Doublet Group distance statistics: 53325

back

Distances from reference structure (by RMSD)

11, 26, 13, 2, 1, 0, 0, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.038, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.025 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.007, 0.033, 0.058, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.033 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.007, 0.037, 0.068, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.037 std_dev=0.030
O4'	A	0, -0.016, 0.081, 0.178, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.081 std_dev=0.097
N1	B	0, 0.040, 0.197, 0.354, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.197 std_dev=0.157
C2'	A	0, -0.033, 0.130, 0.292, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.130 std_dev=0.163
C4'	A	0, -0.020, 0.148, 0.317, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.148 std_dev=0.168
C6	B	0, 0.022, 0.201, 0.379, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.201 std_dev=0.179
C5'	A	0, 0.024, 0.222, 0.421, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.222 std_dev=0.198
C2	B	0, 0.006, 0.225, 0.443, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.225 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.026, 0.249, 0.471, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.249 std_dev=0.223
C5	B	0, -0.014, 0.220, 0.454, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.220 std_dev=0.234
C3'	A	0, -0.059, 0.191, 0.441, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.191 std_dev=0.250
O5'	A	0, 0.003, 0.263, 0.524, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.263 std_dev=0.261
N3	B	0, -0.048, 0.238, 0.524, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.238 std_dev=0.286
C4	B	0, -0.059, 0.236, 0.532, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.236 std_dev=0.296
O2	B	0, -0.008, 0.288, 0.585, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.288 std_dev=0.297
P	A	0, -0.059, 0.285, 0.629, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.285 std_dev=0.344
C2'	B	0, -0.053, 0.326, 0.704, 2.169 max_d=2.169 avg_d=0.326 std_dev=0.378
O4'	B	0, -0.073, 0.308, 0.690, 2.671 max_d=2.671 avg_d=0.308 std_dev=0.382
O4	B	0, -0.102, 0.302, 0.706, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.302 std_dev=0.404
O2'	A	0, -0.147, 0.257, 0.662, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.257 std_dev=0.405
OP1	A	0, -0.029, 0.380, 0.788, 2.301 max_d=2.301 avg_d=0.380 std_dev=0.408
C4'	B	0, -0.093, 0.352, 0.797, 3.132 max_d=3.132 avg_d=0.352 std_dev=0.445
C3'	B	0, -0.107, 0.348, 0.803, 3.206 max_d=3.206 avg_d=0.348 std_dev=0.455
OP2	A	0, -0.143, 0.345, 0.834, 3.084 max_d=3.084 avg_d=0.345 std_dev=0.488
O2'	B	0, -0.106, 0.461, 1.029, 3.161 max_d=3.161 avg_d=0.461 std_dev=0.568
O3'	A	0, -0.250, 0.334, 0.918, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.334 std_dev=0.584
O3'	B	0, -0.205, 0.445, 1.094, 4.528 max_d=4.528 avg_d=0.445 std_dev=0.649
C5'	B	0, -0.375, 0.424, 1.222, 6.102 max_d=6.102 avg_d=0.424 std_dev=0.798
O5'	B	0, -0.495, 0.400, 1.296, 6.932 max_d=6.932 avg_d=0.400 std_dev=0.895
P	B	0, -0.736, 0.487, 1.711, 9.539 max_d=9.539 avg_d=0.487 std_dev=1.224
OP1	B	0, -0.691, 0.616, 1.923, 9.836 max_d=9.836 avg_d=0.616 std_dev=1.307
OP2	B	0, -0.820, 0.575, 1.970, 10.635 max_d=10.635 avg_d=0.575 std_dev=1.395

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.22	0.00	0.09	0.02	0.26	0.07	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.28	0.05	0.13	0.01	0.30	0.18	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.14	0.05	0.07	0.07	0.12	0.09	0.06	0.03	0.00	0.04	0.02	0.28	0.05	0.36	0.26	0.30
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.15	0.10	0.08	0.07	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.07	0.14	0.12	0.11	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.19	0.03	0.13	0.01	0.30	0.17	0.08
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.04	0.03	0.07	0.04	0.12	0.03	0.00	0.01	0.06	0.15	0.08	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.19	0.13	0.03	0.17	0.01	0.31	0.23	0.09
C5'	0.04	0.06	0.14	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.06	0.06	0.12	0.07	0.05	0.12	0.02	0.01	0.11	0.11	0.12	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.16	0.03	0.17	0.00	0.32	0.26	0.09
C8	0.01	0.02	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.08	0.02	0.18	0.02	0.31	0.19	0.08
N1	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.05	0.15	0.01	0.31	0.22	0.09
N2	0.03	0.01	0.12	0.08	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.33	0.06	0.12	0.02	0.29	0.16	0.09
N3	0.02	0.01	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.28	0.04	0.12	0.01	0.29	0.15	0.09
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.09	0.02	0.20	0.02	0.32	0.26	0.09
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.13	0.01	0.13	0.01	0.29	0.13	0.08
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.15	0.12	0.19	0.05	0.21	0.17	0.18	0.14	0.13	0.20	0.12	0.00	0.06	0.09	0.26	0.23	0.34	0.24	0.30
O3'	0.22	0.28	0.04	0.01	0.19	0.03	0.13	0.12	0.16	0.08	0.22	0.33	0.28	0.09	0.13	0.06	0.00	0.16	0.11	0.14	0.13	0.23	0.15
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.04	0.02	0.01	0.09	0.16	0.00	0.07	0.03	0.24	0.08	0.11
O5'	0.09	0.13	0.28	0.07	0.13	0.01	0.17	0.01	0.17	0.18	0.15	0.12	0.12	0.20	0.13	0.26	0.11	0.07	0.00	0.19	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.23	0.14	0.03	0.19	0.00	0.33	0.29	0.10
OP1	0.26	0.30	0.36	0.12	0.30	0.15	0.31	0.11	0.32	0.31	0.31	0.29	0.29	0.32	0.29	0.34	0.13	0.24	0.02	0.33	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.18	0.26	0.11	0.17	0.08	0.23	0.12	0.26	0.19	0.22	0.16	0.15	0.26	0.13	0.24	0.23	0.08	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.09	0.30	0.07	0.08	0.04	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.30	0.15	0.11	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.12	0.29	0.29	0.13	0.16	0.10	0.19	0.15	0.11	0.16	0.15	0.29	0.37	0.17	0.24	0.18	0.24	0.24	0.10
C2	0.13	0.20	0.20	0.24	0.08	0.14	0.19	0.19	0.16	0.11	0.19	0.31	0.19	0.28	0.13	0.13	0.29	0.40	0.32	0.24
C2'	0.22	0.11	0.29	0.29	0.15	0.20	0.09	0.22	0.12	0.12	0.16	0.13	0.34	0.39	0.21	0.32	0.16	0.34	0.24	0.17
C3'	0.26	0.13	0.30	0.31	0.13	0.29	0.14	0.32	0.20	0.16	0.15	0.16	0.36	0.43	0.17	0.41	0.26	0.31	0.32	0.21
C4	0.15	0.15	0.23	0.30	0.10	0.16	0.19	0.21	0.18	0.12	0.13	0.24	0.20	0.35	0.16	0.14	0.31	0.40	0.28	0.27
C4'	0.30	0.17	0.30	0.29	0.16	0.30	0.15	0.31	0.20	0.21	0.17	0.18	0.39	0.41	0.18	0.45	0.25	0.35	0.32	0.27
C5	0.16	0.12	0.22	0.34	0.17	0.22	0.22	0.32	0.18	0.13	0.09	0.24	0.21	0.38	0.23	0.13	0.44	0.59	0.41	0.48
C5'	0.33	0.24	0.31	0.30	0.18	0.22	0.17	0.19	0.20	0.24	0.21	0.27	0.43	0.45	0.19	0.40	0.13	0.38	0.21	0.24
C6	0.14	0.14	0.21	0.31	0.19	0.23	0.23	0.35	0.17	0.12	0.09	0.27	0.23	0.35	0.27	0.14	0.48	0.68	0.47	0.55
C8	0.20	0.12	0.28	0.40	0.15	0.23	0.18	0.30	0.19	0.16	0.13	0.15	0.27	0.46	0.18	0.15	0.41	0.48	0.37	0.41
N1	0.13	0.17	0.20	0.27	0.13	0.19	0.21	0.27	0.16	0.11	0.13	0.31	0.21	0.31	0.21	0.12	0.38	0.57	0.38	0.42
N2	0.13	0.22	0.20	0.21	0.11	0.13	0.17	0.18	0.15	0.12	0.23	0.33	0.20	0.24	0.13	0.14	0.27	0.34	0.37	0.19
N3	0.14	0.19	0.21	0.25	0.10	0.14	0.17	0.18	0.17	0.12	0.21	0.27	0.19	0.29	0.15	0.15	0.26	0.31	0.30	0.16
N7	0.18	0.12	0.25	0.39	0.20	0.27	0.21	0.39	0.19	0.15	0.14	0.17	0.25	0.44	0.25	0.14	0.53	0.64	0.51	0.58
N9	0.18	0.12	0.26	0.34	0.10	0.17	0.16	0.19	0.18	0.13	0.12	0.17	0.24	0.39	0.14	0.17	0.27	0.34	0.24	0.21
O2'	0.12	0.15	0.33	0.29	0.23	0.12	0.18	0.25	0.13	0.10	0.21	0.16	0.36	0.40	0.27	0.21	0.16	0.58	0.36	0.39
O3'	0.40	0.25	0.35	0.37	0.33	0.45	0.43	0.53	0.46	0.36	0.26	0.20	0.40	0.45	0.33	0.57	0.53	0.47	0.61	0.49
O4'	0.23	0.15	0.29	0.28	0.16	0.19	0.15	0.21	0.19	0.18	0.17	0.15	0.32	0.38	0.18	0.33	0.20	0.22	0.27	0.16
O5'	0.22	0.24	0.37	0.48	0.18	0.19	0.13	0.23	0.14	0.19	0.23	0.29	0.40	0.65	0.20	0.17	0.29	0.42	0.33	0.34
O6	0.15	0.13	0.22	0.33	0.23	0.28	0.23	0.43	0.16	0.12	0.12	0.26	0.26	0.37	0.32	0.16	0.57	0.82	0.60	0.70
OP1	0.30	0.34	0.21	0.40	0.33	0.33	0.30	0.42	0.30	0.31	0.35	0.38	0.29	0.63	0.34	0.35	0.38	0.44	0.43	0.43
OP2	0.13	0.19	0.29	0.51	0.15	0.35	0.12	0.52	0.12	0.13	0.19	0.24	0.33	0.65	0.17	0.19	0.61	0.67	0.74	0.68
P	0.13	0.14	0.34	0.56	0.11	0.35	0.10	0.46	0.10	0.10	0.14	0.19	0.34	0.78	0.13	0.18	0.48	0.56	0.55	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.17	0.12	0.05
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.07	0.01	0.11	0.23	0.46	0.23	0.27
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.05	0.10	0.02	0.05	0.17	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.11	0.18	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.08	0.15	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.20	0.15	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.05	0.00	0.03	0.18	0.23	0.39	0.10
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.00	0.12	0.01	0.14	0.02	0.06	0.20	0.08	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.08	0.00	0.12	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.12	0.31	0.16	0.55	0.30
C5'	0.05	0.17	0.05	0.02	0.12	0.01	0.25	0.00	0.26	0.09	0.13	0.33	0.04	0.08	0.12	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.07	0.01	0.14	0.32	0.15	0.47	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.20	0.22	0.06
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.07	0.01	0.07	0.19	0.43	0.26	0.21
O2	0.05	0.00	0.17	0.15	0.02	0.20	0.01	0.33	0.01	0.02	0.02	0.00	0.22	0.12	0.02	0.22	0.43	0.71	0.41	0.53
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.10	0.08	0.14	0.04	0.14	0.05	0.10	0.22	0.00	0.04	0.13	0.05	0.04	0.13	0.17	0.07
O3'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.07	0.03	0.07	0.12	0.04	0.00	0.06	0.03	0.07	0.36	0.16	0.14
O4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.06	0.00	0.03	0.17	0.25	0.41	0.10
O4'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.02	0.14	0.01	0.07	0.22	0.05	0.03	0.03	0.00	0.11	0.22	0.11	0.11
O5'	0.09	0.23	0.05	0.06	0.18	0.01	0.31	0.01	0.32	0.13	0.19	0.43	0.04	0.07	0.17	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.17	0.46	0.11	0.20	0.23	0.09	0.16	0.09	0.15	0.20	0.43	0.71	0.13	0.36	0.25	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.23	0.18	0.15	0.39	0.06	0.55	0.11	0.47	0.22	0.26	0.41	0.17	0.16	0.41	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.27	0.09	0.09	0.10	0.02	0.30	0.01	0.29	0.06	0.21	0.53	0.07	0.14	0.10	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00