Doublet Group distance statistics: 53288

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 7, 7, 5, 4, 3, 5, 2, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.010, 0.027, 0.045, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.041, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.023 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.003, 0.020, 0.038, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.020 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.015, 0.046, 0.077, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.046 std_dev=0.031
O6	A	0, -0.004, 0.036, 0.075, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.036 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.032, 0.142, 0.252, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.142 std_dev=0.110
C2'	A	0, 0.062, 0.184, 0.307, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.184 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.119, 0.269, 0.420, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.269 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.127, 0.286, 0.445, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.286 std_dev=0.159
C3'	A	0, 0.138, 0.304, 0.470, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.304 std_dev=0.166
O5'	A	0, 0.153, 0.374, 0.595, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.374 std_dev=0.221
P	A	0, 0.188, 0.423, 0.658, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.423 std_dev=0.235
C2	B	0, 0.107, 0.347, 0.588, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.347 std_dev=0.241
N3	B	0, 0.120, 0.372, 0.623, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.372 std_dev=0.252
OP2	A	0, 0.223, 0.476, 0.728, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.476 std_dev=0.253
C4	B	0, 0.132, 0.387, 0.642, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.387 std_dev=0.255
O3'	A	0, 0.203, 0.459, 0.715, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.459 std_dev=0.256
N2	B	0, 0.137, 0.396, 0.654, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.396 std_dev=0.258
N1	B	0, 0.091, 0.350, 0.609, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.350 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.142, 0.406, 0.671, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.406 std_dev=0.265
C6	B	0, 0.117, 0.392, 0.667, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.392 std_dev=0.275
C5'	A	0, 0.139, 0.424, 0.709, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.424 std_dev=0.285
N9	B	0, 0.134, 0.433, 0.732, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.433 std_dev=0.299
N7	B	0, 0.171, 0.479, 0.787, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.479 std_dev=0.308
OP1	A	0, 0.213, 0.527, 0.842, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.527 std_dev=0.314
O6	B	0, 0.139, 0.460, 0.781, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.460 std_dev=0.321
C8	B	0, 0.157, 0.479, 0.801, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.479 std_dev=0.322
C1'	B	0, 0.159, 0.503, 0.847, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.503 std_dev=0.344
O4'	B	0, 0.213, 0.601, 0.990, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.601 std_dev=0.389
P	B	0, 0.328, 0.735, 1.141, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.735 std_dev=0.407
C2'	B	0, 0.223, 0.668, 1.113, 2.034 max_d=2.034 avg_d=0.668 std_dev=0.445
O5'	B	0, 0.290, 0.757, 1.224, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.757 std_dev=0.467
OP1	B	0, 0.355, 0.830, 1.305, 1.808 max_d=1.808 avg_d=0.830 std_dev=0.475
C4'	B	0, 0.264, 0.748, 1.231, 2.201 max_d=2.201 avg_d=0.748 std_dev=0.483
C3'	B	0, 0.322, 0.839, 1.357, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.839 std_dev=0.517
C5'	B	0, 0.251, 0.780, 1.308, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.780 std_dev=0.528
O2'	B	0, 0.281, 0.818, 1.356, 2.844 max_d=2.844 avg_d=0.818 std_dev=0.537
OP2	B	0, 0.360, 0.945, 1.529, 3.353 max_d=3.353 avg_d=0.945 std_dev=0.584
O3'	B	0, 0.521, 1.208, 1.895, 2.989 max_d=2.989 avg_d=1.208 std_dev=0.687

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.02	0.09	0.19	0.08
C2	0.05	0.00	0.11	0.15	0.02	0.07	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.19	0.06	0.13	0.02	0.14	0.27	0.15
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.13	0.11	0.06	0.03	0.01	0.04	0.01	0.11	0.07	0.17	0.14	0.08
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.13	0.09	0.14	0.17	0.13	0.10	0.06	0.03	0.01	0.02	0.15	0.13	0.22	0.13	0.12
C4	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.12	0.02	0.13	0.25	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.07	0.08	0.06	0.08	0.04	0.07	0.03	0.00	0.03	0.08	0.10	0.13	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.15	0.02	0.19	0.29	0.19
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.13	0.12	0.09	0.08	0.15	0.08	0.07	0.05	0.02	0.01	0.16	0.09	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.16	0.01	0.21	0.32	0.21
C8	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.16	0.04	0.16	0.26	0.16
N1	0.04	0.01	0.10	0.14	0.02	0.07	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.18	0.05	0.14	0.02	0.18	0.30	0.18
N2	0.06	0.01	0.13	0.17	0.02	0.08	0.02	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.15	0.23	0.08	0.12	0.04	0.13	0.26	0.14
N3	0.05	0.01	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.17	0.06	0.11	0.02	0.11	0.24	0.13
N7	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.17	0.04	0.21	0.30	0.21
N9	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.12	0.02	0.11	0.23	0.12
O2'	0.02	0.12	0.01	0.03	0.07	0.07	0.06	0.07	0.08	0.05	0.11	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.08	0.06	0.07	0.08	0.16	0.14	0.06
O3'	0.03	0.19	0.04	0.01	0.12	0.03	0.12	0.05	0.15	0.10	0.18	0.23	0.17	0.12	0.06	0.08	0.00	0.03	0.16	0.16	0.30	0.19	0.18
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.10	0.04	0.08	0.21	0.11
O5'	0.08	0.13	0.11	0.15	0.12	0.03	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14	0.12	0.11	0.17	0.12	0.07	0.16	0.10	0.00	0.18	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.02	0.08	0.02	0.16	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.08	0.16	0.04	0.18	0.00	0.25	0.34	0.24
OP1	0.09	0.14	0.17	0.22	0.13	0.10	0.19	0.09	0.21	0.16	0.18	0.13	0.11	0.21	0.11	0.16	0.30	0.08	0.02	0.25	0.00	0.02	0.01
OP2	0.19	0.27	0.14	0.13	0.25	0.13	0.29	0.12	0.32	0.26	0.30	0.26	0.24	0.30	0.23	0.14	0.19	0.21	0.03	0.34	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.08	0.12	0.14	0.03	0.19	0.02	0.21	0.16	0.18	0.14	0.13	0.21	0.12	0.06	0.18	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.18	0.25	0.24	0.18	0.20	0.19	0.22	0.22	0.19	0.22	0.21	0.18	0.20	0.19	0.30	0.30	0.24	0.31	0.26	0.22	0.40	0.25
C2	0.17	0.11	0.23	0.18	0.12	0.18	0.15	0.22	0.17	0.17	0.12	0.17	0.13	0.19	0.15	0.28	0.20	0.20	0.29	0.21	0.20	0.40	0.23
C2'	0.22	0.20	0.32	0.29	0.18	0.23	0.18	0.23	0.21	0.18	0.21	0.24	0.19	0.19	0.19	0.38	0.37	0.24	0.25	0.25	0.21	0.43	0.24
C3'	0.21	0.18	0.29	0.27	0.17	0.23	0.18	0.23	0.21	0.18	0.20	0.20	0.17	0.18	0.18	0.35	0.34	0.24	0.26	0.26	0.21	0.43	0.24
C4	0.16	0.12	0.22	0.20	0.13	0.17	0.16	0.20	0.19	0.16	0.15	0.17	0.13	0.18	0.15	0.27	0.24	0.19	0.29	0.24	0.19	0.38	0.22
C4'	0.22	0.20	0.26	0.25	0.19	0.21	0.20	0.22	0.23	0.19	0.23	0.22	0.19	0.20	0.20	0.30	0.31	0.25	0.31	0.26	0.23	0.40	0.24
C5	0.16	0.14	0.21	0.19	0.14	0.16	0.17	0.20	0.19	0.17	0.15	0.20	0.15	0.19	0.15	0.25	0.22	0.18	0.30	0.25	0.18	0.34	0.20
C5'	0.24	0.22	0.26	0.26	0.21	0.22	0.21	0.24	0.24	0.21	0.24	0.24	0.22	0.21	0.22	0.31	0.31	0.26	0.35	0.28	0.25	0.38	0.25
C6	0.17	0.17	0.21	0.18	0.15	0.17	0.17	0.22	0.18	0.18	0.15	0.22	0.17	0.20	0.16	0.24	0.20	0.19	0.31	0.24	0.19	0.33	0.20
C8	0.16	0.15	0.22	0.21	0.15	0.16	0.18	0.19	0.22	0.16	0.19	0.19	0.15	0.19	0.15	0.26	0.26	0.18	0.30	0.28	0.18	0.35	0.21
N1	0.17	0.15	0.21	0.17	0.13	0.18	0.15	0.22	0.16	0.17	0.13	0.20	0.16	0.18	0.15	0.25	0.18	0.20	0.30	0.22	0.20	0.36	0.21
N2	0.20	0.14	0.25	0.21	0.15	0.21	0.18	0.25	0.18	0.21	0.14	0.18	0.15	0.23	0.18	0.32	0.22	0.23	0.29	0.22	0.23	0.45	0.27
N3	0.18	0.12	0.25	0.21	0.14	0.19	0.17	0.21	0.18	0.18	0.15	0.17	0.13	0.19	0.16	0.29	0.25	0.21	0.29	0.22	0.21	0.41	0.24
N7	0.16	0.16	0.21	0.20	0.15	0.16	0.18	0.20	0.21	0.18	0.18	0.21	0.16	0.20	0.16	0.25	0.24	0.18	0.31	0.28	0.18	0.33	0.20
N9	0.17	0.15	0.23	0.21	0.15	0.17	0.17	0.20	0.21	0.17	0.19	0.18	0.14	0.18	0.16	0.28	0.26	0.20	0.29	0.26	0.20	0.38	0.22
O2'	0.24	0.23	0.33	0.30	0.20	0.24	0.20	0.24	0.23	0.21	0.23	0.29	0.21	0.21	0.21	0.40	0.40	0.27	0.26	0.26	0.22	0.44	0.26
O3'	0.24	0.19	0.33	0.30	0.18	0.26	0.19	0.26	0.22	0.20	0.21	0.22	0.19	0.20	0.20	0.40	0.38	0.27	0.26	0.26	0.23	0.45	0.27
O4'	0.25	0.22	0.27	0.26	0.22	0.24	0.23	0.25	0.25	0.23	0.25	0.23	0.22	0.23	0.23	0.31	0.31	0.28	0.36	0.29	0.27	0.40	0.28
O5'	0.25	0.24	0.26	0.26	0.24	0.24	0.25	0.27	0.28	0.24	0.27	0.25	0.24	0.26	0.24	0.30	0.30	0.28	0.38	0.32	0.28	0.41	0.30
O6	0.19	0.21	0.22	0.20	0.18	0.19	0.20	0.24	0.21	0.22	0.20	0.25	0.19	0.23	0.19	0.24	0.22	0.21	0.34	0.26	0.20	0.30	0.21
OP1	0.23	0.19	0.25	0.25	0.19	0.22	0.20	0.25	0.23	0.20	0.20	0.20	0.20	0.22	0.21	0.30	0.30	0.26	0.36	0.27	0.25	0.38	0.26
OP2	0.29	0.25	0.33	0.33	0.27	0.29	0.28	0.30	0.29	0.28	0.26	0.26	0.26	0.30	0.28	0.35	0.38	0.29	0.36	0.33	0.30	0.41	0.30
P	0.20	0.17	0.25	0.25	0.18	0.20	0.20	0.22	0.22	0.19	0.20	0.18	0.18	0.21	0.19	0.29	0.30	0.23	0.33	0.27	0.24	0.38	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.11	0.03	0.08	0.46	0.19
C2	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.22	0.04	0.27	0.02	0.17	0.38	0.18
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.02	0.08	0.02	0.10	0.07	0.12	0.16	0.13	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.17	0.10	0.15	0.36	0.10
C3'	0.02	0.17	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.14	0.12	0.16	0.20	0.15	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.23	0.15	0.25	0.32	0.11
C4	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.29	0.02	0.15	0.38	0.17
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.08	0.10	0.07	0.10	0.05	0.08	0.04	0.01	0.03	0.09	0.10	0.38	0.11
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.03	0.37	0.02	0.20	0.34	0.21
C5'	0.04	0.12	0.02	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.18	0.14	0.12	0.10	0.20	0.11	0.08	0.06	0.03	0.01	0.19	0.16	0.29	0.03
C6	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.19	0.04	0.39	0.01	0.23	0.35	0.23
C8	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.04	0.37	0.04	0.17	0.35	0.18
N1	0.03	0.01	0.12	0.16	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.21	0.04	0.34	0.02	0.21	0.36	0.21
N2	0.04	0.01	0.16	0.20	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.26	0.04	0.24	0.03	0.16	0.40	0.18
N3	0.03	0.01	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.19	0.03	0.23	0.02	0.14	0.40	0.17
N7	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.04	0.42	0.04	0.22	0.32	0.22
N9	0.01	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.26	0.03	0.12	0.40	0.16
O2'	0.03	0.16	0.01	0.02	0.09	0.08	0.08	0.08	0.11	0.05	0.14	0.19	0.14	0.06	0.04	0.00	0.08	0.06	0.08	0.10	0.14	0.38	0.13
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.13	0.04	0.15	0.06	0.19	0.14	0.21	0.26	0.19	0.16	0.07	0.08	0.00	0.03	0.20	0.20	0.36	0.31	0.17
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.09	0.05	0.13	0.51	0.26
O5'	0.11	0.27	0.17	0.23	0.29	0.03	0.37	0.01	0.39	0.37	0.34	0.24	0.23	0.42	0.26	0.08	0.20	0.09	0.00	0.43	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.15	0.02	0.09	0.02	0.19	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.10	0.20	0.05	0.43	0.00	0.27	0.35	0.27
OP1	0.08	0.17	0.15	0.25	0.15	0.10	0.20	0.16	0.23	0.17	0.21	0.16	0.14	0.22	0.12	0.14	0.36	0.13	0.02	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.46	0.38	0.36	0.32	0.38	0.38	0.34	0.29	0.35	0.35	0.36	0.40	0.40	0.32	0.40	0.38	0.31	0.51	0.03	0.35	0.02	0.00	0.01
P	0.19	0.18	0.10	0.11	0.17	0.11	0.21	0.03	0.23	0.18	0.21	0.18	0.17	0.22	0.16	0.13	0.17	0.26	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00