Doublet Group distance statistics: 53286

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 22, 16, 8, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.030 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.011, 0.035, 0.059, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.035 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.002, 0.029, 0.056, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.029 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.008, 0.035, 0.063, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.035 std_dev=0.027
C5	B	0, 0.096, 0.201, 0.307, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.201 std_dev=0.105
C4	B	0, 0.091, 0.198, 0.304, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.198 std_dev=0.107
C6	B	0, 0.125, 0.233, 0.341, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.233 std_dev=0.108
N9	B	0, 0.078, 0.188, 0.298, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.188 std_dev=0.110
C1'	B	0, 0.097, 0.217, 0.336, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.217 std_dev=0.119
N7	B	0, 0.087, 0.207, 0.327, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.207 std_dev=0.120
O6	B	0, 0.151, 0.272, 0.392, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.272 std_dev=0.120
N1	B	0, 0.132, 0.255, 0.377, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.255 std_dev=0.122
C8	B	0, 0.068, 0.190, 0.313, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.190 std_dev=0.123
N3	B	0, 0.108, 0.236, 0.364, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.236 std_dev=0.128
O4'	B	0, 0.095, 0.225, 0.354, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.225 std_dev=0.129
C2	B	0, 0.121, 0.259, 0.397, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.259 std_dev=0.138
C2'	B	0, 0.140, 0.282, 0.424, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.282 std_dev=0.142
C4'	B	0, 0.121, 0.280, 0.440, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.280 std_dev=0.159
O2'	B	0, 0.181, 0.348, 0.515, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.348 std_dev=0.167
N2	B	0, 0.130, 0.313, 0.497, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.313 std_dev=0.184
C3'	B	0, 0.120, 0.306, 0.491, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.306 std_dev=0.185
C5'	B	0, 0.110, 0.313, 0.515, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.313 std_dev=0.203
O3'	B	0, 0.162, 0.407, 0.652, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.407 std_dev=0.245
O5'	B	0, 0.031, 0.359, 0.686, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.359 std_dev=0.328
P	B	0, -0.035, 0.325, 0.685, 2.489 max_d=2.489 avg_d=0.325 std_dev=0.360
O4'	A	0, -0.266, 0.183, 0.632, 2.026 max_d=2.026 avg_d=0.183 std_dev=0.449
C2'	A	0, -0.279, 0.212, 0.704, 2.206 max_d=2.206 avg_d=0.212 std_dev=0.492
O2'	A	0, -0.249, 0.279, 0.807, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.279 std_dev=0.528
OP1	B	0, -0.113, 0.481, 1.075, 2.413 max_d=2.413 avg_d=0.481 std_dev=0.594
C4'	A	0, -0.349, 0.312, 0.973, 2.979 max_d=2.979 avg_d=0.312 std_dev=0.661
OP2	B	0, -0.230, 0.510, 1.249, 3.374 max_d=3.374 avg_d=0.510 std_dev=0.740
C3'	A	0, -0.392, 0.358, 1.108, 3.408 max_d=3.408 avg_d=0.358 std_dev=0.750
O3'	A	0, -0.538, 0.537, 1.612, 4.873 max_d=4.873 avg_d=0.537 std_dev=1.075
C5'	A	0, -0.654, 0.509, 1.671, 5.226 max_d=5.226 avg_d=0.509 std_dev=1.163
O5'	A	0, -0.620, 0.546, 1.713, 5.093 max_d=5.093 avg_d=0.546 std_dev=1.167
OP2	A	0, -0.720, 0.830, 2.380, 7.178 max_d=7.178 avg_d=0.830 std_dev=1.550
P	A	0, -0.853, 0.743, 2.338, 7.427 max_d=7.427 avg_d=0.743 std_dev=1.595
OP1	A	0, -1.118, 1.040, 3.198, 9.894 max_d=9.894 avg_d=1.040 std_dev=2.158

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.21	0.17	0.10
C2	0.03	0.00	0.29	0.25	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.31	0.14	0.30	0.01	0.18	0.34	0.18
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.12	0.02	0.02	0.01	0.08	0.20	0.20	0.37	0.30	0.13	0.03	0.00	0.01	0.00	0.19	0.03	0.11	0.28	0.15
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.06	0.21	0.15	0.35	0.25	0.18	0.08	0.01	0.01	0.02	0.28	0.08	0.18	0.36	0.24
C4	0.01	0.01	0.12	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.08	0.06	0.25	0.01	0.24	0.25	0.14
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.08	0.11	0.08	0.04	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.07	0.10	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.28	0.02	0.33	0.24	0.20
C5'	0.02	0.22	0.01	0.02	0.14	0.00	0.13	0.00	0.16	0.05	0.19	0.25	0.20	0.08	0.07	0.05	0.05	0.01	0.01	0.15	0.15	0.11	0.02
C6	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.04	0.32	0.00	0.32	0.26	0.21
C8	0.01	0.01	0.20	0.21	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.25	0.10	0.22	0.03	0.38	0.20	0.21
N1	0.02	0.00	0.20	0.15	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.09	0.33	0.01	0.25	0.30	0.21
N2	0.03	0.00	0.37	0.35	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.46	0.18	0.31	0.01	0.18	0.41	0.23
N3	0.03	0.00	0.30	0.25	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.30	0.15	0.26	0.00	0.14	0.32	0.14
N7	0.01	0.01	0.13	0.18	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.23	0.08	0.27	0.03	0.40	0.22	0.23
N9	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.19	0.02	0.28	0.21	0.15
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.12	0.05	0.05	0.05	0.10	0.12	0.20	0.34	0.25	0.08	0.02	0.00	0.03	0.03	0.08	0.06	0.14	0.25	0.06
O3'	0.01	0.31	0.01	0.01	0.08	0.03	0.08	0.05	0.07	0.25	0.18	0.46	0.30	0.23	0.08	0.03	0.00	0.02	0.26	0.10	0.27	0.51	0.29
O4'	0.00	0.14	0.00	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.10	0.09	0.18	0.15	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.22	0.21	0.14
O5'	0.11	0.30	0.19	0.28	0.25	0.02	0.28	0.01	0.32	0.22	0.33	0.31	0.26	0.27	0.19	0.08	0.26	0.07	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.02	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.10	0.03	0.34	0.00	0.37	0.26	0.24
OP1	0.21	0.18	0.11	0.18	0.24	0.10	0.33	0.15	0.32	0.38	0.25	0.18	0.14	0.40	0.28	0.14	0.27	0.22	0.01	0.37	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.34	0.28	0.36	0.25	0.14	0.24	0.11	0.26	0.20	0.30	0.41	0.32	0.22	0.21	0.25	0.51	0.21	0.01	0.26	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.18	0.15	0.24	0.14	0.03	0.20	0.02	0.21	0.21	0.21	0.23	0.14	0.23	0.15	0.06	0.29	0.14	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.14	0.10	0.20	0.12	0.09	0.12	0.13	0.12	0.12	0.09	0.13	0.13	0.12	0.30	0.14	0.59	0.42	0.19
C2	0.10	0.14	0.10	0.13	0.09	0.13	0.08	0.18	0.10	0.11	0.13	0.16	0.12	0.12	0.09	0.11	0.13	0.12	0.25	0.13	0.60	0.55	0.30
C2'	0.23	0.14	0.26	0.34	0.11	0.41	0.18	0.49	0.24	0.10	0.20	0.13	0.11	0.20	0.12	0.34	0.38	0.32	0.50	0.31	0.39	0.48	0.30
C3'	0.52	0.23	0.62	0.76	0.31	0.77	0.21	0.90	0.14	0.40	0.16	0.23	0.31	0.24	0.42	0.64	0.82	0.63	0.99	0.13	0.35	1.01	0.84
C4	0.10	0.13	0.09	0.10	0.09	0.12	0.09	0.17	0.11	0.09	0.12	0.15	0.12	0.11	0.07	0.11	0.10	0.11	0.25	0.13	0.62	0.45	0.24
C4'	0.35	0.26	0.43	0.57	0.31	0.52	0.31	0.64	0.27	0.40	0.25	0.24	0.28	0.37	0.35	0.41	0.62	0.39	0.82	0.27	0.29	1.01	0.76
C5	0.08	0.13	0.09	0.08	0.07	0.11	0.08	0.15	0.10	0.10	0.11	0.15	0.12	0.12	0.06	0.12	0.09	0.11	0.23	0.12	0.61	0.39	0.23
C5'	0.53	0.49	0.65	0.83	0.55	0.71	0.59	0.84	0.56	0.67	0.50	0.46	0.50	0.68	0.58	0.57	0.89	0.55	1.08	0.57	0.51	1.43	1.06
C6	0.09	0.14	0.09	0.09	0.07	0.11	0.08	0.15	0.09	0.11	0.11	0.17	0.13	0.12	0.08	0.12	0.09	0.12	0.23	0.11	0.59	0.43	0.26
C8	0.10	0.12	0.10	0.08	0.09	0.09	0.10	0.14	0.11	0.12	0.11	0.14	0.12	0.13	0.08	0.13	0.09	0.08	0.24	0.13	0.62	0.30	0.17
N1	0.10	0.14	0.09	0.11	0.09	0.12	0.08	0.17	0.09	0.11	0.12	0.17	0.13	0.13	0.09	0.12	0.11	0.12	0.24	0.11	0.59	0.50	0.29
N2	0.11	0.14	0.11	0.14	0.10	0.14	0.09	0.20	0.11	0.12	0.13	0.16	0.12	0.12	0.10	0.11	0.15	0.13	0.26	0.13	0.58	0.60	0.32
N3	0.11	0.13	0.10	0.13	0.09	0.14	0.08	0.19	0.11	0.10	0.12	0.15	0.12	0.10	0.09	0.11	0.13	0.12	0.26	0.14	0.61	0.53	0.28
N7	0.08	0.12	0.09	0.07	0.08	0.10	0.10	0.14	0.10	0.12	0.10	0.14	0.12	0.13	0.07	0.13	0.09	0.09	0.22	0.12	0.60	0.30	0.19
N9	0.10	0.12	0.10	0.10	0.09	0.12	0.10	0.17	0.11	0.10	0.11	0.14	0.12	0.12	0.08	0.12	0.10	0.10	0.26	0.13	0.63	0.39	0.20
O2'	0.14	0.23	0.14	0.16	0.22	0.22	0.31	0.27	0.35	0.25	0.30	0.22	0.19	0.35	0.18	0.20	0.19	0.17	0.27	0.40	0.55	0.43	0.21
O3'	0.65	0.28	0.79	0.97	0.37	0.99	0.23	1.15	0.15	0.44	0.18	0.29	0.38	0.24	0.50	0.85	1.08	0.77	1.20	0.16	0.69	1.16	1.14
O4'	0.14	0.14	0.18	0.28	0.16	0.23	0.21	0.34	0.21	0.25	0.16	0.14	0.14	0.28	0.17	0.16	0.29	0.16	0.53	0.25	0.35	0.73	0.43
O5'	0.21	0.15	0.32	0.53	0.22	0.44	0.31	0.62	0.30	0.39	0.22	0.13	0.14	0.42	0.26	0.25	0.61	0.26	0.85	0.38	0.43	1.30	0.88
O6	0.10	0.15	0.10	0.10	0.08	0.12	0.09	0.15	0.10	0.12	0.12	0.19	0.14	0.13	0.09	0.13	0.09	0.13	0.23	0.12	0.55	0.41	0.25
OP1	0.47	0.34	0.64	0.90	0.44	0.75	0.51	0.94	0.47	0.62	0.36	0.32	0.38	0.65	0.50	0.55	1.02	0.53	1.19	0.55	0.77	1.75	1.26
OP2	0.68	0.68	0.82	1.00	0.75	0.83	0.83	0.92	0.83	0.85	0.74	0.63	0.68	0.93	0.75	0.72	1.08	0.67	1.14	0.90	0.63	1.56	1.09
P	0.36	0.26	0.50	0.73	0.36	0.61	0.44	0.78	0.42	0.54	0.31	0.21	0.28	0.58	0.41	0.41	0.83	0.42	1.01	0.50	0.54	1.52	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.02	0.42	0.21	0.21
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.02	0.24	0.01	0.49	0.40	0.33
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.09	0.07	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.03	0.25	0.20	0.16
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.10	0.07	0.09	0.07	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.15	0.10	0.12	0.22	0.13
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.23	0.01	0.51	0.40	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.05	0.03	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.06	0.16	0.10	0.06
C5	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.27	0.01	0.55	0.50	0.38
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.08	0.05	0.05	0.15	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.13	0.06	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.29	0.00	0.54	0.55	0.40
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.26	0.02	0.56	0.44	0.36
N1	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.27	0.01	0.52	0.49	0.37
N2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.03	0.23	0.01	0.47	0.37	0.32
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.09	0.02	0.21	0.01	0.47	0.35	0.31
N7	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.29	0.02	0.58	0.54	0.40
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.21	0.02	0.50	0.35	0.30
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.10	0.15	0.11	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.06	0.19	0.17	0.08
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.09	0.04	0.10	0.11	0.09	0.13	0.09	0.12	0.05	0.05	0.00	0.01	0.16	0.12	0.17	0.26	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.02	0.42	0.18	0.19
O5'	0.13	0.24	0.12	0.15	0.23	0.02	0.27	0.01	0.29	0.26	0.27	0.23	0.21	0.29	0.21	0.05	0.16	0.13	0.00	0.31	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.12	0.02	0.31	0.00	0.55	0.62	0.42
OP1	0.42	0.49	0.25	0.12	0.51	0.16	0.55	0.06	0.54	0.56	0.52	0.47	0.47	0.58	0.50	0.19	0.17	0.42	0.02	0.55	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.40	0.20	0.22	0.40	0.10	0.50	0.14	0.55	0.44	0.49	0.37	0.35	0.54	0.35	0.17	0.26	0.18	0.01	0.62	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.33	0.16	0.13	0.33	0.06	0.38	0.01	0.40	0.36	0.37	0.32	0.31	0.40	0.30	0.08	0.13	0.19	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00