Doublet Group distance statistics: 53296

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 6, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.009, 0.021, 0.032, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.017, 0.035, 0.054, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.035 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.014, 0.036, 0.059, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.004, 0.033, 0.062, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.033 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.035, 0.068, 0.101, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.068 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.030, 0.072, 0.113, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.072 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.031, 0.081, 0.132, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.081 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.039, 0.105, 0.170, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.105 std_dev=0.065
C2'	A	0, 0.059, 0.162, 0.266, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.162 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.059, 0.195, 0.331, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.195 std_dev=0.136
C3'	A	0, 0.082, 0.225, 0.367, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.225 std_dev=0.142
O2'	A	0, 0.150, 0.310, 0.470, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.310 std_dev=0.160
C4	B	0, 0.121, 0.315, 0.508, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.315 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.108, 0.337, 0.566, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.337 std_dev=0.229
C5'	A	0, 0.122, 0.356, 0.591, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.356 std_dev=0.234
C5	B	0, 0.049, 0.296, 0.544, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.296 std_dev=0.247
O3'	A	0, 0.057, 0.308, 0.560, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.308 std_dev=0.251
N9	B	0, 0.245, 0.497, 0.749, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.497 std_dev=0.252
O5'	A	0, 0.259, 0.512, 0.766, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.512 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.117, 0.373, 0.629, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.373 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.055, 0.338, 0.620, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.338 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.564, 0.848, 1.132, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.848 std_dev=0.284
N7	B	0, 0.201, 0.494, 0.787, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.494 std_dev=0.293
N1	B	0, 0.075, 0.371, 0.667, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.371 std_dev=0.296
C8	B	0, 0.272, 0.578, 0.885, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.578 std_dev=0.306
C1'	B	0, 0.370, 0.687, 1.005, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.687 std_dev=0.318
N2	B	0, 0.237, 0.572, 0.907, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.572 std_dev=0.335
O6	B	0, 0.172, 0.508, 0.845, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.508 std_dev=0.336
C2'	B	0, 0.488, 0.829, 1.171, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.829 std_dev=0.341
C5'	B	0, 0.530, 0.931, 1.331, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.931 std_dev=0.401
P	A	0, 0.681, 1.092, 1.502, 1.677 max_d=1.677 avg_d=1.092 std_dev=0.410
O4'	B	0, 0.393, 0.816, 1.238, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.816 std_dev=0.423
C4'	B	0, 0.538, 0.970, 1.402, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.970 std_dev=0.432
O5'	B	0, 0.399, 0.884, 1.369, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.884 std_dev=0.485
C3'	B	0, 0.670, 1.156, 1.642, 2.146 max_d=2.146 avg_d=1.156 std_dev=0.486
P	B	0, 0.846, 1.336, 1.825, 1.887 max_d=1.887 avg_d=1.336 std_dev=0.489
OP2	B	0, 0.955, 1.515, 2.075, 2.470 max_d=2.470 avg_d=1.515 std_dev=0.560
OP1	A	0, 0.666, 1.236, 1.805, 2.161 max_d=2.161 avg_d=1.236 std_dev=0.569
OP2	A	0, 0.968, 1.549, 2.130, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.549 std_dev=0.581
OP1	B	0, 1.033, 1.651, 2.268, 2.384 max_d=2.384 avg_d=1.651 std_dev=0.617
O3'	B	0, 0.782, 1.573, 2.365, 3.355 max_d=3.355 avg_d=1.573 std_dev=0.791

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.10	0.02	0.33	0.10	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.16	0.02	0.31	0.17	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.09	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.30	0.16	0.08
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.11	0.10	0.10	0.09	0.12	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.24	0.21	0.06
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.02	0.18	0.01	0.29	0.18	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.05	0.03	0.03	0.10	0.06	0.04	0.03	0.00	0.01	0.09	0.29	0.13	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.02	0.24	0.01	0.27	0.24	0.14
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.16	0.11	0.05	0.06	0.18	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.16	0.18	0.16	0.03
C6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.02	0.25	0.00	0.27	0.25	0.15
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.25	0.02	0.26	0.23	0.14
N1	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.03	0.21	0.02	0.29	0.22	0.13
N2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.05	0.12	0.02	0.31	0.16	0.11
N3	0.02	0.01	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.14	0.02	0.31	0.15	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.02	0.27	0.03	0.25	0.28	0.16
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.18	0.02	0.29	0.17	0.12
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.03	0.06	0.03	0.09	0.14	0.11	0.03	0.02	0.00	0.07	0.04	0.04	0.06	0.37	0.11	0.12
O3'	0.04	0.13	0.04	0.01	0.09	0.03	0.11	0.02	0.13	0.12	0.12	0.15	0.12	0.14	0.07	0.07	0.00	0.03	0.10	0.15	0.21	0.24	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.11	0.02	0.33	0.07	0.13
O5'	0.10	0.16	0.03	0.02	0.18	0.01	0.24	0.01	0.25	0.25	0.21	0.12	0.14	0.27	0.18	0.04	0.10	0.11	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.12	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.15	0.02	0.28	0.00	0.27	0.27	0.17
OP1	0.33	0.31	0.30	0.24	0.29	0.29	0.27	0.18	0.27	0.26	0.29	0.31	0.31	0.25	0.29	0.37	0.21	0.33	0.02	0.27	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.17	0.16	0.21	0.18	0.13	0.24	0.16	0.25	0.23	0.22	0.16	0.15	0.28	0.17	0.11	0.24	0.07	0.02	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.12	0.08	0.06	0.12	0.08	0.14	0.03	0.15	0.14	0.13	0.11	0.11	0.16	0.12	0.12	0.09	0.13	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.16	0.09	0.17	0.15	0.16	0.18	0.39	0.16	0.23	0.16	0.19	0.15	0.25	0.16	0.30	0.15	0.22	0.21	0.19	0.24	0.44	0.17
C2	0.08	0.27	0.18	0.14	0.12	0.12	0.12	0.48	0.19	0.06	0.25	0.37	0.20	0.10	0.08	0.40	0.17	0.16	0.38	0.23	0.23	0.31	0.17
C2'	0.13	0.16	0.13	0.21	0.14	0.16	0.20	0.39	0.19	0.26	0.18	0.21	0.13	0.29	0.17	0.32	0.23	0.21	0.21	0.24	0.25	0.42	0.16
C3'	0.16	0.12	0.18	0.25	0.13	0.18	0.18	0.30	0.16	0.30	0.13	0.17	0.09	0.30	0.19	0.31	0.30	0.22	0.13	0.20	0.22	0.41	0.12
C4	0.05	0.20	0.14	0.14	0.08	0.11	0.09	0.46	0.13	0.10	0.17	0.27	0.15	0.12	0.06	0.39	0.17	0.18	0.30	0.17	0.24	0.37	0.17
C4'	0.20	0.13	0.22	0.26	0.17	0.22	0.20	0.26	0.15	0.33	0.13	0.16	0.14	0.32	0.23	0.25	0.27	0.24	0.12	0.18	0.20	0.45	0.14
C5	0.07	0.19	0.18	0.14	0.08	0.13	0.10	0.47	0.14	0.10	0.17	0.27	0.15	0.12	0.07	0.42	0.20	0.20	0.31	0.18	0.28	0.38	0.20
C5'	0.25	0.16	0.31	0.33	0.19	0.30	0.19	0.21	0.14	0.33	0.14	0.19	0.18	0.29	0.24	0.25	0.36	0.29	0.18	0.15	0.20	0.48	0.19
C6	0.09	0.23	0.21	0.15	0.11	0.14	0.12	0.49	0.18	0.08	0.22	0.33	0.17	0.11	0.08	0.43	0.21	0.19	0.37	0.22	0.29	0.34	0.21
C8	0.10	0.10	0.10	0.17	0.11	0.17	0.13	0.43	0.09	0.18	0.06	0.15	0.12	0.18	0.15	0.39	0.18	0.25	0.22	0.12	0.30	0.45	0.22
N1	0.10	0.26	0.21	0.15	0.12	0.14	0.13	0.49	0.19	0.07	0.24	0.37	0.20	0.11	0.09	0.42	0.20	0.18	0.40	0.24	0.26	0.30	0.20
N2	0.09	0.28	0.18	0.14	0.13	0.13	0.13	0.48	0.20	0.07	0.27	0.38	0.21	0.11	0.09	0.40	0.17	0.15	0.41	0.25	0.23	0.29	0.18
N3	0.06	0.25	0.15	0.14	0.09	0.11	0.09	0.46	0.16	0.07	0.23	0.33	0.18	0.10	0.06	0.39	0.16	0.16	0.34	0.20	0.22	0.34	0.15
N7	0.08	0.14	0.16	0.15	0.09	0.15	0.11	0.45	0.12	0.13	0.12	0.20	0.12	0.14	0.10	0.42	0.21	0.23	0.25	0.14	0.32	0.44	0.23
N9	0.08	0.15	0.09	0.15	0.09	0.14	0.11	0.43	0.10	0.16	0.11	0.20	0.13	0.17	0.11	0.37	0.16	0.20	0.25	0.13	0.26	0.41	0.18
O2'	0.14	0.21	0.12	0.19	0.19	0.16	0.25	0.38	0.26	0.29	0.24	0.24	0.17	0.33	0.20	0.26	0.19	0.22	0.22	0.31	0.25	0.44	0.19
O3'	0.19	0.12	0.20	0.27	0.15	0.20	0.21	0.28	0.19	0.34	0.14	0.18	0.10	0.34	0.21	0.30	0.35	0.23	0.12	0.24	0.22	0.41	0.11
O4'	0.16	0.14	0.15	0.20	0.17	0.19	0.19	0.34	0.14	0.28	0.12	0.16	0.15	0.28	0.21	0.24	0.16	0.23	0.16	0.16	0.23	0.45	0.16
O5'	0.20	0.19	0.31	0.25	0.20	0.25	0.21	0.21	0.19	0.33	0.19	0.20	0.18	0.28	0.24	0.19	0.18	0.22	0.17	0.20	0.17	0.47	0.19
O6	0.11	0.22	0.24	0.16	0.12	0.17	0.13	0.49	0.19	0.09	0.22	0.31	0.17	0.11	0.10	0.43	0.23	0.20	0.38	0.23	0.33	0.35	0.25
OP1	0.14	0.22	0.26	0.21	0.21	0.23	0.29	0.11	0.33	0.29	0.29	0.21	0.17	0.34	0.19	0.23	0.27	0.15	0.16	0.40	0.20	0.38	0.13
OP2	0.33	0.27	0.43	0.41	0.26	0.46	0.22	0.38	0.20	0.29	0.23	0.29	0.29	0.25	0.29	0.43	0.44	0.36	0.42	0.18	0.38	0.53	0.37
P	0.16	0.10	0.28	0.22	0.12	0.26	0.16	0.13	0.16	0.24	0.13	0.10	0.09	0.23	0.16	0.25	0.23	0.16	0.19	0.19	0.18	0.40	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.10	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.03	0.21	0.01	0.07	0.03	0.18	0.29	0.07
C2	0.04	0.00	0.22	0.12	0.00	0.18	0.00	0.54	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.15	0.15	0.44	0.02	0.30	0.37	0.25
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.13	0.02	0.09	0.23	0.14	0.08	0.19	0.25	0.21	0.05	0.03	0.00	0.02	0.02	0.14	0.13	0.33	0.15	0.15
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.11	0.14	0.11	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.09	0.08	0.31	0.17	0.11
C4	0.02	0.00	0.13	0.06	0.00	0.10	0.01	0.39	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.16	0.08	0.30	0.02	0.22	0.28	0.12
C4'	0.03	0.18	0.02	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.12	0.02	0.16	0.21	0.16	0.04	0.03	0.10	0.05	0.01	0.03	0.12	0.31	0.13	0.14
C5	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.09	0.00	0.39	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05	0.33	0.01	0.22	0.26	0.14
C5'	0.10	0.54	0.23	0.02	0.39	0.00	0.39	0.00	0.46	0.22	0.52	0.58	0.49	0.30	0.24	0.13	0.11	0.02	0.01	0.46	0.10	0.13	0.02
C6	0.03	0.01	0.14	0.08	0.02	0.12	0.01	0.46	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.15	0.08	0.40	0.00	0.25	0.27	0.19
C8	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.17	0.06	0.18	0.01	0.21	0.28	0.14
N1	0.03	0.01	0.19	0.11	0.01	0.16	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.15	0.12	0.45	0.01	0.28	0.33	0.23
N2	0.05	0.00	0.25	0.14	0.01	0.21	0.01	0.58	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.15	0.18	0.47	0.02	0.36	0.48	0.34
N3	0.03	0.01	0.21	0.11	0.00	0.16	0.01	0.49	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.16	0.15	0.36	0.02	0.26	0.34	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.26	0.02	0.21	0.26	0.14
N9	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.17	0.02	0.17	0.02	0.20	0.28	0.10
O2'	0.03	0.29	0.00	0.03	0.17	0.10	0.15	0.13	0.21	0.08	0.27	0.33	0.26	0.06	0.04	0.00	0.12	0.06	0.05	0.20	0.27	0.20	0.05
O3'	0.21	0.15	0.02	0.01	0.16	0.05	0.15	0.11	0.15	0.17	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.12	0.00	0.22	0.06	0.15	0.33	0.13	0.17
O4'	0.01	0.15	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.12	0.18	0.15	0.04	0.02	0.06	0.22	0.00	0.10	0.07	0.13	0.32	0.07
O5'	0.07	0.44	0.14	0.09	0.30	0.03	0.33	0.01	0.40	0.18	0.45	0.47	0.36	0.26	0.17	0.05	0.06	0.10	0.00	0.41	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.13	0.08	0.02	0.12	0.01	0.46	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.20	0.15	0.07	0.41	0.00	0.25	0.26	0.20
OP1	0.18	0.30	0.33	0.31	0.22	0.31	0.22	0.10	0.25	0.21	0.28	0.36	0.26	0.21	0.20	0.27	0.33	0.13	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.37	0.15	0.17	0.28	0.13	0.26	0.13	0.27	0.28	0.33	0.48	0.34	0.26	0.28	0.20	0.13	0.32	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.25	0.15	0.11	0.12	0.14	0.14	0.02	0.19	0.14	0.23	0.34	0.17	0.14	0.10	0.05	0.17	0.07	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00