Doublet Group distance statistics: 53256

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.010, 0.024, 0.038, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.024 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.015, 0.035, 0.056, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C5	B	0, 0.061, 0.310, 0.559, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.310 std_dev=0.249
C4	B	0, 0.158, 0.438, 0.718, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.438 std_dev=0.280
N7	B	0, 0.184, 0.502, 0.820, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.502 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.141, 0.516, 0.891, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.516 std_dev=0.375
N3	B	0, 0.148, 0.575, 1.003, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.575 std_dev=0.428
N9	B	0, 0.173, 0.647, 1.121, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.647 std_dev=0.474
C8	B	0, 0.183, 0.682, 1.181, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.682 std_dev=0.499
N6	B	0, 0.199, 0.723, 1.246, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.723 std_dev=0.523
C2	B	0, 0.118, 0.667, 1.217, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.667 std_dev=0.550
O2'	B	0, 0.290, 0.851, 1.411, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.851 std_dev=0.560
N1	B	0, 0.129, 0.696, 1.262, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.696 std_dev=0.566
C1'	B	0, 0.170, 0.891, 1.611, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.891 std_dev=0.720
C2'	B	0, 0.232, 1.026, 1.820, 2.183 max_d=2.183 avg_d=1.026 std_dev=0.794
O4'	A	0, 0.138, 1.170, 2.201, 2.282 max_d=2.282 avg_d=1.170 std_dev=1.031
C2'	A	0, 0.093, 1.160, 2.228, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.160 std_dev=1.067
O4'	B	0, 0.181, 1.276, 2.371, 2.721 max_d=2.721 avg_d=1.276 std_dev=1.095
O3'	B	0, 0.188, 1.294, 2.400, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.294 std_dev=1.106
C3'	B	0, 0.227, 1.386, 2.545, 3.087 max_d=3.087 avg_d=1.386 std_dev=1.159
O2'	A	0, 0.036, 1.296, 2.556, 2.690 max_d=2.690 avg_d=1.296 std_dev=1.260
C4'	B	0, 0.229, 1.621, 3.012, 3.504 max_d=3.504 avg_d=1.621 std_dev=1.392
O5'	B	0, 0.275, 1.674, 3.073, 3.476 max_d=3.476 avg_d=1.674 std_dev=1.399
C4'	A	0, 0.233, 1.765, 3.296, 3.396 max_d=3.396 avg_d=1.765 std_dev=1.532
C3'	A	0, 0.204, 1.868, 3.533, 3.676 max_d=3.676 avg_d=1.868 std_dev=1.665
C5'	B	0, 0.325, 1.991, 3.657, 4.110 max_d=4.110 avg_d=1.991 std_dev=1.666
OP1	B	0, 0.305, 2.153, 4.001, 4.059 max_d=4.059 avg_d=2.153 std_dev=1.848
P	B	0, 0.251, 2.347, 4.443, 4.706 max_d=4.706 avg_d=2.347 std_dev=2.096
O3'	A	0, 0.308, 2.523, 4.739, 4.954 max_d=4.954 avg_d=2.523 std_dev=2.216
O5'	A	0, 0.462, 2.849, 5.236, 5.523 max_d=5.523 avg_d=2.849 std_dev=2.387
C5'	A	0, 0.335, 2.995, 5.654, 5.856 max_d=5.856 avg_d=2.995 std_dev=2.660
OP2	B	0, 0.273, 3.140, 6.008, 6.331 max_d=6.331 avg_d=3.140 std_dev=2.868
P	A	0, 0.197, 4.011, 7.825, 8.227 max_d=8.227 avg_d=4.011 std_dev=3.814
OP2	A	0, 0.444, 4.593, 8.742, 9.115 max_d=9.115 avg_d=4.593 std_dev=4.149
OP1	A	0, 0.124, 4.308, 8.492, 9.029 max_d=9.029 avg_d=4.308 std_dev=4.184

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.18	0.01	0.52	0.28	0.30
C2	0.01	0.00	0.11	0.52	0.02	0.75	0.02	1.29	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.36	0.44	0.47	0.86	0.01	0.65	0.68	0.75
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.06	0.05	0.09	0.13	0.12	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.05	0.49	0.26	0.26
C3'	0.02	0.52	0.00	0.00	0.19	0.01	0.04	0.01	0.14	0.30	0.34	0.70	0.52	0.23	0.06	0.02	0.02	0.02	0.23	0.07	0.35	0.25	0.22
C4	0.01	0.02	0.07	0.19	0.00	0.33	0.00	0.56	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.16	0.13	0.24	0.14	0.01	0.41	0.15	0.13
C4'	0.00	0.75	0.00	0.01	0.33	0.00	0.11	0.00	0.27	0.39	0.54	0.96	0.73	0.26	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.17	0.11	0.16	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.24	0.01	0.93	0.63	0.62
C5'	0.03	1.29	0.02	0.01	0.56	0.00	0.25	0.00	0.52	0.55	0.98	1.66	1.19	0.36	0.07	0.04	0.05	0.01	0.00	0.36	0.21	0.19	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.27	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.10	0.17	0.03	0.00	0.64	0.40	0.36
C8	0.01	0.02	0.05	0.30	0.00	0.39	0.00	0.55	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.29	0.32	1.01	0.01	1.66	1.35	1.37
N1	0.01	0.01	0.09	0.34	0.01	0.54	0.01	0.98	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.28	0.34	0.52	0.00	0.26	0.29	0.33
N2	0.01	0.00	0.13	0.70	0.02	0.96	0.02	1.66	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.45	0.63	0.58	1.26	0.02	1.28	1.17	1.28
N3	0.01	0.00	0.12	0.52	0.01	0.73	0.00	1.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.40	0.47	0.77	0.01	0.48	0.56	0.62
N7	0.01	0.02	0.04	0.23	0.00	0.26	0.00	0.36	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.24	0.20	0.87	0.01	1.69	1.36	1.35
N9	0.00	0.02	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.34	0.00	0.85	0.55	0.58
O2'	0.01	0.36	0.00	0.02	0.16	0.05	0.06	0.04	0.13	0.14	0.26	0.45	0.35	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.08	0.34	0.17	0.12
O3'	0.03	0.44	0.02	0.02	0.13	0.02	0.06	0.05	0.10	0.29	0.28	0.63	0.40	0.24	0.08	0.02	0.00	0.02	0.20	0.06	0.16	0.21	0.10
O4'	0.00	0.47	0.01	0.02	0.24	0.00	0.07	0.01	0.17	0.32	0.34	0.58	0.47	0.20	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.10	0.28	0.17	0.14
O5'	0.18	0.86	0.20	0.23	0.14	0.01	0.24	0.00	0.03	1.01	0.52	1.26	0.77	0.87	0.34	0.11	0.20	0.12	0.00	0.17	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.17	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.10	0.17	0.00	0.92	0.67	0.61
OP1	0.52	0.65	0.49	0.35	0.41	0.11	0.93	0.21	0.64	1.66	0.26	1.28	0.48	1.69	0.85	0.34	0.16	0.28	0.01	0.92	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.68	0.26	0.25	0.15	0.16	0.63	0.19	0.40	1.35	0.29	1.17	0.56	1.36	0.55	0.17	0.21	0.17	0.02	0.67	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.75	0.26	0.22	0.13	0.03	0.62	0.02	0.36	1.37	0.33	1.28	0.62	1.35	0.58	0.12	0.10	0.14	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.22	0.24	0.20	0.21	0.16	0.22	0.18	0.24	0.19	0.24	0.21	0.24	0.21	0.19	0.26	0.15	0.15	0.14	0.75	0.96	0.59
C2	0.35	0.18	0.29	0.40	0.17	0.50	0.09	0.45	0.28	0.17	0.29	0.23	0.49	0.04	0.25	0.20	0.40	0.48	0.26	0.56	0.99	0.52
C2'	0.48	0.52	0.60	0.50	0.57	0.38	0.67	0.37	0.69	0.64	0.59	0.51	0.77	0.72	0.56	0.65	0.41	0.38	0.39	1.13	1.17	0.90
C3'	0.26	0.72	0.35	0.18	0.55	0.07	0.70	0.13	0.91	0.42	0.89	0.57	1.09	0.61	0.40	0.46	0.12	0.08	0.07	0.75	0.72	0.48
C4	0.30	0.20	0.31	0.36	0.18	0.42	0.12	0.43	0.21	0.24	0.26	0.18	0.28	0.12	0.25	0.23	0.30	0.40	0.30	0.78	1.13	0.68
C4'	0.23	0.41	0.24	0.37	0.18	0.48	0.26	0.60	0.49	0.16	0.55	0.24	0.64	0.14	0.15	0.19	0.38	0.39	0.60	0.24	0.24	0.07
C5	0.42	0.22	0.42	0.50	0.16	0.59	0.05	0.62	0.20	0.35	0.31	0.12	0.27	0.19	0.35	0.30	0.41	0.57	0.50	0.92	1.28	0.83
C5'	0.39	0.56	0.42	0.63	0.17	0.79	0.28	0.97	0.61	0.28	0.74	0.29	0.79	0.12	0.23	0.29	0.63	0.63	0.94	0.23	0.20	0.42
C6	0.53	0.22	0.48	0.61	0.19	0.73	0.05	0.72	0.26	0.36	0.39	0.12	0.37	0.18	0.40	0.35	0.55	0.69	0.55	0.84	1.25	0.79
C8	0.25	0.22	0.35	0.35	0.14	0.37	0.12	0.47	0.12	0.35	0.21	0.16	0.09	0.26	0.24	0.28	0.21	0.32	0.45	1.14	1.38	0.97
N1	0.46	0.14	0.39	0.53	0.19	0.64	0.03	0.61	0.29	0.26	0.37	0.21	0.48	0.08	0.33	0.28	0.52	0.61	0.41	0.67	1.10	0.63
N2	0.33	0.20	0.24	0.37	0.17	0.47	0.11	0.41	0.29	0.11	0.26	0.26	0.55	0.08	0.22	0.16	0.40	0.46	0.19	0.43	0.90	0.41
N3	0.29	0.22	0.26	0.33	0.19	0.39	0.14	0.37	0.26	0.16	0.27	0.23	0.40	0.09	0.22	0.20	0.31	0.39	0.20	0.59	0.98	0.52
N7	0.39	0.26	0.46	0.51	0.11	0.59	0.08	0.68	0.13	0.44	0.27	0.12	0.14	0.28	0.35	0.33	0.35	0.55	0.62	1.14	1.45	1.03
N9	0.22	0.21	0.28	0.28	0.18	0.29	0.17	0.33	0.19	0.24	0.22	0.18	0.18	0.19	0.21	0.25	0.20	0.27	0.26	0.88	1.15	0.74
O2'	0.53	0.42	0.68	0.60	0.53	0.48	0.60	0.49	0.55	0.66	0.45	0.45	0.60	0.70	0.57	0.73	0.51	0.45	0.51	1.25	1.28	1.04
O3'	0.34	0.86	0.45	0.24	0.67	0.07	0.84	0.11	1.08	0.54	1.05	0.68	1.31	0.75	0.50	0.60	0.18	0.10	0.04	0.83	0.72	0.54
O4'	0.39	0.18	0.40	0.45	0.27	0.49	0.25	0.56	0.20	0.40	0.20	0.22	0.23	0.32	0.36	0.37	0.46	0.44	0.62	0.22	0.33	0.07
O5'	1.09	0.23	1.12	1.32	0.62	1.43	0.45	1.53	0.17	0.91	0.15	0.50	0.21	0.64	0.90	1.00	1.34	1.29	1.48	0.58	0.59	0.87
O6	0.65	0.30	0.61	0.76	0.23	0.89	0.12	0.88	0.27	0.44	0.44	0.09	0.37	0.24	0.48	0.47	0.70	0.83	0.70	0.91	1.32	0.87
OP1	1.64	0.67	1.66	1.90	1.08	2.00	0.83	2.02	0.48	1.29	0.43	1.00	0.28	0.97	1.37	1.56	2.00	1.86	1.89	0.91	0.92	1.27
OP2	2.06	0.90	2.14	2.43	1.37	2.53	1.09	2.57	0.68	1.65	0.62	1.27	0.39	1.26	1.73	2.04	2.51	2.30	2.41	1.34	1.41	1.73
P	1.61	0.56	1.64	1.91	1.00	2.03	0.74	2.08	0.37	1.26	0.31	0.90	0.18	0.91	1.32	1.53	1.99	1.85	1.95	0.92	0.99	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.10	0.13	0.11
C2	0.04	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.06	0.03	0.13	0.14	0.23	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.05	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.16	0.25
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.20	0.24
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.13	0.14	0.21	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.08
C5	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.15	0.18	0.26	0.10
C5'	0.03	0.06	0.03	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.07	0.06	0.06	0.12	0.08	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.14	0.19	0.28	0.10
C8	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.02	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.13	0.04	0.05	0.17	0.19	0.21	0.10
N1	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.13	0.17	0.27	0.11
N3	0.04	0.00	0.08	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.03	0.12	0.12	0.20	0.13
N6	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.03	0.01	0.12	0.23	0.33	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.12	0.04	0.04	0.17	0.21	0.25	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.02	0.12	0.14	0.18	0.11
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.04	0.13	0.07	0.12	0.06	0.12	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.15	0.24	0.31
O3'	0.03	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.00	0.03	0.08	0.07	0.18	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.22	0.28	0.09
O5'	0.04	0.13	0.07	0.09	0.13	0.01	0.15	0.00	0.14	0.17	0.13	0.12	0.12	0.17	0.12	0.09	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.10	0.14	0.08	0.08	0.14	0.07	0.18	0.04	0.19	0.19	0.17	0.12	0.23	0.21	0.14	0.15	0.07	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.23	0.16	0.20	0.21	0.06	0.26	0.04	0.28	0.21	0.27	0.20	0.33	0.25	0.18	0.24	0.18	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.25	0.24	0.11	0.08	0.10	0.02	0.10	0.10	0.11	0.13	0.11	0.10	0.11	0.31	0.22	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00