Doublet Group distance statistics: 53399

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 7, 16, 28, 17, 10, 12, 21, 16, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.013, 0.027, 0.040, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.032, 0.066, 0.100, 0.187 max_d=0.187 avg_d=0.066 std_dev=0.034
N4	A	0, 0.036, 0.074, 0.113, 0.193 max_d=0.193 avg_d=0.074 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.067, 0.147, 0.227, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.147 std_dev=0.080
O4'	A	0, 0.039, 0.134, 0.229, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.134 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.110, 0.208, 0.307, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.208 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.105, 0.241, 0.377, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.241 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.087, 0.228, 0.369, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.228 std_dev=0.141
N3	B	0, 0.231, 0.420, 0.610, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.420 std_dev=0.189
O3'	A	0, 0.184, 0.384, 0.584, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.384 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.297, 0.512, 0.726, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.512 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.144, 0.374, 0.603, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.374 std_dev=0.229
N1	B	0, 0.260, 0.501, 0.743, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.501 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.282, 0.535, 0.788, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.535 std_dev=0.253
C4	B	0, 0.343, 0.599, 0.856, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.599 std_dev=0.256
N6	B	0, 0.346, 0.657, 0.967, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.657 std_dev=0.311
C5	B	0, 0.359, 0.700, 1.041, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.700 std_dev=0.341
O2'	B	0, 0.530, 0.904, 1.278, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.904 std_dev=0.374
O5'	A	0, 0.124, 0.518, 0.913, 2.794 max_d=2.794 avg_d=0.518 std_dev=0.394
C2'	B	0, 0.581, 0.984, 1.386, 2.066 max_d=2.066 avg_d=0.984 std_dev=0.402
N9	B	0, 0.455, 0.894, 1.333, 2.001 max_d=2.001 avg_d=0.894 std_dev=0.439
C1'	B	0, 0.510, 0.961, 1.412, 2.170 max_d=2.170 avg_d=0.961 std_dev=0.451
P	A	0, 0.178, 0.662, 1.147, 3.430 max_d=3.430 avg_d=0.662 std_dev=0.485
OP2	A	0, 0.195, 0.709, 1.222, 3.600 max_d=3.600 avg_d=0.709 std_dev=0.514
OP1	A	0, 0.249, 0.797, 1.345, 3.837 max_d=3.837 avg_d=0.797 std_dev=0.548
C3'	B	0, 0.672, 1.248, 1.824, 3.211 max_d=3.211 avg_d=1.248 std_dev=0.576
N7	B	0, 0.472, 1.061, 1.650, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.061 std_dev=0.589
O4'	B	0, 0.585, 1.179, 1.773, 3.185 max_d=3.185 avg_d=1.179 std_dev=0.594
O3'	B	0, 0.757, 1.387, 2.017, 3.304 max_d=3.304 avg_d=1.387 std_dev=0.630
C8	B	0, 0.510, 1.164, 1.819, 2.751 max_d=2.751 avg_d=1.164 std_dev=0.654
C4'	B	0, 0.657, 1.336, 2.016, 3.674 max_d=3.674 avg_d=1.336 std_dev=0.680
C5'	B	0, 0.792, 1.658, 2.524, 4.887 max_d=4.887 avg_d=1.658 std_dev=0.866
O5'	B	0, 0.845, 2.057, 3.269, 5.130 max_d=5.130 avg_d=2.057 std_dev=1.212
OP2	B	0, 2.234, 3.491, 4.748, 6.886 max_d=6.886 avg_d=3.491 std_dev=1.257
P	B	0, 1.285, 2.769, 4.254, 6.529 max_d=6.529 avg_d=2.769 std_dev=1.485
OP1	B	0, 1.489, 2.974, 4.460, 6.130 max_d=6.130 avg_d=2.974 std_dev=1.485

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.08	0.11	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.16	0.17	0.22	0.18
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.11	0.00	0.02	0.01	0.09	0.13	0.10	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.09	0.06	0.09	0.11	0.11	0.02	0.01	0.01	0.12	0.17	0.10	0.11
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.24	0.27	0.33	0.29
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.07	0.06	0.06	0.02	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.04	0.26	0.28	0.32	0.30
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.12	0.07	0.09	0.14	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.22	0.22	0.23	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.15	0.16	0.18	0.16
N3	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.20	0.22	0.28	0.24
N4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.14	0.04	0.27	0.31	0.37	0.33
O2	0.04	0.01	0.11	0.11	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.12	0.14	0.05	0.12	0.14	0.19	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.07	0.12	0.00	0.05	0.05	0.05	0.13	0.08	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.10	0.06	0.12	0.14	0.14	0.05	0.00	0.02	0.12	0.23	0.15	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.06	0.07	0.12	0.09
O5'	0.07	0.16	0.09	0.12	0.24	0.01	0.26	0.01	0.22	0.15	0.20	0.27	0.12	0.05	0.12	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.17	0.13	0.17	0.27	0.08	0.28	0.08	0.22	0.16	0.22	0.31	0.14	0.13	0.23	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.22	0.10	0.10	0.33	0.07	0.32	0.11	0.23	0.18	0.28	0.37	0.19	0.08	0.15	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.09	0.11	0.29	0.02	0.30	0.02	0.23	0.16	0.24	0.33	0.14	0.06	0.15	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.21	0.17	0.19	0.16	0.17	0.16	0.17	0.16	0.17	0.19	0.19	0.17	0.17	0.16	0.17	0.25	0.21	0.28	0.57	0.50	0.27
C2	0.18	0.19	0.14	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.15	0.19	0.17	0.20	0.16	0.15	0.15	0.21	0.23	0.38	0.68	0.66	0.41
C2'	0.19	0.17	0.16	0.16	0.13	0.21	0.13	0.21	0.15	0.14	0.17	0.13	0.16	0.13	0.14	0.21	0.23	0.24	0.28	0.57	0.37	0.24
C3'	0.16	0.16	0.18	0.21	0.11	0.23	0.12	0.23	0.14	0.12	0.16	0.13	0.14	0.11	0.12	0.23	0.32	0.22	0.25	0.52	0.31	0.21
C4	0.19	0.18	0.15	0.17	0.15	0.17	0.16	0.16	0.18	0.15	0.19	0.17	0.21	0.16	0.15	0.16	0.24	0.24	0.33	0.63	0.59	0.34
C4'	0.17	0.20	0.18	0.21	0.13	0.20	0.13	0.20	0.15	0.16	0.18	0.16	0.15	0.15	0.14	0.20	0.32	0.20	0.22	0.51	0.40	0.21
C5	0.19	0.19	0.17	0.20	0.15	0.17	0.16	0.17	0.18	0.16	0.19	0.18	0.19	0.16	0.16	0.17	0.28	0.23	0.27	0.56	0.51	0.26
C5'	0.18	0.21	0.21	0.26	0.14	0.24	0.14	0.26	0.16	0.18	0.19	0.17	0.16	0.16	0.15	0.21	0.39	0.21	0.34	0.56	0.56	0.36
C6	0.19	0.20	0.18	0.20	0.16	0.18	0.16	0.17	0.17	0.17	0.20	0.18	0.18	0.17	0.16	0.18	0.28	0.22	0.25	0.54	0.49	0.24
N1	0.18	0.20	0.16	0.18	0.16	0.16	0.16	0.15	0.17	0.16	0.19	0.18	0.18	0.16	0.16	0.16	0.24	0.21	0.30	0.59	0.53	0.29
N3	0.19	0.18	0.13	0.15	0.16	0.17	0.16	0.17	0.19	0.16	0.19	0.17	0.21	0.16	0.16	0.16	0.21	0.25	0.39	0.69	0.68	0.42
N4	0.19	0.18	0.15	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.19	0.16	0.20	0.17	0.22	0.17	0.16	0.17	0.25	0.26	0.35	0.65	0.62	0.36
O2	0.18	0.18	0.13	0.14	0.16	0.16	0.16	0.17	0.18	0.16	0.19	0.17	0.20	0.16	0.16	0.16	0.18	0.23	0.46	0.76	0.77	0.50
O2'	0.18	0.16	0.19	0.19	0.11	0.21	0.11	0.20	0.13	0.13	0.16	0.13	0.13	0.11	0.13	0.22	0.24	0.22	0.30	0.60	0.42	0.29
O3'	0.23	0.20	0.31	0.37	0.14	0.37	0.14	0.39	0.16	0.19	0.19	0.16	0.16	0.16	0.18	0.39	0.50	0.29	0.37	0.58	0.40	0.36
O4'	0.23	0.26	0.25	0.28	0.17	0.25	0.18	0.25	0.19	0.22	0.23	0.21	0.19	0.20	0.20	0.25	0.35	0.24	0.25	0.54	0.48	0.25
O5'	0.15	0.20	0.18	0.24	0.13	0.20	0.14	0.22	0.16	0.15	0.19	0.16	0.17	0.15	0.14	0.19	0.38	0.18	0.33	0.54	0.53	0.33
OP1	0.19	0.21	0.24	0.32	0.17	0.27	0.17	0.32	0.17	0.20	0.20	0.18	0.18	0.18	0.18	0.23	0.48	0.22	0.55	0.72	0.89	0.62
OP2	0.15	0.21	0.18	0.25	0.14	0.21	0.15	0.24	0.18	0.14	0.21	0.17	0.20	0.15	0.13	0.19	0.39	0.18	0.37	0.59	0.61	0.39
P	0.15	0.20	0.20	0.27	0.13	0.22	0.14	0.26	0.16	0.16	0.20	0.16	0.18	0.15	0.14	0.19	0.42	0.18	0.40	0.60	0.67	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.33	0.69	0.52	0.38
C2	0.04	0.00	0.14	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.18	0.07	0.58	0.97	1.02	0.68
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.08	0.11	0.14	0.08	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.28	0.44	0.47	0.24
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.10	0.01	0.13	0.03	0.14	0.17	0.14	0.13	0.16	0.17	0.09	0.02	0.01	0.01	0.34	0.32	0.57	0.28
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.04	0.64	0.96	1.06	0.72
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.06	0.05	0.10	0.12	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.31	0.24	0.12
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.03	0.81	1.10	1.40	0.93
C5'	0.03	0.11	0.02	0.03	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.21	0.15	0.09	0.22	0.23	0.12	0.06	0.05	0.02	0.01	0.17	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.17	0.04	0.82	1.14	1.46	0.96
C8	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.19	0.05	0.87	1.03	1.35	0.93
N1	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.06	0.71	1.07	1.27	0.84
N3	0.03	0.00	0.14	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.07	0.51	0.90	0.87	0.59
N6	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.20	0.05	0.91	1.22	1.67	1.10
N7	0.01	0.01	0.07	0.17	0.01	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.21	0.03	0.94	1.15	1.59	1.07
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.63	0.89	0.97	0.67
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.06	0.05	0.06	0.08	0.05	0.13	0.15	0.07	0.04	0.02	0.00	0.08	0.06	0.12	0.45	0.35	0.16
O3'	0.03	0.18	0.03	0.01	0.11	0.03	0.15	0.05	0.17	0.19	0.17	0.16	0.20	0.21	0.08	0.08	0.00	0.03	0.40	0.48	0.83	0.46
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.29	0.69	0.46	0.40
O5'	0.33	0.58	0.28	0.34	0.64	0.01	0.81	0.01	0.82	0.87	0.71	0.51	0.91	0.94	0.63	0.12	0.40	0.29	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.69	0.97	0.44	0.32	0.96	0.31	1.10	0.17	1.14	1.03	1.07	0.90	1.22	1.15	0.89	0.45	0.48	0.69	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.52	1.02	0.47	0.57	1.06	0.24	1.40	0.29	1.46	1.35	1.27	0.87	1.67	1.59	0.97	0.35	0.83	0.46	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.38	0.68	0.24	0.28	0.72	0.12	0.93	0.01	0.96	0.93	0.84	0.59	1.10	1.07	0.67	0.16	0.46	0.40	0.00	0.01	0.01	0.00