Doublet Group distance statistics: 53327

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 19, 16, 15, 4, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.011, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.015, 0.020, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.021, 0.027, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.014, 0.020, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.019, 0.026, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.025, 0.033, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.033 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.021, 0.029, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.018, 0.027, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.009
O6	A	0, 0.015, 0.025, 0.034, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.025 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.023, 0.034, 0.045, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.034 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.045, 0.059, 0.072, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.059 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.022, 0.036, 0.049, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.036 std_dev=0.014
O4'	B	0, 0.289, 0.417, 0.545, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.417 std_dev=0.128
C2	B	0, 0.210, 0.340, 0.471, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.340 std_dev=0.131
N1	B	0, 0.143, 0.293, 0.443, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.293 std_dev=0.150
N3	B	0, 0.271, 0.424, 0.577, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.424 std_dev=0.153
O2	B	0, 0.368, 0.525, 0.681, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.525 std_dev=0.156
O4'	A	0, 0.673, 0.837, 1.001, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.837 std_dev=0.164
C4	B	0, 0.393, 0.568, 0.744, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.568 std_dev=0.175
C1'	B	0, 0.286, 0.468, 0.649, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.468 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.776, 0.965, 1.154, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.965 std_dev=0.189
O5'	A	0, 0.706, 0.897, 1.089, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.897 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.346, 0.544, 0.742, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.544 std_dev=0.198
C6	B	0, 0.186, 0.388, 0.589, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.388 std_dev=0.202
C4'	B	0, 0.760, 0.975, 1.190, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.975 std_dev=0.215
O4	B	0, 0.582, 0.800, 1.017, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.800 std_dev=0.218
C4'	A	0, 1.094, 1.359, 1.623, 1.565 max_d=1.565 avg_d=1.359 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.918, 1.203, 1.487, 1.757 max_d=1.757 avg_d=1.203 std_dev=0.285
C5'	A	0, 1.123, 1.410, 1.696, 1.778 max_d=1.778 avg_d=1.410 std_dev=0.287
O2'	A	0, 1.188, 1.477, 1.766, 1.788 max_d=1.788 avg_d=1.477 std_dev=0.289
C3'	B	0, 1.087, 1.383, 1.679, 1.811 max_d=1.811 avg_d=1.383 std_dev=0.296
C3'	A	0, 1.333, 1.653, 1.972, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.653 std_dev=0.319
C5'	B	0, 1.371, 1.710, 2.049, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.710 std_dev=0.339
P	A	0, 1.305, 1.654, 2.003, 2.037 max_d=2.037 avg_d=1.654 std_dev=0.349
O2'	B	0, 1.210, 1.569, 1.928, 2.162 max_d=2.162 avg_d=1.569 std_dev=0.359
O3'	B	0, 1.692, 2.120, 2.549, 2.481 max_d=2.481 avg_d=2.120 std_dev=0.428
OP2	A	0, 2.091, 2.604, 3.118, 2.961 max_d=2.961 avg_d=2.604 std_dev=0.514
O3'	A	0, 2.340, 2.897, 3.455, 3.212 max_d=3.212 avg_d=2.897 std_dev=0.558
O5'	B	0, 2.052, 2.610, 3.169, 3.354 max_d=3.354 avg_d=2.610 std_dev=0.559
OP1	A	0, 3.532, 4.380, 5.227, 4.855 max_d=4.855 avg_d=4.380 std_dev=0.848
P	B	0, 3.576, 4.469, 5.363, 5.367 max_d=5.367 avg_d=4.469 std_dev=0.893
OP2	B	0, 4.132, 5.126, 6.120, 5.916 max_d=5.916 avg_d=5.126 std_dev=0.994
OP1	B	0, 5.586, 6.939, 8.292, 7.936 max_d=7.936 avg_d=6.939 std_dev=1.353

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.09	0.01	0.23	0.07	0.13
C2	0.01	0.00	0.10	0.08	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.07	0.01	0.36	0.10	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.08	0.05	0.04	0.08	0.12	0.10	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.20	0.12	0.19
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.07	0.07	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.11	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.03	0.08	0.01	0.37	0.09	0.16
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.09	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.02	0.09	0.01	0.44	0.13	0.19
C5'	0.04	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.04	0.05	0.09	0.06	0.03	0.08	0.01	0.00	0.09	0.05	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.09	0.00	0.46	0.15	0.19
C8	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.02	0.10	0.01	0.43	0.11	0.19
N1	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.08	0.00	0.42	0.13	0.17
N2	0.02	0.00	0.12	0.07	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.07	0.01	0.33	0.10	0.14
N3	0.01	0.00	0.10	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.04	0.07	0.01	0.33	0.08	0.14
N7	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.08	0.01	0.10	0.01	0.48	0.14	0.20
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.08	0.01	0.34	0.08	0.16
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.09	0.07	0.03	0.06	0.09	0.05	0.08	0.05	0.09	0.05	0.00	0.03	0.06	0.13	0.08	0.15	0.11	0.16
O3'	0.11	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.09	0.08	0.05	0.03	0.00	0.09	0.10	0.07	0.28	0.18	0.18
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.03	0.15	0.06	0.06
O5'	0.09	0.07	0.17	0.03	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.07	0.07	0.10	0.08	0.13	0.10	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.10	0.00	0.49	0.17	0.21
OP1	0.23	0.36	0.20	0.11	0.37	0.05	0.44	0.05	0.46	0.43	0.42	0.33	0.33	0.48	0.34	0.15	0.28	0.15	0.01	0.49	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.10	0.12	0.07	0.09	0.05	0.13	0.11	0.15	0.11	0.13	0.10	0.08	0.14	0.08	0.11	0.18	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.15	0.19	0.06	0.16	0.01	0.19	0.01	0.19	0.19	0.17	0.14	0.14	0.20	0.16	0.16	0.18	0.06	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.12	0.13	0.09	0.15	0.08	0.12	0.13	0.10	0.09	0.15	0.16	0.18	0.10	0.17	0.09	0.15	0.21	0.36	0.20
C2	0.09	0.10	0.08	0.10	0.13	0.13	0.12	0.21	0.10	0.07	0.12	0.13	0.12	0.11	0.15	0.10	0.24	0.37	0.51	0.34
C2'	0.13	0.13	0.17	0.13	0.14	0.10	0.11	0.10	0.10	0.10	0.15	0.17	0.22	0.15	0.17	0.10	0.10	0.14	0.30	0.12
C3'	0.08	0.13	0.09	0.08	0.15	0.11	0.12	0.15	0.10	0.09	0.16	0.15	0.11	0.08	0.17	0.13	0.15	0.18	0.35	0.18
C4	0.09	0.08	0.10	0.08	0.11	0.11	0.11	0.17	0.09	0.06	0.11	0.13	0.14	0.08	0.14	0.10	0.24	0.38	0.48	0.33
C4'	0.10	0.16	0.08	0.09	0.20	0.12	0.17	0.17	0.14	0.13	0.20	0.17	0.10	0.08	0.23	0.15	0.20	0.23	0.37	0.23
C5	0.13	0.09	0.12	0.12	0.08	0.14	0.12	0.19	0.12	0.10	0.07	0.12	0.15	0.12	0.11	0.13	0.31	0.53	0.55	0.43
C5'	0.12	0.18	0.09	0.10	0.25	0.14	0.22	0.19	0.18	0.16	0.24	0.16	0.11	0.09	0.29	0.17	0.26	0.32	0.43	0.30
C6	0.14	0.10	0.13	0.15	0.07	0.16	0.12	0.22	0.14	0.12	0.08	0.12	0.15	0.15	0.10	0.15	0.35	0.63	0.61	0.50
C8	0.11	0.08	0.12	0.10	0.12	0.11	0.12	0.16	0.11	0.09	0.09	0.12	0.16	0.10	0.15	0.11	0.26	0.44	0.48	0.36
N1	0.12	0.09	0.11	0.14	0.09	0.16	0.10	0.23	0.10	0.09	0.09	0.11	0.13	0.15	0.12	0.13	0.32	0.56	0.61	0.47
N2	0.09	0.12	0.08	0.12	0.14	0.14	0.14	0.23	0.12	0.09	0.13	0.13	0.11	0.14	0.16	0.08	0.17	0.26	0.47	0.27
N3	0.08	0.12	0.08	0.08	0.14	0.10	0.13	0.18	0.10	0.08	0.14	0.14	0.13	0.08	0.16	0.09	0.20	0.29	0.44	0.27
N7	0.14	0.11	0.14	0.12	0.11	0.14	0.14	0.18	0.14	0.12	0.09	0.13	0.16	0.12	0.13	0.13	0.31	0.55	0.54	0.43
N9	0.09	0.08	0.11	0.07	0.13	0.09	0.11	0.14	0.09	0.06	0.12	0.13	0.16	0.08	0.15	0.09	0.21	0.34	0.44	0.29
O2'	0.19	0.16	0.25	0.19	0.15	0.14	0.12	0.12	0.12	0.14	0.16	0.22	0.34	0.22	0.18	0.13	0.11	0.13	0.30	0.10
O3'	0.23	0.23	0.19	0.23	0.21	0.29	0.20	0.33	0.21	0.22	0.23	0.26	0.18	0.22	0.22	0.30	0.29	0.25	0.48	0.30
O4'	0.10	0.15	0.08	0.09	0.19	0.13	0.17	0.18	0.14	0.13	0.19	0.14	0.11	0.08	0.21	0.16	0.24	0.29	0.40	0.27
O5'	0.10	0.14	0.08	0.09	0.21	0.14	0.19	0.19	0.15	0.13	0.19	0.12	0.11	0.08	0.25	0.16	0.27	0.38	0.48	0.34
O6	0.16	0.12	0.16	0.18	0.10	0.19	0.16	0.24	0.17	0.15	0.11	0.13	0.16	0.18	0.09	0.17	0.38	0.75	0.65	0.57
OP1	0.36	0.45	0.30	0.37	0.64	0.40	0.60	0.49	0.52	0.45	0.56	0.35	0.23	0.32	0.71	0.42	0.62	0.78	0.84	0.71
OP2	0.12	0.16	0.11	0.12	0.21	0.14	0.18	0.18	0.16	0.14	0.20	0.16	0.12	0.11	0.25	0.15	0.27	0.43	0.46	0.35
P	0.16	0.22	0.12	0.15	0.32	0.20	0.30	0.27	0.25	0.21	0.28	0.17	0.11	0.13	0.37	0.22	0.38	0.53	0.60	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.15	0.11	0.10
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.18	0.30	0.23	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.03	0.00	0.11	0.14	0.07	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.13	0.11	0.07	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.26	0.52	0.33	0.35
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.17	0.05	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.27	0.54	0.32	0.36
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.09	0.01	0.01	0.08	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.24	0.41	0.25	0.29
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.18	0.28	0.20	0.20
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.02	0.22	0.41	0.29	0.29
O2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.14	0.23	0.20	0.17
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.21	0.07	0.08
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.10	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.10	0.10	0.06
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.27	0.58	0.36	0.38
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.15	0.07	0.06
O5'	0.09	0.18	0.11	0.13	0.26	0.01	0.27	0.01	0.24	0.18	0.22	0.14	0.04	0.09	0.27	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.30	0.14	0.11	0.52	0.17	0.54	0.08	0.41	0.28	0.41	0.23	0.21	0.10	0.58	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.23	0.07	0.07	0.33	0.05	0.32	0.05	0.25	0.20	0.29	0.20	0.07	0.10	0.36	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.22	0.09	0.10	0.35	0.05	0.36	0.01	0.29	0.20	0.29	0.17	0.08	0.06	0.38	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00