Doublet Group distance statistics: 53287

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 13, 15, 4, 3, 1, 4, 3, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.014, 0.021, 0.028, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.014, 0.023, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.035, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.020, 0.035, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.035 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.021, 0.037, 0.053, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.016, 0.032, 0.049, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.035, 0.053, 0.071, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.053 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.033 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.017, 0.038, 0.058, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.038 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.022, 0.046, 0.071, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.028, 0.061, 0.093, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.061 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.018, 0.158, 0.299, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.158 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.065, 0.215, 0.365, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.215 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.147, 0.356, 0.566, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.356 std_dev=0.210
C4'	A	0, 0.106, 0.320, 0.533, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.320 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.074, 0.294, 0.514, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.294 std_dev=0.220
C3'	A	0, 0.134, 0.368, 0.602, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.368 std_dev=0.234
C4	B	0, 0.073, 0.316, 0.560, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.316 std_dev=0.243
C2	B	0, 0.030, 0.291, 0.551, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.291 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.122, 0.392, 0.661, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.392 std_dev=0.270
N9	B	0, 0.082, 0.356, 0.629, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.356 std_dev=0.273
N1	B	0, 0.024, 0.320, 0.615, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.320 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.054, 0.354, 0.654, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.354 std_dev=0.300
N2	B	0, 0.017, 0.323, 0.629, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.323 std_dev=0.306
C6	B	0, 0.044, 0.363, 0.683, 1.470 max_d=1.470 avg_d=0.363 std_dev=0.320
O3'	A	0, 0.203, 0.546, 0.888, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.546 std_dev=0.342
C8	B	0, 0.071, 0.420, 0.768, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.420 std_dev=0.348
N7	B	0, 0.063, 0.424, 0.786, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.424 std_dev=0.362
C5'	A	0, 0.144, 0.517, 0.889, 2.127 max_d=2.127 avg_d=0.517 std_dev=0.373
O5'	A	0, 0.140, 0.519, 0.899, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.519 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.106, 0.487, 0.868, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.487 std_dev=0.381
O6	B	0, 0.049, 0.440, 0.831, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.440 std_dev=0.391
C2'	B	0, 0.143, 0.558, 0.973, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.558 std_dev=0.415
P	A	0, 0.100, 0.597, 1.095, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.597 std_dev=0.498
O2'	B	0, 0.159, 0.666, 1.174, 2.798 max_d=2.798 avg_d=0.666 std_dev=0.507
OP2	A	0, 0.102, 0.668, 1.235, 2.925 max_d=2.925 avg_d=0.668 std_dev=0.567
C4'	B	0, 0.127, 0.698, 1.268, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.698 std_dev=0.570
C3'	B	0, 0.163, 0.749, 1.334, 2.393 max_d=2.393 avg_d=0.749 std_dev=0.585
OP1	A	0, 0.107, 0.707, 1.307, 2.826 max_d=2.826 avg_d=0.707 std_dev=0.600
O3'	B	0, 0.270, 1.032, 1.794, 2.846 max_d=2.846 avg_d=1.032 std_dev=0.762
C5'	B	0, 0.074, 0.840, 1.606, 3.243 max_d=3.243 avg_d=0.840 std_dev=0.766
O5'	B	0, 0.071, 0.842, 1.613, 5.128 max_d=5.128 avg_d=0.842 std_dev=0.771
P	B	0, -0.157, 0.855, 1.867, 6.624 max_d=6.624 avg_d=0.855 std_dev=1.012
OP2	B	0, 0.017, 1.072, 2.128, 6.998 max_d=6.998 avg_d=1.072 std_dev=1.055
OP1	B	0, -0.055, 1.139, 2.334, 7.126 max_d=7.126 avg_d=1.139 std_dev=1.194

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.10	0.02	0.12	0.17	0.10
C2	0.03	0.00	0.13	0.19	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.25	0.05	0.23	0.02	0.22	0.33	0.24
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.06	0.11	0.15	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.17	0.08	0.20	0.15	0.15
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.14	0.01	0.14	0.04	0.16	0.12	0.19	0.21	0.17	0.12	0.08	0.03	0.01	0.02	0.24	0.17	0.27	0.14	0.20
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.24	0.01	0.23	0.31	0.24
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.09	0.10	0.08	0.07	0.10	0.06	0.08	0.04	0.01	0.02	0.11	0.10	0.16	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.14	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.03	0.30	0.01	0.30	0.39	0.31
C5'	0.03	0.14	0.03	0.04	0.14	0.01	0.17	0.00	0.19	0.15	0.17	0.14	0.12	0.18	0.11	0.07	0.07	0.02	0.01	0.21	0.11	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.20	0.03	0.31	0.01	0.33	0.43	0.33
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.15	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.13	0.03	0.30	0.02	0.28	0.32	0.29
N1	0.04	0.01	0.11	0.19	0.02	0.10	0.01	0.17	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.24	0.05	0.28	0.02	0.28	0.39	0.29
N2	0.04	0.01	0.15	0.21	0.02	0.08	0.02	0.14	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.17	0.29	0.05	0.22	0.03	0.21	0.32	0.22
N3	0.03	0.01	0.13	0.17	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.22	0.04	0.20	0.02	0.19	0.28	0.20
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.33	0.02	0.34	0.42	0.35
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.21	0.02	0.20	0.25	0.20
O2'	0.03	0.14	0.00	0.03	0.08	0.08	0.06	0.07	0.09	0.05	0.12	0.17	0.13	0.05	0.03	0.00	0.09	0.08	0.09	0.08	0.16	0.13	0.09
O3'	0.03	0.25	0.04	0.01	0.16	0.04	0.16	0.07	0.20	0.13	0.24	0.29	0.22	0.14	0.08	0.09	0.00	0.03	0.24	0.21	0.34	0.18	0.24
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.08	0.03	0.00	0.10	0.03	0.11	0.20	0.11
O5'	0.10	0.23	0.17	0.24	0.24	0.02	0.30	0.01	0.31	0.30	0.28	0.22	0.20	0.33	0.21	0.09	0.24	0.10	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.17	0.01	0.11	0.01	0.21	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.21	0.03	0.34	0.00	0.38	0.48	0.38
OP1	0.12	0.22	0.20	0.27	0.23	0.10	0.30	0.11	0.33	0.28	0.28	0.21	0.19	0.34	0.20	0.16	0.34	0.11	0.02	0.38	0.00	0.03	0.01
OP2	0.17	0.33	0.15	0.14	0.31	0.16	0.39	0.23	0.43	0.32	0.39	0.32	0.28	0.42	0.25	0.13	0.18	0.20	0.02	0.48	0.03	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.15	0.20	0.24	0.03	0.31	0.02	0.33	0.29	0.29	0.22	0.20	0.35	0.20	0.09	0.24	0.11	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.18	0.33	0.28	0.17	0.24	0.20	0.28	0.20	0.24	0.19	0.28	0.16	0.24	0.20	0.41	0.33	0.22	0.39	0.24	0.61	0.80	0.58
C2	0.17	0.24	0.21	0.18	0.13	0.19	0.16	0.26	0.16	0.25	0.20	0.32	0.18	0.24	0.17	0.28	0.21	0.18	0.35	0.17	0.59	0.79	0.55
C2'	0.27	0.18	0.40	0.32	0.21	0.29	0.24	0.32	0.22	0.31	0.19	0.27	0.18	0.30	0.26	0.52	0.40	0.25	0.46	0.25	0.68	0.85	0.65
C3'	0.27	0.19	0.39	0.32	0.21	0.29	0.24	0.33	0.22	0.31	0.20	0.29	0.18	0.31	0.26	0.50	0.38	0.27	0.47	0.27	0.69	0.85	0.66
C4	0.18	0.19	0.26	0.23	0.15	0.20	0.19	0.26	0.17	0.25	0.16	0.30	0.15	0.26	0.19	0.31	0.26	0.18	0.35	0.21	0.59	0.78	0.54
C4'	0.23	0.21	0.35	0.30	0.19	0.26	0.21	0.29	0.21	0.25	0.21	0.31	0.19	0.25	0.21	0.44	0.37	0.24	0.41	0.25	0.63	0.81	0.60
C5	0.18	0.19	0.24	0.25	0.16	0.19	0.21	0.27	0.19	0.27	0.17	0.29	0.15	0.29	0.20	0.26	0.25	0.17	0.33	0.23	0.58	0.74	0.51
C5'	0.25	0.24	0.37	0.32	0.21	0.28	0.22	0.31	0.22	0.27	0.22	0.34	0.22	0.27	0.23	0.44	0.39	0.26	0.42	0.26	0.63	0.80	0.60
C6	0.17	0.21	0.21	0.23	0.14	0.18	0.18	0.27	0.16	0.26	0.20	0.29	0.16	0.28	0.18	0.22	0.23	0.16	0.32	0.20	0.57	0.71	0.48
C8	0.19	0.18	0.30	0.29	0.20	0.21	0.25	0.28	0.25	0.27	0.20	0.26	0.17	0.30	0.22	0.31	0.30	0.19	0.34	0.30	0.60	0.76	0.53
N1	0.16	0.25	0.18	0.20	0.13	0.17	0.16	0.25	0.18	0.25	0.24	0.31	0.18	0.25	0.16	0.22	0.19	0.16	0.32	0.20	0.57	0.73	0.49
N2	0.18	0.25	0.20	0.18	0.17	0.23	0.18	0.29	0.19	0.26	0.22	0.30	0.21	0.25	0.18	0.30	0.23	0.22	0.40	0.20	0.63	0.84	0.59
N3	0.18	0.20	0.26	0.21	0.13	0.21	0.16	0.27	0.14	0.24	0.16	0.32	0.16	0.24	0.18	0.34	0.25	0.20	0.38	0.17	0.60	0.81	0.57
N7	0.19	0.18	0.27	0.29	0.19	0.21	0.25	0.29	0.24	0.28	0.19	0.26	0.16	0.31	0.22	0.27	0.29	0.18	0.33	0.30	0.59	0.74	0.51
N9	0.19	0.18	0.30	0.27	0.18	0.22	0.22	0.27	0.21	0.26	0.19	0.28	0.16	0.27	0.20	0.35	0.30	0.20	0.36	0.26	0.60	0.78	0.55
O2'	0.29	0.18	0.42	0.35	0.23	0.32	0.24	0.35	0.21	0.31	0.19	0.26	0.19	0.30	0.28	0.57	0.43	0.28	0.49	0.24	0.70	0.85	0.67
O3'	0.32	0.20	0.43	0.36	0.24	0.34	0.27	0.38	0.24	0.36	0.21	0.27	0.20	0.34	0.31	0.55	0.43	0.32	0.53	0.28	0.75	0.88	0.71
O4'	0.23	0.22	0.34	0.30	0.20	0.27	0.21	0.30	0.22	0.23	0.22	0.32	0.21	0.24	0.21	0.42	0.37	0.25	0.39	0.26	0.60	0.78	0.57
O5'	0.22	0.26	0.35	0.33	0.22	0.25	0.24	0.29	0.28	0.22	0.28	0.32	0.23	0.24	0.21	0.40	0.39	0.22	0.34	0.32	0.60	0.79	0.56
O6	0.17	0.21	0.20	0.26	0.15	0.19	0.18	0.29	0.17	0.26	0.21	0.27	0.15	0.28	0.18	0.19	0.25	0.17	0.33	0.22	0.56	0.68	0.46
OP1	0.23	0.27	0.37	0.35	0.23	0.26	0.26	0.31	0.29	0.24	0.29	0.33	0.24	0.27	0.22	0.42	0.41	0.23	0.36	0.35	0.63	0.80	0.58
OP2	0.31	0.28	0.38	0.38	0.30	0.32	0.33	0.40	0.34	0.35	0.31	0.30	0.28	0.37	0.31	0.38	0.40	0.31	0.42	0.39	0.63	0.88	0.63
P	0.22	0.24	0.34	0.33	0.21	0.24	0.25	0.30	0.28	0.24	0.27	0.29	0.22	0.27	0.21	0.37	0.37	0.22	0.34	0.34	0.60	0.80	0.56

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.17	0.02	0.19	0.37	0.15
C2	0.03	0.00	0.19	0.23	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.26	0.09	0.31	0.02	0.44	0.61	0.40
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.02	0.09	0.05	0.11	0.10	0.16	0.22	0.18	0.09	0.04	0.01	0.03	0.03	0.19	0.10	0.22	0.29	0.15
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.18	0.01	0.20	0.03	0.23	0.17	0.24	0.24	0.20	0.20	0.12	0.04	0.01	0.02	0.26	0.24	0.27	0.17	0.18
C4	0.01	0.01	0.11	0.18	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.05	0.32	0.01	0.35	0.51	0.32
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.13	0.12	0.12	0.10	0.13	0.07	0.12	0.03	0.01	0.02	0.13	0.13	0.29	0.07
C5	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.20	0.04	0.41	0.01	0.41	0.55	0.39
C5'	0.06	0.20	0.05	0.03	0.19	0.01	0.24	0.00	0.26	0.24	0.24	0.20	0.17	0.27	0.16	0.09	0.09	0.02	0.01	0.28	0.13	0.28	0.02
C6	0.01	0.01	0.11	0.23	0.01	0.12	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.24	0.05	0.42	0.01	0.48	0.62	0.44
C8	0.01	0.01	0.10	0.17	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.17	0.07	0.44	0.02	0.29	0.43	0.32
N1	0.02	0.01	0.16	0.24	0.01	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.26	0.07	0.37	0.01	0.48	0.63	0.43
N2	0.03	0.01	0.22	0.24	0.01	0.12	0.02	0.20	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.30	0.10	0.30	0.03	0.47	0.64	0.42
N3	0.03	0.01	0.18	0.20	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.21	0.08	0.27	0.01	0.38	0.56	0.34
N7	0.01	0.01	0.09	0.20	0.00	0.13	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.20	0.06	0.48	0.02	0.39	0.53	0.41
N9	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.31	0.02	0.25	0.41	0.23
O2'	0.03	0.13	0.01	0.04	0.07	0.12	0.11	0.09	0.11	0.17	0.10	0.18	0.12	0.17	0.08	0.00	0.09	0.11	0.15	0.13	0.20	0.29	0.10
O3'	0.09	0.26	0.03	0.01	0.16	0.03	0.20	0.09	0.24	0.17	0.26	0.30	0.21	0.20	0.09	0.09	0.00	0.06	0.26	0.26	0.38	0.18	0.23
O4'	0.01	0.09	0.03	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.10	0.08	0.06	0.02	0.11	0.06	0.00	0.12	0.06	0.20	0.41	0.18
O5'	0.17	0.31	0.19	0.26	0.32	0.02	0.41	0.01	0.42	0.44	0.37	0.30	0.27	0.48	0.31	0.15	0.26	0.12	0.00	0.46	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.24	0.01	0.13	0.01	0.28	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.13	0.26	0.06	0.46	0.00	0.52	0.66	0.49
OP1	0.19	0.44	0.22	0.27	0.35	0.13	0.41	0.13	0.48	0.29	0.48	0.47	0.38	0.39	0.25	0.20	0.38	0.20	0.03	0.52	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.61	0.29	0.17	0.51	0.29	0.55	0.28	0.62	0.43	0.63	0.64	0.56	0.53	0.41	0.29	0.18	0.41	0.03	0.66	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.40	0.15	0.18	0.32	0.07	0.39	0.02	0.44	0.32	0.43	0.42	0.34	0.41	0.23	0.10	0.23	0.18	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00