Doublet Group distance statistics: 53257

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.008, 0.028, 0.047, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.008, 0.032, 0.055, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.009, 0.035, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.035 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.003, 0.033, 0.062, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.035, 0.071, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.014, 0.049, 0.085, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.049 std_dev=0.036
C5	A	0, -0.009, 0.031, 0.072, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.031 std_dev=0.040
N2	A	0, 0.015, 0.056, 0.098, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.056 std_dev=0.042
O6	A	0, 0.013, 0.073, 0.133, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.073 std_dev=0.060
N7	A	0, -0.007, 0.067, 0.142, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.067 std_dev=0.074
C8	A	0, 0.000, 0.074, 0.149, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.074 std_dev=0.075
O5'	A	0, 0.066, 0.232, 0.398, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.232 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.033, 0.229, 0.425, 0.478 max_d=0.478 avg_d=0.229 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.075, 0.273, 0.471, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.273 std_dev=0.198
C5	B	0, 0.098, 0.338, 0.577, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.338 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.104, 0.385, 0.665, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.385 std_dev=0.280
N9	B	0, 0.096, 0.397, 0.698, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.397 std_dev=0.301
C2	B	0, 0.098, 0.414, 0.729, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.414 std_dev=0.315
N1	B	0, 0.106, 0.458, 0.810, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.458 std_dev=0.352
N6	B	0, 0.085, 0.479, 0.872, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.479 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.055, 0.460, 0.865, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.460 std_dev=0.405
O4'	A	0, -0.061, 0.349, 0.759, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.349 std_dev=0.410
N7	B	0, 0.081, 0.506, 0.931, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.506 std_dev=0.425
C3'	A	0, -0.036, 0.392, 0.821, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.392 std_dev=0.428
C4'	A	0, -0.048, 0.410, 0.868, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.410 std_dev=0.458
C8	B	0, 0.074, 0.545, 1.016, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.545 std_dev=0.471
C2'	B	0, 0.117, 0.607, 1.097, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.607 std_dev=0.490
P	A	0, -0.068, 0.472, 1.012, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.472 std_dev=0.540
O4'	B	0, -0.057, 0.503, 1.063, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.503 std_dev=0.560
C2'	A	0, -0.121, 0.451, 1.023, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.451 std_dev=0.572
O3'	A	0, -0.036, 0.554, 1.145, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.554 std_dev=0.591
O5'	B	0, -0.028, 0.573, 1.174, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.573 std_dev=0.601
O2'	B	0, 0.172, 0.789, 1.405, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.789 std_dev=0.617
C3'	B	0, 0.007, 0.674, 1.342, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.674 std_dev=0.668
C5'	A	0, -0.117, 0.613, 1.343, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.613 std_dev=0.730
OP2	B	0, -0.041, 0.701, 1.444, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.701 std_dev=0.743
C4'	B	0, -0.070, 0.697, 1.463, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.697 std_dev=0.766
P	B	0, -0.081, 0.779, 1.638, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.779 std_dev=0.860
O3'	B	0, -0.035, 0.871, 1.778, 2.121 max_d=2.121 avg_d=0.871 std_dev=0.906
C5'	B	0, -0.130, 0.788, 1.707, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.788 std_dev=0.918
O2'	A	0, -0.238, 0.874, 1.985, 2.442 max_d=2.442 avg_d=0.874 std_dev=1.112
OP2	A	0, -0.237, 1.000, 2.237, 2.743 max_d=2.743 avg_d=1.000 std_dev=1.237
OP1	B	0, -0.331, 1.481, 3.293, 4.032 max_d=4.032 avg_d=1.481 std_dev=1.812
OP1	A	0, -0.363, 1.481, 3.325, 4.081 max_d=4.081 avg_d=1.481 std_dev=1.844

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.00	0.02	0.28	0.00	0.09	0.03	0.76	0.79	0.33
C2	0.06	0.00	0.32	0.17	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.21	0.19	0.10	0.08	0.02	0.91	1.02	0.40
C2'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.12	0.00	0.01	0.16	0.05	0.23	0.20	0.43	0.33	0.17	0.03	0.00	0.01	0.03	0.55	0.02	0.51	0.05	0.14
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.02	0.12	0.06	0.15	0.20	0.16	0.08	0.08	0.03	0.01	0.03	0.31	0.10	0.66	0.19	0.12
C4	0.02	0.02	0.12	0.12	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.20	0.07	0.09	0.01	0.92	0.97	0.39
C4'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.02	0.26	0.04	0.01	0.02	0.04	0.41	0.48	0.21
C5	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.17	0.04	0.10	0.02	0.94	0.95	0.39
C5'	0.03	0.06	0.16	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.04	0.07	0.06	0.05	0.06	0.04	0.08	0.16	0.03	0.01	0.10	0.06	0.12	0.00
C6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.19	0.18	0.06	0.10	0.01	0.92	0.96	0.38
C8	0.02	0.02	0.23	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.43	0.13	0.07	0.12	0.02	0.98	0.87	0.39
N1	0.05	0.01	0.20	0.15	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.08	0.09	0.01	0.92	1.01	0.40
N2	0.08	0.00	0.43	0.20	0.02	0.06	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.39	0.18	0.12	0.08	0.03	0.89	1.03	0.41
N3	0.06	0.01	0.33	0.16	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.24	0.21	0.11	0.08	0.02	0.89	0.99	0.39
N7	0.01	0.01	0.17	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.43	0.13	0.04	0.12	0.03	0.96	0.87	0.38
N9	0.00	0.03	0.03	0.08	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.19	0.19	0.00	0.10	0.02	0.91	0.91	0.39
O2'	0.02	0.21	0.00	0.03	0.06	0.26	0.25	0.08	0.19	0.43	0.01	0.39	0.24	0.43	0.19	0.00	0.08	0.14	0.38	0.28	0.52	0.06	0.09
O3'	0.28	0.19	0.01	0.01	0.20	0.04	0.17	0.16	0.18	0.13	0.18	0.18	0.21	0.13	0.19	0.08	0.00	0.19	0.16	0.18	0.68	0.22	0.17
O4'	0.00	0.10	0.03	0.03	0.07	0.01	0.04	0.03	0.06	0.07	0.08	0.12	0.11	0.04	0.00	0.14	0.19	0.00	0.22	0.05	0.68	1.01	0.50
O5'	0.09	0.08	0.55	0.31	0.09	0.02	0.10	0.01	0.10	0.12	0.09	0.08	0.08	0.12	0.10	0.38	0.16	0.22	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.02	0.10	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.28	0.18	0.05	0.12	0.00	0.90	0.91	0.36
OP1	0.76	0.91	0.51	0.66	0.92	0.41	0.94	0.06	0.92	0.98	0.92	0.89	0.89	0.96	0.91	0.52	0.68	0.68	0.01	0.90	0.00	0.01	0.00
OP2	0.79	1.02	0.05	0.19	0.97	0.48	0.95	0.12	0.96	0.87	1.01	1.03	0.99	0.87	0.91	0.06	0.22	1.01	0.02	0.91	0.01	0.00	0.01
P	0.33	0.40	0.14	0.12	0.39	0.21	0.39	0.00	0.38	0.39	0.40	0.41	0.39	0.38	0.39	0.09	0.17	0.50	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.22	0.32	0.34	0.06	0.39	0.08	0.37	0.07	0.30	0.18	0.12	0.07	0.21	0.24	0.37	0.41	0.37	0.19	1.34	0.08	0.39
C2	0.20	0.10	0.25	0.13	0.08	0.13	0.03	0.04	0.13	0.10	0.15	0.10	0.21	0.06	0.13	0.39	0.18	0.13	0.24	1.63	0.29	0.74
C2'	0.34	0.15	0.25	0.35	0.20	0.45	0.32	0.52	0.19	0.59	0.02	0.08	0.27	0.55	0.39	0.18	0.36	0.48	0.26	1.54	0.16	0.49
C3'	0.04	0.31	0.08	0.07	0.11	0.14	0.03	0.18	0.09	0.18	0.21	0.28	0.04	0.15	0.04	0.13	0.12	0.12	0.25	0.89	0.41	0.14
C4	0.22	0.29	0.26	0.20	0.06	0.23	0.14	0.16	0.25	0.13	0.33	0.13	0.27	0.11	0.11	0.41	0.27	0.20	0.22	1.43	0.17	0.54
C4'	0.12	0.44	0.15	0.05	0.28	0.14	0.20	0.20	0.27	0.07	0.37	0.42	0.23	0.08	0.14	0.17	0.11	0.09	0.21	0.72	0.31	0.17
C5	0.22	0.34	0.29	0.22	0.09	0.25	0.19	0.18	0.34	0.10	0.43	0.14	0.37	0.14	0.09	0.49	0.31	0.21	0.27	1.36	0.20	0.54
C5'	0.27	0.63	0.35	0.14	0.45	0.07	0.36	0.17	0.43	0.16	0.54	0.61	0.39	0.21	0.29	0.40	0.07	0.01	0.28	0.36	0.39	0.39
C6	0.22	0.21	0.30	0.20	0.04	0.21	0.17	0.13	0.31	0.08	0.37	0.03	0.38	0.14	0.09	0.51	0.28	0.18	0.31	1.44	0.28	0.64
C8	0.24	0.44	0.29	0.29	0.16	0.35	0.21	0.31	0.32	0.14	0.43	0.28	0.33	0.13	0.12	0.48	0.40	0.29	0.23	1.16	0.09	0.35
N1	0.22	0.09	0.29	0.16	0.04	0.16	0.09	0.07	0.21	0.07	0.22	0.08	0.31	0.09	0.11	0.46	0.22	0.15	0.30	1.57	0.32	0.73
N2	0.19	0.13	0.23	0.08	0.14	0.07	0.07	0.03	0.06	0.10	0.10	0.16	0.09	0.05	0.15	0.34	0.11	0.08	0.23	1.74	0.34	0.83
N3	0.20	0.16	0.24	0.15	0.03	0.16	0.05	0.09	0.15	0.14	0.20	0.06	0.18	0.09	0.13	0.35	0.20	0.15	0.19	1.58	0.21	0.64
N7	0.22	0.45	0.29	0.26	0.16	0.31	0.24	0.25	0.38	0.11	0.49	0.24	0.40	0.16	0.09	0.51	0.37	0.25	0.27	1.21	0.15	0.42
N9	0.25	0.34	0.28	0.27	0.11	0.31	0.14	0.27	0.24	0.18	0.33	0.21	0.24	0.13	0.14	0.42	0.35	0.27	0.20	1.31	0.10	0.42
O2'	0.87	0.12	0.75	0.92	0.65	1.04	0.79	1.15	0.56	1.22	0.26	0.27	0.63	1.13	0.95	0.60	0.90	1.07	0.92	2.40	0.85	1.26
O3'	0.26	0.55	0.26	0.16	0.38	0.08	0.31	0.02	0.38	0.11	0.48	0.52	0.33	0.14	0.25	0.28	0.08	0.13	0.54	0.80	0.62	0.32
O4'	0.08	0.51	0.08	0.11	0.37	0.19	0.34	0.18	0.41	0.16	0.47	0.47	0.39	0.23	0.20	0.15	0.21	0.11	0.07	0.86	0.16	0.03
O5'	0.31	0.33	0.38	0.59	0.06	0.71	0.04	0.75	0.16	0.25	0.29	0.23	0.15	0.14	0.17	0.45	0.76	0.54	0.30	0.76	0.04	0.09
O6	0.23	0.18	0.32	0.22	0.04	0.23	0.18	0.14	0.33	0.08	0.37	0.01	0.42	0.16	0.08	0.55	0.31	0.19	0.36	1.41	0.31	0.65
OP1	0.09	0.16	0.38	0.31	0.08	0.11	0.05	0.05	0.04	0.11	0.04	0.20	0.11	0.13	0.04	0.47	0.39	0.06	0.31	0.07	0.53	0.54
OP2	1.21	0.79	1.26	1.31	1.02	1.30	1.01	1.27	0.91	1.15	0.81	0.91	0.91	1.09	1.13	1.31	1.38	1.23	1.00	1.32	0.59	0.72
P	0.29	0.17	0.26	0.38	0.09	0.50	0.11	0.53	0.06	0.28	0.12	0.11	0.06	0.22	0.22	0.32	0.47	0.45	0.22	0.59	0.05	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.07	0.07	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.18	0.76	0.18	0.28
C2	0.07	0.00	0.16	0.10	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.12	0.04	0.52	1.29	0.54	0.79
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.10	0.13	0.15	0.04	0.08	0.03	0.01	0.01	0.01	0.27	0.33	0.20	0.15
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.04	0.20	0.05	0.11	0.10	0.18	0.08	0.01	0.01	0.02	0.37	0.10	0.35	0.17
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01	0.46	1.32	0.54	0.79
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.13	0.04	0.08	0.08	0.13	0.04	0.08	0.02	0.00	0.00	0.03	0.09	0.11
C5	0.01	0.02	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.51	1.57	0.70	1.02
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.13	0.04	0.08	0.11	0.14	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.09	0.32	0.01
C6	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.07	0.02	0.55	1.61	0.74	1.07
C8	0.04	0.01	0.10	0.20	0.01	0.13	0.01	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.22	0.06	0.41	1.57	0.66	0.97
N1	0.07	0.00	0.13	0.05	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.20	0.05	0.03	0.57	1.49	0.68	0.98
N3	0.07	0.01	0.15	0.11	0.00	0.08	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.13	0.05	0.47	1.17	0.46	0.67
N6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.14	0.05	0.54	1.71	0.82	1.17
N7	0.03	0.02	0.08	0.18	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.22	0.07	0.47	1.71	0.78	1.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.39	1.24	0.48	0.71
O2'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.09	0.08	0.06	0.09	0.12	0.08	0.20	0.21	0.09	0.05	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.16	0.21	0.32
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.03	0.02	0.11	0.01	0.07	0.22	0.05	0.13	0.14	0.22	0.09	0.05	0.00	0.01	0.27	0.43	0.25	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.67	0.09	0.14
O5'	0.18	0.52	0.27	0.37	0.46	0.00	0.51	0.00	0.55	0.41	0.57	0.47	0.54	0.47	0.39	0.09	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.76	1.29	0.33	0.10	1.32	0.03	1.57	0.09	1.61	1.57	1.49	1.17	1.71	1.71	1.24	0.16	0.43	0.67	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.54	0.20	0.35	0.54	0.09	0.70	0.32	0.74	0.66	0.68	0.46	0.82	0.78	0.48	0.21	0.25	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.28	0.79	0.15	0.17	0.79	0.11	1.02	0.01	1.07	0.97	0.98	0.67	1.17	1.13	0.71	0.32	0.11	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00