Doublet Group distance statistics: 53311

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N3	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.004, 0.026, 0.049, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.026 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.001, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.042, 0.149, 0.340, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.149 std_dev=0.191
O5'	A	0, -0.052, 0.161, 0.374, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.161 std_dev=0.213
C2'	A	0, -0.048, 0.202, 0.451, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.202 std_dev=0.250
N9	B	0, 0.035, 0.305, 0.574, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.305 std_dev=0.269
C4	B	0, -0.010, 0.267, 0.545, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.267 std_dev=0.278
C8	B	0, 0.049, 0.336, 0.623, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.336 std_dev=0.287
C5	B	0, -0.009, 0.278, 0.565, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.278 std_dev=0.287
C3'	B	0, 0.042, 0.335, 0.629, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.335 std_dev=0.294
C6	B	0, -0.006, 0.292, 0.590, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.292 std_dev=0.298
N3	B	0, -0.008, 0.292, 0.591, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.292 std_dev=0.300
N7	B	0, 0.039, 0.344, 0.649, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.344 std_dev=0.305
C2	B	0, -0.044, 0.261, 0.566, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.261 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.055, 0.361, 0.667, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.361 std_dev=0.306
N1	B	0, -0.064, 0.243, 0.551, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.243 std_dev=0.308
O2'	A	0, -0.066, 0.249, 0.564, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.249 std_dev=0.315
N2	B	0, -0.013, 0.305, 0.623, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.305 std_dev=0.318
C4'	A	0, -0.052, 0.271, 0.594, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.271 std_dev=0.323
O3'	B	0, 0.053, 0.380, 0.706, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.380 std_dev=0.326
O4'	B	0, 0.058, 0.387, 0.715, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.387 std_dev=0.328
O6	B	0, 0.049, 0.384, 0.719, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.384 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.069, 0.418, 0.768, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.418 std_dev=0.349
C3'	A	0, -0.046, 0.304, 0.654, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.304 std_dev=0.350
C2'	B	0, 0.063, 0.424, 0.786, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.424 std_dev=0.361
O5'	B	0, 0.064, 0.478, 0.892, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.478 std_dev=0.414
O3'	A	0, -0.018, 0.419, 0.855, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.419 std_dev=0.436
C5'	B	0, 0.051, 0.495, 0.940, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.495 std_dev=0.445
OP2	A	0, -0.014, 0.547, 1.108, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.547 std_dev=0.561
C5'	A	0, -0.150, 0.425, 0.999, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.425 std_dev=0.575
O2'	B	0, 0.019, 0.612, 1.205, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.612 std_dev=0.593
P	A	0, -0.145, 0.645, 1.436, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.645 std_dev=0.790
P	B	0, -0.036, 0.797, 1.629, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.797 std_dev=0.833
OP2	B	0, -0.054, 0.834, 1.723, 2.268 max_d=2.268 avg_d=0.834 std_dev=0.889
OP1	B	0, -0.024, 1.027, 2.078, 2.670 max_d=2.670 avg_d=1.027 std_dev=1.051
OP1	A	0, -0.414, 1.396, 3.206, 4.470 max_d=4.470 avg_d=1.396 std_dev=1.810

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.10	0.02	0.20	0.18	0.20
C2	0.03	0.00	0.16	0.25	0.01	0.14	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.27	0.02	0.02	0.01	0.43	0.26	0.12
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.01	0.08	0.07	0.12	0.20	0.15	0.06	0.03	0.01	0.04	0.02	0.09	0.06	0.11	0.22	0.04
C3'	0.04	0.25	0.01	0.00	0.15	0.01	0.12	0.04	0.16	0.09	0.21	0.29	0.23	0.08	0.07	0.08	0.01	0.01	0.18	0.14	0.11	0.23	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.00	0.02	0.02	0.42	0.27	0.13
C4'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.13	0.17	0.13	0.03	0.04	0.12	0.04	0.01	0.07	0.10	0.53	0.12	0.21
C5	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.01	0.06	0.01	0.74	0.33	0.28
C5'	0.05	0.24	0.01	0.04	0.16	0.01	0.16	0.00	0.20	0.04	0.24	0.26	0.21	0.09	0.10	0.11	0.09	0.02	0.02	0.21	0.42	0.15	0.04
C6	0.02	0.00	0.08	0.16	0.02	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.19	0.02	0.06	0.00	0.84	0.33	0.31
C8	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.06	0.03	0.59	0.31	0.23
N1	0.03	0.00	0.12	0.21	0.02	0.13	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.24	0.02	0.03	0.02	0.67	0.30	0.23
N2	0.03	0.00	0.20	0.29	0.01	0.17	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.32	0.03	0.03	0.03	0.32	0.24	0.07
N3	0.02	0.01	0.15	0.23	0.00	0.13	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.23	0.02	0.03	0.00	0.26	0.23	0.06
N7	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.10	0.03	0.88	0.36	0.36
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.02	0.02	0.27	0.24	0.08
O2'	0.04	0.16	0.01	0.08	0.06	0.12	0.04	0.11	0.08	0.06	0.12	0.21	0.14	0.04	0.03	0.00	0.15	0.08	0.08	0.07	0.37	0.20	0.13
O3'	0.01	0.27	0.04	0.01	0.16	0.04	0.15	0.09	0.19	0.09	0.24	0.32	0.23	0.11	0.07	0.15	0.00	0.03	0.16	0.19	0.29	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.23	0.03	0.47	0.16	0.35
O5'	0.10	0.02	0.09	0.18	0.02	0.07	0.06	0.02	0.06	0.06	0.03	0.03	0.03	0.10	0.02	0.08	0.16	0.23	0.00	0.08	0.03	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.02	0.10	0.01	0.21	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.07	0.19	0.03	0.08	0.00	1.02	0.35	0.39
OP1	0.20	0.43	0.11	0.11	0.42	0.53	0.74	0.42	0.84	0.59	0.67	0.32	0.26	0.88	0.27	0.37	0.29	0.47	0.03	1.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.26	0.22	0.23	0.27	0.12	0.33	0.15	0.33	0.31	0.30	0.24	0.23	0.36	0.24	0.20	0.13	0.16	0.01	0.35	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.12	0.04	0.10	0.13	0.21	0.28	0.04	0.31	0.23	0.23	0.07	0.06	0.36	0.08	0.13	0.10	0.35	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.23	0.16	0.17	0.25	0.21	0.26	0.21	0.25	0.24	0.24	0.16	0.23	0.25	0.23	0.19	0.16	0.23	0.19	0.24	0.45	0.17	0.35
C2	0.12	0.13	0.16	0.12	0.02	0.13	0.11	0.15	0.11	0.13	0.06	0.21	0.14	0.18	0.06	0.21	0.12	0.13	0.15	0.17	0.42	0.22	0.19
C2'	0.25	0.24	0.29	0.29	0.24	0.26	0.23	0.26	0.22	0.22	0.22	0.24	0.27	0.22	0.23	0.26	0.29	0.26	0.25	0.22	0.55	0.21	0.42
C3'	0.28	0.23	0.30	0.30	0.25	0.29	0.24	0.30	0.25	0.24	0.24	0.19	0.26	0.23	0.25	0.27	0.29	0.29	0.28	0.26	0.66	0.23	0.48
C4	0.11	0.05	0.10	0.11	0.10	0.13	0.14	0.16	0.14	0.14	0.05	0.13	0.08	0.16	0.11	0.08	0.10	0.14	0.13	0.17	0.54	0.11	0.35
C4'	0.20	0.25	0.16	0.17	0.24	0.20	0.25	0.21	0.28	0.22	0.28	0.23	0.23	0.23	0.22	0.18	0.15	0.22	0.20	0.28	0.53	0.18	0.40
C5	0.13	0.10	0.10	0.12	0.07	0.14	0.06	0.18	0.09	0.08	0.06	0.17	0.11	0.10	0.08	0.10	0.11	0.13	0.13	0.17	0.67	0.08	0.43
C5'	0.18	0.24	0.15	0.16	0.20	0.19	0.22	0.23	0.26	0.19	0.28	0.24	0.20	0.20	0.18	0.15	0.14	0.21	0.21	0.28	0.67	0.19	0.50
C6	0.18	0.18	0.15	0.13	0.12	0.17	0.05	0.19	0.13	0.05	0.15	0.22	0.18	0.05	0.11	0.19	0.13	0.16	0.11	0.20	0.71	0.11	0.41
C8	0.11	0.06	0.08	0.11	0.12	0.13	0.15	0.17	0.17	0.14	0.11	0.03	0.09	0.16	0.12	0.07	0.09	0.14	0.16	0.20	0.65	0.15	0.48
N1	0.19	0.18	0.19	0.13	0.11	0.15	0.08	0.16	0.13	0.03	0.13	0.23	0.20	0.12	0.09	0.25	0.14	0.15	0.10	0.19	0.58	0.21	0.27
N2	0.11	0.12	0.20	0.12	0.02	0.14	0.13	0.20	0.11	0.18	0.05	0.21	0.14	0.21	0.07	0.30	0.14	0.15	0.23	0.17	0.26	0.32	0.07
N3	0.11	0.06	0.12	0.11	0.11	0.14	0.16	0.17	0.13	0.17	0.03	0.16	0.09	0.19	0.13	0.11	0.11	0.16	0.15	0.16	0.41	0.15	0.24
N7	0.11	0.05	0.07	0.11	0.07	0.14	0.08	0.19	0.08	0.10	0.04	0.11	0.07	0.10	0.09	0.05	0.09	0.13	0.15	0.15	0.73	0.11	0.51
N9	0.14	0.11	0.10	0.13	0.17	0.15	0.20	0.17	0.20	0.18	0.15	0.05	0.13	0.20	0.16	0.10	0.11	0.17	0.16	0.21	0.54	0.13	0.39
O2'	0.27	0.27	0.33	0.32	0.26	0.26	0.23	0.27	0.22	0.22	0.23	0.29	0.30	0.22	0.25	0.29	0.34	0.26	0.27	0.21	0.50	0.26	0.42
O3'	0.29	0.23	0.32	0.31	0.25	0.30	0.25	0.32	0.25	0.25	0.23	0.19	0.26	0.24	0.26	0.30	0.31	0.31	0.30	0.26	0.65	0.24	0.46
O4'	0.22	0.29	0.19	0.18	0.27	0.22	0.28	0.20	0.30	0.25	0.31	0.26	0.27	0.27	0.25	0.26	0.17	0.24	0.17	0.29	0.43	0.14	0.34
O5'	0.14	0.15	0.11	0.13	0.17	0.15	0.20	0.17	0.22	0.17	0.19	0.12	0.15	0.20	0.16	0.12	0.12	0.17	0.15	0.25	0.59	0.13	0.42
O6	0.21	0.21	0.16	0.14	0.17	0.20	0.12	0.24	0.18	0.11	0.20	0.23	0.21	0.07	0.16	0.21	0.13	0.20	0.11	0.24	0.83	0.10	0.46
OP1	0.28	0.19	0.17	0.24	0.39	0.34	0.60	0.41	0.64	0.60	0.42	0.11	0.19	0.71	0.43	0.11	0.19	0.40	0.47	0.81	0.12	0.63	0.25
OP2	0.33	0.41	0.37	0.33	0.39	0.32	0.44	0.26	0.49	0.40	0.48	0.38	0.37	0.44	0.38	0.42	0.35	0.33	0.26	0.52	0.29	0.23	0.16
P	0.05	0.02	0.02	0.02	0.10	0.07	0.20	0.07	0.23	0.19	0.14	0.11	0.02	0.25	0.11	0.02	0.05	0.11	0.05	0.32	0.44	0.08	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.02	0.25	0.10	0.26
C2	0.03	0.00	0.04	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.10	0.02	0.24	0.01	0.50	0.35	0.56
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.03	0.06	0.03	0.05	0.09	0.03	0.05	0.04	0.09	0.05	0.00	0.01	0.03	0.09	0.06	0.06	0.12	0.16
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.11	0.12	0.10	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.10	0.07	0.14	0.15	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.01	0.14	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.05	0.01	0.20	0.02	0.50	0.27	0.52
C4'	0.01	0.07	0.03	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.09	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.02	0.00	0.04	0.08	0.03	0.05	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.21	0.01	0.62	0.29	0.60
C5'	0.05	0.15	0.03	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.19	0.16	0.18	0.13	0.12	0.18	0.13	0.07	0.02	0.00	0.01	0.20	0.06	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.08	0.02	0.08	0.01	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.11	0.06	0.02	0.24	0.01	0.66	0.35	0.65
C8	0.01	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.16	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.02	0.14	0.02	0.57	0.14	0.51
N1	0.03	0.00	0.03	0.11	0.03	0.09	0.02	0.18	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.11	0.10	0.03	0.26	0.02	0.60	0.38	0.63
N2	0.03	0.00	0.05	0.12	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.12	0.02	0.24	0.02	0.46	0.37	0.54
N3	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.01	0.21	0.01	0.43	0.29	0.49
N7	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.01	0.18	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.18	0.01	0.67	0.22	0.61
N9	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.16	0.02	0.44	0.19	0.44
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.11	0.08	0.10	0.07	0.11	0.06	0.11	0.13	0.11	0.08	0.07	0.00	0.02	0.10	0.12	0.11	0.05	0.15	0.15
O3'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.10	0.12	0.09	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.38	0.20	0.08
O4'	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.00	0.04	0.02	0.23	0.06	0.13
O5'	0.09	0.24	0.09	0.10	0.20	0.04	0.21	0.01	0.24	0.14	0.26	0.24	0.21	0.18	0.16	0.12	0.12	0.04	0.00	0.23	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.06	0.02	0.23	0.00	0.71	0.35	0.67
OP1	0.25	0.50	0.06	0.14	0.50	0.03	0.62	0.06	0.66	0.57	0.60	0.46	0.43	0.67	0.44	0.05	0.38	0.23	0.02	0.71	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.35	0.12	0.15	0.27	0.05	0.29	0.03	0.35	0.14	0.38	0.37	0.29	0.22	0.19	0.15	0.20	0.06	0.02	0.35	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.56	0.16	0.10	0.52	0.06	0.60	0.01	0.65	0.51	0.63	0.54	0.49	0.61	0.44	0.15	0.08	0.13	0.01	0.67	0.01	0.00	0.00