Doublet Group distance statistics: 53252

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.002, 0.018, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.010, 0.030, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C6	B	0, 0.142, 0.449, 0.757, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.449 std_dev=0.308
C5	B	0, 0.203, 0.511, 0.819, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.511 std_dev=0.308
N6	B	0, 0.114, 0.435, 0.757, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.435 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.186, 0.565, 0.944, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.565 std_dev=0.379
N7	B	0, 0.238, 0.633, 1.027, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.633 std_dev=0.394
C4	B	0, 0.171, 0.568, 0.966, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.568 std_dev=0.398
C2	B	0, 0.198, 0.628, 1.058, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.628 std_dev=0.430
N3	B	0, 0.131, 0.597, 1.062, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.597 std_dev=0.466
N9	B	0, 0.254, 0.722, 1.189, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.722 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.297, 0.772, 1.248, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.772 std_dev=0.475
O2'	B	0, 0.347, 0.856, 1.365, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.856 std_dev=0.509
C2'	A	0, 0.413, 1.002, 1.590, 1.481 max_d=1.481 avg_d=1.002 std_dev=0.589
C1'	B	0, 0.254, 0.867, 1.480, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.867 std_dev=0.613
O4'	A	0, 0.470, 1.138, 1.806, 1.704 max_d=1.704 avg_d=1.138 std_dev=0.668
C2'	B	0, 0.545, 1.306, 2.067, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.306 std_dev=0.761
O2'	A	0, 0.567, 1.360, 2.153, 1.917 max_d=1.917 avg_d=1.360 std_dev=0.793
C3'	A	0, 0.709, 1.706, 2.704, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.706 std_dev=0.997
C4'	A	0, 0.802, 1.928, 3.055, 2.848 max_d=2.848 avg_d=1.928 std_dev=1.126
O3'	A	0, 0.822, 1.979, 3.137, 2.864 max_d=2.864 avg_d=1.979 std_dev=1.157
O4'	B	0, 0.789, 2.058, 3.328, 3.253 max_d=3.253 avg_d=2.058 std_dev=1.270
C3'	B	0, 1.029, 2.503, 3.976, 3.672 max_d=3.672 avg_d=2.503 std_dev=1.474
C4'	B	0, 1.132, 2.791, 4.451, 4.143 max_d=4.143 avg_d=2.791 std_dev=1.659
O3'	B	0, 1.209, 2.976, 4.743, 4.415 max_d=4.415 avg_d=2.976 std_dev=1.767
O5'	A	0, 1.241, 3.051, 4.860, 4.505 max_d=4.505 avg_d=3.051 std_dev=1.809
C5'	A	0, 1.346, 3.238, 5.129, 4.782 max_d=4.782 avg_d=3.238 std_dev=1.892
OP1	A	0, 1.587, 3.887, 6.187, 5.819 max_d=5.819 avg_d=3.887 std_dev=2.300
C5'	B	0, 1.600, 3.947, 6.294, 6.137 max_d=6.137 avg_d=3.947 std_dev=2.347
P	A	0, 1.761, 4.271, 6.782, 6.183 max_d=6.183 avg_d=4.271 std_dev=2.511
O5'	B	0, 1.898, 4.524, 7.151, 6.408 max_d=6.408 avg_d=4.524 std_dev=2.626
OP2	B	0, 1.920, 4.604, 7.289, 6.748 max_d=6.748 avg_d=4.604 std_dev=2.685
P	B	0, 2.029, 4.849, 7.668, 7.017 max_d=7.017 avg_d=4.849 std_dev=2.820
OP1	B	0, 2.204, 5.262, 8.319, 7.580 max_d=7.580 avg_d=5.262 std_dev=3.058
OP2	A	0, 2.462, 5.882, 9.302, 8.229 max_d=8.229 avg_d=5.882 std_dev=3.420

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.17	0.09	0.14
C2	0.02	0.00	0.22	0.23	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.18	0.13	0.38	0.00	0.37	0.39	0.38
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.13	0.01	0.08	0.00	0.13	0.06	0.19	0.26	0.22	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.28	0.11	0.33	0.12	0.25
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.19	0.00	0.23	0.00	0.26	0.17	0.25	0.22	0.19	0.21	0.14	0.01	0.00	0.01	0.37	0.27	0.41	0.11	0.31
C4	0.01	0.00	0.13	0.19	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.06	0.40	0.00	0.36	0.41	0.40
C4'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.16	0.08	0.14	0.10	0.15	0.06	0.10	0.02	0.00	0.00	0.11	0.13	0.22	0.00
C5	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.15	0.02	0.52	0.00	0.46	0.61	0.54
C5'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.18	0.27	0.13	0.15	0.09	0.28	0.13	0.08	0.04	0.01	0.00	0.23	0.22	0.38	0.00
C6	0.01	0.00	0.13	0.26	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.19	0.05	0.53	0.00	0.49	0.66	0.57
C8	0.00	0.00	0.06	0.17	0.00	0.16	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.11	0.09	0.52	0.01	0.41	0.58	0.54
N1	0.01	0.00	0.19	0.25	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.19	0.10	0.46	0.00	0.44	0.53	0.48
N2	0.02	0.00	0.26	0.22	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.21	0.16	0.34	0.00	0.35	0.33	0.34
N3	0.02	0.00	0.22	0.19	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.16	0.13	0.33	0.00	0.32	0.30	0.32
N7	0.00	0.00	0.02	0.21	0.00	0.15	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.05	0.59	0.01	0.50	0.73	0.64
N9	0.00	0.01	0.03	0.14	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.37	0.00	0.32	0.35	0.35
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.10	0.10	0.08	0.09	0.16	0.07	0.15	0.10	0.15	0.08	0.00	0.08	0.08	0.05	0.11	0.13	0.05	0.05
O3'	0.09	0.18	0.02	0.00	0.12	0.02	0.15	0.04	0.19	0.11	0.19	0.21	0.16	0.15	0.05	0.08	0.00	0.05	0.30	0.21	0.43	0.13	0.29
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.10	0.16	0.13	0.05	0.01	0.08	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.18	0.07
O5'	0.16	0.38	0.28	0.37	0.40	0.00	0.52	0.00	0.53	0.52	0.46	0.34	0.33	0.59	0.37	0.05	0.30	0.05	0.00	0.58	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.11	0.27	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.21	0.03	0.58	0.00	0.54	0.77	0.65
OP1	0.17	0.37	0.33	0.41	0.36	0.13	0.46	0.22	0.49	0.41	0.44	0.35	0.32	0.50	0.32	0.13	0.43	0.04	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.39	0.12	0.11	0.41	0.22	0.61	0.38	0.66	0.58	0.53	0.33	0.30	0.73	0.35	0.05	0.13	0.18	0.01	0.77	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.38	0.25	0.31	0.40	0.00	0.54	0.00	0.57	0.54	0.48	0.34	0.32	0.64	0.35	0.05	0.29	0.07	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.44	0.21	0.49	0.48	0.22	0.69	0.15	0.86	0.18	0.23	0.07	0.33	0.35	0.22	0.29	0.67	0.58	0.67	1.00	0.96	0.80	0.89
C2	0.36	0.31	0.37	0.38	0.21	0.53	0.14	0.74	0.13	0.25	0.12	0.36	0.31	0.28	0.25	0.48	0.39	0.50	0.94	0.86	0.84	0.84
C2'	0.25	0.14	0.36	0.30	0.06	0.50	0.18	0.73	0.25	0.17	0.13	0.20	0.41	0.27	0.11	0.59	0.41	0.48	0.82	0.78	0.64	0.72
C3'	0.41	0.23	0.45	0.52	0.20	0.76	0.19	0.95	0.22	0.25	0.04	0.33	0.41	0.29	0.26	0.64	0.64	0.69	1.00	0.97	0.76	0.88
C4	0.40	0.36	0.41	0.38	0.25	0.56	0.14	0.73	0.12	0.22	0.10	0.41	0.33	0.22	0.28	0.56	0.41	0.56	0.93	0.84	0.75	0.80
C4'	0.72	0.42	0.73	0.82	0.47	1.04	0.34	1.17	0.26	0.46	0.20	0.57	0.35	0.39	0.55	0.88	0.95	0.99	1.26	1.24	0.99	1.12
C5	0.37	0.45	0.38	0.30	0.29	0.46	0.13	0.62	0.06	0.19	0.24	0.45	0.27	0.18	0.27	0.51	0.31	0.48	0.86	0.75	0.67	0.71
C5'	0.84	0.53	0.84	0.91	0.56	1.14	0.38	1.22	0.27	0.52	0.26	0.69	0.33	0.41	0.64	1.00	1.07	1.08	1.28	1.27	0.98	1.13
C6	0.34	0.47	0.33	0.24	0.30	0.38	0.15	0.54	0.10	0.18	0.33	0.44	0.19	0.18	0.27	0.45	0.22	0.40	0.79	0.68	0.64	0.65
C8	0.40	0.38	0.42	0.35	0.26	0.53	0.13	0.68	0.10	0.19	0.14	0.41	0.29	0.17	0.28	0.58	0.41	0.55	0.90	0.80	0.68	0.75
N1	0.33	0.39	0.33	0.28	0.26	0.40	0.11	0.60	0.04	0.20	0.24	0.40	0.24	0.22	0.25	0.43	0.27	0.39	0.82	0.73	0.73	0.71
N2	0.32	0.22	0.36	0.45	0.13	0.56	0.16	0.81	0.16	0.28	0.10	0.26	0.30	0.32	0.22	0.44	0.45	0.48	1.01	0.94	0.95	0.93
N3	0.40	0.28	0.41	0.43	0.21	0.61	0.16	0.81	0.17	0.25	0.07	0.35	0.35	0.27	0.27	0.55	0.46	0.59	0.98	0.91	0.84	0.87
N7	0.37	0.45	0.39	0.29	0.29	0.46	0.14	0.60	0.08	0.18	0.25	0.44	0.24	0.16	0.27	0.53	0.32	0.49	0.85	0.73	0.64	0.69
N9	0.41	0.32	0.44	0.40	0.24	0.60	0.14	0.76	0.14	0.21	0.05	0.39	0.33	0.21	0.28	0.61	0.47	0.60	0.94	0.87	0.75	0.81
O2'	0.25	0.16	0.43	0.33	0.04	0.48	0.17	0.74	0.25	0.13	0.19	0.19	0.39	0.23	0.08	0.70	0.48	0.44	0.90	0.89	0.77	0.84
O3'	0.53	0.26	0.55	0.72	0.31	0.97	0.29	1.19	0.26	0.39	0.11	0.38	0.42	0.40	0.39	0.69	0.84	0.85	1.23	1.24	0.99	1.13
O4'	0.68	0.42	0.69	0.73	0.47	0.94	0.34	1.05	0.25	0.44	0.21	0.56	0.33	0.37	0.53	0.83	0.84	0.92	1.19	1.15	0.95	1.05
O5'	0.73	0.54	0.73	0.79	0.53	0.99	0.35	1.07	0.25	0.44	0.34	0.64	0.12	0.31	0.57	0.85	0.91	0.93	1.20	1.17	0.94	1.06
O6	0.32	0.48	0.29	0.16	0.32	0.30	0.20	0.45	0.21	0.18	0.40	0.44	0.05	0.15	0.27	0.41	0.13	0.34	0.73	0.59	0.56	0.57
OP1	0.77	0.62	0.76	0.81	0.59	1.00	0.43	1.07	0.35	0.50	0.44	0.70	0.21	0.39	0.62	0.88	0.93	0.96	1.22	1.18	0.97	1.07
OP2	0.86	0.67	0.86	0.89	0.62	1.08	0.42	1.07	0.33	0.50	0.44	0.77	0.26	0.35	0.67	1.04	1.05	1.01	1.24	1.19	0.92	1.05
P	0.76	0.56	0.76	0.81	0.54	1.01	0.36	1.06	0.27	0.44	0.37	0.66	0.19	0.31	0.59	0.89	0.95	0.95	1.20	1.17	0.92	1.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.34	0.43	0.15	0.27
C2	0.02	0.00	0.21	0.15	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.17	0.16	0.52	0.46	0.31	0.38
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.03	0.10	0.09	0.17	0.20	0.08	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.16	0.39	0.29	0.19
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.16	0.20	0.15	0.13	0.18	0.19	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.34	0.40	0.16
C4	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.09	0.49	0.44	0.29	0.35
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.10	0.22	0.07	0.09	0.13	0.20	0.09	0.06	0.02	0.00	0.00	0.27	0.27	0.04
C5	0.00	0.00	0.06	0.15	0.00	0.12	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.14	0.04	0.50	0.44	0.37	0.38
C5'	0.07	0.21	0.03	0.01	0.22	0.00	0.31	0.00	0.30	0.40	0.25	0.18	0.35	0.41	0.23	0.05	0.07	0.02	0.00	0.35	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.16	0.00	0.10	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.15	0.08	0.52	0.45	0.40	0.39
C8	0.01	0.00	0.09	0.20	0.00	0.22	0.00	0.40	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.20	0.10	0.47	0.41	0.31	0.36
N1	0.01	0.00	0.17	0.15	0.00	0.07	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.16	0.13	0.53	0.45	0.36	0.39
N3	0.02	0.00	0.20	0.13	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.15	0.16	0.49	0.46	0.27	0.36
N6	0.01	0.00	0.08	0.18	0.00	0.13	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.18	0.05	0.52	0.46	0.45	0.41
N7	0.00	0.00	0.04	0.19	0.00	0.20	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.21	0.05	0.49	0.43	0.41	0.40
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.44	0.42	0.24	0.32
O2'	0.00	0.24	0.00	0.01	0.12	0.06	0.08	0.05	0.12	0.11	0.19	0.23	0.10	0.09	0.04	0.00	0.09	0.08	0.06	0.31	0.35	0.15
O3'	0.04	0.17	0.03	0.00	0.10	0.02	0.14	0.07	0.15	0.20	0.16	0.15	0.18	0.21	0.08	0.09	0.00	0.03	0.33	0.29	0.68	0.38
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.08	0.10	0.13	0.16	0.05	0.05	0.01	0.08	0.03	0.00	0.36	0.46	0.10	0.31
O5'	0.34	0.52	0.16	0.02	0.49	0.00	0.50	0.00	0.52	0.47	0.53	0.49	0.52	0.49	0.44	0.06	0.33	0.36	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.43	0.46	0.39	0.34	0.44	0.27	0.44	0.35	0.45	0.41	0.45	0.46	0.46	0.43	0.42	0.31	0.29	0.46	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.31	0.29	0.40	0.29	0.27	0.37	0.30	0.40	0.31	0.36	0.27	0.45	0.41	0.24	0.35	0.68	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.38	0.19	0.16	0.35	0.04	0.38	0.01	0.39	0.36	0.39	0.36	0.41	0.40	0.32	0.15	0.38	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00