Doublet Group distance statistics: 53305

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.008, 0.042, 0.076, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.042 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.007, 0.042, 0.078, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.042 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.005, 0.042, 0.078, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.042 std_dev=0.036
N3	A	0, 0.006, 0.048, 0.089, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.048 std_dev=0.041
C2	A	0, 0.002, 0.054, 0.106, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.054 std_dev=0.052
C1'	A	0, 0.006, 0.063, 0.120, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.063 std_dev=0.057
N2	A	0, 0.013, 0.125, 0.237, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.125 std_dev=0.112
C5	B	0, 0.084, 0.236, 0.387, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.236 std_dev=0.152
C4	B	0, 0.082, 0.235, 0.388, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.235 std_dev=0.153
N7	B	0, 0.078, 0.250, 0.422, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.250 std_dev=0.172
C2'	B	0, 0.084, 0.275, 0.467, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.275 std_dev=0.192
C8	B	0, 0.057, 0.254, 0.451, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.254 std_dev=0.197
N9	B	0, 0.014, 0.219, 0.423, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.219 std_dev=0.205
C6	B	0, 0.155, 0.424, 0.693, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.424 std_dev=0.269
N3	B	0, 0.112, 0.399, 0.685, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.399 std_dev=0.287
O4'	A	0, 0.064, 0.364, 0.663, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.364 std_dev=0.299
C2'	A	0, -0.042, 0.269, 0.581, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.269 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.143, 0.476, 0.809, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.476 std_dev=0.333
O5'	A	0, 0.129, 0.471, 0.813, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.471 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.186, 0.532, 0.878, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.532 std_dev=0.346
O6	B	0, 0.196, 0.548, 0.900, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.548 std_dev=0.352
C2	B	0, 0.159, 0.514, 0.868, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.514 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.198, 0.559, 0.919, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.559 std_dev=0.360
C1'	B	0, 0.088, 0.456, 0.823, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.456 std_dev=0.367
C4'	A	0, 0.022, 0.396, 0.769, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.396 std_dev=0.373
C3'	A	0, 0.152, 0.531, 0.911, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.531 std_dev=0.379
P	A	0, 0.141, 0.547, 0.953, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.547 std_dev=0.406
O2'	A	0, 0.127, 0.553, 0.979, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.553 std_dev=0.426
O2'	B	0, 0.221, 0.651, 1.081, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.651 std_dev=0.430
N2	B	0, 0.208, 0.710, 1.212, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.710 std_dev=0.502
OP1	A	0, 0.156, 0.659, 1.161, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.659 std_dev=0.503
OP2	A	0, 0.176, 0.705, 1.234, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.705 std_dev=0.529
O3'	A	0, 0.355, 0.944, 1.534, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.944 std_dev=0.589
O4'	B	0, 0.279, 0.883, 1.486, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.883 std_dev=0.604
C4'	B	0, 0.362, 1.033, 1.705, 1.624 max_d=1.624 avg_d=1.033 std_dev=0.672
C5'	A	0, 0.082, 0.849, 1.616, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.849 std_dev=0.767
C5'	B	0, 0.687, 1.877, 3.066, 2.838 max_d=2.838 avg_d=1.877 std_dev=1.189
O5'	B	0, 0.917, 2.523, 4.130, 3.756 max_d=3.756 avg_d=2.523 std_dev=1.606
P	B	0, 1.167, 3.241, 5.314, 4.805 max_d=4.805 avg_d=3.241 std_dev=2.074
OP2	B	0, 1.242, 3.386, 5.530, 5.268 max_d=5.268 avg_d=3.386 std_dev=2.144
OP1	B	0, 1.462, 4.011, 6.559, 6.030 max_d=6.030 avg_d=4.011 std_dev=2.548

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.08	0.05	0.01	0.09	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.18	0.04	0.31	0.29	0.16
C2	0.10	0.00	0.22	0.12	0.03	0.10	0.01	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.29	0.22	0.14	0.22	0.02	0.34	0.36	0.25
C2'	0.00	0.22	0.00	0.01	0.10	0.02	0.05	0.16	0.09	0.11	0.17	0.28	0.21	0.06	0.01	0.00	0.06	0.02	0.37	0.06	0.37	0.39	0.30
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.11	0.13	0.13	0.15	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.31	0.12	0.33	0.40	0.25
C4	0.04	0.03	0.10	0.08	0.00	0.05	0.00	0.16	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.07	0.28	0.02	0.33	0.37	0.26
C4'	0.02	0.10	0.02	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.09	0.08	0.14	0.09	0.08	0.04	0.13	0.03	0.01	0.01	0.06	0.34	0.26	0.13
C5	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.11	0.11	0.03	0.36	0.01	0.36	0.45	0.33
C5'	0.08	0.17	0.16	0.01	0.16	0.01	0.21	0.00	0.21	0.26	0.19	0.19	0.15	0.26	0.16	0.05	0.16	0.02	0.01	0.24	0.13	0.26	0.02
C6	0.05	0.02	0.09	0.11	0.02	0.06	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.12	0.12	0.05	0.36	0.00	0.38	0.48	0.36
C8	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01	0.09	0.01	0.26	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.23	0.07	0.10	0.39	0.02	0.33	0.41	0.30
N1	0.09	0.00	0.17	0.13	0.04	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.21	0.17	0.10	0.29	0.02	0.36	0.43	0.31
N2	0.13	0.00	0.28	0.15	0.03	0.14	0.01	0.19	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.40	0.25	0.19	0.16	0.04	0.34	0.33	0.21
N3	0.09	0.01	0.21	0.11	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.28	0.23	0.14	0.19	0.01	0.32	0.32	0.21
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.06	0.06	0.42	0.03	0.37	0.48	0.36
N9	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.16	0.03	0.00	0.05	0.06	0.04	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.28	0.03	0.31	0.33	0.23
O2'	0.01	0.29	0.00	0.02	0.12	0.13	0.11	0.05	0.12	0.23	0.21	0.40	0.28	0.20	0.10	0.00	0.12	0.06	0.30	0.12	0.31	0.45	0.28
O3'	0.19	0.22	0.06	0.01	0.17	0.03	0.11	0.16	0.12	0.07	0.17	0.25	0.23	0.06	0.13	0.12	0.00	0.13	0.31	0.10	0.54	0.51	0.37
O4'	0.00	0.14	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.05	0.10	0.10	0.19	0.14	0.06	0.01	0.06	0.13	0.00	0.20	0.04	0.40	0.37	0.27
O5'	0.18	0.22	0.37	0.31	0.28	0.01	0.36	0.01	0.36	0.39	0.29	0.16	0.19	0.42	0.28	0.30	0.31	0.20	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01
O6	0.04	0.02	0.06	0.12	0.02	0.06	0.01	0.24	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.12	0.10	0.04	0.40	0.00	0.42	0.54	0.41
OP1	0.31	0.34	0.37	0.33	0.33	0.34	0.36	0.13	0.38	0.33	0.36	0.34	0.32	0.37	0.31	0.31	0.54	0.40	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.36	0.39	0.40	0.37	0.26	0.45	0.26	0.48	0.41	0.43	0.33	0.32	0.48	0.33	0.45	0.51	0.37	0.01	0.54	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.25	0.30	0.25	0.26	0.13	0.33	0.02	0.36	0.30	0.31	0.21	0.21	0.36	0.23	0.28	0.37	0.27	0.01	0.41	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.31	0.15	0.25	0.18	0.49	0.14	0.84	0.18	0.15	0.27	0.40	0.28	0.12	0.12	0.29	0.17	0.39	1.11	0.16	1.27	1.08	1.17
C2	0.04	0.14	0.08	0.09	0.07	0.19	0.08	0.31	0.12	0.08	0.15	0.17	0.11	0.06	0.03	0.15	0.06	0.20	0.35	0.12	0.38	0.58	0.38
C2'	0.15	0.32	0.16	0.26	0.20	0.49	0.19	0.93	0.21	0.22	0.29	0.41	0.28	0.20	0.17	0.33	0.18	0.37	1.27	0.20	1.58	1.50	1.47
C3'	0.15	0.35	0.23	0.31	0.17	0.53	0.14	1.03	0.18	0.21	0.29	0.48	0.31	0.17	0.14	0.44	0.27	0.36	1.40	0.15	1.89	1.61	1.75
C4	0.09	0.25	0.08	0.18	0.10	0.40	0.09	0.60	0.15	0.13	0.23	0.32	0.19	0.09	0.08	0.16	0.11	0.41	0.75	0.15	0.85	0.81	0.78
C4'	0.22	0.37	0.33	0.28	0.25	0.45	0.22	0.84	0.25	0.21	0.32	0.45	0.34	0.20	0.21	0.50	0.25	0.29	1.14	0.24	1.67	1.17	1.36
C5	0.16	0.24	0.09	0.18	0.09	0.41	0.10	0.57	0.17	0.14	0.24	0.32	0.14	0.10	0.12	0.11	0.11	0.44	0.74	0.18	0.89	0.83	0.81
C5'	0.36	0.50	0.55	0.42	0.40	0.44	0.37	0.69	0.41	0.32	0.47	0.57	0.47	0.33	0.35	0.73	0.48	0.33	0.98	0.40	1.68	1.12	1.26
C6	0.16	0.18	0.09	0.15	0.08	0.33	0.11	0.44	0.18	0.12	0.23	0.22	0.08	0.09	0.11	0.08	0.09	0.37	0.57	0.21	0.68	0.71	0.63
C8	0.16	0.28	0.11	0.22	0.10	0.51	0.10	0.75	0.17	0.16	0.26	0.39	0.20	0.11	0.12	0.17	0.13	0.49	1.01	0.17	1.27	1.07	1.13
N1	0.08	0.13	0.06	0.10	0.06	0.23	0.10	0.32	0.16	0.09	0.18	0.15	0.05	0.08	0.07	0.10	0.06	0.26	0.39	0.18	0.44	0.61	0.43
N2	0.11	0.10	0.11	0.06	0.08	0.10	0.07	0.18	0.10	0.09	0.11	0.11	0.09	0.05	0.07	0.17	0.06	0.10	0.22	0.11	0.28	0.57	0.29
N3	0.05	0.20	0.09	0.14	0.09	0.28	0.07	0.46	0.11	0.10	0.17	0.25	0.17	0.08	0.04	0.19	0.09	0.28	0.52	0.10	0.56	0.65	0.53
N7	0.19	0.26	0.12	0.20	0.10	0.47	0.10	0.67	0.18	0.15	0.26	0.36	0.15	0.10	0.14	0.12	0.12	0.49	0.90	0.19	1.13	0.97	1.01
N9	0.11	0.30	0.11	0.21	0.13	0.48	0.11	0.74	0.17	0.15	0.26	0.39	0.24	0.10	0.10	0.22	0.13	0.45	0.97	0.15	1.13	0.99	1.04
O2'	0.34	0.31	0.33	0.41	0.33	0.53	0.34	0.94	0.31	0.43	0.30	0.34	0.32	0.40	0.35	0.39	0.34	0.45	1.22	0.31	1.46	1.67	1.40
O3'	0.30	0.16	0.33	0.61	0.25	0.76	0.33	1.33	0.26	0.52	0.16	0.25	0.16	0.49	0.36	0.38	0.55	0.57	1.65	0.30	2.09	1.93	2.07
O4'	0.23	0.34	0.29	0.26	0.26	0.47	0.25	0.75	0.27	0.25	0.31	0.40	0.32	0.25	0.24	0.40	0.18	0.37	0.99	0.26	1.26	0.88	1.07
O5'	0.20	0.18	0.10	0.25	0.13	0.55	0.15	0.82	0.14	0.24	0.16	0.27	0.14	0.21	0.19	0.19	0.23	0.47	1.12	0.15	1.69	1.18	1.32
O6	0.19	0.15	0.10	0.15	0.09	0.34	0.11	0.43	0.19	0.11	0.23	0.18	0.08	0.09	0.13	0.09	0.10	0.38	0.57	0.24	0.70	0.72	0.64
OP1	0.50	0.29	0.45	0.51	0.40	0.67	0.42	0.86	0.37	0.52	0.31	0.25	0.32	0.49	0.47	0.43	0.47	0.63	1.09	0.38	1.64	1.16	1.29
OP2	0.34	0.18	0.15	0.28	0.24	0.60	0.25	0.83	0.22	0.33	0.19	0.19	0.19	0.31	0.30	0.12	0.18	0.56	1.15	0.23	1.71	1.27	1.34
P	0.36	0.15	0.23	0.31	0.25	0.59	0.25	0.80	0.20	0.36	0.16	0.16	0.18	0.33	0.32	0.21	0.21	0.56	1.10	0.21	1.65	1.17	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.22	0.10
C2	0.03	0.00	0.13	0.17	0.02	0.05	0.00	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.16	0.19	0.05	0.12	0.02	0.10	0.35	0.12
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.04	0.05	0.11	0.10	0.18	0.13	0.09	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.20	0.05	0.09
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.06	0.09	0.10	0.14	0.21	0.15	0.07	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.17	0.14	0.11
C4	0.02	0.02	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.18	0.01	0.16	0.32	0.19
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.06	0.04	0.08	0.04	0.07	0.05	0.00	0.03	0.10	0.12	0.05	0.08
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.04	0.02	0.29	0.01	0.32	0.41	0.31
C5'	0.04	0.12	0.04	0.06	0.14	0.01	0.20	0.00	0.21	0.20	0.18	0.11	0.09	0.23	0.13	0.08	0.12	0.02	0.02	0.25	0.15	0.17	0.05
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.07	0.02	0.28	0.01	0.32	0.42	0.30
C8	0.00	0.02	0.11	0.10	0.01	0.07	0.02	0.20	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.07	0.38	0.03	0.41	0.44	0.39
N1	0.03	0.00	0.10	0.14	0.03	0.07	0.01	0.18	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.15	0.04	0.20	0.03	0.19	0.38	0.20
N2	0.05	0.01	0.18	0.21	0.03	0.06	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.20	0.26	0.07	0.10	0.03	0.14	0.38	0.11
N3	0.03	0.01	0.13	0.15	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.14	0.17	0.06	0.10	0.01	0.11	0.31	0.10
N7	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.10	0.11	0.05	0.40	0.03	0.47	0.49	0.42
N9	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.21	0.02	0.19	0.30	0.21
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.09	0.07	0.10	0.08	0.11	0.09	0.14	0.20	0.14	0.10	0.06	0.00	0.06	0.03	0.08	0.12	0.40	0.07	0.17
O3'	0.02	0.19	0.04	0.01	0.07	0.05	0.04	0.12	0.07	0.14	0.15	0.26	0.17	0.11	0.02	0.06	0.00	0.02	0.11	0.07	0.28	0.31	0.20
O4'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.07	0.04	0.07	0.06	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.04	0.07	0.21	0.12
O5'	0.09	0.12	0.05	0.07	0.18	0.03	0.29	0.02	0.28	0.38	0.20	0.10	0.10	0.40	0.21	0.08	0.11	0.09	0.00	0.35	0.03	0.04	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.10	0.01	0.25	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.12	0.07	0.04	0.35	0.00	0.43	0.49	0.37
OP1	0.10	0.10	0.20	0.17	0.16	0.12	0.32	0.15	0.32	0.41	0.19	0.14	0.11	0.47	0.19	0.40	0.28	0.07	0.03	0.43	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.35	0.05	0.14	0.32	0.05	0.41	0.17	0.42	0.44	0.38	0.38	0.31	0.49	0.30	0.07	0.31	0.21	0.04	0.49	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.09	0.11	0.19	0.08	0.31	0.05	0.30	0.39	0.20	0.11	0.10	0.42	0.21	0.17	0.20	0.12	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00