Doublet Group distance statistics: 53302

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.008, 0.031, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.031 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.012, 0.039, 0.066, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.019, 0.048, 0.078, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.048 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.019, 0.051, 0.084, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.051 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.007, 0.040, 0.073, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.040 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.014, 0.049, 0.084, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.049 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.012, 0.047, 0.083, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.047 std_dev=0.036
C1'	A	0, 0.018, 0.055, 0.092, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.055 std_dev=0.037
O6	A	0, 0.014, 0.054, 0.095, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.054 std_dev=0.040
N2	A	0, 0.031, 0.093, 0.155, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.093 std_dev=0.062
O4'	A	0, 0.026, 0.154, 0.282, 0.338 max_d=0.338 avg_d=0.154 std_dev=0.128
OP2	A	0, 0.124, 0.324, 0.523, 0.489 max_d=0.489 avg_d=0.324 std_dev=0.199
N9	B	0, 0.080, 0.281, 0.482, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.281 std_dev=0.201
C4'	A	0, 0.044, 0.251, 0.459, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.251 std_dev=0.208
C8	B	0, 0.092, 0.303, 0.514, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.303 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.037, 0.256, 0.475, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.256 std_dev=0.219
N7	B	0, 0.090, 0.317, 0.545, 0.572 max_d=0.572 avg_d=0.317 std_dev=0.227
C3'	A	0, 0.052, 0.280, 0.507, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.280 std_dev=0.228
C1'	B	0, 0.110, 0.341, 0.571, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.341 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.041, 0.276, 0.511, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.276 std_dev=0.235
N3	B	0, 0.010, 0.268, 0.525, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.268 std_dev=0.257
O4'	B	0, 0.123, 0.385, 0.646, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.385 std_dev=0.262
P	A	0, 0.043, 0.321, 0.599, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.321 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.025, 0.307, 0.589, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.307 std_dev=0.282
C2'	A	0, -0.041, 0.252, 0.546, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.252 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.105, 0.401, 0.697, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.401 std_dev=0.296
OP1	A	0, 0.046, 0.344, 0.643, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.344 std_dev=0.299
O3'	A	0, 0.094, 0.395, 0.695, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.395 std_dev=0.300
O2'	B	0, 0.186, 0.493, 0.800, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.493 std_dev=0.307
N1	B	0, -0.029, 0.284, 0.596, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.284 std_dev=0.312
O6	B	0, 0.057, 0.373, 0.688, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.373 std_dev=0.315
C2	B	0, -0.065, 0.256, 0.577, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.256 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.153, 0.477, 0.801, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.477 std_dev=0.324
C3'	B	0, 0.121, 0.448, 0.776, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.448 std_dev=0.328
C5'	A	0, 0.034, 0.375, 0.716, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.375 std_dev=0.341
N2	B	0, -0.024, 0.337, 0.699, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.337 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.150, 0.519, 0.888, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.519 std_dev=0.369
O5'	A	0, -0.001, 0.375, 0.751, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.375 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.152, 0.556, 0.960, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.556 std_dev=0.404
C5'	B	0, 0.210, 0.618, 1.025, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.618 std_dev=0.408
P	B	0, 0.047, 0.457, 0.868, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.457 std_dev=0.411
OP1	B	0, 0.235, 0.650, 1.066, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.650 std_dev=0.415
OP2	B	0, 0.110, 0.556, 1.003, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.556 std_dev=0.446
O2'	A	0, -0.141, 0.408, 0.956, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.408 std_dev=0.548

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.08	0.14	0.11	0.03	0.01	0.02	0.10	0.00	0.06	0.02	0.15	0.04	0.07
C2	0.11	0.00	0.29	0.13	0.01	0.12	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.45	0.12	0.07	0.18	0.01	0.09	0.16	0.10
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.14	0.02	0.08	0.05	0.13	0.08	0.23	0.36	0.28	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.14	0.10	0.04	0.22	0.09
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.08	0.10	0.19	0.10	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.09	0.04
C4	0.05	0.01	0.14	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.25	0.05	0.03	0.14	0.01	0.10	0.09	0.06
C4'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.11	0.16	0.09	0.02	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.05	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.04	0.03	0.19	0.01	0.09	0.14	0.09
C5'	0.02	0.16	0.05	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.15	0.07	0.17	0.18	0.11	0.10	0.05	0.12	0.09	0.01	0.01	0.16	0.01	0.05	0.01
C6	0.03	0.01	0.13	0.06	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.27	0.06	0.04	0.23	0.00	0.11	0.19	0.14
C8	0.05	0.01	0.08	0.08	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.15	0.04	0.10	0.08	0.05
N1	0.08	0.00	0.23	0.10	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.39	0.10	0.07	0.22	0.01	0.12	0.21	0.15
N2	0.14	0.00	0.36	0.19	0.02	0.16	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.54	0.16	0.09	0.18	0.01	0.09	0.18	0.11
N3	0.11	0.01	0.28	0.10	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.41	0.10	0.06	0.12	0.01	0.10	0.09	0.06
N7	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.18	0.04	0.09	0.12	0.08
N9	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.09	0.03	0.02	0.11	0.02	0.13	0.06	0.06
O2'	0.02	0.45	0.00	0.02	0.25	0.18	0.19	0.12	0.27	0.04	0.39	0.54	0.41	0.05	0.09	0.00	0.01	0.10	0.03	0.24	0.16	0.17	0.02
O3'	0.10	0.12	0.01	0.00	0.05	0.02	0.04	0.09	0.06	0.03	0.10	0.16	0.10	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.15	0.06	0.10	0.07	0.12
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.07	0.09	0.06	0.03	0.02	0.10	0.06	0.00	0.03	0.03	0.18	0.05	0.12
O5'	0.06	0.18	0.14	0.04	0.14	0.01	0.19	0.01	0.23	0.15	0.22	0.18	0.12	0.18	0.11	0.03	0.15	0.03	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.24	0.06	0.03	0.25	0.00	0.13	0.23	0.18
OP1	0.15	0.09	0.04	0.05	0.10	0.08	0.09	0.01	0.11	0.10	0.12	0.09	0.10	0.09	0.13	0.16	0.10	0.18	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.16	0.22	0.09	0.09	0.04	0.14	0.05	0.19	0.08	0.21	0.18	0.09	0.12	0.06	0.17	0.07	0.05	0.01	0.23	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.01	0.14	0.05	0.15	0.11	0.06	0.08	0.06	0.02	0.12	0.12	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.05	0.10	0.10	0.03	0.19	0.06	0.33	0.04	0.12	0.02	0.08	0.05	0.12	0.06	0.20	0.08	0.16	0.40	0.06	0.27	0.39	0.24
C2	0.18	0.10	0.18	0.14	0.11	0.13	0.08	0.10	0.06	0.13	0.08	0.10	0.11	0.08	0.15	0.21	0.15	0.14	0.26	0.07	0.18	0.16	0.07
C2'	0.10	0.07	0.12	0.17	0.08	0.22	0.15	0.38	0.16	0.17	0.10	0.07	0.06	0.21	0.08	0.23	0.19	0.14	0.44	0.20	0.29	0.46	0.25
C3'	0.13	0.07	0.13	0.17	0.07	0.20	0.07	0.36	0.06	0.11	0.04	0.09	0.09	0.11	0.09	0.22	0.17	0.14	0.40	0.08	0.26	0.39	0.23
C4	0.10	0.07	0.13	0.05	0.04	0.05	0.02	0.13	0.02	0.05	0.03	0.08	0.08	0.06	0.05	0.19	0.06	0.05	0.37	0.05	0.16	0.16	0.12
C4'	0.09	0.06	0.10	0.13	0.04	0.20	0.06	0.38	0.05	0.10	0.04	0.08	0.06	0.10	0.06	0.20	0.13	0.13	0.40	0.07	0.26	0.39	0.23
C5	0.07	0.05	0.10	0.07	0.05	0.11	0.08	0.14	0.07	0.10	0.05	0.06	0.05	0.11	0.07	0.12	0.07	0.12	0.39	0.09	0.16	0.10	0.14
C5'	0.09	0.11	0.10	0.11	0.09	0.18	0.11	0.35	0.12	0.11	0.12	0.12	0.09	0.12	0.08	0.20	0.11	0.11	0.40	0.14	0.25	0.34	0.21
C6	0.08	0.04	0.10	0.09	0.07	0.08	0.10	0.09	0.09	0.11	0.05	0.05	0.05	0.12	0.09	0.10	0.10	0.09	0.35	0.10	0.08	0.10	0.10
C8	0.15	0.08	0.11	0.15	0.10	0.25	0.12	0.32	0.10	0.19	0.09	0.10	0.07	0.17	0.15	0.14	0.12	0.28	0.46	0.11	0.29	0.20	0.24
N1	0.13	0.07	0.14	0.13	0.09	0.11	0.08	0.11	0.04	0.14	0.05	0.09	0.08	0.12	0.12	0.15	0.13	0.11	0.29	0.05	0.11	0.14	0.07
N2	0.23	0.11	0.21	0.20	0.15	0.22	0.12	0.20	0.10	0.20	0.10	0.11	0.13	0.15	0.19	0.24	0.20	0.22	0.22	0.10	0.31	0.23	0.18
N3	0.17	0.09	0.17	0.10	0.10	0.08	0.06	0.03	0.06	0.07	0.06	0.09	0.11	0.04	0.12	0.23	0.11	0.09	0.28	0.08	0.17	0.17	0.04
N7	0.15	0.10	0.11	0.13	0.12	0.21	0.14	0.25	0.13	0.18	0.12	0.09	0.09	0.17	0.16	0.10	0.12	0.24	0.44	0.13	0.25	0.13	0.21
N9	0.08	0.05	0.11	0.08	0.02	0.16	0.06	0.27	0.05	0.13	0.03	0.08	0.05	0.12	0.06	0.19	0.06	0.16	0.43	0.07	0.25	0.24	0.21
O2'	0.26	0.27	0.17	0.19	0.35	0.24	0.44	0.45	0.43	0.51	0.34	0.22	0.24	0.53	0.37	0.21	0.12	0.30	0.44	0.47	0.59	0.87	0.59
O3'	0.12	0.07	0.10	0.09	0.07	0.11	0.09	0.34	0.08	0.12	0.05	0.08	0.08	0.13	0.08	0.24	0.09	0.07	0.31	0.11	0.29	0.44	0.28
O4'	0.08	0.06	0.10	0.10	0.03	0.19	0.03	0.34	0.01	0.09	0.03	0.08	0.05	0.08	0.05	0.20	0.08	0.14	0.40	0.03	0.25	0.35	0.22
O5'	0.12	0.20	0.12	0.06	0.15	0.11	0.16	0.27	0.19	0.11	0.20	0.21	0.17	0.13	0.12	0.21	0.06	0.06	0.39	0.20	0.19	0.24	0.14
O6	0.10	0.05	0.10	0.11	0.12	0.11	0.17	0.11	0.17	0.14	0.12	0.01	0.06	0.18	0.12	0.09	0.11	0.13	0.36	0.19	0.09	0.11	0.13
OP1	0.16	0.13	0.19	0.17	0.12	0.22	0.09	0.32	0.09	0.10	0.11	0.14	0.14	0.07	0.13	0.26	0.18	0.17	0.41	0.08	0.19	0.24	0.15
OP2	0.15	0.21	0.15	0.04	0.17	0.03	0.19	0.16	0.22	0.13	0.22	0.22	0.18	0.16	0.14	0.22	0.02	0.03	0.32	0.23	0.23	0.16	0.05
P	0.13	0.14	0.14	0.10	0.11	0.14	0.10	0.25	0.12	0.08	0.14	0.15	0.12	0.07	0.10	0.22	0.10	0.10	0.39	0.13	0.17	0.19	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.03	0.11	0.26	0.03
C2	0.06	0.00	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.12	0.04	0.21	0.01	0.15	0.07	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.04	0.24	0.16	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.10	0.13	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.28	0.09	0.12
C4	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.23	0.02	0.15	0.08	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.05	0.07	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.25	0.05
C5	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.26	0.01	0.16	0.08	0.13
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.13	0.06	0.12	0.11	0.09	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.14	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.02	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.01	0.25	0.00	0.17	0.11	0.14
C8	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.29	0.01	0.15	0.07	0.12
N1	0.05	0.01	0.05	0.10	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.11	0.03	0.23	0.01	0.16	0.08	0.12
N2	0.07	0.00	0.08	0.13	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.17	0.14	0.05	0.20	0.03	0.15	0.08	0.09
N3	0.06	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.04	0.20	0.01	0.15	0.10	0.08
N7	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.29	0.01	0.17	0.12	0.15
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.23	0.02	0.14	0.13	0.08
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.06	0.04	0.09	0.02	0.12	0.17	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.09	0.17	0.31	0.08
O3'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.11	0.14	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.31	0.09	0.10
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.11	0.02	0.07	0.34	0.10
O5'	0.14	0.21	0.10	0.08	0.23	0.01	0.26	0.01	0.25	0.29	0.23	0.20	0.20	0.29	0.23	0.05	0.02	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.02	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.02	0.27	0.00	0.18	0.17	0.16
OP1	0.11	0.15	0.24	0.28	0.15	0.07	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.15	0.15	0.17	0.14	0.17	0.31	0.07	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.07	0.16	0.09	0.08	0.25	0.08	0.14	0.11	0.07	0.08	0.08	0.10	0.12	0.13	0.31	0.09	0.34	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.09	0.07	0.12	0.09	0.05	0.13	0.01	0.14	0.12	0.12	0.09	0.08	0.15	0.08	0.08	0.10	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00