Doublet Group distance statistics: 53301

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.012, 0.029, 0.047, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.016, 0.035, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.015, 0.036, 0.057, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.036 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.024, 0.048, 0.072, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.048 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.040 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.018, 0.044, 0.070, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.013, 0.041, 0.069, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.041 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.030, 0.060, 0.090, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.060 std_dev=0.030
C8	B	0, 0.071, 0.301, 0.530, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.301 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.068, 0.360, 0.652, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.360 std_dev=0.292
N7	B	0, 0.007, 0.314, 0.621, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.314 std_dev=0.307
C2'	A	0, -0.046, 0.273, 0.592, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.273 std_dev=0.319
O4'	B	0, 0.127, 0.448, 0.769, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.448 std_dev=0.321
O4'	A	0, -0.064, 0.269, 0.602, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.269 std_dev=0.333
C1'	B	0, 0.112, 0.468, 0.824, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.468 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.023, 0.389, 0.755, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.389 std_dev=0.366
C5	B	0, -0.031, 0.354, 0.738, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.354 std_dev=0.385
C4	B	0, 0.009, 0.395, 0.781, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.395 std_dev=0.386
C4'	A	0, 0.003, 0.431, 0.860, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.431 std_dev=0.429
P	B	0, 0.164, 0.614, 1.064, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.614 std_dev=0.450
C3'	A	0, -0.067, 0.412, 0.891, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.412 std_dev=0.479
O5'	A	0, 0.199, 0.683, 1.166, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.683 std_dev=0.483
C6	B	0, -0.085, 0.411, 0.906, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.411 std_dev=0.495
N3	B	0, -0.015, 0.487, 0.990, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.487 std_dev=0.503
O5'	B	0, 0.187, 0.727, 1.268, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.727 std_dev=0.540
N1	B	0, -0.066, 0.501, 1.068, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.501 std_dev=0.567
C2	B	0, -0.041, 0.534, 1.109, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.534 std_dev=0.575
O6	B	0, -0.151, 0.426, 1.003, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.426 std_dev=0.577
P	A	0, 0.045, 0.635, 1.224, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.635 std_dev=0.589
C4'	B	0, 0.112, 0.716, 1.321, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.716 std_dev=0.604
OP2	B	0, 0.178, 0.796, 1.413, 1.915 max_d=1.915 avg_d=0.796 std_dev=0.618
O3'	A	0, -0.040, 0.579, 1.198, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.579 std_dev=0.619
OP1	B	0, 0.154, 0.806, 1.457, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.806 std_dev=0.651
N2	B	0, -0.038, 0.634, 1.307, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.634 std_dev=0.673
C2'	B	0, 0.115, 0.831, 1.547, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.831 std_dev=0.716
OP1	A	0, 0.038, 0.844, 1.650, 2.698 max_d=2.698 avg_d=0.844 std_dev=0.806
C5'	A	0, 0.054, 0.865, 1.676, 2.182 max_d=2.182 avg_d=0.865 std_dev=0.811
C3'	B	0, 0.104, 0.921, 1.737, 2.054 max_d=2.054 avg_d=0.921 std_dev=0.817
C5'	B	0, 0.112, 0.933, 1.755, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.933 std_dev=0.822
O3'	B	0, 0.110, 1.090, 2.071, 3.130 max_d=3.130 avg_d=1.090 std_dev=0.980
O2'	B	0, 0.197, 1.205, 2.213, 3.171 max_d=3.171 avg_d=1.205 std_dev=1.008
OP2	A	0, -0.038, 1.405, 2.848, 4.029 max_d=4.029 avg_d=1.405 std_dev=1.443

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.06	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.26	0.02	0.27	0.51	0.22
C2	0.07	0.00	0.15	0.22	0.01	0.16	0.01	0.37	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.25	0.12	0.42	0.03	0.70	1.17	0.45
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.03	0.08	0.12	0.13	0.18	0.15	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.20	0.08	0.40	0.23	0.21
C3'	0.02	0.22	0.01	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.07	0.17	0.15	0.29	0.22	0.14	0.06	0.01	0.01	0.02	0.34	0.05	0.50	0.14	0.29
C4	0.03	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.05	0.39	0.01	0.59	0.88	0.38
C4'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.08	0.13	0.20	0.14	0.08	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.16	0.35	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.04	0.39	0.02	0.66	0.91	0.37
C5'	0.05	0.37	0.03	0.02	0.23	0.00	0.24	0.00	0.30	0.16	0.34	0.43	0.33	0.21	0.13	0.05	0.08	0.03	0.01	0.30	0.39	0.43	0.02
C6	0.03	0.02	0.08	0.07	0.01	0.10	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.10	0.06	0.40	0.00	0.73	1.03	0.39
C8	0.02	0.01	0.12	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.18	0.02	0.33	0.04	0.51	0.70	0.31
N1	0.06	0.01	0.13	0.15	0.02	0.13	0.01	0.34	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.18	0.10	0.41	0.02	0.74	1.14	0.43
N2	0.08	0.01	0.18	0.29	0.01	0.20	0.02	0.43	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.33	0.14	0.40	0.04	0.70	1.32	0.48
N3	0.07	0.01	0.15	0.22	0.01	0.14	0.01	0.33	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.22	0.12	0.42	0.02	0.61	1.00	0.42
N7	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.08	0.00	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.02	0.36	0.04	0.61	0.80	0.33
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.13	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.34	0.02	0.47	0.70	0.32
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.08	0.04	0.00	0.05	0.06	0.13	0.10	0.19	0.24	0.11
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.10	0.02	0.06	0.08	0.10	0.18	0.18	0.33	0.22	0.14	0.06	0.05	0.00	0.02	0.50	0.08	0.49	0.40	0.36
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.03	0.06	0.02	0.10	0.14	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.37	0.05	0.15	0.60	0.28
O5'	0.26	0.42	0.20	0.34	0.39	0.01	0.39	0.01	0.40	0.33	0.41	0.40	0.42	0.36	0.34	0.13	0.50	0.37	0.00	0.39	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.03	0.08	0.05	0.01	0.09	0.02	0.30	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.10	0.08	0.05	0.39	0.00	0.75	1.04	0.39
OP1	0.27	0.70	0.40	0.50	0.59	0.16	0.66	0.39	0.73	0.51	0.74	0.70	0.61	0.61	0.47	0.19	0.49	0.15	0.02	0.75	0.00	0.02	0.01
OP2	0.51	1.17	0.23	0.14	0.88	0.35	0.91	0.43	1.03	0.70	1.14	1.32	1.00	0.80	0.70	0.24	0.40	0.60	0.02	1.04	0.02	0.00	0.00
P	0.22	0.45	0.21	0.29	0.38	0.03	0.37	0.02	0.39	0.31	0.43	0.48	0.42	0.33	0.32	0.11	0.36	0.28	0.01	0.39	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.41	0.38	0.47	0.31	0.45	0.21	0.61	0.24	0.11	0.34	0.47	0.41	0.11	0.27	0.47	0.37	0.38	0.29	0.22	0.22	0.26	0.10
C2	0.33	0.62	0.27	0.47	0.42	0.29	0.34	0.33	0.45	0.12	0.59	0.67	0.55	0.11	0.30	0.17	0.29	0.25	0.39	0.38	0.33	0.53	0.32
C2'	0.45	0.44	0.52	0.58	0.40	0.50	0.36	0.69	0.36	0.31	0.41	0.47	0.44	0.29	0.39	0.58	0.45	0.42	0.34	0.33	0.26	0.23	0.18
C3'	0.10	0.24	0.26	0.23	0.17	0.12	0.20	0.27	0.25	0.08	0.26	0.27	0.20	0.16	0.11	0.20	0.21	0.15	0.10	0.27	0.04	0.19	0.03
C4	0.35	0.52	0.30	0.39	0.36	0.31	0.23	0.39	0.28	0.07	0.43	0.59	0.50	0.04	0.28	0.32	0.20	0.28	0.29	0.20	0.20	0.45	0.20
C4'	0.12	0.22	0.21	0.17	0.14	0.11	0.15	0.25	0.18	0.19	0.21	0.26	0.19	0.19	0.12	0.08	0.18	0.14	0.08	0.21	0.05	0.35	0.12
C5	0.33	0.52	0.33	0.33	0.31	0.24	0.11	0.31	0.16	0.09	0.37	0.62	0.50	0.13	0.23	0.37	0.13	0.21	0.23	0.12	0.17	0.47	0.18
C5'	0.38	0.22	0.52	0.31	0.32	0.34	0.33	0.35	0.26	0.49	0.22	0.20	0.27	0.45	0.39	0.45	0.34	0.37	0.23	0.26	0.28	0.62	0.32
C6	0.32	0.60	0.34	0.37	0.33	0.21	0.12	0.25	0.18	0.09	0.46	0.71	0.54	0.12	0.23	0.32	0.11	0.18	0.26	0.11	0.21	0.50	0.22
C8	0.33	0.37	0.33	0.29	0.21	0.31	0.05	0.42	0.10	0.12	0.24	0.47	0.38	0.15	0.18	0.52	0.28	0.25	0.25	0.12	0.20	0.42	0.18
N1	0.32	0.64	0.29	0.43	0.39	0.24	0.25	0.26	0.36	0.07	0.58	0.72	0.56	0.02	0.26	0.20	0.20	0.21	0.33	0.22	0.28	0.52	0.28
N2	0.32	0.62	0.25	0.52	0.43	0.31	0.38	0.33	0.51	0.16	0.62	0.67	0.54	0.18	0.31	0.13	0.39	0.26	0.46	0.51	0.41	0.57	0.40
N3	0.35	0.57	0.28	0.47	0.42	0.33	0.34	0.39	0.40	0.14	0.52	0.62	0.52	0.13	0.32	0.24	0.30	0.29	0.38	0.33	0.30	0.49	0.29
N7	0.32	0.40	0.36	0.26	0.21	0.24	0.03	0.32	0.05	0.16	0.23	0.52	0.41	0.20	0.18	0.51	0.25	0.20	0.23	0.14	0.18	0.47	0.19
N9	0.36	0.44	0.33	0.38	0.31	0.36	0.17	0.48	0.21	0.07	0.34	0.51	0.44	0.06	0.25	0.42	0.26	0.31	0.26	0.17	0.18	0.38	0.14
O2'	0.63	0.53	0.74	0.84	0.50	0.78	0.41	1.02	0.39	0.39	0.45	0.56	0.55	0.33	0.51	0.87	0.72	0.64	0.46	0.34	0.46	0.19	0.28
O3'	0.11	0.26	0.33	0.28	0.22	0.13	0.27	0.23	0.31	0.19	0.30	0.27	0.22	0.26	0.17	0.31	0.31	0.20	0.02	0.35	0.01	0.01	0.01
O4'	0.19	0.35	0.13	0.26	0.22	0.23	0.22	0.39	0.27	0.17	0.32	0.41	0.31	0.24	0.15	0.18	0.20	0.17	0.15	0.30	0.10	0.33	0.05
O5'	0.28	0.59	0.19	0.39	0.45	0.28	0.49	0.27	0.59	0.28	0.63	0.63	0.51	0.38	0.33	0.20	0.42	0.33	0.36	0.64	0.49	0.33	0.39
O6	0.31	0.57	0.40	0.36	0.27	0.18	0.08	0.20	0.06	0.12	0.36	0.75	0.51	0.18	0.20	0.38	0.15	0.15	0.23	0.20	0.20	0.51	0.21
OP1	0.83	1.12	0.61	0.92	1.02	0.72	1.06	0.59	1.12	0.86	1.14	1.14	1.06	0.97	0.91	0.57	1.01	0.77	0.63	1.12	0.71	0.89	0.68
OP2	0.33	1.01	0.41	0.33	0.70	0.36	0.81	0.50	1.09	0.37	1.14	1.08	0.81	0.59	0.45	0.46	0.37	0.38	0.34	1.25	0.51	0.51	0.42
P	0.25	0.60	0.21	0.28	0.44	0.17	0.47	0.05	0.60	0.24	0.65	0.64	0.50	0.34	0.30	0.31	0.35	0.29	0.24	0.66	0.29	0.18	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.20	0.02	0.20	0.41	0.18
C2	0.04	0.00	0.23	0.21	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.38	0.28	0.10	0.28	0.01	0.28	0.53	0.29
C2'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.18	0.10	0.12	0.18	0.29	0.22	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.48	0.07	0.50	0.46	0.43
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.23	0.01	0.33	0.02	0.33	0.39	0.27	0.21	0.17	0.41	0.23	0.02	0.01	0.02	0.34	0.38	0.39	0.26	0.27
C4	0.02	0.01	0.11	0.23	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.28	0.10	0.05	0.30	0.01	0.28	0.51	0.28
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.12	0.20	0.07	0.01	0.02	0.20	0.09	0.29	0.03	0.00	0.01	0.15	0.14	0.35	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.33	0.01	0.13	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.13	0.03	0.38	0.01	0.39	0.59	0.37
C5'	0.06	0.05	0.18	0.02	0.07	0.01	0.14	0.00	0.14	0.17	0.09	0.05	0.03	0.20	0.07	0.12	0.19	0.02	0.00	0.18	0.17	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.33	0.01	0.12	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.12	0.05	0.39	0.00	0.43	0.63	0.40
C8	0.01	0.01	0.12	0.39	0.01	0.20	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.28	0.27	0.08	0.38	0.01	0.35	0.54	0.32
N1	0.03	0.00	0.18	0.27	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.39	0.15	0.07	0.34	0.02	0.36	0.59	0.35
N2	0.06	0.01	0.29	0.21	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.41	0.38	0.11	0.25	0.03	0.25	0.51	0.27
N3	0.03	0.01	0.22	0.17	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.33	0.31	0.09	0.25	0.01	0.23	0.48	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.41	0.01	0.20	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.30	0.05	0.43	0.01	0.45	0.62	0.41
N9	0.01	0.02	0.01	0.23	0.01	0.09	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.19	0.03	0.01	0.28	0.01	0.24	0.47	0.24
O2'	0.02	0.38	0.00	0.02	0.28	0.29	0.32	0.12	0.37	0.28	0.39	0.41	0.33	0.32	0.19	0.00	0.04	0.21	0.41	0.38	0.49	0.56	0.43
O3'	0.26	0.28	0.02	0.01	0.10	0.03	0.13	0.19	0.12	0.27	0.15	0.38	0.31	0.30	0.03	0.04	0.00	0.18	0.32	0.20	0.43	0.35	0.34
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.07	0.11	0.09	0.05	0.01	0.21	0.18	0.00	0.12	0.04	0.11	0.51	0.23
O5'	0.20	0.28	0.48	0.34	0.30	0.01	0.38	0.00	0.39	0.38	0.34	0.25	0.25	0.43	0.28	0.41	0.32	0.12	0.00	0.44	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.38	0.01	0.15	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.38	0.20	0.04	0.44	0.00	0.51	0.69	0.47
OP1	0.20	0.28	0.50	0.39	0.28	0.14	0.39	0.17	0.43	0.35	0.36	0.25	0.23	0.45	0.24	0.49	0.43	0.11	0.03	0.51	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.53	0.46	0.26	0.51	0.35	0.59	0.37	0.63	0.54	0.59	0.51	0.48	0.62	0.47	0.56	0.35	0.51	0.02	0.69	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.29	0.43	0.27	0.28	0.07	0.37	0.02	0.40	0.32	0.35	0.27	0.24	0.41	0.24	0.43	0.34	0.23	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00