Doublet Group distance statistics: 53259

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.003, 0.024, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.002, 0.024, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.024 std_dev=0.021
C4	A	0, -0.003, 0.019, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.001, 0.022, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N2	A	0, -0.004, 0.031, 0.066, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.004, 0.051, 0.098, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.051 std_dev=0.047
C2'	A	0, -0.008, 0.059, 0.126, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.059 std_dev=0.067
C8	B	0, 0.009, 0.091, 0.173, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.091 std_dev=0.082
C3'	A	0, -0.005, 0.080, 0.166, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.080 std_dev=0.085
N9	B	0, 0.003, 0.097, 0.190, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.097 std_dev=0.094
C4'	A	0, -0.007, 0.096, 0.198, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.096 std_dev=0.102
C3'	B	0, 0.008, 0.120, 0.232, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.120 std_dev=0.112
C2'	B	0, 0.019, 0.135, 0.251, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.135 std_dev=0.116
C1'	B	0, 0.004, 0.134, 0.265, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.134 std_dev=0.131
O2'	A	0, -0.014, 0.117, 0.248, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.117 std_dev=0.131
O3'	B	0, 0.010, 0.141, 0.273, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.141 std_dev=0.131
O3'	A	0, -0.003, 0.130, 0.263, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.130 std_dev=0.133
O5'	A	0, 0.001, 0.135, 0.268, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.135 std_dev=0.133
C5'	A	0, -0.005, 0.136, 0.278, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.136 std_dev=0.142
N7	B	0, -0.006, 0.145, 0.296, 0.353 max_d=0.353 avg_d=0.145 std_dev=0.151
O2'	B	0, 0.038, 0.197, 0.357, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.197 std_dev=0.160
C4	B	0, -0.020, 0.142, 0.303, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.142 std_dev=0.161
C4'	B	0, -0.017, 0.156, 0.328, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.156 std_dev=0.173
C5'	B	0, -0.028, 0.150, 0.327, 0.398 max_d=0.398 avg_d=0.150 std_dev=0.177
C5	B	0, -0.020, 0.165, 0.349, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.165 std_dev=0.184
O4'	B	0, -0.020, 0.168, 0.356, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.168 std_dev=0.188
P	A	0, -0.001, 0.191, 0.383, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.191 std_dev=0.192
OP1	A	0, 0.001, 0.232, 0.463, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.232 std_dev=0.231
N3	B	0, -0.040, 0.198, 0.436, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.198 std_dev=0.238
O5'	B	0, -0.042, 0.227, 0.497, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.227 std_dev=0.270
C6	B	0, -0.035, 0.237, 0.510, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.237 std_dev=0.272
P	B	0, -0.063, 0.237, 0.537, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.237 std_dev=0.300
C2	B	0, -0.061, 0.246, 0.553, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.246 std_dev=0.307
OP2	A	0, -0.029, 0.279, 0.586, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.279 std_dev=0.308
OP1	B	0, -0.054, 0.265, 0.584, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.265 std_dev=0.319
N1	B	0, -0.055, 0.267, 0.589, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.267 std_dev=0.322
N6	B	0, -0.031, 0.295, 0.620, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.295 std_dev=0.326
OP2	B	0, -0.061, 0.274, 0.608, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.274 std_dev=0.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
C2	0.03	0.00	0.07	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.06	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.06	0.08	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02
C4	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.04	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.07	0.05
C5'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.06	0.00	0.09	0.10	0.07
C8	0.03	0.02	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.06	0.05	0.01	0.05	0.04	0.03
N1	0.03	0.00	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.08	0.05
N2	0.04	0.00	0.08	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02
N3	0.04	0.00	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01
N7	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.08	0.01	0.10	0.10	0.07
N9	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.09	0.13	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01
O3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.08	0.06	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01
O5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.00	0.13	0.14	0.10
OP1	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.10	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.01	0.05	0.05	0.06	0.03	0.02	0.07	0.02	0.10	0.04	0.08	0.04	0.01	0.10	0.01	0.03	0.08	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00
P	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.03	0.05	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.02	0.03	0.01	0.04	0.09	0.08	0.03	0.05
C2	0.04	0.16	0.00	0.02	0.04	0.08	0.04	0.11	0.04	0.07	0.09	0.13	0.13	0.11	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.02	0.06	0.02
C2'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.10	0.08	0.04	0.06
C3'	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.01	0.02	0.10	0.08	0.04	0.06
C4	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.07	0.07	0.02	0.07	0.12	0.11	0.02	0.03	0.02	0.08	0.10	0.06	0.01	0.04
C4'	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.06	0.06	0.01	0.03
C5	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.10	0.09	0.13	0.07	0.08	0.03	0.18	0.12	0.02	0.02	0.01	0.09	0.09	0.05	0.02	0.03
C5'	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.06	0.01	0.02	0.03	0.05	0.05	0.09	0.05	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02
C6	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.10	0.12	0.14	0.07	0.08	0.06	0.21	0.12	0.01	0.01	0.02	0.12	0.06	0.01	0.06	0.02
C8	0.02	0.07	0.04	0.03	0.07	0.01	0.10	0.03	0.12	0.08	0.10	0.05	0.13	0.11	0.05	0.04	0.03	0.03	0.14	0.12	0.05	0.09
N1	0.04	0.10	0.01	0.03	0.02	0.09	0.08	0.12	0.10	0.07	0.02	0.10	0.18	0.12	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.02	0.07	0.03
N2	0.04	0.20	0.00	0.03	0.06	0.08	0.02	0.12	0.03	0.06	0.15	0.16	0.09	0.10	0.02	0.01	0.01	0.12	0.04	0.03	0.07	0.03
N3	0.02	0.15	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.08	0.02	0.07	0.11	0.12	0.08	0.10	0.01	0.03	0.02	0.09	0.08	0.04	0.02	0.02
N7	0.01	0.09	0.01	0.01	0.07	0.04	0.12	0.07	0.15	0.07	0.14	0.04	0.18	0.12	0.04	0.02	0.01	0.07	0.12	0.08	0.01	0.06
N9	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.07	0.04	0.06	0.08	0.01	0.03	0.09	0.10	0.04	0.05	0.03	0.04	0.13	0.09	0.04	0.07
O2'	0.02	0.10	0.03	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.07	0.01	0.10	0.09	0.07	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.06	0.02	0.04
O3'	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.02	0.03	0.09	0.07	0.04	0.05
O4'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.01	0.08	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03	0.04	0.04	0.03	0.07	0.06	0.02	0.03
O5'	0.06	0.05	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.08	0.05	0.05	0.07	0.08	0.07	0.12	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.03
O6	0.06	0.02	0.03	0.05	0.02	0.10	0.11	0.14	0.16	0.06	0.12	0.04	0.23	0.12	0.00	0.03	0.03	0.13	0.03	0.02	0.09	0.04
OP1	0.10	0.08	0.11	0.02	0.08	0.04	0.07	0.03	0.07	0.08	0.07	0.09	0.06	0.08	0.09	0.18	0.00	0.06	0.04	0.06	0.02	0.03
OP2	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.10	0.04	0.18	0.05	0.02	0.04	0.01	0.06	0.04	0.00	0.07	0.00	0.09	0.04	0.06	0.07	0.07
P	0.04	0.07	0.07	0.00	0.06	0.02	0.06	0.07	0.07	0.05	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.11	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01
C2	0.02	0.00	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.03	0.24	0.24	0.17	0.21
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.05	0.05
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.10	0.10	0.07	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.05	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.14	0.15	0.10	0.12
C4'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.09	0.09	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.16	0.17	0.11	0.13
C5'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.12	0.04	0.14	0.13	0.11	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.20	0.21	0.14	0.17
C8	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.07	0.09	0.05	0.06
N1	0.02	0.00	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	0.23	0.24	0.17	0.21
N3	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.19	0.20	0.13	0.16
N6	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.20	0.21	0.15	0.18
N7	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.12	0.13	0.08	0.10
N9	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.09	0.05	0.06
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.05	0.03
O3'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.11	0.11	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.11	0.09	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
O5'	0.02	0.24	0.05	0.08	0.14	0.01	0.16	0.00	0.20	0.07	0.23	0.19	0.20	0.12	0.07	0.02	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.24	0.08	0.10	0.15	0.07	0.17	0.10	0.21	0.09	0.24	0.20	0.21	0.13	0.09	0.05	0.11	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.01	0.17	0.05	0.05	0.10	0.01	0.11	0.03	0.14	0.05	0.17	0.13	0.15	0.08	0.05	0.05	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.01	0.21	0.05	0.07	0.12	0.01	0.13	0.01	0.17	0.06	0.21	0.16	0.18	0.10	0.06	0.03	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00