Doublet Group distance statistics: 53260

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N2	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.004, 0.020, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.003, 0.019, 0.042, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.026
C4'	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.001, 0.030, 0.058, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.028
C2'	A	0, -0.004, 0.039, 0.082, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.039 std_dev=0.043
C3'	A	0, 0.007, 0.054, 0.101, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.054 std_dev=0.047
C5'	A	0, 0.008, 0.056, 0.104, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.056 std_dev=0.048
O5'	A	0, 0.013, 0.068, 0.123, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.068 std_dev=0.055
P	A	0, 0.024, 0.103, 0.182, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.103 std_dev=0.079
O3'	A	0, 0.006, 0.087, 0.167, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.087 std_dev=0.080
OP2	A	0, 0.019, 0.124, 0.228, 0.256 max_d=0.256 avg_d=0.124 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.003, 0.120, 0.238, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.120 std_dev=0.118
O4'	B	0, 0.038, 0.171, 0.304, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.171 std_dev=0.133
C4	B	0, 0.044, 0.178, 0.312, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.178 std_dev=0.134
N3	B	0, 0.056, 0.191, 0.325, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.191 std_dev=0.135
C1'	B	0, 0.054, 0.192, 0.330, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.192 std_dev=0.138
N1	B	0, 0.056, 0.201, 0.346, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.201 std_dev=0.145
N9	B	0, 0.061, 0.208, 0.355, 0.321 max_d=0.321 avg_d=0.208 std_dev=0.147
C2	B	0, 0.061, 0.213, 0.366, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.213 std_dev=0.153
C4'	B	0, 0.062, 0.217, 0.372, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.217 std_dev=0.155
C6	B	0, 0.069, 0.238, 0.407, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.238 std_dev=0.169
C3'	B	0, 0.070, 0.240, 0.411, 0.373 max_d=0.373 avg_d=0.240 std_dev=0.170
C2'	B	0, 0.073, 0.248, 0.423, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.248 std_dev=0.175
C5'	B	0, 0.074, 0.254, 0.434, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.254 std_dev=0.180
C5	B	0, 0.076, 0.261, 0.447, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.261 std_dev=0.185
O3'	B	0, 0.079, 0.270, 0.461, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.270 std_dev=0.191
OP1	A	0, 0.058, 0.252, 0.446, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.252 std_dev=0.194
O5'	B	0, 0.076, 0.274, 0.471, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.274 std_dev=0.198
N6	B	0, 0.087, 0.316, 0.545, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.316 std_dev=0.229
P	B	0, 0.079, 0.318, 0.557, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.318 std_dev=0.239
O2'	B	0, 0.080, 0.328, 0.576, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.328 std_dev=0.248
C8	B	0, 0.082, 0.334, 0.587, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.334 std_dev=0.253
OP2	B	0, 0.085, 0.360, 0.635, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.360 std_dev=0.275
N7	B	0, 0.091, 0.372, 0.653, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.372 std_dev=0.281
OP1	B	0, 0.104, 0.387, 0.670, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.387 std_dev=0.283

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.07	0.06	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.03	0.08	0.06	0.06
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01	0.04	0.03	0.09	0.07	0.07
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00
C6	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.06	0.02	0.03	0.01	0.09	0.06	0.07
C8	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.05	0.09	0.08	0.08
N1	0.04	0.00	0.05	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.06	0.03	0.02	0.00	0.08	0.05	0.06
N2	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.06
N3	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.06	0.05	0.04
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.05	0.05	0.11	0.08	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.06	0.06
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.05	0.06	0.02	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.01	0.05	0.01
O3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.08	0.04	0.02	0.03
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.06	0.05
O5'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00
O6	0.05	0.01	0.07	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.05	0.05	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.09	0.06	0.06
OP1	0.05	0.07	0.01	0.03	0.08	0.02	0.09	0.01	0.09	0.09	0.08	0.07	0.06	0.11	0.07	0.01	0.04	0.06	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.06	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.02	0.06	0.08	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.05	0.01	0.02	0.06	0.02	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.04	0.09	0.06	0.01	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.11	0.02	0.08	0.16	0.01	0.05	0.12	0.19	0.06	0.01	0.03	0.02	0.09	0.08	0.05	0.06
C2	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.08	0.08	0.08	0.11	0.11	0.02	0.04	0.01	0.01	0.10	0.05	0.03	0.04
C2'	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.11	0.03	0.08	0.17	0.01	0.03	0.12	0.19	0.07	0.03	0.04	0.03	0.08	0.08	0.05	0.06
C3'	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.05	0.11	0.05	0.07	0.17	0.01	0.02	0.10	0.19	0.08	0.05	0.05	0.04	0.07	0.08	0.06	0.07
C4	0.03	0.11	0.03	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.10	0.13	0.15	0.04	0.05	0.02	0.02	0.11	0.08	0.06	0.06
C4'	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.04	0.10	0.03	0.07	0.17	0.02	0.01	0.09	0.17	0.08	0.05	0.04	0.03	0.09	0.10	0.07	0.08
C5	0.05	0.14	0.06	0.04	0.06	0.04	0.09	0.03	0.08	0.10	0.09	0.12	0.14	0.14	0.05	0.08	0.05	0.03	0.12	0.09	0.07	0.07
C5'	0.06	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.11	0.04	0.09	0.15	0.04	0.00	0.10	0.16	0.08	0.07	0.05	0.05	0.11	0.15	0.11	0.11
C6	0.04	0.14	0.06	0.04	0.06	0.03	0.08	0.03	0.08	0.08	0.10	0.12	0.14	0.12	0.04	0.09	0.05	0.03	0.12	0.08	0.07	0.07
C8	0.06	0.12	0.07	0.06	0.07	0.05	0.10	0.05	0.09	0.12	0.06	0.12	0.13	0.15	0.07	0.08	0.06	0.05	0.12	0.11	0.09	0.09
N1	0.03	0.12	0.04	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.09	0.10	0.12	0.10	0.02	0.07	0.02	0.01	0.11	0.06	0.05	0.05
N2	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.01	0.03	0.02	0.02	0.10	0.05	0.03	0.04
N3	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.04	0.04	0.10	0.06	0.07	0.12	0.14	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.06	0.03	0.04
N7	0.07	0.14	0.08	0.07	0.08	0.06	0.10	0.06	0.10	0.11	0.08	0.14	0.15	0.14	0.07	0.11	0.08	0.06	0.13	0.11	0.10	0.10
N9	0.02	0.08	0.02	0.02	0.04	0.02	0.10	0.01	0.08	0.13	0.03	0.08	0.13	0.17	0.05	0.03	0.02	0.02	0.10	0.08	0.06	0.07
O2'	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.08	0.04	0.06	0.14	0.02	0.05	0.10	0.16	0.05	0.02	0.03	0.02	0.07	0.05	0.02	0.03
O3'	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	0.07	0.10	0.08	0.07	0.17	0.03	0.04	0.10	0.18	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06
O4'	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.03	0.12	0.02	0.08	0.17	0.02	0.02	0.11	0.19	0.08	0.02	0.04	0.02	0.09	0.09	0.06	0.07
O5'	0.08	0.05	0.08	0.07	0.07	0.06	0.08	0.05	0.06	0.11	0.04	0.05	0.07	0.11	0.08	0.08	0.06	0.06	0.08	0.11	0.09	0.09
O6	0.05	0.14	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.03	0.08	0.08	0.10	0.12	0.13	0.11	0.04	0.10	0.06	0.03	0.12	0.08	0.07	0.07
OP1	0.09	0.10	0.10	0.11	0.08	0.10	0.05	0.08	0.06	0.03	0.08	0.11	0.05	0.02	0.07	0.09	0.12	0.10	0.03	0.08	0.07	0.05
OP2	0.07	0.08	0.08	0.07	0.09	0.06	0.11	0.06	0.10	0.12	0.08	0.08	0.11	0.13	0.09	0.07	0.06	0.06	0.06	0.11	0.09	0.08
P	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.06	0.08	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.10	0.08	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.05	0.02	0.03
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C4	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.04	0.06	0.05
C5'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.03	0.03	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.04	0.06	0.04
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.11	0.05	0.09	0.06
N1	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.05	0.04	0.03
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.05	0.05	0.02	0.03
N6	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.11	0.05	0.09	0.07
N7	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.11	0.05	0.10	0.07
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.05	0.05	0.04
O2'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.08	0.04	0.06
O3'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.03	0.06	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05
O5'	0.05	0.06	0.03	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.09	0.11	0.08	0.05	0.11	0.11	0.08	0.07	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.08	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.06	0.09	0.04	0.02	0.09	0.10	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.07	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00