Doublet Group distance statistics: 53335

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.011, 0.019, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.018, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.012, 0.021, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.013, 0.023, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.017, 0.028, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.028 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.015, 0.028, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.012, 0.027, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.021, 0.036, 0.052, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.036 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.027, 0.056, 0.086, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.014, 0.046, 0.078, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.046 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.208, 0.331, 0.455, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.331 std_dev=0.124
O2'	A	0, 0.254, 0.384, 0.515, 0.483 max_d=0.483 avg_d=0.384 std_dev=0.130
O4'	A	0, 0.218, 0.368, 0.519, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.368 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.367, 0.559, 0.751, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.559 std_dev=0.192
N1	B	0, 0.246, 0.441, 0.636, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.441 std_dev=0.195
C3'	A	0, 0.376, 0.574, 0.771, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.574 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.291, 0.489, 0.688, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.489 std_dev=0.199
C4'	B	0, 0.355, 0.555, 0.755, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.555 std_dev=0.200
O2	B	0, 0.318, 0.533, 0.748, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.533 std_dev=0.215
C6	B	0, 0.353, 0.568, 0.784, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.568 std_dev=0.216
N3	B	0, 0.492, 0.751, 1.009, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.751 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.520, 0.787, 1.055, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.787 std_dev=0.267
O3'	A	0, 0.523, 0.794, 1.065, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.794 std_dev=0.271
O4'	B	0, 0.522, 0.814, 1.106, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.814 std_dev=0.292
C5	B	0, 0.558, 0.870, 1.182, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.870 std_dev=0.312
C5'	B	0, 0.549, 0.880, 1.211, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.880 std_dev=0.331
P	A	0, 0.589, 0.924, 1.259, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.924 std_dev=0.335
C5'	A	0, 0.655, 0.995, 1.334, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.995 std_dev=0.340
C4	B	0, 0.633, 0.978, 1.323, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.978 std_dev=0.345
C3'	B	0, 0.658, 1.034, 1.411, 1.354 max_d=1.354 avg_d=1.034 std_dev=0.377
P	B	0, 0.679, 1.079, 1.480, 1.409 max_d=1.409 avg_d=1.079 std_dev=0.401
O4	B	0, 0.801, 1.259, 1.718, 1.645 max_d=1.645 avg_d=1.259 std_dev=0.458
O5'	B	0, 1.025, 1.562, 2.099, 1.898 max_d=1.898 avg_d=1.562 std_dev=0.537
O5'	A	0, 0.978, 1.533, 2.089, 1.981 max_d=1.981 avg_d=1.533 std_dev=0.555
OP2	A	0, 0.722, 1.281, 1.840, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.281 std_dev=0.559
O3'	B	0, 1.073, 1.650, 2.226, 2.028 max_d=2.028 avg_d=1.650 std_dev=0.577
C2'	B	0, 1.047, 1.647, 2.247, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.647 std_dev=0.600
OP1	A	0, 0.754, 1.407, 2.060, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.407 std_dev=0.653
OP1	B	0, 0.870, 1.546, 2.223, 2.549 max_d=2.549 avg_d=1.546 std_dev=0.677
OP2	B	0, 0.886, 1.573, 2.261, 2.091 max_d=2.091 avg_d=1.573 std_dev=0.688
O2'	B	0, 2.107, 3.233, 4.358, 3.948 max_d=3.948 avg_d=3.233 std_dev=1.125

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.04	0.15	0.09	0.08
C2	0.05	0.00	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.07	0.10	0.33	0.04	0.16	0.30	0.15
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.24	0.07	0.06
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.12	0.13	0.11	0.10	0.09	0.13	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.13	0.30	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.05	0.30	0.03	0.05	0.26	0.10
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.10	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.11	0.27	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.12	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.34	0.02	0.05	0.32	0.12
C5'	0.02	0.18	0.01	0.02	0.16	0.01	0.19	0.00	0.21	0.15	0.20	0.19	0.16	0.19	0.12	0.06	0.04	0.01	0.01	0.23	0.29	0.10	0.02
C6	0.03	0.02	0.03	0.12	0.02	0.10	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.09	0.11	0.05	0.37	0.01	0.12	0.36	0.15
C8	0.02	0.01	0.02	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.04	0.28	0.04	0.12	0.25	0.10
N1	0.04	0.01	0.03	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.08	0.36	0.03	0.16	0.35	0.16
N2	0.07	0.01	0.05	0.10	0.02	0.10	0.02	0.19	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.07	0.12	0.32	0.05	0.22	0.29	0.17
N3	0.05	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.10	0.29	0.04	0.10	0.24	0.12
N7	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03	0.33	0.03	0.07	0.32	0.12
N9	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.25	0.03	0.09	0.20	0.08
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.06	0.06	0.08	0.06	0.09	0.06	0.08	0.05	0.05	0.08	0.05	0.00	0.03	0.06	0.07	0.10	0.29	0.14	0.07
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.07	0.01	0.11	0.04	0.11	0.13	0.09	0.07	0.06	0.14	0.08	0.03	0.00	0.02	0.06	0.13	0.37	0.17	0.03
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.12	0.10	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.13	0.06	0.15	0.08	0.08
O5'	0.13	0.33	0.07	0.05	0.30	0.01	0.34	0.01	0.37	0.28	0.36	0.32	0.29	0.33	0.25	0.07	0.06	0.13	0.00	0.38	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.04	0.05	0.13	0.03	0.11	0.02	0.23	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.03	0.10	0.13	0.06	0.38	0.00	0.14	0.39	0.16
OP1	0.15	0.16	0.24	0.30	0.05	0.27	0.05	0.29	0.12	0.12	0.16	0.22	0.10	0.07	0.09	0.29	0.37	0.15	0.02	0.14	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.30	0.07	0.09	0.26	0.10	0.32	0.10	0.36	0.25	0.35	0.29	0.24	0.32	0.20	0.14	0.17	0.08	0.02	0.39	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.06	0.05	0.10	0.04	0.12	0.02	0.15	0.10	0.16	0.17	0.12	0.12	0.08	0.07	0.03	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.20	0.17	0.12	0.10	0.09	0.07	0.06	0.10	0.15	0.22	0.37	0.30	0.14	0.09	0.07	0.23	0.08	0.05
C2	0.11	0.11	0.14	0.15	0.13	0.15	0.16	0.26	0.14	0.08	0.13	0.15	0.18	0.10	0.16	0.11	0.25	0.23	0.32	0.18
C2'	0.13	0.15	0.20	0.18	0.13	0.09	0.10	0.07	0.07	0.09	0.15	0.22	0.39	0.33	0.15	0.09	0.07	0.24	0.08	0.05
C3'	0.08	0.11	0.17	0.16	0.16	0.08	0.16	0.08	0.13	0.10	0.14	0.11	0.37	0.35	0.18	0.12	0.07	0.21	0.10	0.07
C4	0.10	0.13	0.11	0.10	0.14	0.09	0.12	0.15	0.08	0.04	0.14	0.20	0.23	0.20	0.16	0.06	0.12	0.16	0.19	0.07
C4'	0.09	0.09	0.17	0.16	0.13	0.09	0.13	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.37	0.29	0.14	0.12	0.08	0.23	0.15	0.09
C5	0.11	0.11	0.12	0.10	0.14	0.09	0.15	0.16	0.10	0.03	0.13	0.19	0.22	0.25	0.18	0.09	0.13	0.10	0.23	0.09
C5'	0.18	0.20	0.16	0.17	0.22	0.15	0.21	0.16	0.20	0.20	0.21	0.18	0.37	0.31	0.22	0.20	0.11	0.24	0.26	0.15
C6	0.13	0.09	0.14	0.11	0.15	0.12	0.20	0.21	0.17	0.09	0.11	0.16	0.20	0.21	0.18	0.13	0.19	0.13	0.32	0.14
C8	0.15	0.15	0.20	0.18	0.13	0.11	0.10	0.09	0.07	0.08	0.15	0.24	0.35	0.38	0.16	0.10	0.08	0.11	0.16	0.07
N1	0.13	0.09	0.16	0.14	0.14	0.14	0.19	0.26	0.18	0.10	0.11	0.14	0.20	0.13	0.17	0.13	0.25	0.18	0.36	0.18
N2	0.13	0.11	0.18	0.20	0.13	0.18	0.15	0.30	0.15	0.10	0.13	0.15	0.20	0.14	0.16	0.12	0.31	0.30	0.39	0.25
N3	0.09	0.13	0.10	0.11	0.14	0.11	0.13	0.20	0.09	0.06	0.14	0.18	0.19	0.11	0.16	0.06	0.18	0.22	0.22	0.12
N7	0.12	0.13	0.16	0.14	0.14	0.10	0.13	0.12	0.08	0.05	0.14	0.23	0.28	0.35	0.17	0.09	0.10	0.08	0.20	0.08
N9	0.13	0.15	0.18	0.15	0.13	0.10	0.10	0.09	0.06	0.08	0.15	0.23	0.33	0.29	0.15	0.08	0.07	0.16	0.13	0.04
O2'	0.12	0.16	0.18	0.14	0.13	0.07	0.10	0.09	0.07	0.10	0.17	0.23	0.37	0.25	0.15	0.08	0.08	0.30	0.07	0.08
O3'	0.09	0.14	0.16	0.16	0.18	0.09	0.17	0.10	0.14	0.12	0.17	0.14	0.37	0.33	0.20	0.12	0.08	0.23	0.13	0.09
O4'	0.14	0.14	0.21	0.18	0.11	0.09	0.10	0.08	0.08	0.10	0.13	0.19	0.38	0.30	0.12	0.10	0.08	0.24	0.09	0.07
O5'	0.48	0.49	0.37	0.13	0.50	0.24	0.49	0.18	0.48	0.49	0.49	0.46	0.51	0.02	0.50	0.46	0.18	0.27	0.27	0.19
O6	0.15	0.10	0.16	0.12	0.17	0.12	0.24	0.21	0.20	0.13	0.09	0.16	0.23	0.25	0.21	0.14	0.20	0.13	0.35	0.16
OP1	0.07	0.03	0.14	0.35	0.09	0.30	0.14	0.51	0.14	0.07	0.03	0.07	0.12	0.01	0.09	0.13	0.47	0.58	0.68	0.54
OP2	0.53	0.56	0.57	0.18	0.57	0.15	0.57	0.09	0.56	0.56	0.57	0.54	0.80	0.02	0.58	0.38	0.25	0.19	0.33	0.21
P	0.24	0.23	0.22	0.04	0.23	0.08	0.23	0.12	0.23	0.23	0.23	0.22	0.40	0.01	0.23	0.20	0.05	0.14	0.30	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.20	0.02	0.01	0.08	0.12	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.30	0.01	0.04	0.13	0.19	0.18	0.15
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.06	0.08	0.07	0.02	0.03	0.08	0.00	0.05	0.04	0.02	0.11	0.24	0.28	0.14
C3'	0.03	0.05	0.01	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.12	0.02	0.02	0.12	0.03	0.01	0.08	0.01	0.10	0.24	0.24	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.16	0.00	0.03	0.20	0.29	0.35	0.24
C4'	0.02	0.02	0.03	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.10	0.03	0.04	0.07	0.05	0.04	0.09	0.01	0.03	0.10	0.09	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.07	0.02	0.05	0.21	0.31	0.39	0.25
C5'	0.03	0.10	0.08	0.02	0.20	0.01	0.22	0.00	0.18	0.10	0.15	0.07	0.06	0.09	0.22	0.01	0.01	0.13	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.06	0.02	0.05	0.17	0.25	0.28	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.18	0.01	0.01	0.12	0.19	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.26	0.01	0.03	0.16	0.24	0.25	0.19
O2	0.04	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.41	0.01	0.07	0.12	0.16	0.15	0.12
O2'	0.02	0.12	0.00	0.03	0.15	0.05	0.15	0.06	0.13	0.09	0.14	0.14	0.00	0.09	0.16	0.03	0.11	0.29	0.38	0.17
O3'	0.20	0.30	0.05	0.01	0.16	0.04	0.07	0.09	0.06	0.18	0.26	0.41	0.09	0.00	0.16	0.11	0.13	0.38	0.28	0.23
O4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.09	0.02	0.22	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.00	0.04	0.22	0.32	0.40	0.26
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.07	0.03	0.11	0.04	0.00	0.09	0.05	0.14	0.10
O5'	0.08	0.13	0.11	0.10	0.20	0.03	0.21	0.01	0.17	0.12	0.16	0.12	0.11	0.13	0.22	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.19	0.24	0.24	0.29	0.10	0.31	0.13	0.25	0.19	0.24	0.16	0.29	0.38	0.32	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.18	0.28	0.24	0.35	0.09	0.39	0.03	0.28	0.18	0.25	0.15	0.38	0.28	0.40	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.14	0.14	0.24	0.03	0.25	0.02	0.20	0.14	0.19	0.12	0.17	0.23	0.26	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00