Doublet Group distance statistics: 53312

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, -0.002, 0.008, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C1'	A	0, -0.002, 0.014, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.016
N1	A	0, -0.003, 0.016, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.019
N3	A	0, -0.006, 0.016, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.022
C5	A	0, -0.005, 0.020, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.020 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.004, 0.023, 0.050, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.023 std_dev=0.027
C4	A	0, -0.012, 0.022, 0.057, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.022 std_dev=0.034
N9	A	0, -0.010, 0.026, 0.063, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.026 std_dev=0.037
O6	A	0, -0.008, 0.040, 0.088, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.040 std_dev=0.048
N7	A	0, -0.014, 0.041, 0.095, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.041 std_dev=0.055
C8	A	0, -0.022, 0.047, 0.115, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.047 std_dev=0.069
C5	B	0, 0.082, 0.295, 0.509, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.295 std_dev=0.213
C4	B	0, 0.045, 0.319, 0.594, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.319 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.076, 0.366, 0.656, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.366 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.037, 0.437, 0.837, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.437 std_dev=0.400
N3	B	0, -0.001, 0.416, 0.832, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.416 std_dev=0.416
N7	B	0, 0.014, 0.442, 0.870, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.442 std_dev=0.428
C2	B	0, 0.007, 0.464, 0.922, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.464 std_dev=0.458
O6	B	0, 0.033, 0.511, 0.990, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.511 std_dev=0.479
N9	B	0, -0.052, 0.431, 0.914, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.431 std_dev=0.483
C8	B	0, -0.058, 0.491, 1.040, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.491 std_dev=0.549
O4'	B	0, -0.168, 0.523, 1.215, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.523 std_dev=0.692
N2	B	0, -0.068, 0.655, 1.377, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.655 std_dev=0.722
C1'	B	0, -0.183, 0.564, 1.311, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.564 std_dev=0.747
O3'	B	0, -0.136, 0.707, 1.550, 2.139 max_d=2.139 avg_d=0.707 std_dev=0.843
C4'	B	0, -0.229, 0.687, 1.602, 2.263 max_d=2.263 avg_d=0.687 std_dev=0.915
C3'	B	0, -0.211, 0.739, 1.690, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.739 std_dev=0.951
O4'	A	0, -0.404, 0.674, 1.753, 2.540 max_d=2.540 avg_d=0.674 std_dev=1.078
C5'	B	0, -0.275, 0.812, 1.899, 2.684 max_d=2.684 avg_d=0.812 std_dev=1.087
C2'	A	0, -0.440, 0.728, 1.896, 2.750 max_d=2.750 avg_d=0.728 std_dev=1.168
P	B	0, -0.393, 0.846, 2.084, 2.985 max_d=2.985 avg_d=0.846 std_dev=1.239
C2'	B	0, -0.361, 0.908, 2.177, 3.098 max_d=3.098 avg_d=0.908 std_dev=1.269
O5'	B	0, -0.384, 0.899, 2.183, 3.116 max_d=3.116 avg_d=0.899 std_dev=1.284
C4'	A	0, -0.489, 0.888, 2.265, 3.269 max_d=3.269 avg_d=0.888 std_dev=1.377
OP1	B	0, -0.400, 1.007, 2.414, 3.435 max_d=3.435 avg_d=1.007 std_dev=1.407
C3'	A	0, -0.543, 0.952, 2.448, 3.539 max_d=3.539 avg_d=0.952 std_dev=1.496
O3'	A	0, -0.559, 1.032, 2.623, 3.781 max_d=3.781 avg_d=1.032 std_dev=1.591
O2'	B	0, -0.527, 1.131, 2.789, 3.996 max_d=3.996 avg_d=1.131 std_dev=1.658
O2'	A	0, -0.641, 1.083, 2.807, 4.067 max_d=4.067 avg_d=1.083 std_dev=1.724
OP2	B	0, -0.680, 1.223, 3.126, 4.516 max_d=4.516 avg_d=1.223 std_dev=1.903
C5'	A	0, -0.984, 1.666, 4.315, 6.251 max_d=6.251 avg_d=1.666 std_dev=2.650
O5'	A	0, -1.152, 1.931, 5.014, 7.267 max_d=7.267 avg_d=1.931 std_dev=3.083
P	A	0, -1.705, 2.682, 7.068, 10.277 max_d=10.277 avg_d=2.682 std_dev=4.387
OP1	A	0, -1.899, 2.925, 7.749, 11.279 max_d=11.279 avg_d=2.925 std_dev=4.824
OP2	A	0, -1.974, 2.997, 7.968, 11.605 max_d=11.605 avg_d=2.997 std_dev=4.971

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.25	0.01	0.06	0.42	0.17
C2	0.02	0.00	0.42	0.94	0.00	0.61	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.69	0.17	0.59	0.00	1.01	0.72	0.92
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.19	0.01	0.05	0.11	0.14	0.29	0.30	0.53	0.43	0.18	0.03	0.00	0.02	0.01	0.54	0.07	0.56	0.74	0.53
C3'	0.01	0.94	0.00	0.00	0.50	0.00	0.32	0.01	0.50	0.22	0.77	1.14	0.89	0.05	0.11	0.01	0.00	0.02	0.33	0.41	0.58	0.29	0.30
C4	0.01	0.00	0.19	0.50	0.00	0.29	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.29	0.09	0.02	0.01	0.38	0.21	0.16
C4'	0.00	0.61	0.01	0.00	0.29	0.00	0.15	0.00	0.28	0.23	0.48	0.76	0.58	0.11	0.02	0.19	0.02	0.00	0.00	0.23	0.22	0.10	0.00
C5	0.00	0.00	0.05	0.32	0.00	0.15	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.17	0.05	0.29	0.01	0.19	0.67	0.16
C5'	0.05	0.96	0.11	0.01	0.37	0.00	0.15	0.00	0.38	0.46	0.73	1.26	0.86	0.29	0.06	0.08	0.16	0.01	0.01	0.28	0.40	0.27	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.50	0.00	0.28	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.33	0.09	0.06	0.00	0.47	0.35	0.13
C8	0.01	0.00	0.29	0.22	0.00	0.23	0.00	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.25	0.08	0.92	0.01	0.48	1.50	0.91
N1	0.01	0.00	0.30	0.77	0.00	0.48	0.01	0.73	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.56	0.14	0.33	0.00	0.84	0.30	0.63
N2	0.02	0.00	0.53	1.14	0.00	0.76	0.01	1.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.90	0.20	0.91	0.00	1.32	1.29	1.33
N3	0.02	0.00	0.43	0.89	0.00	0.58	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.60	0.17	0.50	0.00	0.82	0.55	0.75
N7	0.01	0.01	0.18	0.05	0.00	0.11	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.12	0.03	0.77	0.02	0.30	1.42	0.76
N9	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.03	0.00	0.41	0.01	0.06	0.71	0.31
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.14	0.19	0.23	0.08	0.23	0.25	0.17	0.03	0.05	0.28	0.15	0.00	0.01	0.11	0.25	0.28	0.31	0.53	0.29
O3'	0.14	0.69	0.02	0.00	0.29	0.02	0.17	0.16	0.33	0.25	0.56	0.90	0.60	0.12	0.03	0.01	0.00	0.09	0.07	0.27	0.46	0.12	0.06
O4'	0.00	0.17	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.08	0.14	0.20	0.17	0.03	0.00	0.11	0.09	0.00	0.03	0.08	0.17	0.02	0.10
O5'	0.25	0.59	0.54	0.33	0.02	0.00	0.29	0.01	0.06	0.92	0.33	0.91	0.50	0.77	0.41	0.25	0.07	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.00	0.07	0.41	0.01	0.23	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.28	0.27	0.08	0.18	0.00	0.38	0.59	0.02
OP1	0.06	1.01	0.56	0.58	0.38	0.22	0.19	0.40	0.47	0.48	0.84	1.32	0.82	0.30	0.06	0.31	0.46	0.17	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.72	0.74	0.29	0.21	0.10	0.67	0.27	0.35	1.50	0.30	1.29	0.55	1.42	0.71	0.53	0.12	0.02	0.01	0.59	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.92	0.53	0.30	0.16	0.00	0.16	0.01	0.13	0.91	0.63	1.33	0.75	0.76	0.31	0.29	0.06	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.48	0.15	0.41	0.14	0.48	0.08	0.44	0.07	0.38	0.30	0.70	0.44	0.35	0.08	0.19	0.74	0.17	0.77	0.09	0.46	0.13	0.19
C2	0.12	0.41	0.15	0.16	0.22	0.39	0.07	0.41	0.12	0.11	0.28	0.49	0.40	0.12	0.09	0.11	0.44	0.37	0.06	0.04	0.33	1.01	0.57
C2'	0.99	0.26	0.88	0.65	0.75	0.62	0.93	0.62	0.76	1.36	0.46	0.06	0.37	1.26	1.04	1.19	0.31	0.94	0.10	0.86	0.07	0.23	0.41
C3'	0.91	0.52	0.69	0.43	1.01	0.40	1.35	0.54	1.23	1.74	0.84	0.18	0.54	1.76	1.23	0.86	0.03	0.86	0.19	1.42	0.01	0.55	0.55
C4	0.06	0.52	0.03	0.19	0.16	0.36	0.02	0.36	0.13	0.30	0.37	0.71	0.45	0.24	0.08	0.23	0.56	0.21	0.33	0.05	0.06	0.51	0.25
C4'	0.14	0.30	0.42	0.72	0.14	0.70	0.55	0.38	0.48	0.86	0.10	0.62	0.34	0.96	0.29	0.27	1.22	0.17	0.60	0.71	0.48	0.36	0.04
C5	0.22	0.53	0.24	0.07	0.12	0.22	0.06	0.25	0.20	0.29	0.43	0.74	0.38	0.20	0.16	0.46	0.44	0.11	0.26	0.16	0.10	0.51	0.26
C5'	0.25	0.32	0.55	0.87	0.21	0.79	0.77	0.31	0.72	1.08	0.20	0.74	0.40	1.28	0.35	0.56	1.56	0.24	0.31	1.04	0.27	0.98	0.39
C6	0.22	0.47	0.28	0.10	0.12	0.18	0.11	0.24	0.25	0.22	0.43	0.65	0.29	0.13	0.15	0.43	0.33	0.12	0.12	0.23	0.09	0.73	0.41
C8	0.23	0.55	0.22	0.14	0.11	0.23	0.03	0.24	0.17	0.38	0.42	0.81	0.41	0.27	0.18	0.58	0.57	0.04	0.52	0.11	0.44	0.06	0.06
N1	0.08	0.41	0.11	0.06	0.15	0.25	0.11	0.31	0.21	0.14	0.36	0.51	0.30	0.10	0.07	0.14	0.33	0.23	0.07	0.16	0.27	0.95	0.54
N2	0.29	0.29	0.35	0.21	0.27	0.44	0.10	0.46	0.09	0.10	0.18	0.33	0.34	0.04	0.25	0.41	0.41	0.47	0.15	0.12	0.55	1.26	0.72
N3	0.15	0.46	0.22	0.29	0.22	0.48	0.04	0.47	0.10	0.22	0.30	0.59	0.46	0.23	0.06	0.09	0.58	0.41	0.20	0.07	0.18	0.80	0.43
N7	0.29	0.55	0.33	0.07	0.11	0.17	0.06	0.20	0.22	0.34	0.45	0.81	0.37	0.22	0.21	0.66	0.46	0.06	0.38	0.18	0.31	0.26	0.09
N9	0.09	0.52	0.03	0.25	0.13	0.36	0.03	0.34	0.11	0.37	0.36	0.75	0.44	0.30	0.11	0.34	0.64	0.13	0.54	0.04	0.32	0.16	0.02
O2'	0.95	0.11	0.93	0.82	0.52	0.81	0.62	0.75	0.44	1.05	0.20	0.17	0.23	0.90	0.84	1.36	0.68	0.92	0.07	0.49	0.22	0.22	0.29
O3'	0.92	0.59	0.73	0.59	1.01	0.57	1.35	0.74	1.25	1.71	0.89	0.28	0.59	1.74	1.21	0.92	0.32	0.91	0.32	1.44	0.23	0.23	0.60
O4'	0.64	0.80	0.86	1.15	0.45	1.17	0.12	0.89	0.17	0.17	0.50	1.04	0.84	0.25	0.31	0.63	1.60	0.74	1.05	0.07	0.68	0.04	0.30
O5'	0.55	0.85	0.77	1.03	0.25	0.96	0.33	0.44	0.25	0.71	0.34	1.33	0.89	0.89	0.05	0.77	1.73	0.52	0.47	0.59	0.23	0.82	0.31
O6	0.31	0.42	0.42	0.19	0.11	0.11	0.14	0.18	0.30	0.21	0.45	0.59	0.20	0.12	0.19	0.57	0.24	0.08	0.10	0.32	0.08	0.73	0.41
OP1	0.66	0.71	1.02	1.40	0.17	1.21	0.46	0.71	0.45	0.71	0.16	1.20	0.80	0.98	0.05	1.09	2.25	0.62	0.72	0.85	0.78	0.52	0.10
OP2	0.36	0.83	0.51	0.67	0.07	0.65	0.68	0.08	0.59	1.12	0.20	1.48	0.84	1.38	0.24	0.65	1.43	0.31	0.06	1.04	0.41	1.50	0.87
P	0.52	0.77	0.77	1.05	0.12	0.94	0.55	0.38	0.50	0.90	0.18	1.32	0.82	1.15	0.09	0.88	1.87	0.47	0.32	0.90	0.19	1.08	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.26	0.01	0.35	0.01	0.17	0.77	0.45
C2	0.02	0.00	0.41	0.33	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.03	0.22	0.38	0.00	0.30	1.12	0.62
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.22	0.01	0.12	0.15	0.20	0.18	0.33	0.49	0.39	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.23	0.15	0.08	0.42	0.13
C3'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.32	0.01	0.42	0.01	0.46	0.33	0.41	0.29	0.26	0.42	0.25	0.01	0.01	0.03	0.26	0.50	0.16	0.32	0.06
C4	0.01	0.00	0.22	0.32	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.04	0.11	0.61	0.01	0.58	1.33	0.84
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.17	0.01	0.16	0.27	0.06	0.11	0.07	0.27	0.11	0.27	0.02	0.01	0.02	0.21	0.14	0.13	0.00
C5	0.01	0.00	0.12	0.42	0.00	0.17	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.20	0.02	0.92	0.01	1.01	1.77	1.21
C5'	0.03	0.05	0.15	0.01	0.06	0.01	0.21	0.00	0.20	0.32	0.08	0.13	0.08	0.34	0.11	0.11	0.18	0.02	0.01	0.28	0.17	0.04	0.02
C6	0.01	0.00	0.20	0.46	0.01	0.16	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.23	0.06	0.90	0.00	1.02	1.81	1.21
C8	0.00	0.00	0.18	0.33	0.00	0.27	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.50	0.19	0.17	1.14	0.01	1.20	1.85	1.37
N1	0.01	0.00	0.33	0.41	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.15	0.64	0.00	0.66	1.48	0.92
N2	0.03	0.00	0.49	0.29	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.35	0.08	0.27	0.19	0.00	0.06	0.89	0.40
N3	0.02	0.00	0.39	0.26	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.09	0.23	0.31	0.01	0.20	0.98	0.52
N7	0.00	0.00	0.08	0.42	0.00	0.27	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.28	0.11	1.20	0.01	1.38	2.09	1.52
N9	0.00	0.01	0.02	0.25	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.01	0.01	0.70	0.01	0.64	1.30	0.88
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.10	0.27	0.31	0.11	0.26	0.50	0.05	0.35	0.20	0.51	0.23	0.00	0.02	0.18	0.34	0.36	0.02	0.49	0.23
O3'	0.26	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.20	0.18	0.23	0.19	0.13	0.08	0.09	0.28	0.01	0.02	0.00	0.16	0.21	0.31	0.29	0.20	0.07
O4'	0.01	0.22	0.02	0.03	0.11	0.01	0.02	0.02	0.06	0.17	0.15	0.27	0.23	0.11	0.01	0.18	0.16	0.00	0.25	0.01	0.21	0.60	0.42
O5'	0.35	0.38	0.23	0.26	0.61	0.02	0.92	0.01	0.90	1.14	0.64	0.19	0.31	1.20	0.70	0.34	0.21	0.25	0.00	1.06	0.03	0.05	0.01
O6	0.01	0.00	0.15	0.50	0.01	0.21	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.31	0.01	1.06	0.00	1.27	2.05	1.42
OP1	0.17	0.30	0.08	0.16	0.58	0.14	1.01	0.17	1.02	1.20	0.66	0.06	0.20	1.38	0.64	0.02	0.29	0.21	0.03	1.27	0.00	0.00	0.00
OP2	0.77	1.12	0.42	0.32	1.33	0.13	1.77	0.04	1.81	1.85	1.48	0.89	0.98	2.09	1.30	0.49	0.20	0.60	0.05	2.05	0.00	0.00	0.00
P	0.45	0.62	0.13	0.06	0.84	0.00	1.21	0.02	1.21	1.37	0.92	0.40	0.52	1.52	0.88	0.23	0.07	0.42	0.01	1.42	0.00	0.00	0.00