Doublet Group distance statistics: 53261

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C8	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N2	A	0, 0.000, 0.085, 0.170, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.085 std_dev=0.085
C1'	B	0, 0.000, 0.290, 0.580, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.290 std_dev=0.290
N3	B	0, 0.000, 0.361, 0.722, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.361 std_dev=0.361
C4	B	0, 0.000, 0.393, 0.786, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.393 std_dev=0.393
N9	B	0, 0.000, 0.399, 0.798, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.399 std_dev=0.399
C2	B	0, 0.000, 0.407, 0.815, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.407 std_dev=0.407
N1	B	0, 0.000, 0.480, 0.961, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.480 std_dev=0.480
C5	B	0, 0.000, 0.560, 1.120, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.560 std_dev=0.560
C8	B	0, 0.000, 0.588, 1.176, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.588
C6	B	0, 0.000, 0.594, 1.188, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.594 std_dev=0.594
O4'	A	0, 0.000, 0.604, 1.208, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.604 std_dev=0.604
C2'	A	0, 0.000, 0.680, 1.360, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.680 std_dev=0.680
N7	B	0, 0.000, 0.696, 1.392, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.696 std_dev=0.696
C2'	B	0, 0.000, 0.768, 1.535, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.768 std_dev=0.768
N6	B	0, 0.000, 0.775, 1.549, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.775 std_dev=0.775
C4'	A	0, 0.000, 0.977, 1.955, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.977 std_dev=0.977
C3'	A	0, 0.000, 1.012, 2.023, 2.023 max_d=2.023 avg_d=1.012 std_dev=1.012
O2'	A	0, 0.000, 1.028, 2.056, 2.056 max_d=2.056 avg_d=1.028 std_dev=1.028
O4'	B	0, 0.000, 1.101, 2.203, 2.203 max_d=2.203 avg_d=1.101 std_dev=1.101
C5'	A	0, 0.000, 1.167, 2.335, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.167 std_dev=1.167
C3'	B	0, 0.000, 1.196, 2.392, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.196 std_dev=1.196
O2'	B	0, 0.000, 1.239, 2.478, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.239 std_dev=1.239
O3'	B	0, 0.000, 1.264, 2.528, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.264 std_dev=1.264
C4'	B	0, 0.000, 1.421, 2.842, 2.842 max_d=2.842 avg_d=1.421 std_dev=1.421
O3'	A	0, 0.000, 1.487, 2.974, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.487 std_dev=1.487
OP2	A	0, 0.000, 1.948, 3.896, 3.896 max_d=3.896 avg_d=1.948 std_dev=1.948
O5'	A	0, 0.000, 1.961, 3.922, 3.922 max_d=3.922 avg_d=1.961 std_dev=1.961
C5'	B	0, 0.000, 2.100, 4.199, 4.199 max_d=4.199 avg_d=2.100 std_dev=2.100
O5'	B	0, 0.000, 2.192, 4.385, 4.385 max_d=4.385 avg_d=2.192 std_dev=2.192
P	A	0, 0.000, 2.278, 4.556, 4.556 max_d=4.556 avg_d=2.278 std_dev=2.278
OP1	A	0, 0.000, 2.913, 5.826, 5.826 max_d=5.826 avg_d=2.913 std_dev=2.913
OP2	B	0, 0.000, 2.992, 5.985, 5.985 max_d=5.985 avg_d=2.992 std_dev=2.992
P	B	0, 0.000, 3.120, 6.240, 6.240 max_d=6.240 avg_d=3.120 std_dev=3.120
OP1	B	0, 0.000, 4.035, 8.070, 8.070 max_d=8.070 avg_d=4.035 std_dev=4.035

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.25	0.00	0.05	0.00	0.06	0.41	0.17
C2	0.01	0.00	0.31	0.26	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.07	0.17	0.05	0.02	0.10	0.26	0.20
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.14	0.01	0.06	0.23	0.12	0.16	0.23	0.40	0.30	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.06	0.50	0.19
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.24	0.00	0.28	0.02	0.31	0.22	0.30	0.27	0.22	0.27	0.19	0.01	0.00	0.01	0.28	0.33	0.30	0.01	0.22
C4	0.00	0.00	0.14	0.24	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.03	0.10	0.01	0.01	0.07	0.29	0.16
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.11	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.25	0.02	0.00	0.02	0.06	0.07	0.23	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.28	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.08	0.06	0.07	0.01	0.07	0.24	0.14
C5'	0.09	0.07	0.23	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00	0.06	0.27	0.00
C6	0.00	0.01	0.12	0.31	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.17	0.09	0.09	0.06	0.00	0.08	0.19	0.15
C8	0.02	0.00	0.16	0.22	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.09	0.08	0.16	0.01	0.03	0.32	0.07
N1	0.00	0.01	0.23	0.30	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.14	0.01	0.02	0.10	0.22	0.19
N2	0.05	0.00	0.40	0.27	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.22	0.09	0.17	0.06	0.04	0.09	0.25	0.20
N3	0.02	0.00	0.30	0.22	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.12	0.15	0.04	0.00	0.08	0.29	0.18
N7	0.01	0.00	0.09	0.27	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.14	0.03	0.16	0.01	0.04	0.23	0.08
N9	0.01	0.01	0.00	0.19	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.16	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.34	0.14
O2'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.10	0.25	0.21	0.01	0.17	0.32	0.05	0.22	0.09	0.32	0.16	0.00	0.01	0.20	0.10	0.23	0.12	0.50	0.07
O3'	0.25	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.15	0.09	0.09	0.02	0.09	0.12	0.14	0.04	0.01	0.00	0.21	0.38	0.14	0.65	0.25	0.45
O4'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.08	0.14	0.17	0.15	0.03	0.01	0.20	0.21	0.00	0.14	0.07	0.08	0.36	0.17
O5'	0.05	0.05	0.04	0.28	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.16	0.01	0.06	0.04	0.16	0.04	0.10	0.38	0.14	0.00	0.09	0.01	0.02	0.00
O6	0.00	0.02	0.09	0.33	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.23	0.14	0.07	0.09	0.00	0.07	0.13	0.12
OP1	0.06	0.10	0.06	0.30	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.03	0.10	0.09	0.08	0.04	0.05	0.12	0.65	0.08	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00
OP2	0.41	0.26	0.50	0.01	0.29	0.23	0.24	0.27	0.19	0.32	0.22	0.25	0.29	0.23	0.34	0.50	0.25	0.36	0.02	0.13	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.20	0.19	0.22	0.16	0.02	0.14	0.00	0.15	0.07	0.19	0.20	0.18	0.08	0.14	0.07	0.45	0.17	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.08	0.10	0.55	0.23	0.85	0.35	1.23	0.32	0.40	0.19	0.07	0.38	0.43	0.27	0.47	0.69	0.69	1.23	1.64	1.20	1.47
C2	0.05	0.03	0.07	0.12	0.17	0.44	0.38	0.66	0.40	0.36	0.19	0.05	0.52	0.46	0.19	0.25	0.39	0.45	0.66	0.89	0.54	0.86
C2'	0.11	0.20	0.09	0.51	0.34	0.79	0.54	1.29	0.54	0.56	0.37	0.14	0.67	0.65	0.35	0.57	0.56	0.61	1.40	2.00	1.54	1.79
C3'	0.27	0.08	0.28	0.16	0.03	0.37	0.17	0.82	0.25	0.06	0.19	0.04	0.34	0.18	0.05	0.95	0.23	0.15	0.89	1.57	1.03	1.27
C4	0.10	0.10	0.08	0.29	0.24	0.65	0.38	0.90	0.38	0.37	0.25	0.06	0.46	0.44	0.25	0.46	0.56	0.63	0.87	1.13	0.76	1.06
C4'	0.45	0.19	0.46	0.06	0.23	0.30	0.12	0.77	0.07	0.18	0.11	0.28	0.00	0.10	0.28	1.16	0.15	0.01	0.75	1.40	0.85	1.08
C5	0.11	0.16	0.19	0.24	0.25	0.63	0.38	0.84	0.40	0.34	0.30	0.11	0.47	0.41	0.24	0.55	0.55	0.65	0.77	0.97	0.62	0.92
C5'	0.51	0.25	0.64	0.03	0.30	0.23	0.20	0.67	0.14	0.26	0.17	0.34	0.07	0.19	0.35	1.43	0.05	0.02	0.62	1.22	0.72	0.91
C6	0.09	0.15	0.22	0.13	0.22	0.53	0.37	0.71	0.41	0.32	0.32	0.08	0.50	0.40	0.21	0.47	0.47	0.58	0.63	0.79	0.45	0.77
C8	0.16	0.19	0.12	0.44	0.27	0.81	0.36	1.06	0.36	0.35	0.28	0.16	0.42	0.39	0.27	0.68	0.71	0.76	0.97	1.26	0.87	1.14
N1	0.06	0.04	0.17	0.08	0.19	0.44	0.37	0.63	0.42	0.32	0.27	0.00	0.54	0.42	0.19	0.33	0.39	0.49	0.58	0.75	0.41	0.74
N2	0.03	0.13	0.01	0.08	0.11	0.36	0.34	0.57	0.34	0.35	0.07	0.11	0.51	0.47	0.16	0.10	0.33	0.35	0.60	0.84	0.50	0.81
N3	0.07	0.01	0.02	0.24	0.20	0.54	0.38	0.80	0.37	0.39	0.19	0.02	0.47	0.47	0.22	0.30	0.48	0.51	0.82	1.10	0.74	1.04
N7	0.14	0.21	0.21	0.32	0.26	0.72	0.36	0.93	0.38	0.33	0.30	0.16	0.44	0.38	0.25	0.68	0.63	0.71	0.83	1.05	0.69	0.98
N9	0.13	0.12	0.04	0.43	0.25	0.78	0.36	1.07	0.35	0.38	0.24	0.10	0.42	0.42	0.27	0.56	0.66	0.71	1.03	1.35	0.94	1.23
O2'	0.46	0.19	0.58	0.98	0.51	1.22	0.70	1.82	0.61	0.90	0.36	0.22	0.73	0.92	0.64	0.06	0.97	0.93	2.00	2.74	2.22	2.50
O3'	0.66	0.31	0.55	0.16	0.40	0.01	0.29	0.44	0.20	0.41	0.22	0.42	0.11	0.30	0.49	1.15	0.07	0.32	0.51	1.40	0.72	0.97
O4'	0.26	0.21	0.27	0.29	0.17	0.60	0.09	0.98	0.09	0.06	0.15	0.25	0.03	0.04	0.16	0.88	0.45	0.31	0.88	1.34	0.85	1.11
O5'	0.92	0.45	1.23	0.61	0.60	0.25	0.48	0.16	0.36	0.62	0.35	0.60	0.28	0.50	0.71	2.05	0.50	0.36	0.10	0.59	0.17	0.37
O6	0.10	0.17	0.28	0.09	0.21	0.51	0.33	0.67	0.39	0.29	0.32	0.10	0.47	0.36	0.19	0.50	0.45	0.58	0.56	0.67	0.34	0.67
OP1	1.03	0.62	1.46	0.85	0.75	0.45	0.64	0.01	0.53	0.76	0.53	0.76	0.44	0.66	0.85	2.35	0.89	0.50	0.05	0.44	0.09	0.23
OP2	0.87	0.52	1.29	0.62	0.63	0.20	0.51	0.15	0.40	0.62	0.41	0.66	0.31	0.52	0.71	2.08	0.45	0.28	0.06	0.48	0.09	0.30
P	0.96	0.61	1.39	0.72	0.72	0.30	0.61	0.10	0.52	0.72	0.52	0.74	0.44	0.63	0.80	2.23	0.63	0.38	0.01	0.45	0.07	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.28	0.00	0.08	0.01	0.05	0.08
C2	0.02	0.00	0.29	0.18	0.00	0.12	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.21	0.26	0.01	0.12	0.29	0.03
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.16	0.00	0.10	0.16	0.16	0.13	0.25	0.28	0.12	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.29	0.06	0.38	0.27
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.22	0.00	0.32	0.01	0.33	0.31	0.27	0.14	0.37	0.36	0.20	0.01	0.01	0.01	0.08	0.28	0.06	0.15
C4	0.01	0.00	0.16	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.13	0.07	0.19	0.27	0.08
C4'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.06	0.26	0.03	0.13	0.11	0.24	0.09	0.24	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03
C5	0.01	0.01	0.10	0.32	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.04	0.04	0.21	0.34	0.47	0.23
C5'	0.04	0.13	0.16	0.01	0.00	0.00	0.13	0.00	0.08	0.29	0.02	0.14	0.15	0.28	0.07	0.06	0.19	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00
C6	0.00	0.01	0.16	0.33	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.03	0.10	0.21	0.35	0.53	0.23
C8	0.01	0.01	0.13	0.31	0.01	0.26	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.40	0.12	0.18	0.30	0.37	0.36	0.26
N1	0.00	0.00	0.25	0.27	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.19	0.12	0.25	0.45	0.14
N3	0.02	0.00	0.28	0.14	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.26	0.26	0.03	0.07	0.19	0.02
N6	0.00	0.02	0.12	0.37	0.00	0.11	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.10	0.06	0.28	0.46	0.67	0.33
N7	0.02	0.01	0.04	0.36	0.00	0.24	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.17	0.11	0.34	0.46	0.55	0.35
N9	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.09	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.07	0.01	0.08	0.17	0.17	0.07
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.24	0.21	0.06	0.14	0.40	0.01	0.15	0.22	0.37	0.18	0.00	0.01	0.18	0.21	0.04	0.47	0.22
O3'	0.28	0.21	0.02	0.01	0.10	0.00	0.04	0.19	0.03	0.12	0.08	0.26	0.10	0.17	0.07	0.01	0.00	0.18	0.26	0.68	0.30	0.43
O4'	0.00	0.26	0.01	0.01	0.13	0.00	0.04	0.01	0.10	0.18	0.19	0.26	0.06	0.11	0.01	0.18	0.18	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03
O5'	0.08	0.01	0.29	0.08	0.07	0.02	0.21	0.00	0.21	0.30	0.12	0.03	0.28	0.34	0.08	0.21	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.01	0.12	0.06	0.28	0.19	0.04	0.34	0.09	0.35	0.37	0.25	0.07	0.46	0.46	0.17	0.04	0.68	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.29	0.38	0.06	0.27	0.01	0.47	0.02	0.53	0.36	0.45	0.19	0.67	0.55	0.17	0.47	0.30	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.03	0.27	0.15	0.08	0.03	0.23	0.00	0.23	0.26	0.14	0.02	0.33	0.35	0.07	0.22	0.43	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00