Doublet Group distance statistics: 53298

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.016, 0.039, 0.062, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.039 std_dev=0.023
C5	A	0, 0.032, 0.056, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.056 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.017, 0.044, 0.071, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.044 std_dev=0.027
C4	A	0, 0.028, 0.055, 0.083, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.055 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.048, 0.086, 0.123, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.086 std_dev=0.037
O6	A	0, 0.061, 0.118, 0.175, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.118 std_dev=0.057
N7	A	0, 0.060, 0.122, 0.184, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.122 std_dev=0.062
C8	A	0, 0.086, 0.153, 0.221, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.153 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.149, 0.331, 0.513, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.331 std_dev=0.182
C4	B	0, 0.193, 0.379, 0.565, 0.571 max_d=0.571 avg_d=0.379 std_dev=0.186
N9	B	0, 0.224, 0.425, 0.626, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.425 std_dev=0.201
O2'	A	0, 0.144, 0.347, 0.551, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.347 std_dev=0.203
N3	B	0, 0.130, 0.340, 0.550, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.340 std_dev=0.210
C5	B	0, 0.213, 0.432, 0.651, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.432 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.219, 0.445, 0.670, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.445 std_dev=0.226
C1'	B	0, 0.201, 0.430, 0.660, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.430 std_dev=0.229
O4'	A	0, 0.228, 0.476, 0.723, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.476 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.135, 0.386, 0.638, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.386 std_dev=0.251
O6	B	0, 0.261, 0.516, 0.771, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.516 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.072, 0.332, 0.592, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.332 std_dev=0.260
C8	B	0, 0.238, 0.504, 0.770, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.504 std_dev=0.266
N7	B	0, 0.241, 0.513, 0.786, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.513 std_dev=0.272
N2	B	0, 0.102, 0.375, 0.647, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.375 std_dev=0.272
C3'	A	0, 0.251, 0.559, 0.867, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.559 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.282, 0.590, 0.899, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.590 std_dev=0.309
O5'	A	0, 0.296, 0.640, 0.983, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.640 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.283, 0.628, 0.973, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.628 std_dev=0.345
C2'	B	0, 0.378, 0.734, 1.090, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.734 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.274, 0.640, 1.006, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.640 std_dev=0.366
O4'	B	0, 0.370, 0.758, 1.145, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.758 std_dev=0.388
OP2	B	0, 0.653, 1.109, 1.564, 1.540 max_d=1.540 avg_d=1.109 std_dev=0.456
P	A	0, 0.457, 0.946, 1.435, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.946 std_dev=0.489
O5'	B	0, 0.676, 1.223, 1.770, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.223 std_dev=0.547
C5'	A	0, 0.468, 1.052, 1.637, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.052 std_dev=0.585
C3'	B	0, 0.509, 1.096, 1.684, 1.814 max_d=1.814 avg_d=1.096 std_dev=0.588
C4'	B	0, 0.496, 1.096, 1.695, 1.966 max_d=1.966 avg_d=1.096 std_dev=0.599
OP1	A	0, 0.563, 1.175, 1.788, 2.240 max_d=2.240 avg_d=1.175 std_dev=0.612
P	B	0, 0.272, 0.925, 1.578, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.925 std_dev=0.653
OP2	A	0, 0.436, 1.099, 1.762, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.099 std_dev=0.663
O3'	B	0, 0.612, 1.369, 2.126, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.369 std_dev=0.757
C5'	B	0, 0.656, 1.557, 2.459, 2.907 max_d=2.907 avg_d=1.557 std_dev=0.902
OP1	B	0, 0.501, 1.456, 2.411, 3.704 max_d=3.704 avg_d=1.456 std_dev=0.955

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.13	0.04	0.14	0.40	0.16
C2	0.03	0.00	0.09	0.14	0.00	0.04	0.01	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.04	0.21	0.03	0.20	0.49	0.23
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.08	0.10	0.09	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.14	0.07	0.16	0.36	0.14
C3'	0.03	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.05	0.13	0.09	0.15	0.14	0.12	0.10	0.07	0.02	0.01	0.04	0.21	0.14	0.21	0.34	0.17
C4	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.01	0.17	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.23	0.02	0.22	0.48	0.24
C4'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.04	0.04	0.09	0.04	0.06	0.04	0.01	0.05	0.10	0.09	0.31	0.06
C5	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.07	0.00	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.29	0.03	0.29	0.52	0.30
C5'	0.04	0.16	0.04	0.05	0.17	0.01	0.23	0.00	0.23	0.24	0.19	0.12	0.13	0.27	0.16	0.07	0.07	0.03	0.02	0.26	0.16	0.32	0.02
C6	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.10	0.15	0.06	0.29	0.01	0.31	0.55	0.32
C8	0.03	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.02	0.24	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.07	0.30	0.07	0.27	0.48	0.28
N1	0.03	0.00	0.08	0.15	0.02	0.06	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.17	0.04	0.26	0.03	0.26	0.52	0.28
N2	0.04	0.01	0.10	0.14	0.02	0.04	0.01	0.12	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.16	0.17	0.06	0.20	0.05	0.19	0.48	0.22
N3	0.04	0.01	0.09	0.12	0.01	0.04	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.04	0.19	0.01	0.18	0.46	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.27	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.07	0.32	0.07	0.32	0.53	0.32
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.03	0.22	0.04	0.20	0.44	0.21
O2'	0.03	0.12	0.01	0.02	0.08	0.06	0.07	0.07	0.10	0.05	0.11	0.16	0.12	0.05	0.04	0.00	0.05	0.07	0.07	0.10	0.10	0.32	0.07
O3'	0.03	0.16	0.03	0.01	0.10	0.04	0.13	0.07	0.15	0.10	0.17	0.17	0.13	0.12	0.07	0.05	0.00	0.03	0.19	0.16	0.20	0.35	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.06	0.04	0.07	0.03	0.07	0.03	0.00	0.14	0.09	0.14	0.44	0.20
O5'	0.13	0.21	0.14	0.21	0.23	0.05	0.29	0.02	0.29	0.30	0.26	0.20	0.19	0.32	0.22	0.07	0.19	0.14	0.00	0.31	0.03	0.03	0.01
O6	0.04	0.03	0.07	0.14	0.02	0.10	0.03	0.26	0.01	0.07	0.03	0.05	0.01	0.07	0.04	0.10	0.16	0.09	0.31	0.00	0.37	0.60	0.37
OP1	0.14	0.20	0.16	0.21	0.22	0.09	0.29	0.16	0.31	0.27	0.26	0.19	0.18	0.32	0.20	0.10	0.20	0.14	0.03	0.37	0.00	0.04	0.01
OP2	0.40	0.49	0.36	0.34	0.48	0.31	0.52	0.32	0.55	0.48	0.52	0.48	0.46	0.53	0.44	0.32	0.35	0.44	0.03	0.60	0.04	0.00	0.03
P	0.16	0.23	0.14	0.17	0.24	0.06	0.30	0.02	0.32	0.28	0.28	0.22	0.20	0.32	0.21	0.07	0.16	0.20	0.01	0.37	0.01	0.03	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.11	0.16	0.16	0.14	0.16	0.18	0.20	0.23	0.17	0.20	0.12	0.12	0.21	0.14	0.28	0.20	0.22	0.42	0.27	0.33	0.48	0.30
C2	0.21	0.14	0.19	0.21	0.13	0.27	0.13	0.31	0.16	0.21	0.16	0.18	0.13	0.18	0.19	0.25	0.18	0.30	0.49	0.20	0.34	0.58	0.40
C2'	0.17	0.17	0.13	0.16	0.19	0.20	0.23	0.25	0.25	0.22	0.23	0.16	0.16	0.25	0.19	0.16	0.15	0.27	0.43	0.28	0.26	0.52	0.34
C3'	0.14	0.11	0.11	0.14	0.15	0.18	0.19	0.23	0.20	0.20	0.17	0.13	0.11	0.22	0.16	0.19	0.16	0.26	0.43	0.23	0.24	0.50	0.31
C4	0.19	0.12	0.19	0.19	0.16	0.22	0.17	0.28	0.15	0.23	0.10	0.18	0.15	0.23	0.19	0.26	0.18	0.25	0.44	0.20	0.32	0.53	0.36
C4'	0.12	0.17	0.20	0.19	0.15	0.13	0.19	0.19	0.22	0.17	0.21	0.19	0.15	0.21	0.14	0.31	0.28	0.20	0.41	0.25	0.37	0.49	0.30
C5	0.22	0.16	0.22	0.23	0.19	0.26	0.19	0.33	0.12	0.27	0.11	0.21	0.17	0.27	0.23	0.27	0.21	0.27	0.46	0.15	0.36	0.56	0.40
C5'	0.15	0.17	0.23	0.21	0.14	0.16	0.13	0.19	0.13	0.14	0.16	0.24	0.17	0.15	0.14	0.37	0.32	0.21	0.44	0.14	0.42	0.44	0.29
C6	0.25	0.18	0.23	0.25	0.19	0.29	0.17	0.35	0.09	0.28	0.16	0.22	0.18	0.26	0.24	0.27	0.22	0.29	0.50	0.10	0.40	0.58	0.44
C8	0.20	0.14	0.22	0.25	0.20	0.24	0.24	0.33	0.23	0.27	0.15	0.18	0.17	0.30	0.22	0.28	0.24	0.25	0.42	0.27	0.36	0.53	0.36
N1	0.25	0.17	0.23	0.25	0.16	0.30	0.12	0.34	0.12	0.25	0.17	0.20	0.16	0.20	0.23	0.27	0.22	0.31	0.52	0.18	0.39	0.61	0.45
N2	0.20	0.15	0.18	0.23	0.13	0.32	0.17	0.36	0.20	0.19	0.19	0.16	0.11	0.18	0.17	0.23	0.20	0.33	0.51	0.24	0.35	0.57	0.40
N3	0.18	0.12	0.16	0.17	0.14	0.23	0.16	0.27	0.17	0.20	0.15	0.17	0.12	0.20	0.17	0.24	0.14	0.27	0.45	0.21	0.31	0.54	0.35
N7	0.23	0.17	0.23	0.26	0.22	0.27	0.25	0.37	0.20	0.30	0.14	0.21	0.19	0.32	0.25	0.28	0.25	0.27	0.44	0.23	0.39	0.56	0.40
N9	0.17	0.10	0.19	0.20	0.16	0.20	0.20	0.27	0.21	0.22	0.14	0.14	0.14	0.25	0.18	0.27	0.21	0.23	0.41	0.26	0.32	0.52	0.34
O2'	0.21	0.29	0.19	0.20	0.27	0.22	0.30	0.26	0.33	0.28	0.33	0.29	0.26	0.30	0.25	0.16	0.20	0.29	0.45	0.34	0.35	0.56	0.38
O3'	0.17	0.18	0.13	0.13	0.18	0.21	0.21	0.25	0.22	0.22	0.21	0.20	0.16	0.24	0.18	0.18	0.16	0.29	0.45	0.24	0.24	0.51	0.34
O4'	0.20	0.20	0.24	0.21	0.18	0.20	0.21	0.24	0.24	0.20	0.22	0.24	0.21	0.24	0.19	0.39	0.28	0.25	0.44	0.29	0.44	0.49	0.33
O5'	0.24	0.24	0.26	0.30	0.30	0.28	0.38	0.37	0.40	0.37	0.34	0.18	0.24	0.43	0.30	0.32	0.33	0.31	0.49	0.47	0.52	0.63	0.47
O6	0.28	0.21	0.26	0.28	0.22	0.31	0.20	0.37	0.14	0.31	0.20	0.24	0.21	0.28	0.27	0.29	0.26	0.32	0.54	0.13	0.43	0.57	0.47
OP1	0.22	0.24	0.27	0.30	0.28	0.26	0.37	0.37	0.40	0.37	0.33	0.21	0.23	0.44	0.29	0.38	0.36	0.29	0.47	0.47	0.54	0.64	0.45
OP2	0.51	0.42	0.48	0.59	0.54	0.59	0.62	0.73	0.62	0.66	0.51	0.32	0.46	0.70	0.57	0.39	0.56	0.56	0.50	0.68	0.66	0.88	0.65
P	0.27	0.25	0.26	0.35	0.33	0.33	0.41	0.46	0.43	0.42	0.35	0.16	0.26	0.48	0.34	0.29	0.35	0.34	0.44	0.49	0.53	0.66	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.22	0.03	0.29	0.40	0.11
C2	0.04	0.00	0.13	0.23	0.02	0.12	0.02	0.24	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.18	0.26	0.05	0.41	0.02	0.44	0.28	0.24
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.16	0.14	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.26	0.04	0.52	0.33	0.24
C3'	0.04	0.23	0.01	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.18	0.14	0.21	0.26	0.21	0.14	0.09	0.01	0.01	0.02	0.35	0.17	0.63	0.33	0.37
C4	0.02	0.02	0.06	0.15	0.00	0.11	0.01	0.22	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.15	0.03	0.42	0.02	0.38	0.28	0.21
C4'	0.02	0.12	0.02	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.16	0.11	0.14	0.12	0.10	0.13	0.09	0.10	0.03	0.00	0.03	0.17	0.25	0.38	0.10
C5	0.02	0.02	0.03	0.14	0.01	0.14	0.00	0.28	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.04	0.49	0.02	0.38	0.28	0.28
C5'	0.05	0.24	0.02	0.02	0.22	0.01	0.28	0.00	0.32	0.22	0.29	0.23	0.20	0.28	0.17	0.09	0.06	0.02	0.01	0.34	0.18	0.38	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.18	0.01	0.16	0.01	0.32	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.11	0.19	0.04	0.49	0.01	0.42	0.29	0.30
C8	0.02	0.03	0.08	0.14	0.01	0.11	0.01	0.22	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.17	0.05	0.51	0.03	0.30	0.30	0.24
N1	0.04	0.01	0.09	0.21	0.02	0.14	0.01	0.29	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.15	0.23	0.04	0.46	0.03	0.44	0.27	0.28
N2	0.05	0.02	0.16	0.26	0.02	0.12	0.02	0.23	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.21	0.31	0.06	0.38	0.02	0.45	0.27	0.22
N3	0.04	0.01	0.14	0.21	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.17	0.23	0.04	0.37	0.01	0.41	0.28	0.19
N7	0.01	0.02	0.06	0.14	0.00	0.13	0.01	0.28	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.18	0.04	0.54	0.04	0.35	0.29	0.31
N9	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.09	0.02	0.17	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.39	0.03	0.31	0.32	0.16
O2'	0.03	0.18	0.01	0.01	0.10	0.10	0.09	0.09	0.11	0.07	0.15	0.21	0.17	0.07	0.05	0.00	0.07	0.06	0.09	0.11	0.42	0.35	0.14
O3'	0.03	0.26	0.02	0.01	0.15	0.03	0.16	0.06	0.19	0.17	0.23	0.31	0.23	0.18	0.09	0.07	0.00	0.03	0.29	0.20	0.76	0.45	0.45
O4'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.09	0.04	0.13	0.51	0.17
O5'	0.22	0.41	0.26	0.35	0.42	0.03	0.49	0.01	0.49	0.51	0.46	0.38	0.37	0.54	0.39	0.09	0.29	0.09	0.00	0.51	0.05	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.17	0.02	0.17	0.02	0.34	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.11	0.20	0.04	0.51	0.00	0.41	0.30	0.32
OP1	0.29	0.44	0.52	0.63	0.38	0.25	0.38	0.18	0.42	0.30	0.44	0.45	0.41	0.35	0.31	0.42	0.76	0.13	0.05	0.41	0.00	0.04	0.01
OP2	0.40	0.28	0.33	0.33	0.28	0.38	0.28	0.38	0.29	0.30	0.27	0.27	0.28	0.29	0.32	0.35	0.45	0.51	0.02	0.30	0.04	0.00	0.01
P	0.11	0.24	0.24	0.37	0.21	0.10	0.28	0.02	0.30	0.24	0.28	0.22	0.19	0.31	0.16	0.14	0.45	0.17	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00