Doublet Group distance statistics: 53304

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C6	A	0, -0.001, 0.007, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N7	A	0, -0.003, 0.024, 0.050, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.024 std_dev=0.026
N1	A	0, -0.015, 0.024, 0.062, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.024 std_dev=0.038
C8	A	0, -0.009, 0.030, 0.069, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.030 std_dev=0.039
N9	A	0, -0.015, 0.025, 0.064, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.025 std_dev=0.039
N3	A	0, -0.017, 0.024, 0.065, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.024 std_dev=0.041
O6	A	0, -0.021, 0.039, 0.098, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.039 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.053, 0.143, 0.234, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.143 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.061, 0.168, 0.274, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.168 std_dev=0.106
O2'	A	0, 0.086, 0.222, 0.357, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.222 std_dev=0.136
C4	B	0, 0.086, 0.234, 0.383, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.234 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.138, 0.304, 0.469, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.304 std_dev=0.166
C4'	A	0, 0.076, 0.252, 0.429, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.252 std_dev=0.177
N3	B	0, 0.162, 0.378, 0.593, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.378 std_dev=0.216
N9	B	0, 0.273, 0.505, 0.737, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.505 std_dev=0.232
O3'	A	0, 0.212, 0.462, 0.712, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.462 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.207, 0.483, 0.759, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.483 std_dev=0.276
C2	B	0, 0.278, 0.600, 0.922, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.600 std_dev=0.322
C5'	A	0, 0.238, 0.575, 0.912, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.575 std_dev=0.337
C8	B	0, 0.434, 0.799, 1.164, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.799 std_dev=0.365
C1'	B	0, 0.352, 0.717, 1.082, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.717 std_dev=0.365
N7	B	0, 0.409, 0.789, 1.170, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.789 std_dev=0.380
C6	B	0, 0.281, 0.672, 1.063, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.672 std_dev=0.391
O5'	A	0, 0.284, 0.676, 1.069, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.676 std_dev=0.392
N1	B	0, 0.303, 0.699, 1.095, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.699 std_dev=0.396
N2	B	0, 0.433, 0.913, 1.393, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.913 std_dev=0.480
O6	B	0, 0.432, 0.970, 1.508, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.970 std_dev=0.538
P	A	0, 0.411, 1.062, 1.714, 1.968 max_d=1.968 avg_d=1.062 std_dev=0.652
O4'	B	0, 0.864, 1.528, 2.191, 2.223 max_d=2.223 avg_d=1.528 std_dev=0.664
OP2	A	0, 0.471, 1.222, 1.974, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.222 std_dev=0.752
OP1	A	0, 0.420, 1.195, 1.971, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.195 std_dev=0.775
C2'	B	0, 1.375, 2.386, 3.398, 3.256 max_d=3.256 avg_d=2.386 std_dev=1.012
C4'	B	0, 1.378, 2.407, 3.436, 3.493 max_d=3.493 avg_d=2.407 std_dev=1.029
C3'	B	0, 1.385, 2.436, 3.487, 3.592 max_d=3.592 avg_d=2.436 std_dev=1.051
O3'	B	0, 1.466, 2.565, 3.665, 3.760 max_d=3.760 avg_d=2.565 std_dev=1.100
O2'	B	0, 1.836, 3.137, 4.439, 3.964 max_d=3.964 avg_d=3.137 std_dev=1.301
C5'	B	0, 2.008, 3.512, 5.016, 4.914 max_d=4.914 avg_d=3.512 std_dev=1.504
O5'	B	0, 2.736, 4.676, 6.615, 6.208 max_d=6.208 avg_d=4.676 std_dev=1.939
P	B	0, 3.353, 5.691, 8.029, 7.232 max_d=7.232 avg_d=5.691 std_dev=2.338
OP2	B	0, 3.562, 6.056, 8.551, 7.716 max_d=7.716 avg_d=6.056 std_dev=2.495
OP1	B	0, 3.850, 6.538, 9.225, 8.344 max_d=8.344 avg_d=6.538 std_dev=2.687

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.19	0.02	0.24	0.31	0.22
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03	0.13	0.13	0.08
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.10	0.10	0.09	0.08	0.11	0.07	0.02	0.01	0.03	0.07	0.11	0.16	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.04	0.20	0.02	0.22	0.27	0.20
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.06	0.10	0.04	0.04	0.03	0.10	0.05	0.07	0.03	0.01	0.03	0.08	0.06	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.07	0.25	0.01	0.28	0.35	0.27
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.12	0.02	0.17	0.00	0.17	0.19	0.13	0.08	0.09	0.21	0.12	0.07	0.05	0.06	0.01	0.19	0.07	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.12	0.05	0.26	0.01	0.31	0.39	0.30
C8	0.02	0.00	0.04	0.10	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.11	0.10	0.24	0.01	0.23	0.25	0.23
N1	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.04	0.23	0.01	0.28	0.36	0.26
N2	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.17	0.03	0.23	0.30	0.20
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.03	0.00	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.17	0.03	0.20	0.26	0.18
N7	0.02	0.00	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.09	0.27	0.01	0.30	0.35	0.30
N9	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.06	0.17	0.01	0.17	0.20	0.15
O2'	0.03	0.05	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.07	0.04	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.03	0.00	0.08	0.07	0.07	0.04	0.14	0.11	0.08
O3'	0.04	0.10	0.03	0.01	0.08	0.03	0.11	0.05	0.12	0.11	0.12	0.12	0.09	0.12	0.06	0.08	0.00	0.05	0.07	0.13	0.22	0.14	0.14
O4'	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.07	0.06	0.05	0.10	0.04	0.03	0.03	0.09	0.06	0.07	0.05	0.00	0.07	0.06	0.05	0.12	0.08
O5'	0.08	0.19	0.07	0.07	0.20	0.03	0.25	0.01	0.26	0.24	0.23	0.17	0.17	0.27	0.17	0.07	0.07	0.07	0.00	0.28	0.03	0.01	0.01
O6	0.00	0.02	0.03	0.11	0.02	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.13	0.06	0.28	0.00	0.36	0.45	0.35
OP1	0.08	0.24	0.13	0.16	0.22	0.06	0.28	0.07	0.31	0.23	0.28	0.23	0.20	0.30	0.17	0.14	0.22	0.05	0.03	0.36	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.31	0.13	0.13	0.27	0.05	0.35	0.01	0.39	0.25	0.36	0.30	0.26	0.35	0.20	0.11	0.14	0.12	0.01	0.45	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.22	0.08	0.10	0.20	0.02	0.27	0.02	0.30	0.23	0.26	0.20	0.18	0.30	0.15	0.08	0.14	0.08	0.01	0.35	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.31	0.23	0.12	0.24	0.16	0.27	0.23	0.13	0.21	0.16	0.14	0.16	0.12	0.46	0.31	0.26	0.37	0.29	0.54	0.88	0.58
C2	0.13	0.12	0.18	0.14	0.06	0.25	0.09	0.32	0.12	0.11	0.12	0.17	0.13	0.12	0.07	0.31	0.24	0.26	0.38	0.16	0.59	0.90	0.61
C2'	0.22	0.13	0.31	0.24	0.12	0.30	0.12	0.34	0.18	0.11	0.17	0.17	0.16	0.12	0.13	0.47	0.32	0.31	0.43	0.24	0.61	0.90	0.64
C3'	0.21	0.11	0.30	0.23	0.10	0.29	0.10	0.34	0.15	0.11	0.14	0.16	0.15	0.10	0.13	0.46	0.32	0.32	0.43	0.23	0.62	0.93	0.65
C4	0.15	0.09	0.23	0.17	0.10	0.22	0.14	0.27	0.18	0.14	0.14	0.17	0.13	0.16	0.11	0.37	0.24	0.24	0.35	0.24	0.58	0.90	0.60
C4'	0.18	0.14	0.33	0.26	0.12	0.25	0.16	0.28	0.22	0.13	0.21	0.16	0.13	0.16	0.12	0.47	0.35	0.26	0.38	0.30	0.56	0.89	0.60
C5	0.15	0.12	0.21	0.16	0.10	0.20	0.15	0.26	0.16	0.17	0.07	0.25	0.14	0.19	0.12	0.33	0.21	0.23	0.33	0.24	0.60	0.91	0.61
C5'	0.20	0.14	0.34	0.27	0.12	0.25	0.15	0.27	0.21	0.16	0.18	0.21	0.13	0.16	0.13	0.51	0.36	0.27	0.37	0.29	0.55	0.89	0.58
C6	0.13	0.15	0.16	0.13	0.08	0.20	0.11	0.28	0.10	0.17	0.08	0.26	0.14	0.18	0.11	0.27	0.17	0.22	0.32	0.18	0.63	0.90	0.61
C8	0.17	0.13	0.27	0.21	0.13	0.21	0.18	0.25	0.22	0.17	0.15	0.24	0.15	0.21	0.14	0.41	0.26	0.23	0.34	0.31	0.58	0.91	0.60
N1	0.13	0.14	0.17	0.13	0.06	0.23	0.09	0.30	0.11	0.16	0.11	0.22	0.13	0.16	0.10	0.28	0.20	0.24	0.34	0.16	0.62	0.90	0.61
N2	0.12	0.15	0.17	0.16	0.09	0.29	0.10	0.37	0.13	0.10	0.14	0.17	0.16	0.12	0.06	0.30	0.27	0.30	0.42	0.14	0.58	0.88	0.61
N3	0.15	0.12	0.22	0.16	0.09	0.24	0.12	0.30	0.16	0.10	0.16	0.14	0.15	0.12	0.09	0.36	0.25	0.27	0.38	0.20	0.57	0.89	0.60
N7	0.15	0.14	0.23	0.19	0.12	0.20	0.17	0.25	0.20	0.19	0.10	0.28	0.16	0.22	0.14	0.36	0.22	0.22	0.33	0.29	0.60	0.92	0.61
N9	0.17	0.10	0.28	0.21	0.11	0.22	0.16	0.26	0.21	0.15	0.17	0.18	0.13	0.18	0.12	0.43	0.28	0.24	0.35	0.29	0.56	0.90	0.59
O2'	0.20	0.16	0.35	0.26	0.13	0.28	0.15	0.32	0.21	0.13	0.21	0.20	0.16	0.15	0.13	0.51	0.37	0.27	0.42	0.26	0.59	0.85	0.61
O3'	0.24	0.12	0.34	0.27	0.12	0.33	0.10	0.38	0.14	0.13	0.13	0.18	0.16	0.10	0.15	0.51	0.37	0.34	0.47	0.21	0.67	0.93	0.68
O4'	0.17	0.15	0.32	0.26	0.13	0.23	0.20	0.25	0.27	0.15	0.25	0.16	0.13	0.20	0.12	0.47	0.33	0.24	0.35	0.35	0.52	0.86	0.56
O5'	0.24	0.14	0.32	0.22	0.13	0.26	0.11	0.27	0.14	0.18	0.10	0.23	0.17	0.13	0.16	0.49	0.26	0.30	0.35	0.23	0.54	0.90	0.58
O6	0.14	0.20	0.12	0.13	0.11	0.22	0.11	0.30	0.10	0.18	0.18	0.29	0.17	0.20	0.13	0.21	0.16	0.23	0.33	0.16	0.67	0.89	0.62
OP1	0.23	0.11	0.29	0.19	0.12	0.24	0.12	0.26	0.16	0.18	0.11	0.17	0.15	0.14	0.15	0.45	0.22	0.31	0.35	0.26	0.54	0.90	0.59
OP2	0.29	0.23	0.32	0.23	0.23	0.28	0.24	0.29	0.25	0.30	0.21	0.29	0.24	0.27	0.26	0.47	0.21	0.34	0.31	0.32	0.54	0.87	0.56
P	0.19	0.12	0.27	0.17	0.12	0.20	0.14	0.21	0.18	0.19	0.13	0.19	0.14	0.16	0.14	0.43	0.19	0.26	0.30	0.28	0.51	0.87	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.02	0.21	0.37	0.13
C2	0.03	0.00	0.24	0.20	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.33	0.22	0.09	0.22	0.02	0.26	0.73	0.36
C2'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.15	0.04	0.11	0.08	0.15	0.09	0.20	0.26	0.24	0.07	0.04	0.02	0.02	0.03	0.16	0.13	0.19	0.38	0.13
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.02	0.14	0.19	0.18	0.24	0.19	0.15	0.09	0.03	0.01	0.01	0.25	0.15	0.10	0.32	0.15
C4	0.02	0.01	0.15	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.21	0.09	0.05	0.23	0.01	0.23	0.67	0.33
C4'	0.01	0.09	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.16	0.07	0.12	0.09	0.11	0.05	0.16	0.05	0.01	0.02	0.08	0.26	0.18	0.12
C5	0.02	0.01	0.11	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.20	0.06	0.03	0.31	0.01	0.34	0.80	0.46
C5'	0.03	0.13	0.08	0.02	0.09	0.00	0.11	0.00	0.13	0.20	0.13	0.16	0.11	0.15	0.07	0.14	0.07	0.02	0.00	0.15	0.07	0.10	0.01
C6	0.03	0.01	0.15	0.14	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.09	0.04	0.32	0.00	0.38	0.87	0.50
C8	0.01	0.03	0.09	0.19	0.04	0.16	0.05	0.20	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.17	0.19	0.09	0.38	0.04	0.35	0.67	0.44
N1	0.03	0.01	0.20	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.30	0.16	0.07	0.27	0.02	0.31	0.82	0.44
N2	0.04	0.01	0.26	0.24	0.03	0.12	0.03	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.35	0.29	0.12	0.23	0.02	0.29	0.73	0.36
N3	0.03	0.01	0.24	0.19	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.32	0.22	0.09	0.18	0.02	0.23	0.65	0.30
N7	0.02	0.02	0.07	0.15	0.00	0.11	0.01	0.15	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.18	0.15	0.04	0.38	0.03	0.43	0.83	0.53
N9	0.01	0.02	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.12	0.05	0.02	0.22	0.01	0.18	0.55	0.26
O2'	0.05	0.33	0.02	0.03	0.21	0.16	0.20	0.14	0.24	0.17	0.30	0.35	0.32	0.18	0.12	0.00	0.04	0.10	0.13	0.24	0.32	0.26	0.11
O3'	0.11	0.22	0.02	0.01	0.09	0.05	0.06	0.07	0.09	0.19	0.16	0.29	0.22	0.15	0.05	0.04	0.00	0.08	0.25	0.09	0.23	0.28	0.15
O4'	0.01	0.09	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.09	0.07	0.12	0.09	0.04	0.02	0.10	0.08	0.00	0.09	0.05	0.26	0.32	0.17
O5'	0.09	0.22	0.16	0.25	0.23	0.02	0.31	0.00	0.32	0.38	0.27	0.23	0.18	0.38	0.22	0.13	0.25	0.09	0.00	0.36	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.13	0.15	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.24	0.09	0.05	0.36	0.00	0.48	0.96	0.59
OP1	0.21	0.26	0.19	0.10	0.23	0.26	0.34	0.07	0.38	0.35	0.31	0.29	0.23	0.43	0.18	0.32	0.23	0.26	0.01	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.73	0.38	0.32	0.67	0.18	0.80	0.10	0.87	0.67	0.82	0.73	0.65	0.83	0.55	0.26	0.28	0.32	0.01	0.96	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.36	0.13	0.15	0.33	0.12	0.46	0.01	0.50	0.44	0.44	0.36	0.30	0.53	0.26	0.11	0.15	0.17	0.00	0.59	0.01	0.00	0.00