sequences=6 maxmove=0.1 pval=0.1 usescval=false complexatt=true cooling=1.0 currcool=1.0 attfactor=10.0 attvalpow=1 repfactor=10.0 repvalpow=1 dampening=1.0 minattract=1.0 cluster2d=false blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500 formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb showinfo=true zoom=1.0 dotsize=0 ovalsize=10 groupsize=4 usefoldchange=false avgfoldchange=false colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9; colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23): 1.0;0.0;0.0; 0.0;1.0;0.0; 0.0;0.0;1.0; >2ZJR-X99-X97 X >3OI1-B20-B21 X >3OHZ-B20-B21 X >3OHJ-B20-B21 X >3OH5-B20-B21 X >3OH7-B20-B21 X 0 1:0.900012594593 0 2:0.90478960242 0 3:0.999999859784 0 4:0.859174552171 0 5:0.85768084994 1 2:0.0348664426085 1 3:0.305604722584 1 4:0.196689547297 1 5:0.185012070661 2 3:0.290094689075 2 4:0.183996225383 2 5:0.178618112143 3 4:0.194527691999 3 5:0.213584882182 4 5:0.0423514960561