Doublet Group distance statistics: 53297

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, -0.005, 0.014, 0.033, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.014 std_dev=0.019
N1	A	0, -0.007, 0.015, 0.036, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.015 std_dev=0.022
N9	A	0, -0.005, 0.018, 0.041, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.018 std_dev=0.023
N7	A	0, -0.008, 0.017, 0.043, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.017 std_dev=0.025
C4	A	0, -0.013, 0.013, 0.038, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.013 std_dev=0.025
C8	A	0, -0.010, 0.017, 0.045, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.017 std_dev=0.027
C2	A	0, -0.013, 0.018, 0.049, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.018 std_dev=0.031
N3	A	0, -0.011, 0.020, 0.051, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.020 std_dev=0.031
O6	A	0, -0.003, 0.037, 0.076, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.037 std_dev=0.040
C1'	A	0, -0.014, 0.030, 0.074, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.030 std_dev=0.044
N2	A	0, -0.029, 0.036, 0.101, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.036 std_dev=0.065
C2'	A	0, -0.020, 0.195, 0.410, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.195 std_dev=0.215
O4'	A	0, -0.022, 0.215, 0.452, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.215 std_dev=0.237
C2	B	0, 0.098, 0.346, 0.594, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.346 std_dev=0.248
O2'	A	0, -0.023, 0.242, 0.507, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.242 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.044, 0.315, 0.586, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.315 std_dev=0.271
C4'	A	0, -0.007, 0.322, 0.652, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.322 std_dev=0.329
C3'	A	0, -0.022, 0.309, 0.641, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.309 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.157, 0.501, 0.845, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.501 std_dev=0.344
N2	B	0, 0.123, 0.479, 0.835, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.479 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.276, 0.653, 1.031, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.653 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.135, 0.514, 0.893, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.514 std_dev=0.379
C2'	B	0, 0.217, 0.604, 0.991, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.604 std_dev=0.387
O3'	A	0, -0.035, 0.427, 0.889, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.427 std_dev=0.462
C1'	B	0, 0.133, 0.604, 1.074, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.604 std_dev=0.470
N9	B	0, 0.154, 0.652, 1.150, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.652 std_dev=0.498
OP2	A	0, 0.214, 0.731, 1.247, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.731 std_dev=0.516
C6	B	0, 0.237, 0.763, 1.289, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.763 std_dev=0.526
C5	B	0, 0.232, 0.770, 1.307, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.770 std_dev=0.538
O5'	A	0, 0.082, 0.626, 1.170, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.626 std_dev=0.544
C5'	A	0, 0.022, 0.599, 1.176, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.599 std_dev=0.577
P	A	0, 0.173, 0.791, 1.408, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.791 std_dev=0.618
C3'	B	0, 0.201, 0.852, 1.503, 2.396 max_d=2.396 avg_d=0.852 std_dev=0.651
C8	B	0, 0.252, 0.959, 1.666, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.959 std_dev=0.707
O6	B	0, 0.292, 1.000, 1.709, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.000 std_dev=0.709
O4'	B	0, 0.116, 0.842, 1.569, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.842 std_dev=0.726
N7	B	0, 0.294, 1.051, 1.808, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.051 std_dev=0.757
C4'	B	0, 0.186, 0.966, 1.745, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.966 std_dev=0.779
OP1	A	0, 0.156, 1.000, 1.843, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.000 std_dev=0.844
O3'	B	0, 0.100, 0.946, 1.793, 3.245 max_d=3.245 avg_d=0.946 std_dev=0.846
C5'	B	0, 0.120, 1.215, 2.310, 3.025 max_d=3.025 avg_d=1.215 std_dev=1.095
O5'	B	0, 0.183, 1.558, 2.932, 3.324 max_d=3.324 avg_d=1.558 std_dev=1.374
P	B	0, 0.159, 2.348, 4.538, 5.177 max_d=5.177 avg_d=2.348 std_dev=2.189
OP1	B	0, 0.216, 2.593, 4.970, 5.900 max_d=5.900 avg_d=2.593 std_dev=2.377
OP2	B	0, 0.046, 2.930, 5.815, 7.640 max_d=7.640 avg_d=2.930 std_dev=2.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.05	0.09	0.23	0.13
C2	0.07	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.14	0.20	0.08	0.19	0.02	0.24	0.29	0.22
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.03	0.05	0.10	0.09	0.18	0.13	0.09	0.03	0.01	0.02	0.02	0.08	0.05	0.13	0.21	0.11
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.14	0.12	0.20	0.14	0.11	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.15	0.20	0.10
C4	0.04	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.04	0.19	0.01	0.21	0.28	0.21
C4'	0.02	0.07	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.04	0.12	0.07	0.11	0.04	0.08	0.03	0.01	0.03	0.09	0.11	0.12	0.04
C5	0.03	0.01	0.05	0.06	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.07	0.04	0.26	0.02	0.28	0.31	0.27
C5'	0.03	0.08	0.03	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.17	0.19	0.11	0.09	0.07	0.21	0.10	0.09	0.03	0.03	0.01	0.22	0.11	0.06	0.01
C6	0.05	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.10	0.09	0.05	0.28	0.00	0.32	0.34	0.30
C8	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.12	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.14	0.08	0.25	0.04	0.24	0.27	0.22
N1	0.06	0.00	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.05	0.24	0.02	0.29	0.32	0.27
N2	0.10	0.00	0.18	0.20	0.01	0.12	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.19	0.27	0.12	0.18	0.03	0.22	0.30	0.21
N3	0.07	0.00	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.09	0.16	0.01	0.19	0.28	0.19
N7	0.02	0.02	0.09	0.11	0.00	0.11	0.01	0.21	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.07	0.30	0.05	0.30	0.31	0.29
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.10	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.02	0.16	0.03	0.18	0.26	0.18
O2'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.07	0.08	0.08	0.09	0.10	0.07	0.12	0.19	0.13	0.08	0.04	0.00	0.04	0.04	0.08	0.10	0.09	0.20	0.10
O3'	0.03	0.20	0.02	0.00	0.09	0.03	0.07	0.03	0.09	0.14	0.16	0.27	0.17	0.11	0.05	0.04	0.00	0.03	0.10	0.09	0.18	0.21	0.10
O4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.05	0.12	0.09	0.07	0.02	0.04	0.03	0.00	0.05	0.07	0.03	0.24	0.14
O5'	0.08	0.19	0.08	0.08	0.19	0.03	0.26	0.01	0.28	0.25	0.24	0.18	0.16	0.30	0.16	0.08	0.10	0.05	0.00	0.33	0.02	0.05	0.01
O6	0.05	0.02	0.05	0.08	0.01	0.09	0.02	0.22	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.10	0.09	0.07	0.33	0.00	0.38	0.39	0.36
OP1	0.09	0.24	0.13	0.15	0.21	0.11	0.28	0.11	0.32	0.24	0.29	0.22	0.19	0.30	0.18	0.09	0.18	0.03	0.02	0.38	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.29	0.21	0.20	0.28	0.12	0.31	0.06	0.34	0.27	0.32	0.30	0.28	0.31	0.26	0.20	0.21	0.24	0.05	0.39	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.22	0.11	0.10	0.21	0.04	0.27	0.01	0.30	0.22	0.27	0.21	0.19	0.29	0.18	0.10	0.10	0.14	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.22	0.31	0.21	0.14	0.19	0.19	0.15	0.25	0.17	0.25	0.36	0.17	0.21	0.15	0.31	0.26	0.20	0.28	0.32	0.72	0.74	0.48
C2	0.24	0.23	0.28	0.25	0.18	0.18	0.23	0.22	0.28	0.23	0.22	0.30	0.25	0.30	0.19	0.35	0.24	0.16	0.38	0.39	0.78	0.85	0.59
C2'	0.23	0.35	0.43	0.28	0.22	0.19	0.23	0.14	0.28	0.20	0.32	0.49	0.30	0.23	0.19	0.51	0.41	0.15	0.31	0.33	0.83	0.73	0.52
C3'	0.20	0.27	0.39	0.24	0.19	0.18	0.22	0.14	0.27	0.19	0.27	0.37	0.24	0.23	0.17	0.47	0.42	0.15	0.31	0.33	0.83	0.71	0.52
C4	0.22	0.24	0.33	0.28	0.20	0.16	0.21	0.16	0.23	0.22	0.18	0.33	0.25	0.26	0.20	0.33	0.20	0.14	0.38	0.32	0.71	0.77	0.54
C4'	0.18	0.12	0.23	0.15	0.11	0.22	0.18	0.23	0.23	0.17	0.21	0.19	0.09	0.21	0.13	0.27	0.39	0.25	0.23	0.31	0.77	0.70	0.47
C5	0.24	0.24	0.33	0.32	0.23	0.20	0.25	0.24	0.25	0.26	0.19	0.31	0.26	0.30	0.24	0.32	0.22	0.17	0.44	0.35	0.65	0.77	0.54
C5'	0.20	0.09	0.22	0.16	0.12	0.23	0.15	0.23	0.19	0.16	0.15	0.13	0.12	0.18	0.14	0.24	0.38	0.25	0.22	0.26	0.73	0.72	0.44
C6	0.27	0.24	0.30	0.32	0.23	0.24	0.24	0.33	0.23	0.28	0.19	0.30	0.26	0.31	0.25	0.32	0.25	0.22	0.46	0.35	0.61	0.76	0.53
C8	0.22	0.26	0.35	0.31	0.24	0.18	0.28	0.16	0.33	0.26	0.29	0.32	0.25	0.31	0.23	0.31	0.19	0.14	0.42	0.42	0.66	0.76	0.53
N1	0.28	0.24	0.29	0.29	0.21	0.24	0.23	0.32	0.27	0.26	0.23	0.30	0.26	0.30	0.24	0.34	0.25	0.23	0.44	0.41	0.68	0.78	0.54
N2	0.25	0.25	0.26	0.23	0.21	0.19	0.34	0.24	0.40	0.28	0.30	0.30	0.26	0.41	0.20	0.36	0.29	0.18	0.40	0.50	0.90	0.99	0.69
N3	0.21	0.22	0.31	0.25	0.16	0.16	0.19	0.16	0.21	0.21	0.13	0.32	0.24	0.26	0.18	0.35	0.23	0.14	0.36	0.30	0.78	0.83	0.58
N7	0.24	0.25	0.34	0.34	0.25	0.20	0.29	0.24	0.31	0.28	0.25	0.30	0.26	0.33	0.25	0.31	0.21	0.16	0.46	0.41	0.63	0.78	0.55
N9	0.21	0.25	0.34	0.28	0.20	0.17	0.23	0.13	0.28	0.22	0.25	0.34	0.23	0.26	0.20	0.32	0.20	0.15	0.37	0.35	0.70	0.75	0.52
O2'	0.18	0.37	0.40	0.26	0.19	0.21	0.22	0.22	0.28	0.17	0.34	0.56	0.28	0.21	0.15	0.52	0.50	0.22	0.23	0.32	0.86	0.81	0.54
O3'	0.21	0.29	0.41	0.26	0.19	0.21	0.21	0.17	0.26	0.19	0.28	0.39	0.25	0.23	0.17	0.53	0.50	0.17	0.30	0.32	0.92	0.76	0.56
O4'	0.23	0.11	0.26	0.20	0.13	0.25	0.17	0.23	0.22	0.18	0.19	0.18	0.14	0.20	0.17	0.25	0.28	0.28	0.24	0.31	0.68	0.74	0.45
O5'	0.21	0.19	0.29	0.21	0.17	0.20	0.18	0.14	0.21	0.17	0.19	0.25	0.20	0.19	0.17	0.30	0.32	0.20	0.29	0.26	0.66	0.78	0.45
O6	0.29	0.23	0.30	0.33	0.24	0.29	0.25	0.41	0.23	0.32	0.19	0.30	0.25	0.34	0.28	0.33	0.27	0.27	0.50	0.34	0.53	0.75	0.53
OP1	0.22	0.15	0.27	0.21	0.15	0.23	0.17	0.16	0.20	0.16	0.16	0.19	0.18	0.19	0.17	0.28	0.31	0.22	0.28	0.28	0.65	0.80	0.44
OP2	0.21	0.23	0.25	0.18	0.23	0.21	0.27	0.26	0.31	0.25	0.26	0.25	0.23	0.29	0.22	0.35	0.38	0.23	0.31	0.38	0.42	0.77	0.33
P	0.17	0.15	0.22	0.16	0.15	0.17	0.18	0.17	0.23	0.17	0.19	0.18	0.16	0.20	0.14	0.28	0.33	0.18	0.26	0.31	0.55	0.75	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.16	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.18	0.01	0.16	0.02	0.47	0.45	0.15
C2	0.04	0.00	0.14	0.17	0.01	0.04	0.02	0.21	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.19	0.12	0.05	0.27	0.03	0.40	0.68	0.28
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.05	0.05	0.29	0.07	0.06	0.11	0.17	0.14	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.06	0.32	0.41	0.19
C3'	0.03	0.17	0.00	0.00	0.19	0.01	0.26	0.03	0.26	0.28	0.21	0.15	0.14	0.30	0.18	0.03	0.01	0.03	0.25	0.29	0.21	0.42	0.18
C4	0.02	0.01	0.08	0.19	0.00	0.04	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.03	0.27	0.01	0.38	0.65	0.28
C4'	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.04	0.05	0.04	0.12	0.05	0.18	0.02	0.01	0.03	0.09	0.39	0.60	0.28
C5	0.02	0.02	0.05	0.26	0.01	0.08	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.03	0.33	0.01	0.43	0.86	0.44
C5'	0.16	0.21	0.29	0.03	0.23	0.01	0.26	0.00	0.27	0.27	0.24	0.20	0.20	0.29	0.22	0.16	0.16	0.03	0.01	0.28	0.27	0.27	0.05
C6	0.02	0.02	0.07	0.26	0.01	0.07	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.16	0.17	0.03	0.33	0.00	0.48	0.94	0.48
C8	0.02	0.03	0.06	0.28	0.01	0.11	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.10	0.23	0.07	0.32	0.02	0.37	0.72	0.39
N1	0.03	0.01	0.11	0.21	0.01	0.04	0.01	0.24	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.11	0.04	0.31	0.02	0.43	0.84	0.39
N2	0.04	0.00	0.17	0.15	0.01	0.05	0.02	0.20	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.21	0.17	0.06	0.26	0.04	0.42	0.65	0.24
N3	0.04	0.00	0.14	0.14	0.00	0.04	0.01	0.20	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.14	0.05	0.24	0.02	0.41	0.59	0.22
N7	0.02	0.03	0.04	0.30	0.01	0.12	0.01	0.29	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.26	0.06	0.35	0.02	0.49	0.95	0.52
N9	0.01	0.02	0.02	0.18	0.01	0.05	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.03	0.25	0.01	0.36	0.54	0.22
O2'	0.03	0.19	0.01	0.03	0.13	0.18	0.14	0.16	0.16	0.10	0.18	0.21	0.17	0.12	0.07	0.00	0.07	0.14	0.10	0.17	0.52	0.41	0.20
O3'	0.18	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.17	0.16	0.17	0.23	0.11	0.17	0.14	0.26	0.10	0.07	0.00	0.20	0.36	0.22	0.29	0.48	0.20
O4'	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.07	0.04	0.06	0.05	0.06	0.03	0.14	0.20	0.00	0.19	0.04	0.58	0.58	0.28
O5'	0.16	0.27	0.11	0.25	0.27	0.03	0.33	0.01	0.33	0.32	0.31	0.26	0.24	0.35	0.25	0.10	0.36	0.19	0.00	0.35	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.06	0.29	0.01	0.09	0.01	0.28	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.17	0.22	0.04	0.35	0.00	0.57	1.07	0.57
OP1	0.47	0.40	0.32	0.21	0.38	0.39	0.43	0.27	0.48	0.37	0.43	0.42	0.41	0.49	0.36	0.52	0.29	0.58	0.02	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.68	0.41	0.42	0.65	0.60	0.86	0.27	0.94	0.72	0.84	0.65	0.59	0.95	0.54	0.41	0.48	0.58	0.02	1.07	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.28	0.19	0.18	0.28	0.28	0.44	0.05	0.48	0.39	0.39	0.24	0.22	0.52	0.22	0.20	0.20	0.28	0.01	0.57	0.01	0.01	0.00