Doublet Group distance statistics: 53267

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
O6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
N1	B	0, 0.000, 0.211, 0.422, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.211 std_dev=0.211
C2	B	0, 0.000, 0.237, 0.474, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.237 std_dev=0.237
C6	B	0, 0.000, 0.275, 0.550, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.275 std_dev=0.275
C2'	A	0, 0.000, 0.285, 0.570, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.285 std_dev=0.285
O4'	A	0, 0.000, 0.286, 0.571, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.286 std_dev=0.286
N6	B	0, 0.000, 0.286, 0.573, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.286 std_dev=0.286
N3	B	0, 0.000, 0.326, 0.653, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.326 std_dev=0.326
O2'	A	0, 0.000, 0.342, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.000, 0.373, 0.746, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.373 std_dev=0.373
C4	B	0, 0.000, 0.389, 0.779, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.389 std_dev=0.389
C3'	A	0, 0.000, 0.425, 0.850, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.425 std_dev=0.425
C4'	A	0, 0.000, 0.429, 0.858, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.429 std_dev=0.429
N7	B	0, 0.000, 0.489, 0.977, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.489 std_dev=0.489
N9	B	0, 0.000, 0.518, 1.037, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.518 std_dev=0.518
C8	B	0, 0.000, 0.566, 1.132, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.566 std_dev=0.566
OP1	A	0, 0.000, 0.573, 1.146, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.573 std_dev=0.573
C1'	B	0, 0.000, 0.594, 1.188, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.594 std_dev=0.594
O3'	A	0, 0.000, 0.629, 1.257, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.629 std_dev=0.629
C5'	A	0, 0.000, 0.769, 1.537, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.769 std_dev=0.769
O5'	A	0, 0.000, 0.875, 1.749, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.875 std_dev=0.875
P	A	0, 0.000, 0.902, 1.804, 1.804 max_d=1.804 avg_d=0.902 std_dev=0.902
C2'	B	0, 0.000, 1.308, 2.617, 2.617 max_d=2.617 avg_d=1.308 std_dev=1.308
OP2	A	0, 0.000, 1.433, 2.867, 2.867 max_d=2.867 avg_d=1.433 std_dev=1.433
O2'	B	0, 0.000, 1.528, 3.056, 3.056 max_d=3.056 avg_d=1.528 std_dev=1.528
O4'	B	0, 0.000, 1.845, 3.689, 3.689 max_d=3.689 avg_d=1.845 std_dev=1.845
C3'	B	0, 0.000, 2.192, 4.383, 4.383 max_d=4.383 avg_d=2.192 std_dev=2.192
C4'	B	0, 0.000, 2.257, 4.514, 4.514 max_d=4.514 avg_d=2.257 std_dev=2.257
O3'	B	0, 0.000, 2.596, 5.192, 5.192 max_d=5.192 avg_d=2.596 std_dev=2.596
C5'	B	0, 0.000, 3.781, 7.562, 7.562 max_d=7.562 avg_d=3.781 std_dev=3.781
O5'	B	0, 0.000, 4.325, 8.651, 8.651 max_d=8.651 avg_d=4.325 std_dev=4.325
OP1	B	0, 0.000, 5.251, 10.501, 10.501 max_d=10.501 avg_d=5.251 std_dev=5.251
P	B	0, 0.000, 5.512, 11.025, 11.025 max_d=11.025 avg_d=5.512 std_dev=5.512
OP2	B	0, 0.000, 6.499, 12.999, 12.999 max_d=12.999 avg_d=6.499 std_dev=6.499

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.24	0.01	0.12	0.26	0.05
C2	0.03	0.00	0.09	0.18	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.23	0.06	0.36	0.00	0.19	0.07	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.06	0.10	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.01	0.34	0.15	0.17
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.14	0.01	0.12	0.02	0.14	0.02	0.17	0.18	0.17	0.07	0.07	0.04	0.00	0.01	0.27	0.13	0.51	0.35	0.33
C4	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.02	0.38	0.01	0.17	0.11	0.12
C4'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.01	0.02	0.06	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.06	0.21	0.14	0.04
C5	0.00	0.00	0.01	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.15	0.01	0.46	0.01	0.19	0.06	0.21
C5'	0.01	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.08	0.09	0.04	0.05	0.11	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.13	0.31	0.11	0.06
C6	0.02	0.00	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.19	0.02	0.46	0.00	0.20	0.01	0.23
C8	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.48	0.01	0.17	0.13	0.19
N1	0.03	0.00	0.06	0.17	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.22	0.05	0.42	0.00	0.20	0.03	0.19
N2	0.05	0.00	0.10	0.18	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.23	0.08	0.33	0.01	0.20	0.06	0.11
N3	0.03	0.01	0.11	0.17	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.05	0.32	0.01	0.17	0.11	0.08
N7	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.50	0.01	0.18	0.06	0.25
N9	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.38	0.01	0.16	0.17	0.09
O2'	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.10	0.01	0.06	0.06	0.22	0.00	0.02
O3'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.16	0.03	0.15	0.03	0.19	0.03	0.22	0.23	0.20	0.09	0.07	0.10	0.00	0.02	0.15	0.18	0.62	0.51	0.38
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.02	0.02	0.46	0.18
O5'	0.24	0.36	0.24	0.27	0.38	0.03	0.46	0.02	0.46	0.48	0.42	0.33	0.32	0.50	0.38	0.06	0.15	0.15	0.00	0.49	0.02	0.04	0.02
O6	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.02	0.49	0.00	0.20	0.02	0.28
OP1	0.12	0.19	0.34	0.51	0.17	0.21	0.19	0.31	0.20	0.17	0.20	0.20	0.17	0.18	0.16	0.22	0.62	0.02	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	0.07	0.15	0.35	0.11	0.14	0.06	0.11	0.01	0.13	0.03	0.06	0.11	0.06	0.17	0.00	0.51	0.46	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.17	0.33	0.12	0.04	0.21	0.06	0.23	0.19	0.19	0.11	0.08	0.25	0.09	0.02	0.38	0.18	0.02	0.28	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.01	0.60	0.60	0.05	0.20	0.03	0.32	0.09	0.06	0.09	0.07	0.12	0.02	0.12	0.50	0.77	0.59	0.58	0.92	1.01	0.74
C2	0.30	0.10	0.29	0.33	0.22	0.30	0.19	0.48	0.10	0.28	0.05	0.18	0.05	0.24	0.28	0.23	0.52	0.58	0.74	1.38	1.49	1.06
C2'	0.21	0.02	0.62	0.44	0.01	0.46	0.10	0.72	0.16	0.01	0.13	0.07	0.23	0.12	0.08	0.67	0.66	0.80	1.05	1.26	1.55	1.21
C3'	0.33	0.03	0.56	0.44	0.10	0.52	0.02	0.68	0.10	0.08	0.08	0.14	0.17	0.03	0.18	0.59	0.70	0.89	0.95	1.08	1.26	1.05
C4	0.22	0.05	0.47	0.61	0.13	0.07	0.09	0.12	0.01	0.16	0.02	0.12	0.03	0.11	0.18	0.30	0.79	0.44	0.33	0.86	0.84	0.54
C4'	0.40	0.11	0.52	0.48	0.19	0.44	0.09	0.51	0.03	0.18	0.03	0.21	0.01	0.09	0.26	0.52	0.76	0.87	0.75	0.88	0.93	0.81
C5	0.16	0.02	0.50	0.78	0.10	0.14	0.07	0.21	0.02	0.13	0.02	0.08	0.01	0.09	0.13	0.24	0.95	0.26	0.07	0.48	0.32	0.09
C5'	0.45	0.16	0.41	0.55	0.24	0.30	0.15	0.20	0.09	0.23	0.08	0.27	0.04	0.16	0.31	0.30	0.89	0.75	0.38	0.49	0.38	0.39
C6	0.19	0.05	0.43	0.70	0.13	0.10	0.12	0.16	0.07	0.18	0.02	0.10	0.05	0.15	0.17	0.18	0.88	0.27	0.01	0.58	0.42	0.17
C8	0.09	0.04	0.65	1.00	0.01	0.32	0.02	0.47	0.06	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.04	0.31	1.17	0.15	0.35	0.10	0.12	0.24
N1	0.26	0.09	0.33	0.49	0.19	0.12	0.18	0.18	0.11	0.25	0.06	0.15	0.08	0.22	0.24	0.18	0.67	0.43	0.39	1.03	1.00	0.65
N2	0.35	0.12	0.19	0.14	0.25	0.48	0.23	0.76	0.12	0.34	0.06	0.20	0.07	0.29	0.32	0.21	0.32	0.70	1.07	1.76	1.99	1.47
N3	0.30	0.09	0.35	0.35	0.20	0.32	0.15	0.50	0.06	0.24	0.02	0.17	0.01	0.18	0.26	0.29	0.54	0.62	0.79	1.36	1.49	1.08
N7	0.08	0.04	0.60	1.00	0.02	0.37	0.00	0.56	0.03	0.04	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05	0.25	1.17	0.09	0.46	0.03	0.25	0.37
N9	0.18	0.00	0.57	0.74	0.07	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.07	0.08	0.08	0.03	0.12	0.36	0.91	0.39	0.18	0.63	0.58	0.35
O2'	0.16	0.05	0.60	0.22	0.04	0.67	0.15	1.11	0.19	0.07	0.15	0.02	0.24	0.17	0.03	0.82	0.43	0.91	1.53	1.67	2.18	1.73
O3'	0.44	0.06	0.43	0.17	0.15	0.84	0.02	1.12	0.07	0.16	0.06	0.18	0.16	0.02	0.26	0.59	0.45	1.12	1.41	1.43	1.74	1.51
O4'	0.27	0.10	0.61	0.72	0.16	0.10	0.08	0.10	0.04	0.13	0.04	0.18	0.01	0.08	0.19	0.44	0.92	0.56	0.32	0.62	0.57	0.43
O5'	0.01	0.38	0.87	1.20	0.18	0.45	0.17	0.59	0.26	0.00	0.35	0.30	0.25	0.06	0.05	0.74	1.67	0.14	0.32	0.20	0.25	0.28
O6	0.16	0.04	0.44	0.79	0.11	0.22	0.11	0.35	0.07	0.16	0.03	0.08	0.07	0.15	0.14	0.14	0.96	0.17	0.25	0.34	0.08	0.11
OP1	0.36	0.16	1.01	1.52	0.26	1.00	0.23	1.39	0.17	0.32	0.14	0.23	0.15	0.28	0.32	0.75	1.99	0.41	1.16	1.24	1.36	1.25
OP2	0.94	0.83	1.69	2.26	0.91	1.54	0.84	1.85	0.76	0.88	0.74	0.94	0.69	0.84	0.93	1.27	2.50	0.96	1.69	1.56	1.68	1.69
P	0.65	0.25	1.41	1.95	0.47	1.29	0.42	1.56	0.30	0.57	0.22	0.39	0.27	0.49	0.58	1.10	2.41	0.66	1.30	1.24	1.31	1.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.45	0.39	0.26
C2	0.01	0.00	0.30	0.81	0.00	0.60	0.01	0.87	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.80	0.33	0.97	0.32	0.76	0.86
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.17	0.02	0.11	0.04	0.17	0.08	0.25	0.29	0.13	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.09	0.63	0.26	0.31
C3'	0.01	0.81	0.00	0.00	0.42	0.01	0.25	0.01	0.42	0.23	0.66	0.78	0.33	0.07	0.06	0.00	0.03	0.03	0.03	0.49	0.03	0.21
C4	0.01	0.00	0.17	0.42	0.00	0.27	0.01	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.39	0.17	0.26	0.35	0.15	0.07
C4'	0.00	0.60	0.02	0.01	0.27	0.00	0.12	0.01	0.24	0.26	0.46	0.58	0.16	0.15	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.11	0.25	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.27	0.06	0.02	0.73	0.56	0.27
C5'	0.07	0.87	0.04	0.01	0.29	0.01	0.06	0.00	0.28	0.53	0.64	0.79	0.14	0.37	0.11	0.05	0.10	0.05	0.00	0.06	0.10	0.02
C6	0.01	0.01	0.17	0.42	0.01	0.24	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.44	0.12	0.26	0.48	0.23	0.04
C8	0.00	0.01	0.08	0.23	0.00	0.26	0.00	0.53	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.16	0.17	0.72	1.41	1.30	1.04
N1	0.01	0.01	0.25	0.66	0.00	0.46	0.00	0.64	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.67	0.24	0.70	0.01	0.40	0.57
N3	0.01	0.00	0.29	0.78	0.00	0.58	0.01	0.79	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.17	0.72	0.34	0.85	0.24	0.57	0.70
N6	0.02	0.01	0.13	0.33	0.02	0.16	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.36	0.06	0.09	0.70	0.49	0.17
N7	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.54	1.33	1.24	0.90
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.01	0.22	0.74	0.63	0.42
O2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.07	0.04	0.05	0.08	0.06	0.13	0.17	0.06	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.43	0.17	0.20
O3'	0.03	0.80	0.04	0.03	0.39	0.05	0.27	0.10	0.44	0.16	0.67	0.72	0.36	0.02	0.09	0.04	0.00	0.04	0.13	0.29	0.20	0.07
O4'	0.01	0.33	0.01	0.03	0.17	0.01	0.06	0.05	0.12	0.17	0.24	0.34	0.06	0.10	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.11	0.25	0.09
O5'	0.16	0.97	0.09	0.03	0.26	0.02	0.02	0.00	0.26	0.72	0.70	0.85	0.09	0.54	0.22	0.03	0.13	0.11	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.45	0.32	0.63	0.49	0.35	0.06	0.73	0.06	0.48	1.41	0.01	0.24	0.70	1.33	0.74	0.43	0.29	0.11	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.39	0.76	0.26	0.03	0.15	0.03	0.56	0.10	0.23	1.30	0.40	0.57	0.49	1.24	0.63	0.17	0.20	0.25	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.26	0.86	0.31	0.21	0.07	0.05	0.27	0.02	0.04	1.04	0.57	0.70	0.17	0.90	0.42	0.20	0.07	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00