 0.051, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.038 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.020, 0.042, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.042 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.012, 0.037, 0.062, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.037 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.012, 0.041, 0.069, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.028, 0.056, 0.085, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.056 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.039, 0.082, 0.124, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.082 std_dev=0.043
C4	B	0, 0.226, 0.512, 0.799, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.512 std_dev=0.287
N9	B	0, 0.221, 0.510, 0.798, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.510 std_dev=0.288
C3'	B	0, 0.268, 0.557, 0.846, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.557 std_dev=0.289
C1'	B	0, 0.288, 0.627, 0.965, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.627 std_dev=0.339
C2'	B	0, 0.336, 0.694, 1.051, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.694 std_dev=0.357
N3	B	0, 0.340, 0.703, 1.065, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.703 std_dev=0.362
C8	B	0, 0.236, 0.634, 1.032, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.634 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.107, 0.517, 0.927, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.517 std_dev=0.410
O2'	B	0, 0.359, 0.772, 1.185, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.772 std_dev=0.413
O4'	A	0, -0.078, 0.350, 0.779, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.350 std_dev=0.428
C2'	A	0, -0.113, 0.317, 0.747, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.317 std_dev=0.430
O4'	B	0, 0.276, 0.708, 1.141, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.708 std_dev=0.432
C2	B	0, 0.375, 0.844, 1.313, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.844 std_dev=0.469
N7	B	0, 0.169, 0.645, 1.120, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.645 std_dev=0.476
C4'	B	0, 0.245, 0.743, 1.241, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.743 std_dev=0.498
P	B	0, 0.473, 0.980, 1.486, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.980 std_dev=0.507
C6	B	0, 0.095, 0.630, 1.165, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.630 std_dev=0.535
N1	B	0, 0.247, 0.793, 1.338, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.793 std_dev=0.546
OP2	A	0, 0.128, 0.710, 1.291, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.710 std_dev=0.582
O5'	B	0, 0.395, 0.988, 1.581, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.988 std_dev=0.593
O5'	A	0, -0.067, 0.584, 1.235, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.584 std_dev=0.651
C3'	A	0, -0.097, 0.563, 1.224, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.563 std_dev=0.660
C4'	A	0, -0.095, 0.570, 1.234, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.570 std_dev=0.665
P	A	0, 0.022, 0.699, 1.375, 1.995 max_d=1.995 avg_d=0.699 std_dev=0.677
OP1	B	0, 0.549, 1.247, 1.946, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.247 std_dev=0.699
O3'	B	0, 0.072, 0.773, 1.474, 2.077 max_d=2.077 avg_d=0.773 std_dev=0.701
O2'	A	0, -0.113, 0.592, 1.297, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.592 std_dev=0.705
N6	B	0, 0.000, 0.723, 1.445, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.723 std_dev=0.723
OP2	B	0, 0.428, 1.174, 1.920, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.174 std_dev=0.746
OP1	A	0, -0.007, 0.814, 1.636, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.814 std_dev=0.821
C5'	A	0, -0.061, 0.780, 1.620, 2.416 max_d=2.416 avg_d=0.780 std_dev=0.840
C5'	B	0, 0.446, 1.308, 2.171, 2.614 max_d=2.614 avg_d=1.308 std_dev=0.862
O3'	A	0, -0.067, 0.899, 1.864, 2.753 max_d=2.753 avg_d=0.899 std_dev=0.966

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.24	0.00	0.16	0.02	0.27	0.26	0.21
C2	0.02	0.00	0.29	0.23	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.16	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.14	0.01	0.05	0.18	0.11	0.15	0.21	0.35	0.28	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.39	0.07	0.61	0.59	0.53
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.22	0.00	0.27	0.01	0.29	0.23	0.27	0.21	0.19	0.28	0.18	0.02	0.01	0.02	0.09	0.31	0.29	0.18	0.18
C4	0.01	0.01	0.14	0.22	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.08	0.08	0.01	0.10	0.13	0.10
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.14	0.02	0.07	0.04	0.13	0.06	0.24	0.02	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.27	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.06	0.03	0.03	0.01	0.04	0.09	0.05
C5'	0.07	0.09	0.18	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.06	0.11	0.09	0.08	0.04	0.07	0.19	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.29	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.06	0.06	0.04	0.00	0.05	0.06	0.05
C8	0.01	0.01	0.15	0.23	0.00	0.14	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.33	0.12	0.12	0.03	0.01	0.08	0.16	0.08
N1	0.02	0.00	0.21	0.27	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.12	0.05	0.00	0.05	0.07	0.05
N2	0.03	0.00	0.35	0.21	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.23	0.20	0.11	0.01	0.11	0.10	0.10
N3	0.02	0.00	0.28	0.19	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.16	0.11	0.00	0.13	0.14	0.12
N7	0.01	0.01	0.09	0.28	0.00	0.13	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.15	0.07	0.05	0.01	0.04	0.09	0.05
N9	0.01	0.01	0.00	0.18	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.06	0.01	0.09	0.01	0.15	0.19	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.11	0.24	0.24	0.07	0.21	0.33	0.11	0.20	0.11	0.35	0.17	0.00	0.05	0.17	0.28	0.27	0.61	0.68	0.50
O3'	0.24	0.16	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.19	0.06	0.12	0.08	0.23	0.19	0.15	0.06	0.05	0.00	0.17	0.21	0.10	0.40	0.34	0.31
O4'	0.00	0.16	0.01	0.02	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.12	0.12	0.20	0.16	0.07	0.01	0.17	0.17	0.00	0.09	0.04	0.05	0.14	0.10
O5'	0.16	0.09	0.39	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.11	0.11	0.05	0.09	0.28	0.21	0.09	0.00	0.05	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.31	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.10	0.04	0.05	0.00	0.09	0.08	0.07
OP1	0.27	0.09	0.61	0.29	0.10	0.10	0.04	0.06	0.05	0.08	0.05	0.11	0.13	0.04	0.15	0.61	0.40	0.05	0.02	0.09	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.10	0.59	0.18	0.13	0.02	0.09	0.01	0.06	0.16	0.07	0.10	0.14	0.09	0.19	0.68	0.34	0.14	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.08	0.53	0.18	0.10	0.03	0.05	0.02	0.05	0.08	0.05	0.10	0.12	0.05	0.13	0.50	0.31	0.10	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.18	0.38	0.27	0.25	0.24	0.21	0.41	0.18	0.31	0.18	0.22	0.19	0.23	0.33	0.41	0.68	0.26	0.26	0.28	0.34	0.19
C2	0.13	0.17	0.20	0.12	0.22	0.19	0.36	0.31	0.35	0.37	0.24	0.13	0.42	0.44	0.23	0.36	0.49	0.20	0.24	0.29	0.49	0.27
C2'	0.38	0.29	0.28	0.12	0.35	0.17	0.36	0.61	0.33	0.42	0.30	0.30	0.34	0.40	0.38	0.30	0.50	0.16	0.31	0.47	0.36	0.27
C3'	0.35	0.21	0.25	0.10	0.19	0.14	0.13	0.72	0.13	0.15	0.15	0.25	0.16	0.13	0.22	0.34	0.54	0.16	0.47	0.77	0.50	0.55
C4	0.18	0.22	0.21	0.12	0.24	0.23	0.25	0.49	0.25	0.24	0.23	0.22	0.25	0.25	0.22	0.34	0.59	0.21	0.34	0.39	0.46	0.33
C4'	0.24	0.24	0.16	0.13	0.25	0.17	0.37	0.78	0.40	0.34	0.33	0.20	0.50	0.44	0.22	0.22	0.40	0.17	0.58	0.81	0.62	0.67
C5	0.09	0.31	0.12	0.08	0.23	0.40	0.24	0.64	0.30	0.12	0.32	0.27	0.30	0.18	0.13	0.25	0.56	0.45	0.47	0.50	0.53	0.44
C5'	0.27	0.31	0.30	0.36	0.38	0.41	0.52	1.16	0.52	0.57	0.41	0.29	0.61	0.64	0.39	0.30	0.30	0.33	0.91	1.27	1.02	1.08
C6	0.16	0.34	0.11	0.09	0.21	0.43	0.29	0.57	0.38	0.12	0.40	0.24	0.42	0.23	0.09	0.23	0.47	0.50	0.45	0.47	0.55	0.43
C8	0.19	0.29	0.18	0.14	0.23	0.37	0.19	0.80	0.21	0.12	0.25	0.29	0.19	0.13	0.18	0.25	0.65	0.33	0.52	0.58	0.53	0.48
N1	0.11	0.24	0.13	0.10	0.20	0.31	0.34	0.43	0.41	0.24	0.36	0.16	0.48	0.35	0.13	0.29	0.46	0.37	0.35	0.37	0.50	0.34
N2	0.16	0.21	0.22	0.14	0.21	0.16	0.42	0.22	0.39	0.46	0.20	0.16	0.51	0.56	0.27	0.38	0.46	0.16	0.19	0.24	0.52	0.26
N3	0.22	0.17	0.26	0.14	0.23	0.15	0.31	0.31	0.26	0.39	0.19	0.15	0.29	0.39	0.29	0.39	0.55	0.12	0.22	0.27	0.46	0.25
N7	0.13	0.34	0.12	0.10	0.22	0.50	0.20	0.81	0.26	0.09	0.32	0.31	0.25	0.12	0.14	0.21	0.59	0.52	0.57	0.61	0.60	0.54
N9	0.28	0.23	0.26	0.17	0.24	0.21	0.21	0.58	0.20	0.21	0.21	0.24	0.19	0.19	0.25	0.34	0.66	0.13	0.36	0.42	0.42	0.33
O2'	0.52	0.21	0.47	0.34	0.43	0.32	0.53	0.28	0.43	0.75	0.27	0.25	0.49	0.72	0.57	0.39	0.66	0.39	0.47	0.16	0.71	0.47
O3'	0.15	0.30	0.10	0.13	0.23	0.20	0.37	0.76	0.45	0.25	0.41	0.21	0.55	0.39	0.15	0.18	0.41	0.12	0.56	0.70	0.57	0.58
O4'	0.28	0.28	0.21	0.12	0.27	0.15	0.39	0.58	0.43	0.33	0.37	0.22	0.52	0.43	0.23	0.26	0.55	0.18	0.42	0.49	0.41	0.42
O5'	0.17	0.20	0.20	0.26	0.25	0.51	0.37	1.28	0.35	0.47	0.25	0.19	0.42	0.50	0.29	0.20	0.28	0.38	0.94	1.23	1.00	1.04
O6	0.27	0.41	0.16	0.12	0.19	0.52	0.28	0.63	0.42	0.08	0.47	0.26	0.47	0.20	0.09	0.19	0.41	0.60	0.52	0.53	0.60	0.49
OP1	0.16	0.18	0.19	0.27	0.23	0.52	0.35	1.28	0.32	0.46	0.22	0.18	0.41	0.49	0.27	0.18	0.22	0.38	0.92	1.37	1.08	1.09
OP2	0.21	0.20	0.26	0.36	0.17	0.77	0.24	1.43	0.19	0.42	0.15	0.18	0.24	0.40	0.26	0.22	0.31	0.58	1.03	1.28	1.13	1.10
P	0.15	0.16	0.21	0.29	0.21	0.60	0.32	1.36	0.29	0.46	0.18	0.15	0.37	0.48	0.27	0.19	0.22	0.43	0.98	1.35	1.12	1.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.23	0.00	0.07	0.14	0.39	0.10
C2	0.02	0.00	0.21	0.12	0.01	0.03	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.56	0.41	0.12	0.24	0.17	0.45	0.24
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.04	0.17	0.09	0.12	0.16	0.22	0.06	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.15	0.13	0.49	0.21
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.14	0.38	0.05	0.14	0.21	0.35	0.16	0.02	0.01	0.01	0.37	0.26	0.64	0.41
C4	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.06	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.19	0.06	0.25	0.19	0.48	0.26
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.14	0.06	0.02	0.12	0.14	0.08	0.19	0.04	0.00	0.03	0.26	0.11	0.09
C5	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.30	0.02	0.03	0.32	0.28	0.53	0.35
C5'	0.09	0.20	0.17	0.01	0.20	0.01	0.25	0.00	0.26	0.26	0.23	0.17	0.29	0.28	0.18	0.06	0.13	0.02	0.01	0.05	0.15	0.02
C6	0.02	0.00	0.09	0.14	0.01	0.10	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.08	0.05	0.33	0.29	0.52	0.36
C8	0.01	0.01	0.12	0.38	0.00	0.14	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.24	0.09	0.33	0.29	0.55	0.35
N1	0.02	0.00	0.16	0.05	0.01	0.06	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.50	0.26	0.09	0.29	0.23	0.49	0.31
N3	0.02	0.00	0.22	0.14	0.00	0.02	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.53	0.43	0.12	0.20	0.14	0.44	0.20
N6	0.02	0.00	0.06	0.21	0.01	0.12	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.35	0.04	0.04	0.37	0.36	0.54	0.42
N7	0.00	0.01	0.08	0.35	0.00	0.14	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.15	0.22	0.05	0.37	0.35	0.57	0.41
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.05	0.01	0.22	0.17	0.48	0.23
O2'	0.01	0.56	0.00	0.02	0.36	0.19	0.30	0.06	0.39	0.06	0.50	0.53	0.35	0.15	0.15	0.00	0.04	0.12	0.22	0.19	0.55	0.28
O3'	0.23	0.41	0.01	0.01	0.19	0.04	0.02	0.13	0.08	0.24	0.26	0.43	0.04	0.22	0.05	0.04	0.00	0.20	0.39	0.46	0.92	0.56
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.09	0.09	0.12	0.04	0.05	0.01	0.12	0.20	0.00	0.10	0.22	0.31	0.14
O5'	0.07	0.24	0.15	0.37	0.25	0.03	0.32	0.01	0.33	0.33	0.29	0.20	0.37	0.37	0.22	0.22	0.39	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.14	0.17	0.13	0.26	0.19	0.26	0.28	0.05	0.29	0.29	0.23	0.14	0.36	0.35	0.17	0.19	0.46	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.45	0.49	0.64	0.48	0.11	0.53	0.15	0.52	0.55	0.49	0.44	0.54	0.57	0.48	0.55	0.92	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.24	0.21	0.41	0.26	0.09	0.35	0.02	0.36	0.35	0.31	0.20	0.42	0.41	0.23	0.28	0.56	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00