Doublet Group distance statistics: 53270

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C2	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O6	A	0, 0.000, 0.053, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.053 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.000, 0.113, 0.225, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.113 std_dev=0.113
O2'	A	0, 0.000, 0.240, 0.480, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.240 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.000, 0.246, 0.491, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.246 std_dev=0.246
C6	B	0, 0.000, 0.266, 0.532, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.266 std_dev=0.266
C5	B	0, 0.000, 0.266, 0.532, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.266 std_dev=0.266
C8	B	0, 0.000, 0.321, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.321
O3'	A	0, 0.000, 0.336, 0.671, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.336 std_dev=0.336
N6	B	0, 0.000, 0.345, 0.690, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.345 std_dev=0.345
N9	B	0, 0.000, 0.367, 0.734, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.367 std_dev=0.367
C4'	A	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
N7	B	0, 0.000, 0.378, 0.757, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.378 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.000, 0.413, 0.825, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.413 std_dev=0.413
N1	B	0, 0.000, 0.449, 0.898, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.449 std_dev=0.449
C1'	B	0, 0.000, 0.543, 1.085, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C2	B	0, 0.000, 0.674, 1.348, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.674 std_dev=0.674
N3	B	0, 0.000, 0.675, 1.351, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.675 std_dev=0.675
C5'	A	0, 0.000, 0.684, 1.369, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.684 std_dev=0.684
O5'	A	0, 0.000, 0.840, 1.681, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.840 std_dev=0.840
O4'	B	0, 0.000, 0.888, 1.776, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.888 std_dev=0.888
P	A	0, 0.000, 1.015, 2.030, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.015 std_dev=1.015
C4'	B	0, 0.000, 1.458, 2.916, 2.916 max_d=2.916 avg_d=1.458 std_dev=1.458
C2'	B	0, 0.000, 1.820, 3.640, 3.640 max_d=3.640 avg_d=1.820 std_dev=1.820
OP1	A	0, 0.000, 2.014, 4.028, 4.028 max_d=4.028 avg_d=2.014 std_dev=2.014
C3'	B	0, 0.000, 2.038, 4.077, 4.077 max_d=4.077 avg_d=2.038 std_dev=2.038
OP2	A	0, 0.000, 2.112, 4.223, 4.223 max_d=4.223 avg_d=2.112 std_dev=2.112
O3'	B	0, 0.000, 2.332, 4.663, 4.663 max_d=4.663 avg_d=2.332 std_dev=2.332
O2'	B	0, 0.000, 2.660, 5.319, 5.319 max_d=5.319 avg_d=2.660 std_dev=2.660
C5'	B	0, 0.000, 2.896, 5.792, 5.792 max_d=5.792 avg_d=2.896 std_dev=2.896
O5'	B	0, 0.000, 3.580, 7.159, 7.159 max_d=7.159 avg_d=3.580 std_dev=3.580
P	B	0, 0.000, 4.661, 9.323, 9.323 max_d=9.323 avg_d=4.661 std_dev=4.661
OP1	B	0, 0.000, 4.836, 9.671, 9.671 max_d=9.671 avg_d=4.836 std_dev=4.836
OP2	B	0, 0.000, 5.854, 11.709, 11.709 max_d=11.709 avg_d=5.854 std_dev=5.854

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.01	0.33	0.34	0.04
C2	0.05	0.00	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.06	0.03	0.26	0.02	0.05	0.90	0.25
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.01
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.12	0.09	0.10	0.06	0.06	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.20	0.14	0.01
C4	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.08	0.01	0.32	0.01	0.12	0.83	0.20
C4'	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.09	0.11	0.05	0.01	0.01	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.01	0.05
C5	0.01	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.11	0.01	0.44	0.00	0.09	1.06	0.30
C5'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.15	0.00	0.23	0.00	0.24	0.22	0.18	0.08	0.08	0.27	0.13	0.01	0.03	0.00	0.00	0.29	0.00	0.14	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.12	0.01	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.44	0.00	0.02	1.17	0.37
C8	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.04	0.46	0.02	0.39	0.82	0.16
N1	0.04	0.00	0.02	0.10	0.01	0.05	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.09	0.01	0.36	0.02	0.08	1.08	0.34
N2	0.05	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.04	0.04	0.21	0.03	0.11	0.86	0.24
N3	0.05	0.00	0.02	0.06	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.04	0.04	0.22	0.01	0.04	0.76	0.17
N7	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.51	0.02	0.23	1.07	0.30
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.30	0.00	0.29	0.65	0.09
O2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.11	0.00	0.15	0.18	0.15	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.11	0.01	0.18	0.02
O3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.03	0.11	0.09	0.09	0.04	0.04	0.11	0.06	0.02	0.00	0.00	0.23	0.13	0.44	0.01	0.03
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.14	0.03	0.50	0.13	0.14
O5'	0.14	0.26	0.01	0.12	0.32	0.00	0.44	0.00	0.44	0.46	0.36	0.21	0.22	0.51	0.30	0.03	0.23	0.14	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00
O6	0.01	0.02	0.01	0.13	0.01	0.12	0.00	0.29	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.11	0.13	0.03	0.51	0.00	0.07	1.31	0.45
OP1	0.33	0.05	0.01	0.20	0.12	0.10	0.09	0.00	0.02	0.39	0.08	0.11	0.04	0.23	0.29	0.01	0.44	0.50	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00
OP2	0.34	0.90	0.28	0.14	0.83	0.01	1.06	0.14	1.17	0.82	1.08	0.86	0.76	1.07	0.65	0.18	0.01	0.13	0.00	1.31	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.25	0.01	0.01	0.20	0.05	0.30	0.01	0.37	0.16	0.34	0.24	0.17	0.30	0.09	0.02	0.03	0.14	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.27	0.36	0.11	0.14	0.51	0.07	1.14	0.14	0.12	0.23	0.23	0.08	0.11	0.05	0.62	0.23	0.54	1.60	1.64	1.85	1.53
C2	0.08	0.22	0.25	0.37	0.00	0.10	0.11	0.29	0.01	0.23	0.20	0.13	0.10	0.28	0.10	0.09	0.27	0.28	0.76	0.75	0.54	0.46
C2'	0.07	0.29	0.35	0.13	0.13	0.52	0.06	1.18	0.14	0.12	0.25	0.24	0.08	0.13	0.04	0.62	0.28	0.53	1.68	1.84	2.06	1.68
C3'	0.12	0.38	0.48	0.18	0.19	0.58	0.10	1.35	0.19	0.12	0.33	0.33	0.11	0.12	0.08	0.88	0.43	0.59	1.81	2.04	2.42	1.94
C4	0.02	0.33	0.45	0.44	0.12	0.17	0.01	0.48	0.12	0.18	0.28	0.26	0.03	0.21	0.01	0.43	0.39	0.37	0.90	0.86	0.82	0.67
C4'	0.10	0.31	0.42	0.04	0.15	0.70	0.05	1.56	0.13	0.15	0.25	0.27	0.06	0.14	0.05	0.93	0.34	0.65	2.01	2.23	2.72	2.20
C5	0.06	0.41	0.62	0.69	0.16	0.04	0.02	0.12	0.11	0.14	0.31	0.34	0.01	0.18	0.03	0.53	0.58	0.28	0.48	0.40	0.29	0.20
C5'	0.20	0.45	0.61	0.16	0.26	0.67	0.14	1.58	0.22	0.09	0.38	0.41	0.14	0.08	0.13	1.22	0.55	0.61	1.95	2.21	2.87	2.25
C6	0.02	0.38	0.56	0.75	0.09	0.17	0.05	0.15	0.03	0.16	0.28	0.28	0.10	0.21	0.01	0.37	0.59	0.17	0.22	0.13	0.13	0.13
C8	0.18	0.40	0.82	0.65	0.25	0.16	0.12	0.54	0.17	0.06	0.31	0.39	0.07	0.07	0.14	0.94	0.65	0.44	0.83	0.74	0.87	0.66
N1	0.05	0.28	0.38	0.57	0.02	0.07	0.10	0.01	0.02	0.20	0.22	0.18	0.15	0.25	0.07	0.17	0.42	0.20	0.41	0.34	0.06	0.05
N2	0.11	0.15	0.13	0.28	0.05	0.13	0.13	0.32	0.04	0.24	0.12	0.07	0.14	0.28	0.13	0.07	0.17	0.27	0.82	0.84	0.59	0.51
N3	0.05	0.25	0.25	0.28	0.04	0.23	0.05	0.55	0.08	0.23	0.23	0.17	0.00	0.26	0.07	0.19	0.23	0.37	1.03	1.05	0.94	0.79
N7	0.15	0.45	0.85	0.86	0.24	0.08	0.08	0.10	0.14	0.07	0.32	0.43	0.03	0.10	0.12	0.83	0.77	0.29	0.39	0.31	0.28	0.17
N9	0.09	0.34	0.54	0.38	0.19	0.30	0.09	0.75	0.16	0.11	0.29	0.30	0.08	0.12	0.07	0.67	0.40	0.47	1.14	1.10	1.21	0.98
O2'	0.02	0.14	0.15	0.06	0.03	0.59	0.04	1.29	0.02	0.15	0.11	0.11	0.03	0.18	0.03	0.41	0.10	0.52	1.85	2.11	2.29	1.90
O3'	0.09	0.35	0.41	0.10	0.15	0.64	0.06	1.45	0.15	0.15	0.30	0.30	0.08	0.15	0.04	0.83	0.39	0.61	1.96	2.31	2.71	2.17
O4'	0.12	0.28	0.44	0.07	0.16	0.65	0.08	1.42	0.14	0.09	0.23	0.25	0.08	0.08	0.08	0.89	0.28	0.63	1.82	1.85	2.25	1.85
O5'	0.59	0.82	1.16	0.76	0.62	0.17	0.45	1.00	0.51	0.22	0.70	0.81	0.38	0.20	0.50	1.73	1.13	0.22	1.29	1.50	2.11	1.54
O6	0.05	0.39	0.65	0.92	0.10	0.35	0.05	0.46	0.00	0.13	0.24	0.31	0.14	0.19	0.01	0.42	0.73	0.07	0.13	0.25	0.59	0.52
OP1	0.78	0.14	0.17	0.59	0.47	1.62	0.47	2.31	0.27	0.83	0.12	0.30	0.24	0.68	0.70	0.40	0.23	1.65	2.44	2.49	3.03	2.61
OP2	0.67	1.37	1.31	0.98	0.96	0.06	0.81	0.74	0.99	0.37	1.26	1.25	0.88	0.46	0.68	1.78	1.36	0.11	0.94	1.18	1.78	1.25
P	0.14	0.57	0.80	0.42	0.28	0.60	0.16	1.32	0.29	0.13	0.48	0.50	0.21	0.09	0.11	1.37	0.82	0.69	1.50	1.65	2.24	1.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.08	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.25	0.00	0.30	0.19	0.17	0.15
C2	0.04	0.00	0.23	0.62	0.00	0.54	0.01	0.87	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.29	0.19	0.28	0.53	0.66	1.15	0.98
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.10	0.02	0.02	0.20	0.07	0.16	0.16	0.23	0.04	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.65	0.87	0.57	0.69
C3'	0.02	0.62	0.00	0.00	0.33	0.00	0.22	0.00	0.34	0.15	0.52	0.59	0.28	0.03	0.08	0.02	0.01	0.02	0.34	0.59	0.32	0.48
C4	0.03	0.00	0.10	0.33	0.00	0.25	0.01	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.00	0.14	0.06	0.07	0.30	0.28
C4'	0.01	0.54	0.02	0.00	0.25	0.00	0.11	0.00	0.22	0.25	0.41	0.52	0.15	0.15	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02
C5	0.02	0.01	0.02	0.22	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.04	0.05	0.34	0.21	0.01	0.02
C5'	0.08	0.87	0.20	0.00	0.30	0.00	0.06	0.00	0.28	0.55	0.64	0.79	0.14	0.40	0.12	0.01	0.17	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00
C6	0.03	0.00	0.07	0.34	0.01	0.22	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.04	0.11	0.12	0.03	0.35	0.31
C8	0.00	0.01	0.16	0.15	0.00	0.25	0.01	0.55	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.24	0.16	0.96	0.83	0.81	0.71
N1	0.04	0.00	0.16	0.52	0.00	0.41	0.01	0.64	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.32	0.14	0.21	0.28	0.44	0.88	0.75
N3	0.05	0.00	0.23	0.59	0.00	0.52	0.00	0.79	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.14	0.29	0.46	0.55	0.94	0.82
N6	0.02	0.00	0.04	0.28	0.01	0.15	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.02	0.07	0.27	0.14	0.16	0.15
N7	0.01	0.01	0.11	0.03	0.01	0.15	0.00	0.40	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.17	0.10	0.83	0.72	0.63	0.53
N9	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.15	0.01	0.45	0.32	0.23	0.19
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.24	0.19	0.27	0.01	0.31	0.16	0.32	0.24	0.32	0.23	0.14	0.00	0.06	0.12	0.43	0.84	0.46	0.61
O3'	0.25	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.17	0.04	0.24	0.14	0.14	0.02	0.17	0.15	0.06	0.00	0.18	0.02	0.34	0.04	0.24
O4'	0.00	0.28	0.02	0.02	0.14	0.01	0.05	0.00	0.11	0.16	0.21	0.29	0.07	0.10	0.01	0.12	0.18	0.00	0.00	0.28	0.08	0.21
O5'	0.30	0.53	0.65	0.34	0.06	0.00	0.34	0.00	0.12	0.96	0.28	0.46	0.27	0.83	0.45	0.43	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.19	0.66	0.87	0.59	0.07	0.04	0.21	0.03	0.03	0.83	0.44	0.55	0.14	0.72	0.32	0.84	0.34	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	1.15	0.57	0.32	0.30	0.07	0.01	0.06	0.35	0.81	0.88	0.94	0.16	0.63	0.23	0.46	0.04	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.98	0.69	0.48	0.28	0.02	0.02	0.00	0.31	0.71	0.75	0.82	0.15	0.53	0.19	0.61	0.24	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00