Doublet Group distance statistics: 53344

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.001, 0.009, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C6	A	0, -0.003, 0.011, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.015
N7	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N1	A	0, -0.003, 0.016, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.004, 0.019, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.023
C8	A	0, -0.007, 0.030, 0.067, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.030 std_dev=0.037
N9	A	0, -0.008, 0.030, 0.069, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.030 std_dev=0.039
O6	A	0, -0.006, 0.032, 0.071, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.011, 0.055, 0.099, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.055 std_dev=0.044
C2'	A	0, -0.008, 0.060, 0.128, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.060 std_dev=0.068
C3'	A	0, -0.022, 0.161, 0.344, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.161 std_dev=0.183
O2'	A	0, -0.054, 0.181, 0.415, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.181 std_dev=0.235
C4'	A	0, -0.035, 0.215, 0.465, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.215 std_dev=0.250
O3'	A	0, -0.035, 0.225, 0.486, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.225 std_dev=0.261
P	B	0, -0.031, 0.398, 0.826, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.398 std_dev=0.428
C6	B	0, 0.027, 0.459, 0.890, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.459 std_dev=0.432
C5	B	0, 0.030, 0.463, 0.896, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.463 std_dev=0.433
OP2	B	0, -0.007, 0.459, 0.925, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.459 std_dev=0.466
C4	B	0, 0.049, 0.523, 0.997, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.523 std_dev=0.474
O4	B	0, 0.064, 0.550, 1.037, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.550 std_dev=0.487
O5'	B	0, -0.030, 0.459, 0.949, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.459 std_dev=0.489
OP1	A	0, 0.085, 0.583, 1.081, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.583 std_dev=0.498
N1	B	0, 0.038, 0.542, 1.047, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.542 std_dev=0.505
O4'	B	0, 0.007, 0.512, 1.017, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.512 std_dev=0.505
C5'	A	0, -0.085, 0.425, 0.935, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.425 std_dev=0.510
OP1	B	0, -0.047, 0.476, 0.998, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.476 std_dev=0.522
C5'	B	0, -0.042, 0.485, 1.012, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.485 std_dev=0.527
C1'	B	0, 0.048, 0.575, 1.103, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.575 std_dev=0.527
N3	B	0, 0.051, 0.585, 1.118, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.585 std_dev=0.533
C4'	B	0, 0.009, 0.561, 1.113, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.561 std_dev=0.552
O5'	A	0, -0.021, 0.531, 1.084, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.531 std_dev=0.553
C2	B	0, 0.045, 0.613, 1.181, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.613 std_dev=0.568
C2'	B	0, 0.085, 0.664, 1.244, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.664 std_dev=0.579
C3'	B	0, 0.053, 0.653, 1.253, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.653 std_dev=0.600
O2'	B	0, 0.102, 0.733, 1.364, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.733 std_dev=0.631
O3'	B	0, 0.075, 0.723, 1.371, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.723 std_dev=0.648
O2	B	0, 0.041, 0.739, 1.438, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.739 std_dev=0.699
P	A	0, -0.141, 1.041, 2.223, 2.694 max_d=2.694 avg_d=1.041 std_dev=1.182
OP2	A	0, -0.502, 1.887, 4.275, 5.256 max_d=5.256 avg_d=1.887 std_dev=2.388

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.12	0.33	0.11
C2	0.01	0.00	0.00	0.15	0.03	0.21	0.01	0.43	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.18	0.04	0.34	0.01	0.17	1.72	0.83
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.14	0.00	0.14	0.03	0.15	0.08	0.15	0.15	0.13	0.12	0.09	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.02	0.01
C4	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.15	0.00	0.31	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.14	0.04	0.18	0.02	0.04	1.13	0.52
C4'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.17	0.04	0.20	0.23	0.18	0.10	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.15	0.06	0.02	0.02
C5	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.14	0.00	0.33	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.13	0.04	0.20	0.03	0.07	1.23	0.57
C5'	0.04	0.43	0.03	0.03	0.31	0.00	0.33	0.00	0.39	0.17	0.43	0.46	0.36	0.27	0.17	0.02	0.02	0.01	0.01	0.39	0.13	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.17	0.01	0.39	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.07	0.15	0.04	0.28	0.01	0.15	1.52	0.72
C8	0.01	0.04	0.03	0.08	0.01	0.04	0.03	0.17	0.05	0.00	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.11	0.06	0.01	0.04	0.07	0.06	0.70	0.29
N1	0.02	0.00	0.02	0.15	0.03	0.20	0.02	0.43	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.17	0.04	0.34	0.00	0.19	1.73	0.84
N2	0.00	0.00	0.02	0.15	0.03	0.23	0.01	0.46	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.20	0.04	0.42	0.01	0.24	2.00	0.98
N3	0.00	0.00	0.01	0.13	0.01	0.18	0.01	0.36	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.15	0.04	0.26	0.01	0.08	1.37	0.65
N7	0.01	0.01	0.02	0.12	0.02	0.10	0.00	0.27	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.10	0.04	0.14	0.05	0.04	0.99	0.45
N9	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.07	0.02	0.17	0.03	0.00	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.05	0.07	0.72	0.30
O2'	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.11	0.03	0.05	0.02	0.10	0.04	0.00	0.00	0.05	0.02	0.11	0.02	0.26	0.08
O3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.14	0.03	0.13	0.02	0.15	0.06	0.17	0.20	0.15	0.10	0.08	0.00	0.00	0.02	0.12	0.14	0.05	0.37	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.02	0.14	0.38	0.13
O5'	0.05	0.34	0.01	0.05	0.18	0.01	0.20	0.01	0.28	0.04	0.34	0.42	0.26	0.14	0.05	0.02	0.12	0.06	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.05	0.14	0.02	0.15	0.03	0.39	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.11	0.14	0.02	0.28	0.00	0.16	1.56	0.74
OP1	0.12	0.17	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.13	0.15	0.06	0.19	0.24	0.08	0.04	0.07	0.02	0.05	0.14	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	1.72	0.04	0.02	1.13	0.02	1.23	0.13	1.52	0.70	1.73	2.00	1.37	0.99	0.72	0.26	0.37	0.38	0.01	1.56	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.83	0.02	0.01	0.52	0.02	0.57	0.02	0.72	0.29	0.84	0.98	0.65	0.45	0.30	0.08	0.09	0.13	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.20	0.06	0.06	0.17	0.03	0.11	0.05	0.09	0.14	0.20	0.24	0.03	0.03	0.18	0.03	0.10	0.01	0.01	0.03
C2	0.18	0.10	0.16	0.18	0.14	0.20	0.23	0.17	0.23	0.16	0.10	0.08	0.16	0.18	0.11	0.21	0.17	0.22	0.27	0.22
C2'	0.12	0.27	0.12	0.11	0.25	0.06	0.21	0.09	0.21	0.23	0.27	0.30	0.07	0.08	0.24	0.07	0.17	0.04	0.10	0.08
C3'	0.08	0.02	0.06	0.05	0.00	0.09	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
C4	0.13	0.03	0.10	0.11	0.04	0.15	0.07	0.12	0.13	0.06	0.07	0.06	0.12	0.12	0.09	0.17	0.09	0.13	0.15	0.13
C4'	0.05	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04	0.11	0.00	0.07	0.01	0.03	0.06	0.03	0.04	0.08	0.06	0.02	0.07	0.15	0.08
C5	0.14	0.01	0.11	0.12	0.04	0.15	0.09	0.11	0.16	0.09	0.07	0.05	0.13	0.12	0.10	0.17	0.08	0.12	0.14	0.12
C5'	0.23	0.24	0.20	0.19	0.36	0.16	0.38	0.10	0.30	0.24	0.31	0.19	0.17	0.17	0.39	0.20	0.15	0.11	0.32	0.17
C6	0.18	0.10	0.16	0.17	0.09	0.19	0.20	0.15	0.23	0.17	0.06	0.07	0.16	0.16	0.02	0.20	0.14	0.16	0.20	0.17
C8	0.05	0.22	0.04	0.04	0.22	0.06	0.13	0.02	0.08	0.12	0.26	0.25	0.06	0.04	0.24	0.07	0.06	0.02	0.02	0.02
N1	0.20	0.13	0.17	0.19	0.17	0.21	0.25	0.18	0.26	0.19	0.13	0.11	0.18	0.19	0.12	0.22	0.17	0.21	0.26	0.21
N2	0.20	0.14	0.18	0.21	0.19	0.22	0.26	0.21	0.25	0.19	0.15	0.12	0.18	0.21	0.18	0.23	0.21	0.28	0.33	0.26
N3	0.14	0.04	0.12	0.13	0.05	0.16	0.14	0.13	0.16	0.09	0.04	0.03	0.13	0.14	0.04	0.18	0.12	0.17	0.21	0.17
N7	0.08	0.14	0.06	0.07	0.17	0.11	0.07	0.06	0.08	0.04	0.21	0.17	0.09	0.08	0.21	0.12	0.03	0.06	0.07	0.06
N9	0.05	0.14	0.04	0.04	0.15	0.09	0.07	0.04	0.03	0.06	0.17	0.18	0.07	0.06	0.18	0.10	0.02	0.05	0.05	0.04
O2'	0.30	0.40	0.28	0.27	0.31	0.25	0.26	0.24	0.29	0.36	0.36	0.46	0.26	0.21	0.28	0.29	0.26	0.07	0.09	0.11
O3'	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
O4'	0.02	0.12	0.02	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.11	0.16	0.02	0.01	0.08	0.04	0.05	0.03	0.05	0.02
O5'	0.15	0.17	0.16	0.17	0.32	0.13	0.35	0.10	0.26	0.17	0.25	0.10	0.11	0.18	0.37	0.13	0.19	0.26	0.44	0.28
O6	0.18	0.13	0.15	0.16	0.12	0.18	0.19	0.14	0.23	0.19	0.09	0.11	0.16	0.16	0.06	0.19	0.13	0.15	0.18	0.15
OP1	0.12	0.14	0.13	0.15	0.27	0.11	0.27	0.09	0.19	0.13	0.21	0.09	0.09	0.16	0.31	0.11	0.16	0.26	0.36	0.23
OP2	0.44	0.84	0.32	0.14	1.23	0.01	1.07	0.22	0.76	0.67	1.10	0.76	0.19	0.04	1.44	0.24	0.01	0.49	0.26	0.15
P	0.25	0.41	0.21	0.15	0.65	0.07	0.60	0.02	0.43	0.35	0.56	0.34	0.14	0.09	0.76	0.17	0.11	0.03	0.36	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01
C2	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.05	0.05	0.01	0.04
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.07	0.05	0.05
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.06	0.05
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02
C5	0.01	0.02	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.03	0.10	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.07	0.02	0.02	0.07	0.07	0.03	0.05
N1	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.02	0.05
N3	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01
O2	0.12	0.00	0.05	0.03	0.00	0.09	0.02	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.08	0.02	0.02	0.13	0.08	0.09	0.03	0.07
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.08	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.09	0.06	0.05
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.07	0.04	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.09	0.09	0.06
O4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02
O4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.13	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02
O5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.02	0.08	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.04	0.05	0.07	0.08	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.07	0.01	0.09	0.09	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.09	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.07	0.05	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00