Doublet Group distance statistics: 53265

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C5	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.000, 0.037, 0.074, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.037
N9	A	0, 0.000, 0.048, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O6	A	0, 0.000, 0.054, 0.109, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.054 std_dev=0.054
N7	A	0, 0.000, 0.076, 0.152, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.076 std_dev=0.076
C8	A	0, 0.000, 0.086, 0.171, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.086 std_dev=0.086
N6	B	0, 0.000, 0.350, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.350 std_dev=0.350
N1	B	0, 0.000, 0.354, 0.707, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.354 std_dev=0.354
C6	B	0, 0.000, 0.372, 0.744, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.372 std_dev=0.372
C2	B	0, 0.000, 0.396, 0.792, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.396 std_dev=0.396
C5	B	0, 0.000, 0.444, 0.887, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.444 std_dev=0.444
N3	B	0, 0.000, 0.454, 0.907, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.454 std_dev=0.454
C4	B	0, 0.000, 0.476, 0.952, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.476 std_dev=0.476
N7	B	0, 0.000, 0.517, 1.034, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.517 std_dev=0.517
N9	B	0, 0.000, 0.566, 1.132, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.566 std_dev=0.566
C8	B	0, 0.000, 0.581, 1.163, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.581 std_dev=0.581
C1'	B	0, 0.000, 0.675, 1.351, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.675 std_dev=0.675
O4'	B	0, 0.000, 0.722, 1.444, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.722 std_dev=0.722
C4'	B	0, 0.000, 0.755, 1.511, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.755 std_dev=0.755
C3'	B	0, 0.000, 0.774, 1.548, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.774 std_dev=0.774
C5'	B	0, 0.000, 0.854, 1.708, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.854 std_dev=0.854
C2'	B	0, 0.000, 0.861, 1.722, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.861 std_dev=0.861
O5'	B	0, 0.000, 0.976, 1.952, 1.952 max_d=1.952 avg_d=0.976 std_dev=0.976
O3'	B	0, 0.000, 0.981, 1.963, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.981 std_dev=0.981
O2'	B	0, 0.000, 1.177, 2.355, 2.355 max_d=2.355 avg_d=1.177 std_dev=1.177
P	B	0, 0.000, 1.194, 2.389, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.194 std_dev=1.194
OP2	B	0, 0.000, 1.239, 2.479, 2.479 max_d=2.479 avg_d=1.239 std_dev=1.239
C2'	A	0, 0.000, 1.331, 2.662, 2.662 max_d=2.662 avg_d=1.331 std_dev=1.331
O4'	A	0, 0.000, 1.374, 2.748, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.374 std_dev=1.374
OP1	B	0, 0.000, 1.416, 2.831, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.416 std_dev=1.416
O3'	A	0, 0.000, 1.427, 2.854, 2.854 max_d=2.854 avg_d=1.427 std_dev=1.427
C3'	A	0, 0.000, 1.736, 3.473, 3.473 max_d=3.473 avg_d=1.736 std_dev=1.736
O2'	A	0, 0.000, 1.845, 3.690, 3.690 max_d=3.690 avg_d=1.845 std_dev=1.845
C4'	A	0, 0.000, 1.873, 3.745, 3.745 max_d=3.745 avg_d=1.873 std_dev=1.873
C5'	A	0, 0.000, 3.284, 6.567, 6.567 max_d=6.567 avg_d=3.284 std_dev=3.284
O5'	A	0, 0.000, 4.075, 8.149, 8.149 max_d=8.149 avg_d=4.075 std_dev=4.075
OP1	A	0, 0.000, 5.486, 10.971, 10.971 max_d=10.971 avg_d=5.486 std_dev=5.486
P	A	0, 0.000, 5.498, 10.995, 10.995 max_d=10.995 avg_d=5.498 std_dev=5.498
OP2	A	0, 0.000, 6.429, 12.859, 12.859 max_d=12.859 avg_d=6.429 std_dev=6.429

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.28	0.02	0.04	0.43	0.18
C2	0.00	0.00	0.51	0.81	0.01	0.40	0.01	0.59	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.47	0.01	1.44	0.00	1.37	2.21	1.54
C2'	0.00	0.51	0.00	0.00	0.23	0.00	0.08	0.15	0.19	0.29	0.37	0.64	0.51	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.11	0.22	0.08
C3'	0.00	0.81	0.00	0.00	0.43	0.00	0.29	0.01	0.46	0.16	0.67	0.98	0.76	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.06	0.40	0.13	0.18	0.11
C4	0.00	0.01	0.23	0.43	0.00	0.20	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.00	0.94	0.02	0.73	1.40	0.91
C4'	0.01	0.40	0.00	0.00	0.20	0.00	0.12	0.00	0.21	0.12	0.33	0.48	0.37	0.04	0.03	0.21	0.03	0.01	0.00	0.18	0.16	0.00	0.09
C5	0.00	0.01	0.08	0.29	0.00	0.12	0.00	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.05	0.01	0.84	0.02	0.69	1.41	0.87
C5'	0.06	0.59	0.15	0.01	0.22	0.00	0.09	0.00	0.25	0.32	0.46	0.75	0.51	0.20	0.05	0.05	0.19	0.00	0.00	0.19	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.19	0.46	0.01	0.21	0.02	0.25	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.19	0.02	1.09	0.00	1.00	1.85	1.19
C8	0.01	0.01	0.29	0.16	0.00	0.12	0.00	0.32	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.30	0.27	0.02	0.21	0.03	0.06	0.51	0.18
N1	0.01	0.00	0.37	0.67	0.01	0.33	0.01	0.46	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.37	0.00	1.35	0.01	1.31	2.22	1.49
N2	0.01	0.00	0.64	0.98	0.01	0.48	0.01	0.75	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.64	0.02	1.60	0.01	1.66	2.49	1.78
N3	0.00	0.01	0.51	0.76	0.00	0.37	0.00	0.51	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.38	0.02	1.26	0.01	1.09	1.81	1.27
N7	0.01	0.01	0.17	0.00	0.00	0.04	0.00	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.29	0.16	0.02	0.44	0.03	0.30	0.88	0.44
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.11	0.01	0.49	0.02	0.28	0.79	0.43
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.04	0.21	0.16	0.05	0.10	0.30	0.02	0.24	0.14	0.29	0.13	0.00	0.00	0.15	0.10	0.15	0.15	0.19	0.12
O3'	0.21	0.47	0.01	0.01	0.13	0.03	0.05	0.19	0.19	0.27	0.37	0.64	0.38	0.16	0.11	0.00	0.00	0.14	0.08	0.16	0.17	0.16	0.13
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.15	0.14	0.00	0.27	0.03	0.10	0.31	0.09
O5'	0.28	1.44	0.06	0.06	0.94	0.00	0.84	0.00	1.09	0.21	1.35	1.60	1.26	0.44	0.49	0.10	0.08	0.27	0.00	1.04	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.13	0.40	0.02	0.18	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.15	0.16	0.03	1.04	0.00	0.99	1.85	1.17
OP1	0.04	1.37	0.11	0.13	0.73	0.16	0.69	0.09	1.00	0.06	1.31	1.66	1.09	0.30	0.28	0.15	0.17	0.10	0.01	0.99	0.00	0.00	0.00
OP2	0.43	2.21	0.22	0.18	1.40	0.00	1.41	0.02	1.85	0.51	2.22	2.49	1.81	0.88	0.79	0.19	0.16	0.31	0.01	1.85	0.00	0.00	0.00
P	0.18	1.54	0.08	0.11	0.91	0.09	0.87	0.01	1.19	0.18	1.49	1.78	1.27	0.44	0.43	0.12	0.13	0.09	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.06	0.32	0.42	0.13	0.43	0.16	0.55	0.10	0.26	0.01	0.00	0.13	0.24	0.22	0.33	0.40	0.37	0.04	0.33	0.56	0.42
C2	0.15	0.25	0.10	0.10	0.21	0.08	0.10	0.27	0.09	0.06	0.18	0.27	0.02	0.01	0.16	0.14	0.16	0.11	0.55	0.26	0.08	0.25
C2'	0.51	0.26	0.49	0.46	0.43	0.44	0.36	0.35	0.25	0.48	0.21	0.39	0.20	0.41	0.50	0.38	0.45	0.48	0.93	1.15	1.44	1.29
C3'	0.08	0.04	0.06	0.14	0.15	0.10	0.23	0.26	0.16	0.34	0.04	0.01	0.19	0.34	0.21	0.20	0.07	0.11	0.99	1.41	1.89	1.62
C4	0.02	0.21	0.06	0.22	0.07	0.22	0.01	0.40	0.02	0.08	0.13	0.19	0.06	0.10	0.01	0.01	0.22	0.11	0.33	0.02	0.24	0.07
C4'	0.87	0.64	0.90	0.76	0.65	0.75	0.49	0.46	0.44	0.50	0.50	0.75	0.35	0.42	0.67	1.15	0.79	0.80	0.32	0.97	1.31	1.08
C5	0.02	0.23	0.00	0.17	0.10	0.18	0.03	0.37	0.06	0.02	0.17	0.19	0.02	0.04	0.03	0.07	0.15	0.08	0.36	0.02	0.16	0.02
C5'	1.13	1.19	1.12	0.82	0.98	0.78	0.74	0.32	0.74	0.62	0.93	1.27	0.58	0.54	0.90	1.49	0.86	0.90	0.40	1.26	1.64	1.32
C6	0.10	0.25	0.09	0.10	0.17	0.11	0.12	0.31	0.13	0.07	0.21	0.23	0.02	0.05	0.12	0.17	0.10	0.01	0.46	0.15	0.01	0.13
C8	0.12	0.13	0.13	0.26	0.03	0.28	0.06	0.44	0.02	0.12	0.08	0.07	0.06	0.12	0.09	0.09	0.22	0.24	0.15	0.22	0.39	0.27
N1	0.16	0.26	0.14	0.07	0.22	0.06	0.16	0.26	0.14	0.11	0.21	0.26	0.03	0.08	0.18	0.20	0.10	0.10	0.54	0.27	0.13	0.25
N2	0.23	0.26	0.17	0.03	0.24	0.02	0.14	0.16	0.11	0.13	0.18	0.29	0.01	0.06	0.23	0.20	0.13	0.23	0.64	0.42	0.28	0.43
N3	0.04	0.22	0.02	0.20	0.12	0.18	0.01	0.37	0.03	0.06	0.14	0.22	0.06	0.09	0.05	0.01	0.24	0.00	0.44	0.10	0.16	0.06
N7	0.04	0.18	0.04	0.20	0.04	0.22	0.00	0.40	0.03	0.05	0.14	0.12	0.02	0.05	0.02	0.02	0.15	0.16	0.25	0.10	0.26	0.14
N9	0.13	0.14	0.17	0.30	0.03	0.31	0.09	0.46	0.04	0.16	0.07	0.09	0.09	0.16	0.11	0.14	0.27	0.24	0.17	0.20	0.41	0.26
O2'	0.76	0.49	0.74	0.67	0.56	0.67	0.38	0.44	0.27	0.49	0.32	0.65	0.14	0.36	0.62	0.75	0.71	0.68	1.05	1.18	1.20	1.21
O3'	0.02	0.06	0.00	0.08	0.05	0.04	0.08	0.20	0.04	0.18	0.03	0.03	0.04	0.16	0.10	0.23	0.00	0.04	1.05	1.55	1.81	1.71
O4'	1.09	0.61	1.11	1.07	0.85	1.05	0.73	0.90	0.59	0.85	0.52	0.80	0.51	0.75	0.95	1.21	1.05	1.10	0.28	0.32	0.59	0.40
O5'	0.69	0.62	0.75	0.49	0.35	0.50	0.01	0.04	0.00	0.06	0.28	0.72	0.22	0.22	0.32	1.26	0.64	0.50	0.65	1.32	2.04	1.52
O6	0.11	0.23	0.12	0.07	0.17	0.09	0.14	0.29	0.16	0.10	0.22	0.21	0.08	0.09	0.13	0.22	0.07	0.02	0.47	0.18	0.07	0.16
OP1	1.12	0.86	1.26	0.88	0.65	0.85	0.24	0.15	0.20	0.18	0.49	1.02	0.07	0.03	0.64	1.98	1.13	0.82	0.52	1.30	2.18	1.49
OP2	0.53	0.45	0.63	0.30	0.06	0.33	0.45	0.22	0.46	0.54	0.04	0.57	0.81	0.79	0.01	1.33	0.55	0.28	0.81	1.42	2.40	1.69
P	1.02	0.87	1.12	0.76	0.59	0.73	0.16	0.12	0.13	0.09	0.46	1.02	0.15	0.12	0.56	1.78	0.96	0.73	0.54	1.28	2.11	1.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.11	0.29	0.22	0.00
C2	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.05	0.05	0.06	0.33	0.23
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.03	0.04	0.01	0.07	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.27	0.62	0.04	0.27
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.06	0.03	0.09	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.35	0.75	0.14	0.42
C4	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.01	0.03	0.25	0.22	0.14	0.01
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.10	0.06	0.01	0.11	0.12	0.05	0.06	0.01	0.00	0.00	0.31	0.25	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.04	0.04	0.47	0.40	0.10	0.23
C5'	0.02	0.12	0.00	0.00	0.13	0.00	0.21	0.00	0.22	0.19	0.18	0.08	0.27	0.24	0.12	0.05	0.03	0.01	0.00	0.18	0.34	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.05	0.43	0.31	0.06	0.17
C8	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.11	0.01	0.63	0.66	0.27	0.46
N1	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.03	0.05	0.23	0.09	0.15	0.05
N3	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.04	0.01	0.04	0.37	0.24
N6	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.11	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.04	0.06	0.55	0.43	0.23	0.31
N7	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.15	0.10	0.03	0.68	0.65	0.35	0.49
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.34	0.39	0.05	0.15
O2'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.10	0.06	0.15	0.05	0.18	0.11	0.15	0.07	0.21	0.15	0.07	0.00	0.10	0.07	0.17	0.62	0.01	0.23
O3'	0.06	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.11	0.03	0.07	0.04	0.10	0.02	0.10	0.00	0.03	0.33	1.01	0.34	0.58
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.03	0.01	0.07	0.03	0.00	0.06	0.07	0.47	0.20
O5'	0.11	0.05	0.27	0.35	0.25	0.00	0.47	0.00	0.43	0.63	0.23	0.01	0.55	0.68	0.34	0.17	0.33	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.29	0.06	0.62	0.75	0.22	0.31	0.40	0.18	0.31	0.66	0.09	0.04	0.43	0.65	0.39	0.62	1.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.22	0.33	0.04	0.14	0.14	0.25	0.10	0.34	0.06	0.27	0.15	0.37	0.23	0.35	0.05	0.01	0.34	0.47	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.00	0.23	0.27	0.42	0.01	0.03	0.23	0.01	0.17	0.46	0.05	0.24	0.31	0.49	0.15	0.23	0.58	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00