Doublet Group distance statistics: 53264

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.000, 0.041, 0.082, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.041
O3'	A	0, 0.000, 0.135, 0.269, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.135 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.000, 0.171, 0.342, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.171 std_dev=0.171
C3'	A	0, 0.000, 0.224, 0.448, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.224 std_dev=0.224
O2'	A	0, 0.000, 0.234, 0.468, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.234 std_dev=0.234
O4'	A	0, 0.000, 0.251, 0.501, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C4'	A	0, 0.000, 0.305, 0.609, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.305 std_dev=0.305
C4	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C1'	B	0, 0.000, 0.322, 0.644, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.322 std_dev=0.322
N9	B	0, 0.000, 0.325, 0.651, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.325 std_dev=0.325
N3	B	0, 0.000, 0.329, 0.658, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.329 std_dev=0.329
C6	B	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.000, 0.338, 0.676, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.338 std_dev=0.338
C5	B	0, 0.000, 0.347, 0.695, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.347 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.000, 0.353, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.353 std_dev=0.353
C8	B	0, 0.000, 0.358, 0.715, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.358 std_dev=0.358
N7	B	0, 0.000, 0.379, 0.759, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.379 std_dev=0.379
N6	B	0, 0.000, 0.381, 0.762, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.381 std_dev=0.381
C5'	A	0, 0.000, 0.572, 1.145, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.572 std_dev=0.572
C2'	B	0, 0.000, 0.925, 1.850, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.925 std_dev=0.925
O4'	B	0, 0.000, 1.168, 2.335, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.168 std_dev=1.168
O2'	B	0, 0.000, 1.223, 2.446, 2.446 max_d=2.446 avg_d=1.223 std_dev=1.223
C3'	B	0, 0.000, 1.541, 3.082, 3.082 max_d=3.082 avg_d=1.541 std_dev=1.541
O3'	B	0, 0.000, 1.644, 3.288, 3.288 max_d=3.288 avg_d=1.644 std_dev=1.644
O5'	A	0, 0.000, 1.660, 3.319, 3.319 max_d=3.319 avg_d=1.660 std_dev=1.659
C4'	B	0, 0.000, 1.670, 3.340, 3.340 max_d=3.340 avg_d=1.670 std_dev=1.670
OP2	A	0, 0.000, 1.672, 3.344, 3.344 max_d=3.344 avg_d=1.672 std_dev=1.672
P	A	0, 0.000, 2.001, 4.002, 4.002 max_d=4.002 avg_d=2.001 std_dev=2.001
O5'	B	0, 0.000, 2.191, 4.382, 4.382 max_d=4.382 avg_d=2.191 std_dev=2.191
C5'	B	0, 0.000, 2.409, 4.817, 4.817 max_d=4.817 avg_d=2.409 std_dev=2.409
OP2	B	0, 0.000, 2.770, 5.541, 5.541 max_d=5.541 avg_d=2.770 std_dev=2.770
P	B	0, 0.000, 2.947, 5.895, 5.895 max_d=5.895 avg_d=2.947 std_dev=2.947
OP1	A	0, 0.000, 3.017, 6.035, 6.035 max_d=6.035 avg_d=3.017 std_dev=3.017
OP1	B	0, 0.000, 3.369, 6.737, 6.737 max_d=6.737 avg_d=3.369 std_dev=3.369

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.35	0.01	0.56	0.41	0.39
C2	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.12	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.02	0.32	0.44	0.16
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.56	0.03	0.74	0.32	0.51
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.30	0.00	0.33	0.04	0.23
C4	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.09	0.25	0.00	0.68	0.58	0.41
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.10	0.15	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.36	0.00	0.96	0.74	0.57
C5'	0.01	0.15	0.04	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.07	0.12	0.19	0.13	0.05	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00
C6	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.09	0.26	0.00	0.84	0.73	0.48
C8	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.66	0.00	1.28	0.82	0.82
N1	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.14	0.09	0.01	0.53	0.58	0.29
N2	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.01	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.18	0.14	0.02	0.09	0.33	0.01
N3	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.15	0.04	0.01	0.34	0.42	0.18
N7	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.58	0.01	1.33	0.88	0.81
N9	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.42	0.01	0.83	0.61	0.54
O2'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.06	0.06	0.00	0.07	0.08	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.59	0.06	0.85	0.32	0.57
O3'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.02	0.15	0.08	0.10
O4'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.01	0.09	0.02	0.14	0.18	0.15	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.10	0.07	0.21	0.35	0.19
O5'	0.35	0.01	0.56	0.30	0.25	0.02	0.36	0.01	0.26	0.66	0.09	0.14	0.04	0.58	0.42	0.59	0.14	0.10	0.00	0.32	0.04	0.04	0.00
O6	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.32	0.00	0.97	0.81	0.56
OP1	0.56	0.32	0.74	0.33	0.68	0.03	0.96	0.03	0.84	1.28	0.53	0.09	0.34	1.33	0.83	0.85	0.15	0.21	0.04	0.97	0.00	0.03	0.00
OP2	0.41	0.44	0.32	0.04	0.58	0.05	0.74	0.00	0.73	0.82	0.58	0.33	0.42	0.88	0.61	0.32	0.08	0.35	0.04	0.81	0.03	0.00	0.01
P	0.39	0.16	0.51	0.23	0.41	0.04	0.57	0.00	0.48	0.82	0.29	0.01	0.18	0.81	0.54	0.57	0.10	0.19	0.00	0.56	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.19	0.21	0.38	0.12	0.89	0.11	1.18	0.12	0.07	0.17	0.15	0.12	0.09	0.09	0.71	0.61	0.78	0.99	0.75	0.67	0.93
C2	0.09	0.01	0.01	0.20	0.03	0.54	0.01	0.90	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.00	0.06	0.28	0.33	0.42	0.87	0.70	0.71	0.89
C2'	0.07	0.17	0.23	0.40	0.11	0.93	0.12	1.26	0.13	0.08	0.16	0.13	0.12	0.10	0.09	0.77	0.62	0.79	1.05	0.82	0.73	1.01
C3'	0.04	0.15	0.31	0.39	0.08	0.89	0.08	1.19	0.10	0.04	0.14	0.10	0.10	0.06	0.05	0.90	0.63	0.74	0.98	0.77	0.68	0.94
C4	0.00	0.10	0.17	0.20	0.05	0.68	0.06	0.99	0.08	0.02	0.11	0.05	0.08	0.04	0.02	0.51	0.40	0.63	0.86	0.59	0.56	0.80
C4'	0.05	0.13	0.48	0.19	0.02	0.67	0.04	0.90	0.07	0.03	0.12	0.06	0.07	0.00	0.02	1.03	0.46	0.60	0.71	0.44	0.40	0.62
C5	0.04	0.04	0.22	0.06	0.00	0.54	0.02	0.83	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.02	0.45	0.26	0.52	0.70	0.39	0.38	0.61
C5'	0.18	0.04	0.72	0.11	0.08	0.42	0.04	0.62	0.01	0.12	0.06	0.05	0.03	0.08	0.13	1.22	0.15	0.44	0.44	0.06	0.08	0.29
C6	0.08	0.05	0.16	0.02	0.07	0.40	0.04	0.68	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.03	0.07	0.30	0.16	0.38	0.59	0.31	0.32	0.53
C8	0.02	0.13	0.30	0.13	0.06	0.67	0.08	0.95	0.10	0.04	0.13	0.07	0.10	0.06	0.04	0.62	0.36	0.66	0.77	0.42	0.40	0.66
N1	0.12	0.06	0.07	0.04	0.09	0.38	0.05	0.69	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.05	0.10	0.23	0.18	0.31	0.65	0.46	0.48	0.65
N2	0.12	0.01	0.13	0.27	0.04	0.49	0.01	0.90	0.02	0.06	0.03	0.04	0.03	0.02	0.08	0.15	0.35	0.27	0.97	0.89	0.93	1.06
N3	0.01	0.09	0.06	0.31	0.05	0.73	0.07	1.08	0.08	0.02	0.11	0.05	0.08	0.05	0.02	0.44	0.46	0.62	0.98	0.77	0.74	0.96
N7	0.02	0.06	0.29	0.02	0.01	0.55	0.03	0.82	0.06	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.01	0.53	0.25	0.56	0.66	0.30	0.29	0.54
N9	0.04	0.15	0.23	0.25	0.08	0.76	0.09	1.06	0.11	0.05	0.15	0.10	0.11	0.07	0.05	0.62	0.47	0.71	0.89	0.60	0.55	0.81
O2'	0.12	0.18	0.10	0.55	0.14	1.06	0.14	1.46	0.14	0.12	0.17	0.15	0.13	0.12	0.12	0.67	0.75	0.85	1.25	1.10	0.97	1.26
O3'	0.12	0.20	0.13	0.62	0.14	1.06	0.14	1.40	0.14	0.11	0.18	0.17	0.13	0.12	0.12	0.79	0.84	0.81	1.18	1.09	0.94	1.20
O4'	0.04	0.15	0.43	0.17	0.03	0.66	0.04	0.88	0.07	0.03	0.13	0.08	0.07	0.00	0.02	0.92	0.45	0.61	0.70	0.42	0.37	0.60
O5'	0.55	0.01	1.21	0.68	0.25	0.07	0.14	0.17	0.02	0.34	0.11	0.22	0.10	0.21	0.39	1.72	0.52	0.07	0.05	0.47	0.30	0.14
O6	0.10	0.10	0.18	0.12	0.10	0.29	0.08	0.54	0.06	0.08	0.07	0.11	0.04	0.07	0.10	0.25	0.06	0.30	0.44	0.15	0.16	0.37
OP1	0.75	0.24	1.63	1.32	0.22	0.61	0.01	0.39	0.31	0.37	0.46	0.18	0.48	0.12	0.47	2.04	1.32	0.24	0.43	1.21	0.78	0.71
OP2	0.10	0.76	0.67	0.28	0.48	0.28	0.61	0.42	0.77	0.37	0.86	0.51	0.86	0.52	0.31	1.09	0.16	0.55	0.37	0.27	0.04	0.12
P	0.47	0.18	1.24	0.82	0.12	0.18	0.02	0.02	0.21	0.22	0.31	0.09	0.31	0.06	0.28	1.67	0.71	0.08	0.07	0.73	0.45	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.24	0.01	0.15	0.06	0.12	0.14
C2	0.00	0.00	0.40	0.31	0.01	0.16	0.01	0.23	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.33	0.04	0.36	0.10	0.37	0.33	0.13
C2'	0.01	0.40	0.00	0.01	0.21	0.00	0.09	0.18	0.19	0.22	0.31	0.39	0.12	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.43	0.33	0.50	0.45
C3'	0.00	0.31	0.01	0.00	0.29	0.00	0.34	0.01	0.39	0.25	0.36	0.26	0.41	0.32	0.21	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.01
C4	0.00	0.01	0.21	0.29	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.17	0.02	0.29	0.24	0.12
C4'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.05	0.28	0.08	0.17	0.11	0.24	0.10	0.24	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01
C5	0.00	0.01	0.09	0.34	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.12	0.05	0.13	0.42	0.40	0.28
C5'	0.05	0.23	0.18	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.02	0.31	0.13	0.23	0.10	0.27	0.06	0.04	0.17	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00
C6	0.01	0.03	0.19	0.39	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.16	0.12	0.12	0.51	0.50	0.32
C8	0.01	0.01	0.22	0.25	0.00	0.28	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.47	0.06	0.26	0.26	0.26	0.21	0.23
N1	0.01	0.01	0.31	0.36	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.11	0.27	0.01	0.47	0.44	0.23
N3	0.01	0.00	0.39	0.26	0.00	0.17	0.00	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.34	0.02	0.36	0.15	0.26	0.20	0.05
N6	0.01	0.02	0.12	0.41	0.01	0.11	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.15	0.21	0.06	0.21	0.59	0.61	0.42
N7	0.01	0.02	0.12	0.32	0.00	0.24	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.13	0.15	0.29	0.42	0.42	0.35
N9	0.00	0.01	0.00	0.21	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.03	0.02	0.17	0.10	0.06
O2'	0.03	0.33	0.01	0.02	0.05	0.24	0.15	0.04	0.04	0.47	0.15	0.34	0.15	0.41	0.15	0.00	0.02	0.20	0.34	0.41	0.68	0.48
O3'	0.24	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.12	0.17	0.16	0.06	0.11	0.02	0.21	0.13	0.03	0.02	0.00	0.16	0.13	0.43	0.24	0.28
O4'	0.01	0.36	0.01	0.01	0.17	0.01	0.05	0.01	0.12	0.26	0.27	0.36	0.06	0.15	0.03	0.20	0.16	0.00	0.04	0.03	0.03	0.02
O5'	0.15	0.10	0.43	0.05	0.02	0.02	0.13	0.01	0.12	0.26	0.01	0.15	0.21	0.29	0.02	0.34	0.13	0.04	0.00	0.02	0.04	0.00
OP1	0.06	0.37	0.33	0.04	0.29	0.06	0.42	0.04	0.51	0.26	0.47	0.26	0.59	0.42	0.17	0.41	0.43	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.12	0.33	0.50	0.02	0.24	0.04	0.40	0.04	0.50	0.21	0.44	0.20	0.61	0.42	0.10	0.68	0.24	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01
P	0.14	0.13	0.45	0.01	0.12	0.01	0.28	0.00	0.32	0.23	0.23	0.05	0.42	0.35	0.06	0.48	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00