Doublet Group distance statistics: 53292

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 8, 6, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.016, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.021, 0.037, 0.053, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.024, 0.041, 0.058, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.041 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.025, 0.047, 0.069, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.047 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.030, 0.052, 0.075, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.052 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.031, 0.057, 0.083, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.057 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.041, 0.072, 0.103, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.072 std_dev=0.031
OP3	A	0, 0.000, 0.097, 0.194, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.097 std_dev=0.097
C4	B	0, 0.223, 0.350, 0.478, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.350 std_dev=0.128
C5	B	0, 0.254, 0.386, 0.518, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.386 std_dev=0.132
N3	B	0, 0.250, 0.387, 0.524, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.387 std_dev=0.137
C6	B	0, 0.251, 0.406, 0.561, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.406 std_dev=0.155
N9	B	0, 0.244, 0.415, 0.587, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.415 std_dev=0.172
C2	B	0, 0.234, 0.409, 0.583, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.409 std_dev=0.174
N1	B	0, 0.206, 0.394, 0.582, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.394 std_dev=0.188
C8	B	0, 0.289, 0.490, 0.690, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.490 std_dev=0.201
N7	B	0, 0.278, 0.481, 0.684, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.481 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.297, 0.501, 0.706, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.501 std_dev=0.204
N2	B	0, 0.353, 0.558, 0.762, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.558 std_dev=0.205
O6	B	0, 0.289, 0.503, 0.717, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.503 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.385, 0.612, 0.840, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.612 std_dev=0.227
O2'	B	0, 0.443, 0.693, 0.943, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.693 std_dev=0.250
O4'	B	0, 0.306, 0.565, 0.824, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.565 std_dev=0.259
C4'	B	0, 0.346, 0.639, 0.932, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.639 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.332, 0.653, 0.974, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.653 std_dev=0.321
C5'	B	0, 0.374, 0.746, 1.118, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.746 std_dev=0.372
O3'	B	0, 0.383, 0.788, 1.192, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.788 std_dev=0.405
O5'	B	0, 0.479, 0.887, 1.295, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.887 std_dev=0.408
P	B	0, 0.486, 0.913, 1.340, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.913 std_dev=0.427
O4'	A	0, -0.113, 0.364, 0.842, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.364 std_dev=0.477
OP2	B	0, 0.428, 0.946, 1.463, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.946 std_dev=0.517
OP1	B	0, 0.562, 1.088, 1.615, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.088 std_dev=0.526
C2'	A	0, -0.105, 0.433, 0.971, 2.314 max_d=2.314 avg_d=0.433 std_dev=0.538
C3'	A	0, -0.028, 0.634, 1.296, 3.025 max_d=3.025 avg_d=0.634 std_dev=0.662
C4'	A	0, -0.094, 0.613, 1.320, 2.985 max_d=2.985 avg_d=0.613 std_dev=0.707
O3'	A	0, 0.099, 0.833, 1.567, 3.527 max_d=3.527 avg_d=0.833 std_dev=0.734
O2'	A	0, -0.177, 0.596, 1.369, 3.085 max_d=3.085 avg_d=0.596 std_dev=0.773
C5'	A	0, -0.084, 1.015, 2.113, 4.553 max_d=4.553 avg_d=1.015 std_dev=1.099
OP1	A	0, 1.726, 2.978, 4.230, 7.053 max_d=7.053 avg_d=2.978 std_dev=1.252
O5'	A	0, -0.211, 1.166, 2.542, 6.591 max_d=6.591 avg_d=1.166 std_dev=1.377
OP2	A	0, 1.224, 2.823, 4.422, 8.689 max_d=8.689 avg_d=2.823 std_dev=1.599
P	A	0, -0.443, 1.344, 3.130, 8.133 max_d=8.133 avg_d=1.344 std_dev=1.787

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	OP3	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.19	0.00	0.20	0.02	0.39	0.40	0.02	0.24
C2	0.03	0.00	0.33	0.28	0.01	0.19	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.28	0.29	0.36	0.01	0.75	0.84	0.01	0.60
C2'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.16	0.02	0.08	0.14	0.14	0.18	0.25	0.39	0.32	0.10	0.03	0.01	0.02	0.02	0.38	0.11	0.40	0.37	0.04	0.33
C3'	0.02	0.28	0.00	0.00	0.23	0.01	0.25	0.03	0.28	0.20	0.30	0.29	0.25	0.23	0.15	0.02	0.01	0.02	0.37	0.29	0.49	0.18	0.03	0.25
C4	0.02	0.01	0.16	0.23	0.00	0.11	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.16	0.17	0.37	0.01	0.66	0.66	0.00	0.46
C4'	0.01	0.19	0.02	0.01	0.11	0.00	0.12	0.01	0.13	0.19	0.16	0.24	0.18	0.17	0.08	0.19	0.03	0.01	0.02	0.14	0.16	0.47	0.01	0.13
C5	0.01	0.01	0.08	0.25	0.01	0.12	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.17	0.11	0.49	0.01	0.74	0.78	0.02	0.55
C5'	0.07	0.33	0.14	0.03	0.25	0.01	0.28	0.00	0.32	0.28	0.33	0.37	0.29	0.31	0.18	0.08	0.14	0.02	0.01	0.34	0.28	0.37	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.14	0.28	0.01	0.13	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.22	0.16	0.47	0.01	0.79	0.87	0.02	0.60
C8	0.02	0.01	0.18	0.20	0.01	0.19	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.11	0.13	0.62	0.02	0.70	0.70	0.01	0.57
N1	0.03	0.00	0.25	0.30	0.01	0.16	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.26	0.24	0.40	0.01	0.79	0.86	0.02	0.60
N2	0.04	0.01	0.39	0.29	0.01	0.24	0.02	0.37	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.41	0.33	0.34	0.39	0.02	0.79	0.92	0.02	0.68
N3	0.03	0.01	0.32	0.25	0.00	0.18	0.01	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.24	0.28	0.32	0.01	0.67	0.76	0.00	0.53
N7	0.02	0.01	0.10	0.23	0.01	0.17	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.31	0.15	0.06	0.63	0.02	0.78	0.89	0.02	0.65
N9	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.04	0.39	0.02	0.57	0.49	0.01	0.38
O2'	0.02	0.28	0.01	0.02	0.09	0.19	0.14	0.08	0.11	0.35	0.17	0.41	0.28	0.31	0.13	0.00	0.05	0.15	0.28	0.14	0.24	0.54	0.02	0.30
O3'	0.19	0.28	0.02	0.01	0.16	0.03	0.17	0.14	0.22	0.11	0.26	0.33	0.24	0.15	0.08	0.05	0.00	0.12	0.30	0.24	0.65	0.45	0.02	0.28
O4'	0.00	0.29	0.02	0.02	0.17	0.01	0.11	0.02	0.16	0.13	0.24	0.34	0.28	0.06	0.04	0.15	0.12	0.00	0.06	0.14	0.37	0.54	0.01	0.27
O5'	0.20	0.36	0.38	0.37	0.37	0.02	0.49	0.01	0.47	0.62	0.40	0.39	0.32	0.63	0.39	0.28	0.30	0.06	0.00	0.53	0.02	0.06	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.11	0.29	0.01	0.14	0.01	0.34	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.24	0.14	0.53	0.00	0.84	0.99	0.04	0.66
OP1	0.39	0.75	0.40	0.49	0.66	0.16	0.74	0.28	0.79	0.70	0.79	0.79	0.67	0.78	0.57	0.24	0.65	0.37	0.02	0.84	0.00	0.04	0.00	0.01
OP2	0.40	0.84	0.37	0.18	0.66	0.47	0.78	0.37	0.87	0.70	0.86	0.92	0.76	0.89	0.49	0.54	0.45	0.54	0.06	0.99	0.04	0.00	0.01	0.01
OP3	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.60	0.33	0.25	0.46	0.13	0.55	0.02	0.60	0.57	0.60	0.68	0.53	0.65	0.38	0.30	0.28	0.27	0.01	0.66	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.15	0.28	0.27	0.15	0.25	0.19	0.24	0.25	0.18	0.24	0.16	0.13	0.20	0.17	0.36	0.35	0.26	0.30	0.31	0.31	0.33	0.22
C2	0.16	0.18	0.20	0.16	0.09	0.22	0.16	0.26	0.22	0.17	0.22	0.23	0.11	0.19	0.13	0.27	0.18	0.25	0.29	0.25	0.24	0.28	0.18
C2'	0.31	0.19	0.36	0.33	0.22	0.31	0.24	0.33	0.25	0.27	0.24	0.23	0.19	0.27	0.26	0.42	0.39	0.36	0.35	0.29	0.34	0.45	0.32
C3'	0.34	0.18	0.51	0.50	0.20	0.41	0.18	0.38	0.21	0.22	0.19	0.25	0.23	0.20	0.25	0.62	0.64	0.35	0.39	0.27	0.39	0.36	0.31
C4	0.20	0.12	0.23	0.20	0.14	0.22	0.19	0.23	0.24	0.19	0.21	0.18	0.12	0.22	0.17	0.30	0.24	0.25	0.30	0.30	0.27	0.33	0.21
C4'	0.61	0.41	0.79	0.80	0.45	0.72	0.37	0.68	0.33	0.45	0.34	0.45	0.50	0.38	0.51	0.88	0.94	0.60	0.67	0.32	0.70	0.50	0.59
C5	0.19	0.15	0.21	0.18	0.16	0.21	0.21	0.24	0.25	0.22	0.19	0.23	0.16	0.25	0.19	0.27	0.21	0.25	0.32	0.33	0.27	0.36	0.23
C5'	0.82	0.66	1.04	1.06	0.69	0.94	0.60	0.91	0.55	0.67	0.56	0.71	0.74	0.60	0.73	1.11	1.21	0.80	0.90	0.49	0.92	0.70	0.81
C6	0.18	0.18	0.19	0.17	0.16	0.21	0.21	0.27	0.24	0.23	0.20	0.25	0.17	0.26	0.18	0.24	0.17	0.25	0.33	0.31	0.26	0.37	0.24
C8	0.21	0.14	0.24	0.22	0.18	0.21	0.22	0.23	0.26	0.22	0.21	0.19	0.17	0.24	0.19	0.30	0.27	0.25	0.32	0.34	0.29	0.37	0.24
N1	0.17	0.18	0.17	0.16	0.12	0.21	0.18	0.27	0.22	0.20	0.21	0.24	0.14	0.23	0.15	0.23	0.15	0.24	0.31	0.27	0.23	0.32	0.21
N2	0.14	0.21	0.19	0.16	0.11	0.23	0.16	0.28	0.21	0.15	0.23	0.25	0.16	0.18	0.10	0.27	0.18	0.25	0.28	0.23	0.24	0.24	0.17
N3	0.19	0.16	0.23	0.20	0.11	0.23	0.17	0.25	0.22	0.17	0.22	0.22	0.08	0.19	0.15	0.31	0.24	0.26	0.29	0.27	0.27	0.30	0.19
N7	0.20	0.17	0.22	0.20	0.19	0.21	0.23	0.24	0.26	0.23	0.20	0.25	0.19	0.27	0.20	0.28	0.23	0.25	0.33	0.35	0.29	0.39	0.25
N9	0.20	0.12	0.25	0.22	0.15	0.22	0.20	0.23	0.25	0.19	0.23	0.14	0.14	0.22	0.18	0.32	0.28	0.25	0.30	0.32	0.29	0.34	0.22
O2'	0.44	0.28	0.45	0.44	0.33	0.45	0.32	0.47	0.31	0.37	0.30	0.28	0.31	0.35	0.38	0.51	0.47	0.50	0.45	0.33	0.44	0.55	0.43
O3'	0.51	0.30	0.71	0.71	0.34	0.62	0.27	0.58	0.24	0.35	0.24	0.35	0.37	0.29	0.40	0.82	0.87	0.52	0.55	0.26	0.58	0.44	0.48
O4'	0.58	0.36	0.69	0.69	0.44	0.66	0.37	0.62	0.32	0.44	0.31	0.36	0.47	0.38	0.50	0.78	0.78	0.59	0.63	0.32	0.66	0.49	0.56
O5'	0.88	0.63	1.09	1.11	0.68	1.02	0.59	0.97	0.55	0.68	0.55	0.66	0.73	0.60	0.75	1.23	1.28	0.87	0.94	0.56	0.97	0.75	0.85
O6	0.19	0.22	0.19	0.19	0.17	0.22	0.22	0.29	0.25	0.25	0.21	0.28	0.19	0.28	0.19	0.23	0.19	0.25	0.35	0.33	0.29	0.41	0.28
OP1	1.41	1.26	1.66	1.70	1.30	1.54	1.22	1.51	1.15	1.29	1.16	1.27	1.34	1.22	1.34	1.72	1.87	1.38	1.53	1.09	1.55	1.39	1.45
OP2	1.58	1.35	1.78	1.77	1.43	1.68	1.34	1.62	1.28	1.41	1.26	1.34	1.48	1.35	1.48	1.88	1.89	1.55	1.60	1.29	1.60	1.41	1.50
OP3	0.06	0.08	0.02	0.04	0.07	0.05	0.06	0.07	0.05	0.06	0.06	0.10	0.08	0.06	0.07	0.07	0.01	0.07	0.05	0.04	0.06	0.01	0.03
P	1.34	1.08	1.57	1.59	1.15	1.48	1.04	1.43	0.96	1.14	0.96	1.09	1.20	1.05	1.22	1.69	1.76	1.32	1.40	0.92	1.43	1.19	1.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.12	0.02	0.17	0.25	0.11
C2	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.03	0.21	0.02	0.27	0.37	0.21
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.13	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.15	0.07	0.29	0.21	0.14
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.09	0.01	0.07	0.03	0.10	0.09	0.14	0.20	0.15	0.07	0.04	0.04	0.01	0.02	0.23	0.09	0.34	0.21	0.20
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.22	0.01	0.25	0.35	0.20
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.10	0.07	0.09	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.09	0.17	0.21	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.27	0.01	0.29	0.39	0.25
C5'	0.05	0.18	0.02	0.03	0.18	0.01	0.22	0.00	0.23	0.21	0.21	0.18	0.16	0.24	0.15	0.07	0.08	0.02	0.01	0.25	0.13	0.25	0.04
C6	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.12	0.04	0.28	0.00	0.32	0.42	0.27
C8	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.05	0.27	0.03	0.25	0.33	0.21
N1	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.17	0.03	0.25	0.01	0.30	0.41	0.24
N2	0.05	0.01	0.16	0.20	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.16	0.26	0.04	0.20	0.03	0.27	0.37	0.20
N3	0.03	0.01	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.18	0.03	0.19	0.02	0.25	0.34	0.18
N7	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.09	0.00	0.24	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.06	0.30	0.03	0.30	0.39	0.27
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.03	0.20	0.02	0.22	0.30	0.16
O2'	0.03	0.12	0.00	0.04	0.07	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.10	0.16	0.11	0.06	0.04	0.00	0.07	0.05	0.08	0.08	0.28	0.20	0.11
O3'	0.02	0.21	0.03	0.01	0.10	0.03	0.08	0.08	0.12	0.09	0.17	0.26	0.18	0.09	0.04	0.07	0.00	0.02	0.24	0.11	0.45	0.27	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.15	0.28	0.17
O5'	0.12	0.21	0.15	0.23	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.25	0.20	0.19	0.30	0.20	0.08	0.24	0.12	0.00	0.30	0.04	0.04	0.00
O6	0.02	0.02	0.07	0.09	0.01	0.09	0.01	0.25	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.08	0.11	0.05	0.30	0.00	0.35	0.44	0.30
OP1	0.17	0.27	0.29	0.34	0.25	0.17	0.29	0.13	0.32	0.25	0.30	0.27	0.25	0.30	0.22	0.28	0.45	0.15	0.04	0.35	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.37	0.21	0.21	0.35	0.21	0.39	0.25	0.42	0.33	0.41	0.37	0.34	0.39	0.30	0.20	0.27	0.28	0.04	0.44	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.21	0.14	0.20	0.20	0.06	0.25	0.04	0.27	0.21	0.24	0.20	0.18	0.27	0.16	0.11	0.27	0.17	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00