Doublet Group distance statistics: 53384

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.011, 0.029, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.029 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.013, 0.034, 0.055, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.034 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.019, 0.067, 0.114, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.067 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.020, 0.069, 0.119, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.069 std_dev=0.049
O4	A	0, 0.029, 0.081, 0.132, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.081 std_dev=0.051
C4'	A	0, 0.057, 0.154, 0.252, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.154 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.062, 0.192, 0.323, 0.367 max_d=0.367 avg_d=0.192 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.070, 0.224, 0.377, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.224 std_dev=0.154
O2'	A	0, 0.112, 0.328, 0.544, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.328 std_dev=0.216
O3'	A	0, 0.110, 0.343, 0.577, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.343 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.025, 0.263, 0.502, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.263 std_dev=0.239
O5'	A	0, 0.117, 0.372, 0.627, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.372 std_dev=0.255
C5	B	0, 0.205, 0.503, 0.800, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.503 std_dev=0.297
N7	B	0, 0.219, 0.556, 0.892, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.556 std_dev=0.337
C4	B	0, 0.211, 0.552, 0.893, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.552 std_dev=0.341
C6	B	0, 0.208, 0.578, 0.949, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.578 std_dev=0.370
N9	B	0, 0.246, 0.618, 0.990, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.618 std_dev=0.372
C8	B	0, 0.279, 0.663, 1.047, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.663 std_dev=0.384
O4'	B	0, 0.204, 0.599, 0.994, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.599 std_dev=0.395
N3	B	0, 0.252, 0.665, 1.078, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.665 std_dev=0.413
N6	B	0, 0.183, 0.608, 1.033, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.608 std_dev=0.425
P	A	0, 0.292, 0.722, 1.151, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.722 std_dev=0.429
C1'	B	0, 0.271, 0.730, 1.189, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.730 std_dev=0.459
N1	B	0, 0.285, 0.756, 1.227, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.756 std_dev=0.471
C2	B	0, 0.301, 0.774, 1.247, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.774 std_dev=0.473
OP2	A	0, 0.420, 0.997, 1.574, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.997 std_dev=0.577
C4'	B	0, 0.231, 0.819, 1.407, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.819 std_dev=0.588
O5'	B	0, 0.291, 0.946, 1.601, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.946 std_dev=0.655
C2'	B	0, 0.432, 1.087, 1.743, 1.747 max_d=1.747 avg_d=1.087 std_dev=0.655
C5'	B	0, 0.328, 1.102, 1.876, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.102 std_dev=0.774
C3'	B	0, 0.416, 1.194, 1.972, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.194 std_dev=0.778
OP1	A	0, 0.376, 1.162, 1.948, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.162 std_dev=0.786
O2'	B	0, 0.575, 1.395, 2.216, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.395 std_dev=0.820
P	B	0, 0.335, 1.293, 2.251, 2.459 max_d=2.459 avg_d=1.293 std_dev=0.958
O3'	B	0, 0.277, 1.313, 2.349, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.313 std_dev=1.036
OP2	B	0, 0.405, 1.604, 2.804, 3.206 max_d=3.206 avg_d=1.604 std_dev=1.200
OP1	B	0, 0.626, 2.428, 4.229, 4.344 max_d=4.344 avg_d=2.428 std_dev=1.801

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.05	0.15	0.11
C2	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01	0.08	0.17	0.23	0.14
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.11	0.10	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.04	0.03	0.05	0.10	0.01	0.00	0.06	0.02	0.08	0.15	0.12	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.07	0.26	0.24	0.15
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.05	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.02	0.14	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.04	0.06	0.19	0.25	0.16
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.11	0.06	0.11	0.07	0.07	0.04	0.16	0.01	0.01	0.21	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.07	0.11	0.23	0.17
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.21	0.14
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.08	0.25	0.23	0.15
O2	0.03	0.01	0.07	0.10	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.02	0.03	0.11	0.17	0.23	0.15
O2'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.04	0.07	0.00	0.05	0.05	0.06	0.07	0.13	0.12	0.08
O3'	0.02	0.06	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.10	0.05	0.00	0.07	0.01	0.14	0.25	0.19	0.20
O4	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.03	0.09	0.33	0.24	0.16
O4'	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.13	0.19	0.13	0.15
O5'	0.08	0.08	0.04	0.08	0.07	0.02	0.06	0.01	0.07	0.07	0.08	0.11	0.07	0.14	0.09	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.17	0.11	0.15	0.26	0.14	0.19	0.21	0.11	0.08	0.25	0.17	0.13	0.25	0.33	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.23	0.10	0.12	0.24	0.07	0.25	0.12	0.23	0.21	0.23	0.23	0.12	0.19	0.24	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.14	0.05	0.10	0.15	0.02	0.16	0.02	0.17	0.14	0.15	0.15	0.08	0.20	0.16	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.14	0.16	0.13	0.12	0.06	0.12	0.11	0.14	0.10	0.14	0.13	0.19	0.10	0.11	0.31	0.23	0.13	0.56	1.16	0.87	0.48
C2	0.10	0.18	0.11	0.10	0.14	0.05	0.14	0.11	0.17	0.08	0.18	0.16	0.20	0.10	0.11	0.24	0.17	0.13	0.56	1.18	0.84	0.47
C2'	0.12	0.14	0.15	0.11	0.13	0.03	0.11	0.08	0.12	0.10	0.13	0.14	0.11	0.09	0.12	0.29	0.22	0.12	0.55	1.09	0.76	0.37
C3'	0.15	0.16	0.15	0.09	0.16	0.07	0.14	0.08	0.14	0.13	0.14	0.17	0.13	0.13	0.15	0.31	0.19	0.17	0.53	0.99	0.82	0.32
C4	0.14	0.20	0.14	0.12	0.19	0.07	0.19	0.15	0.21	0.16	0.20	0.20	0.22	0.19	0.17	0.28	0.11	0.18	0.56	1.12	1.11	0.59
C4'	0.13	0.14	0.13	0.07	0.14	0.08	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13	0.15	0.15	0.13	0.14	0.29	0.17	0.17	0.57	0.99	0.93	0.41
C5	0.15	0.21	0.16	0.13	0.19	0.08	0.20	0.16	0.23	0.17	0.22	0.20	0.26	0.20	0.17	0.31	0.14	0.18	0.55	1.09	1.17	0.61
C5'	0.20	0.19	0.12	0.02	0.21	0.17	0.21	0.22	0.19	0.21	0.18	0.21	0.20	0.22	0.21	0.28	0.12	0.26	0.58	0.86	1.05	0.42
C6	0.14	0.20	0.15	0.12	0.18	0.08	0.19	0.14	0.22	0.15	0.22	0.19	0.27	0.18	0.16	0.31	0.15	0.17	0.56	1.10	1.09	0.56
N1	0.12	0.18	0.14	0.11	0.15	0.06	0.16	0.12	0.19	0.11	0.19	0.17	0.24	0.13	0.13	0.28	0.17	0.15	0.56	1.14	0.94	0.50
N3	0.11	0.19	0.11	0.10	0.16	0.05	0.17	0.12	0.19	0.11	0.19	0.18	0.19	0.13	0.13	0.24	0.12	0.15	0.57	1.17	0.93	0.51
O2	0.08	0.17	0.09	0.08	0.12	0.07	0.10	0.12	0.13	0.05	0.16	0.15	0.13	0.05	0.08	0.20	0.21	0.12	0.55	1.20	0.67	0.42
O2'	0.10	0.09	0.18	0.15	0.08	0.05	0.07	0.12	0.08	0.09	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.31	0.26	0.06	0.57	1.13	0.71	0.40
O3'	0.14	0.13	0.16	0.10	0.13	0.06	0.13	0.05	0.12	0.13	0.13	0.14	0.12	0.13	0.14	0.30	0.20	0.15	0.50	0.98	0.71	0.26
O4	0.15	0.20	0.15	0.14	0.19	0.08	0.19	0.17	0.19	0.17	0.19	0.20	0.19	0.19	0.18	0.28	0.14	0.19	0.53	1.11	1.18	0.64
O4'	0.12	0.15	0.14	0.11	0.13	0.07	0.14	0.12	0.17	0.12	0.16	0.14	0.22	0.13	0.12	0.30	0.19	0.15	0.56	1.10	0.96	0.49
O5'	0.18	0.18	0.12	0.07	0.19	0.15	0.18	0.22	0.17	0.19	0.17	0.19	0.17	0.18	0.19	0.28	0.10	0.26	0.57	0.84	1.11	0.45
OP1	0.42	0.35	0.27	0.23	0.39	0.47	0.36	0.57	0.31	0.41	0.31	0.39	0.28	0.38	0.42	0.32	0.21	0.56	0.71	0.54	1.33	0.58
OP2	0.31	0.29	0.26	0.18	0.31	0.26	0.29	0.33	0.26	0.32	0.26	0.31	0.24	0.30	0.32	0.36	0.21	0.37	0.44	0.84	1.14	0.48
P	0.24	0.20	0.19	0.14	0.23	0.22	0.21	0.31	0.19	0.24	0.18	0.23	0.18	0.23	0.25	0.32	0.17	0.33	0.53	0.78	1.19	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.03	0.03	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.33	0.01	0.20	0.84	0.16	0.31
C2	0.05	0.00	0.06	0.13	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.63	0.01	0.18	1.09	0.45	0.43
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.11	0.01	0.05	0.03	0.06	0.02	0.05	0.01	0.00	0.11	0.03	0.30	0.85	0.32	0.41
C3'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.10	0.08	0.13	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.27	0.71	0.29	0.43
C4	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.44	0.02	0.27	1.12	0.29	0.41
C4'	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.34	0.16	0.14
C5	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.35	0.03	0.36	1.25	0.33	0.47
C5'	0.04	0.02	0.11	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.05	0.05	0.02	0.08	0.07	0.03	0.09	0.08	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01
C6	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.43	0.03	0.32	1.27	0.37	0.48
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.05	0.46	1.22	0.42	0.48
N1	0.04	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.55	0.02	0.24	1.20	0.42	0.46
N3	0.05	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.61	0.01	0.16	1.02	0.40	0.40
N6	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.37	0.04	0.36	1.33	0.39	0.50
N7	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.05	0.45	1.30	0.44	0.51
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.30	0.02	0.32	1.07	0.22	0.39
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.09	0.09	0.05	0.10	0.10	0.08	0.06	0.04	0.00	0.10	0.02	0.31	0.90	0.34	0.44
O3'	0.33	0.63	0.11	0.02	0.44	0.07	0.35	0.08	0.43	0.14	0.55	0.61	0.37	0.19	0.30	0.10	0.00	0.23	0.19	0.84	0.28	0.47
O4'	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.02	0.23	0.00	0.09	0.73	0.33	0.32
O5'	0.20	0.18	0.30	0.27	0.27	0.02	0.36	0.01	0.32	0.46	0.24	0.16	0.36	0.45	0.32	0.31	0.19	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.84	1.09	0.85	0.71	1.12	0.34	1.25	0.10	1.27	1.22	1.20	1.02	1.33	1.30	1.07	0.90	0.84	0.73	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.16	0.45	0.32	0.29	0.29	0.16	0.33	0.11	0.37	0.42	0.42	0.40	0.39	0.44	0.22	0.34	0.28	0.33	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.31	0.43	0.41	0.43	0.41	0.14	0.47	0.01	0.48	0.48	0.46	0.40	0.50	0.51	0.39	0.44	0.47	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00