Doublet Group distance statistics: 53316

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C5	A	0, 0.000, 0.054, 0.109, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.054 std_dev=0.054
O6	A	0, 0.000, 0.057, 0.115, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.057 std_dev=0.057
N3	A	0, 0.000, 0.065, 0.130, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.065 std_dev=0.065
C4	A	0, 0.000, 0.067, 0.134, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.067 std_dev=0.067
N1	A	0, 0.000, 0.079, 0.157, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.079 std_dev=0.079
N7	A	0, 0.000, 0.086, 0.172, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.086 std_dev=0.086
N9	A	0, 0.000, 0.100, 0.200, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.100 std_dev=0.100
C8	A	0, 0.000, 0.110, 0.219, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.110 std_dev=0.110
C8	B	0, 0.000, 0.573, 1.146, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.573 std_dev=0.573
N1	B	0, 0.000, 0.582, 1.164, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C4	B	0, 0.000, 0.598, 1.197, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.598 std_dev=0.598
C5	B	0, 0.000, 0.604, 1.208, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.604 std_dev=0.604
N9	B	0, 0.000, 0.611, 1.222, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.611 std_dev=0.611
C2	B	0, 0.000, 0.635, 1.270, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.635 std_dev=0.635
N7	B	0, 0.000, 0.639, 1.279, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.639 std_dev=0.639
C6	B	0, 0.000, 0.650, 1.301, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.650 std_dev=0.650
N3	B	0, 0.000, 0.680, 1.360, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.680 std_dev=0.680
N2	B	0, 0.000, 0.722, 1.444, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.722 std_dev=0.722
C3'	B	0, 0.000, 0.803, 1.607, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.803 std_dev=0.803
C1'	B	0, 0.000, 0.814, 1.627, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.814 std_dev=0.814
O6	B	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
C4'	B	0, 0.000, 0.834, 1.669, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.834 std_dev=0.834
C2'	B	0, 0.000, 1.002, 2.004, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.002 std_dev=1.002
C2'	A	0, 0.000, 1.004, 2.007, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.004 std_dev=1.004
O4'	A	0, 0.000, 1.005, 2.009, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.005 std_dev=1.005
O4'	B	0, 0.000, 1.065, 2.130, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.065 std_dev=1.065
O3'	A	0, 0.000, 1.115, 2.230, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.115 std_dev=1.115
O3'	B	0, 0.000, 1.182, 2.364, 2.364 max_d=2.364 avg_d=1.182 std_dev=1.182
C3'	A	0, 0.000, 1.214, 2.427, 2.427 max_d=2.427 avg_d=1.214 std_dev=1.214
C4'	A	0, 0.000, 1.392, 2.785, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.392 std_dev=1.392
O2'	A	0, 0.000, 1.504, 3.007, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.504 std_dev=1.504
O2'	B	0, 0.000, 1.596, 3.193, 3.193 max_d=3.193 avg_d=1.596 std_dev=1.596
C5'	B	0, 0.000, 1.731, 3.462, 3.462 max_d=3.462 avg_d=1.731 std_dev=1.731
O5'	B	0, 0.000, 1.745, 3.490, 3.490 max_d=3.490 avg_d=1.745 std_dev=1.745
OP1	B	0, 0.000, 1.854, 3.709, 3.709 max_d=3.709 avg_d=1.854 std_dev=1.854
P	B	0, 0.000, 1.888, 3.776, 3.776 max_d=3.776 avg_d=1.888 std_dev=1.888
OP2	A	0, 0.000, 2.052, 4.104, 4.104 max_d=4.104 avg_d=2.052 std_dev=2.052
C5'	A	0, 0.000, 2.335, 4.670, 4.670 max_d=4.670 avg_d=2.335 std_dev=2.335
P	A	0, 0.000, 2.351, 4.702, 4.702 max_d=4.702 avg_d=2.351 std_dev=2.351
O5'	A	0, 0.000, 2.480, 4.961, 4.961 max_d=4.961 avg_d=2.480 std_dev=2.480
OP2	B	0, 0.000, 2.574, 5.148, 5.148 max_d=5.148 avg_d=2.574 std_dev=2.574
OP1	A	0, 0.000, 2.814, 5.628, 5.628 max_d=5.628 avg_d=2.814 std_dev=2.814

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.01	0.12	0.02	0.63	0.10	0.33
C2	0.01	0.00	0.41	0.24	0.00	0.21	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.08	0.37	0.13	0.01	0.29	0.32	0.01
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.23	0.01	0.10	0.12	0.19	0.18	0.32	0.50	0.42	0.09	0.03	0.00	0.03	0.01	0.15	0.14	0.49	0.48	0.07
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.25	0.01	0.29	0.03	0.31	0.24	0.27	0.22	0.22	0.28	0.21	0.02	0.01	0.02	0.21	0.32	0.38	0.44	0.00
C4	0.01	0.00	0.23	0.25	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.19	0.13	0.00	0.49	0.19	0.20
C4'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.25	0.12	0.29	0.19	0.20	0.08	0.26	0.01	0.00	0.01	0.05	0.58	0.08	0.26
C5	0.01	0.01	0.10	0.29	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.03	0.07	0.31	0.01	0.54	0.12	0.27
C5'	0.04	0.27	0.12	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.01	0.31	0.17	0.38	0.25	0.26	0.08	0.13	0.22	0.00	0.00	0.05	0.33	0.26	0.01
C6	0.02	0.00	0.19	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.03	0.14	0.23	0.00	0.47	0.17	0.20
C8	0.00	0.00	0.18	0.24	0.00	0.25	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.04	0.22	0.58	0.01	0.73	0.03	0.49
N1	0.01	0.00	0.32	0.27	0.00	0.12	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.03	0.27	0.02	0.01	0.35	0.26	0.07
N2	0.01	0.00	0.50	0.22	0.00	0.29	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.47	0.11	0.45	0.29	0.01	0.19	0.39	0.11
N3	0.01	0.00	0.42	0.22	0.00	0.19	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.10	0.37	0.12	0.00	0.35	0.29	0.04
N7	0.00	0.00	0.09	0.28	0.00	0.20	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.41	0.07	0.12	0.55	0.02	0.67	0.00	0.42
N9	0.00	0.00	0.03	0.21	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.04	0.00	0.28	0.01	0.62	0.10	0.33
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.02	0.26	0.17	0.13	0.08	0.45	0.13	0.47	0.32	0.41	0.17	0.00	0.03	0.17	0.12	0.16	0.94	0.11	0.48
O3'	0.24	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.22	0.03	0.04	0.03	0.11	0.10	0.07	0.04	0.03	0.00	0.14	0.11	0.06	0.67	0.14	0.23
O4'	0.01	0.37	0.01	0.02	0.19	0.00	0.07	0.00	0.14	0.22	0.27	0.45	0.37	0.12	0.00	0.17	0.14	0.00	0.25	0.09	0.67	0.11	0.44
O5'	0.12	0.13	0.15	0.21	0.13	0.01	0.31	0.00	0.23	0.58	0.02	0.29	0.12	0.55	0.28	0.12	0.11	0.25	0.00	0.33	0.02	0.00	0.01
O6	0.02	0.01	0.14	0.32	0.00	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.06	0.09	0.33	0.00	0.49	0.13	0.23
OP1	0.63	0.29	0.49	0.38	0.49	0.58	0.54	0.33	0.47	0.73	0.35	0.19	0.35	0.67	0.62	0.94	0.67	0.67	0.02	0.49	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.32	0.48	0.44	0.19	0.08	0.12	0.26	0.17	0.03	0.26	0.39	0.29	0.00	0.10	0.11	0.14	0.11	0.00	0.13	0.02	0.00	0.00
P	0.33	0.01	0.07	0.00	0.20	0.26	0.27	0.01	0.20	0.49	0.07	0.11	0.04	0.42	0.33	0.48	0.23	0.44	0.01	0.23	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.36	0.49	0.03	0.14	0.57	0.05	1.06	0.10	0.06	0.24	0.51	0.31	0.05	0.05	0.77	0.07	0.59	1.03	0.04	0.43	0.98	0.75
C2	0.11	0.28	0.03	0.39	0.09	0.49	0.03	0.87	0.05	0.17	0.22	0.35	0.24	0.20	0.01	0.26	0.39	0.29	1.15	0.03	0.90	1.52	1.12
C2'	0.47	0.24	0.78	0.32	0.29	0.13	0.22	0.62	0.16	0.29	0.18	0.22	0.31	0.22	0.34	1.08	0.40	0.13	0.46	0.11	0.18	0.29	0.11
C3'	0.11	0.11	0.18	0.30	0.04	0.79	0.05	1.25	0.02	0.15	0.11	0.20	0.03	0.11	0.12	0.44	0.25	0.73	0.99	0.02	0.35	0.69	0.59
C4	0.00	0.22	0.18	0.26	0.03	0.60	0.13	1.02	0.06	0.22	0.12	0.35	0.15	0.24	0.12	0.42	0.19	0.57	1.16	0.12	0.72	1.35	1.01
C4'	0.67	0.13	0.28	0.73	0.46	1.28	0.45	1.65	0.30	0.66	0.15	0.10	0.31	0.57	0.62	0.04	0.63	1.30	1.45	0.29	0.75	1.15	1.02
C5	0.08	0.08	0.10	0.28	0.15	0.58	0.25	0.96	0.20	0.29	0.01	0.23	0.00	0.33	0.20	0.31	0.21	0.56	1.16	0.25	0.78	1.47	1.07
C5'	1.11	0.52	0.74	1.08	0.85	1.57	0.78	1.82	0.60	1.00	0.46	0.30	0.76	0.88	1.02	0.59	0.98	1.61	1.62	0.54	0.89	1.30	1.15
C6	0.06	0.08	0.01	0.32	0.14	0.52	0.27	0.84	0.22	0.30	0.00	0.20	0.01	0.36	0.19	0.20	0.29	0.44	1.12	0.30	0.88	1.59	1.13
C8	0.09	0.06	0.26	0.15	0.14	0.61	0.20	1.03	0.16	0.25	0.02	0.24	0.02	0.26	0.18	0.47	0.04	0.67	1.13	0.20	0.60	1.27	0.94
N1	0.02	0.20	0.02	0.37	0.02	0.46	0.14	0.79	0.06	0.24	0.15	0.28	0.13	0.29	0.10	0.18	0.36	0.31	1.10	0.14	0.93	1.62	1.15
N2	0.20	0.31	0.05	0.46	0.18	0.40	0.08	0.77	0.13	0.07	0.26	0.35	0.29	0.09	0.10	0.19	0.51	0.06	1.10	0.05	0.99	1.58	1.16
N3	0.11	0.30	0.15	0.33	0.09	0.58	0.03	1.03	0.04	0.16	0.21	0.39	0.26	0.17	0.02	0.40	0.30	0.45	1.19	0.03	0.77	1.35	1.03
N7	0.12	0.02	0.16	0.21	0.20	0.60	0.27	0.98	0.24	0.30	0.10	0.15	0.08	0.33	0.23	0.35	0.12	0.63	1.15	0.29	0.71	1.41	1.02
N9	0.01	0.20	0.29	0.17	0.03	0.62	0.11	1.06	0.06	0.19	0.10	0.37	0.13	0.20	0.11	0.54	0.07	0.64	1.13	0.10	0.59	1.20	0.91
O2'	1.00	0.43	1.39	0.91	0.60	0.44	0.43	0.16	0.28	0.61	0.29	0.39	0.62	0.46	0.73	1.83	1.04	0.40	0.04	0.16	0.64	0.07	0.27
O3'	0.23	0.01	0.03	0.52	0.19	0.99	0.23	1.55	0.16	0.35	0.04	0.14	0.07	0.33	0.28	0.38	0.46	0.86	1.23	0.19	0.60	0.87	0.83
O4'	0.65	0.02	0.19	0.66	0.45	1.24	0.46	1.62	0.29	0.69	0.09	0.28	0.23	0.61	0.63	0.08	0.51	1.34	1.55	0.30	0.87	1.40	1.19
O5'	1.00	0.12	0.66	1.01	0.56	1.55	0.48	1.80	0.24	0.82	0.06	0.15	0.42	0.64	0.82	0.62	0.96	1.54	1.60	0.18	0.94	1.29	1.17
O6	0.10	0.02	0.04	0.33	0.20	0.50	0.33	0.79	0.32	0.33	0.11	0.10	0.07	0.40	0.23	0.13	0.30	0.43	1.10	0.42	0.92	1.65	1.16
OP1	0.46	0.07	0.14	0.40	0.19	0.85	0.15	1.05	0.01	0.37	0.09	0.22	0.09	0.26	0.35	0.11	0.36	0.85	0.80	0.02	0.06	0.38	0.30
OP2	0.91	0.49	0.41	0.62	0.71	1.19	0.65	1.41	0.53	0.82	0.44	0.35	0.65	0.73	0.82	0.36	0.45	1.35	1.29	0.49	0.49	1.01	0.83
P	0.75	0.16	0.34	0.59	0.45	1.10	0.40	1.29	0.24	0.63	0.12	0.02	0.36	0.51	0.62	0.33	0.49	1.17	1.12	0.20	0.37	0.79	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.12	0.01	0.26	0.14	0.13
C2	0.01	0.00	0.35	0.28	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.36	0.25	0.43	0.01	0.02	0.71	0.30
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.18	0.01	0.07	0.02	0.14	0.19	0.25	0.44	0.36	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.09	0.15	0.29	0.00
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.17	0.00	0.09	0.01	0.13	0.09	0.21	0.33	0.27	0.04	0.06	0.02	0.00	0.00	0.32	0.10	0.05	0.39	0.18
C4	0.01	0.00	0.18	0.17	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.19	0.13	0.35	0.00	0.04	0.64	0.25
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.06	0.08	0.05	0.05	0.03	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.34	0.09	0.22
C5	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.05	0.39	0.00	0.23	0.85	0.41
C5'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.19	0.12	0.20	0.12	0.13	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.13	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.17	0.11	0.45	0.00	0.28	0.97	0.49
C8	0.00	0.00	0.19	0.09	0.01	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.12	0.16	0.21	0.00	0.18	0.64	0.26
N1	0.01	0.00	0.25	0.21	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.28	0.19	0.47	0.00	0.17	0.88	0.43
N2	0.01	0.00	0.44	0.33	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.45	0.29	0.44	0.01	0.06	0.66	0.26
N3	0.01	0.00	0.36	0.27	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.34	0.24	0.37	0.00	0.07	0.57	0.19
N7	0.00	0.00	0.11	0.04	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.06	0.08	0.31	0.01	0.32	0.87	0.43
N9	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.24	0.00	0.01	0.48	0.13
O2'	0.00	0.30	0.00	0.02	0.12	0.06	0.03	0.06	0.09	0.16	0.20	0.39	0.29	0.11	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.52	0.09	0.35
O3'	0.01	0.36	0.01	0.00	0.19	0.01	0.11	0.03	0.17	0.12	0.28	0.45	0.34	0.06	0.05	0.01	0.00	0.00	0.25	0.13	0.02	0.28	0.12
O4'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.13	0.00	0.05	0.01	0.11	0.16	0.19	0.29	0.24	0.08	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.07	0.38	0.10	0.29
O5'	0.12	0.43	0.23	0.32	0.35	0.00	0.39	0.00	0.45	0.21	0.47	0.44	0.37	0.31	0.24	0.01	0.25	0.04	0.00	0.46	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.07	0.46	0.00	0.39	1.10	0.59
OP1	0.26	0.02	0.15	0.05	0.04	0.34	0.23	0.05	0.28	0.18	0.17	0.06	0.07	0.32	0.01	0.52	0.02	0.38	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00
OP2	0.14	0.71	0.29	0.39	0.64	0.09	0.85	0.04	0.97	0.64	0.88	0.66	0.57	0.87	0.48	0.09	0.28	0.10	0.01	1.10	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.30	0.00	0.18	0.25	0.22	0.41	0.01	0.49	0.26	0.43	0.26	0.19	0.43	0.13	0.35	0.12	0.29	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00