Doublet Group distance statistics: 53381

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.015, 0.032, 0.048, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.032 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.035 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.016, 0.034, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.034 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.046, 0.096, 0.145, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.096 std_dev=0.050
O4	A	0, 0.016, 0.069, 0.122, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.069 std_dev=0.053
C5	B	0, 0.061, 0.231, 0.402, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.231 std_dev=0.171
N9	B	0, 0.080, 0.276, 0.472, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.276 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.053, 0.254, 0.455, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.254 std_dev=0.201
C6	B	0, 0.109, 0.338, 0.568, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.338 std_dev=0.229
C3'	B	0, 0.256, 0.536, 0.816, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.536 std_dev=0.280
C8	B	0, 0.250, 0.539, 0.829, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.539 std_dev=0.289
C2'	B	0, 0.225, 0.521, 0.816, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.521 std_dev=0.295
C1'	B	0, 0.205, 0.507, 0.809, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.507 std_dev=0.302
N7	B	0, 0.287, 0.605, 0.924, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.605 std_dev=0.319
N1	B	0, 0.277, 0.601, 0.924, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.601 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.300, 0.625, 0.951, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.625 std_dev=0.326
N6	B	0, 0.225, 0.566, 0.906, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.566 std_dev=0.341
O5'	B	0, 0.283, 0.650, 1.017, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.650 std_dev=0.367
O3'	B	0, 0.224, 0.591, 0.959, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.591 std_dev=0.367
O4'	A	0, 0.371, 0.748, 1.126, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.748 std_dev=0.378
O4'	B	0, 0.261, 0.648, 1.034, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.648 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.261, 0.658, 1.055, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.658 std_dev=0.397
O2'	B	0, 0.241, 0.639, 1.037, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.639 std_dev=0.398
N3	B	0, 0.245, 0.661, 1.077, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.661 std_dev=0.416
C2	B	0, 0.361, 0.789, 1.216, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.789 std_dev=0.427
C2'	A	0, 0.418, 0.849, 1.281, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.849 std_dev=0.432
O2'	A	0, 0.511, 1.042, 1.573, 1.472 max_d=1.472 avg_d=1.042 std_dev=0.531
OP1	B	0, 0.484, 1.017, 1.550, 1.501 max_d=1.501 avg_d=1.017 std_dev=0.533
C4'	A	0, 0.523, 1.063, 1.604, 1.512 max_d=1.512 avg_d=1.063 std_dev=0.540
P	B	0, 0.561, 1.165, 1.770, 1.705 max_d=1.705 avg_d=1.165 std_dev=0.604
C3'	A	0, 0.618, 1.258, 1.898, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.258 std_dev=0.640
OP2	B	0, 0.795, 1.639, 2.484, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.639 std_dev=0.844
O3'	A	0, 0.866, 1.760, 2.655, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.760 std_dev=0.895
C5'	A	0, 0.951, 1.924, 2.897, 2.682 max_d=2.682 avg_d=1.924 std_dev=0.973
O5'	A	0, 1.046, 2.102, 3.157, 2.709 max_d=2.709 avg_d=2.102 std_dev=1.055
P	A	0, 1.147, 2.430, 3.712, 3.425 max_d=3.425 avg_d=2.430 std_dev=1.283
OP1	A	0, 0.878, 2.236, 3.594, 3.454 max_d=3.454 avg_d=2.236 std_dev=1.358
OP2	A	0, 1.303, 2.724, 4.146, 3.805 max_d=3.805 avg_d=2.724 std_dev=1.421

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.15	0.10	0.22
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.03	0.09	0.15	0.12	0.25
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.02	0.07	0.16	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.15	0.10	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.04	0.08	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.28	0.16	0.10
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.00	0.02	0.04	0.18	0.13	0.24
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.02	0.05	0.04	0.24	0.17	0.27
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.08	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.12	0.02	0.05	0.05	0.26	0.18	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.08	0.19	0.13	0.26
N3	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.01	0.07	0.16	0.12	0.24
O2	0.05	0.01	0.16	0.15	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.17	0.02	0.07	0.11	0.13	0.11	0.24
O2'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.05	0.14	0.00	0.05	0.03	0.05	0.02	0.15	0.09	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.02	0.12	0.04	0.10	0.17	0.05	0.00	0.09	0.02	0.04	0.46	0.25	0.22
O4	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.09	0.00	0.03	0.01	0.15	0.09	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.03	0.00	0.08	0.26	0.15	0.27
O5'	0.07	0.09	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.08	0.07	0.11	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.15	0.15	0.28	0.18	0.05	0.24	0.04	0.26	0.19	0.16	0.13	0.15	0.46	0.15	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.12	0.10	0.16	0.13	0.02	0.17	0.02	0.18	0.13	0.12	0.11	0.09	0.25	0.09	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.25	0.06	0.10	0.24	0.07	0.27	0.03	0.29	0.26	0.24	0.24	0.05	0.22	0.19	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.11	0.05	0.10	0.06	0.12	0.09	0.27	0.16	0.11	0.16	0.07	0.23	0.08	0.09	0.07	0.15	0.14	0.22	0.15	0.28	0.14
C2	0.13	0.11	0.07	0.09	0.09	0.11	0.10	0.26	0.15	0.13	0.14	0.09	0.21	0.10	0.11	0.08	0.14	0.15	0.20	0.15	0.27	0.12
C2'	0.10	0.24	0.05	0.13	0.11	0.16	0.15	0.32	0.27	0.05	0.30	0.16	0.38	0.06	0.06	0.07	0.18	0.13	0.20	0.13	0.32	0.16
C3'	0.12	0.28	0.07	0.16	0.15	0.22	0.20	0.38	0.32	0.03	0.35	0.20	0.44	0.11	0.08	0.11	0.20	0.16	0.22	0.18	0.39	0.22
C4	0.14	0.14	0.08	0.09	0.12	0.11	0.16	0.28	0.19	0.12	0.17	0.11	0.24	0.15	0.12	0.07	0.14	0.16	0.24	0.15	0.27	0.13
C4'	0.11	0.18	0.01	0.12	0.08	0.17	0.13	0.33	0.23	0.06	0.24	0.11	0.33	0.08	0.06	0.08	0.17	0.14	0.24	0.19	0.36	0.20
C5	0.14	0.12	0.07	0.09	0.11	0.12	0.15	0.27	0.19	0.11	0.17	0.10	0.26	0.14	0.11	0.07	0.14	0.15	0.26	0.15	0.27	0.14
C5'	0.11	0.20	0.02	0.12	0.10	0.18	0.17	0.34	0.27	0.06	0.27	0.12	0.38	0.13	0.06	0.09	0.17	0.14	0.27	0.23	0.38	0.23
C6	0.14	0.11	0.07	0.08	0.09	0.12	0.13	0.27	0.18	0.11	0.16	0.08	0.25	0.11	0.11	0.08	0.13	0.16	0.25	0.15	0.27	0.14
N1	0.13	0.11	0.06	0.09	0.08	0.12	0.10	0.27	0.16	0.11	0.15	0.08	0.24	0.09	0.10	0.08	0.14	0.15	0.22	0.15	0.28	0.13
N3	0.13	0.12	0.07	0.09	0.10	0.12	0.12	0.27	0.17	0.12	0.16	0.10	0.22	0.09	0.11	0.07	0.14	0.15	0.20	0.15	0.27	0.12
O2	0.14	0.11	0.08	0.08	0.10	0.10	0.10	0.24	0.12	0.16	0.13	0.10	0.17	0.14	0.13	0.10	0.13	0.15	0.19	0.16	0.26	0.11
O2'	0.10	0.21	0.06	0.11	0.09	0.12	0.11	0.28	0.22	0.09	0.26	0.14	0.30	0.06	0.07	0.08	0.17	0.13	0.20	0.13	0.30	0.14
O3'	0.14	0.36	0.12	0.21	0.21	0.26	0.24	0.42	0.38	0.06	0.42	0.27	0.48	0.13	0.12	0.13	0.23	0.19	0.19	0.18	0.41	0.24
O4	0.17	0.17	0.10	0.09	0.16	0.10	0.20	0.28	0.21	0.16	0.19	0.15	0.24	0.21	0.16	0.08	0.14	0.18	0.24	0.15	0.27	0.12
O4'	0.13	0.11	0.06	0.10	0.07	0.13	0.10	0.27	0.16	0.11	0.16	0.07	0.24	0.09	0.10	0.08	0.15	0.15	0.25	0.18	0.30	0.17
O5'	0.13	0.22	0.05	0.10	0.15	0.16	0.22	0.32	0.31	0.10	0.30	0.16	0.42	0.19	0.10	0.12	0.14	0.14	0.29	0.22	0.36	0.22
OP1	0.16	0.19	0.07	0.09	0.12	0.10	0.16	0.27	0.22	0.10	0.21	0.17	0.31	0.18	0.10	0.18	0.13	0.13	0.37	0.17	0.22	0.18
OP2	0.20	0.23	0.13	0.06	0.18	0.14	0.22	0.26	0.28	0.14	0.27	0.21	0.38	0.22	0.16	0.23	0.09	0.18	0.37	0.19	0.26	0.20
P	0.15	0.27	0.12	0.13	0.22	0.07	0.30	0.25	0.37	0.21	0.34	0.21	0.48	0.31	0.17	0.12	0.16	0.09	0.37	0.15	0.21	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.25	0.05	0.11
C2	0.04	0.00	0.07	0.08	0.02	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.14	0.09	0.04	0.10	0.20	0.13	0.05
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04	0.08	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.18	0.11	0.07
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.11	0.18	0.08	0.08	0.14	0.18	0.08	0.02	0.01	0.01	0.16	0.18	0.16	0.10
C4	0.01	0.02	0.03	0.06	0.00	0.06	0.01	0.15	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.13	0.20	0.12	0.07
C4'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.17	0.08	0.06	0.13	0.16	0.08	0.05	0.02	0.00	0.02	0.23	0.12	0.06
C5	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.02	0.11	0.16	0.17	0.10
C5'	0.05	0.13	0.02	0.02	0.15	0.01	0.22	0.00	0.22	0.29	0.17	0.11	0.26	0.30	0.16	0.05	0.05	0.02	0.02	0.33	0.16	0.02
C6	0.03	0.01	0.02	0.11	0.02	0.11	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.11	0.03	0.09	0.15	0.18	0.10
C8	0.01	0.03	0.06	0.18	0.02	0.17	0.01	0.29	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.05	0.19	0.03	0.17	0.17	0.17	0.13
N1	0.03	0.00	0.04	0.08	0.02	0.08	0.02	0.17	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.07	0.04	0.09	0.17	0.16	0.07
N3	0.04	0.01	0.08	0.08	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.13	0.10	0.04	0.12	0.22	0.10	0.06
N6	0.03	0.02	0.03	0.14	0.02	0.13	0.01	0.26	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.16	0.03	0.09	0.12	0.21	0.12
N7	0.01	0.03	0.06	0.18	0.01	0.16	0.01	0.30	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.20	0.03	0.14	0.14	0.20	0.14
N9	0.00	0.03	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.17	0.21	0.10	0.09
O2'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.10	0.13	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.09	0.11	0.13	0.18	0.16
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.02	0.12	0.05	0.11	0.19	0.07	0.10	0.16	0.20	0.08	0.03	0.00	0.01	0.35	0.11	0.21	0.18
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.29	0.27	0.05	0.14
O5'	0.19	0.10	0.03	0.16	0.13	0.02	0.11	0.02	0.09	0.17	0.09	0.12	0.09	0.14	0.17	0.11	0.35	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.25	0.20	0.18	0.18	0.20	0.23	0.16	0.33	0.15	0.17	0.17	0.22	0.12	0.14	0.21	0.13	0.11	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.13	0.11	0.16	0.12	0.12	0.17	0.16	0.18	0.17	0.16	0.10	0.21	0.20	0.10	0.18	0.21	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.05	0.07	0.10	0.07	0.06	0.10	0.02	0.10	0.13	0.07	0.06	0.12	0.14	0.09	0.16	0.18	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00