Doublet Group distance statistics: 53401

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 7, 9, 10, 13, 3, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.020 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.041 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.027, 0.063, 0.099, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.063 std_dev=0.036
O2'	A	0, 0.071, 0.172, 0.274, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.172 std_dev=0.101
C2'	A	0, 0.094, 0.211, 0.327, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.211 std_dev=0.116
O4'	A	0, 0.079, 0.221, 0.363, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.221 std_dev=0.142
C1'	B	0, 0.248, 0.390, 0.532, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.390 std_dev=0.142
C2'	B	0, 0.235, 0.389, 0.543, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.389 std_dev=0.154
N9	B	0, 0.296, 0.452, 0.608, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.452 std_dev=0.156
C4	B	0, 0.343, 0.507, 0.671, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.507 std_dev=0.164
N3	B	0, 0.344, 0.526, 0.709, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.526 std_dev=0.182
O4'	B	0, 0.284, 0.485, 0.686, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.485 std_dev=0.201
C4'	B	0, 0.385, 0.591, 0.797, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.591 std_dev=0.206
C3'	B	0, 0.305, 0.519, 0.733, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.519 std_dev=0.214
C3'	A	0, 0.194, 0.411, 0.627, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.411 std_dev=0.216
O2'	B	0, 0.192, 0.410, 0.627, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.410 std_dev=0.217
C4'	A	0, 0.185, 0.404, 0.623, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.404 std_dev=0.219
C5	B	0, 0.446, 0.668, 0.890, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.668 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.386, 0.607, 0.829, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.607 std_dev=0.222
N7	B	0, 0.464, 0.704, 0.944, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.704 std_dev=0.240
O5'	A	0, 0.223, 0.494, 0.765, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.494 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.449, 0.726, 1.002, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.726 std_dev=0.277
C5'	B	0, 0.497, 0.794, 1.090, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.794 std_dev=0.296
C6	B	0, 0.543, 0.846, 1.149, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.846 std_dev=0.303
O3'	B	0, 0.300, 0.610, 0.920, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.610 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.268, 0.586, 0.904, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.586 std_dev=0.318
N1	B	0, 0.542, 0.873, 1.204, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.873 std_dev=0.331
O3'	A	0, 0.274, 0.618, 0.962, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.618 std_dev=0.344
O5'	B	0, 0.546, 0.914, 1.282, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.914 std_dev=0.368
N6	B	0, 0.660, 1.045, 1.431, 2.129 max_d=2.129 avg_d=1.045 std_dev=0.385
P	A	0, 0.342, 0.755, 1.169, 2.198 max_d=2.198 avg_d=0.755 std_dev=0.414
OP2	A	0, 0.334, 0.748, 1.162, 2.205 max_d=2.205 avg_d=0.748 std_dev=0.414
OP1	A	0, 0.462, 1.015, 1.569, 3.044 max_d=3.044 avg_d=1.015 std_dev=0.553
P	B	0, 0.685, 1.347, 2.010, 3.322 max_d=3.322 avg_d=1.347 std_dev=0.663
OP2	B	0, 0.725, 1.531, 2.337, 3.573 max_d=3.573 avg_d=1.531 std_dev=0.806
OP1	B	0, 0.724, 1.573, 2.422, 3.832 max_d=3.832 avg_d=1.573 std_dev=0.849

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.07	0.10	0.09	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.14	0.19	0.21	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.12	0.00	0.02	0.01	0.04	0.13	0.08	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.07	0.05	0.11	0.10	0.13	0.02	0.01	0.01	0.04	0.15	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.02	0.19	0.25	0.29	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.03	0.19	0.24	0.27	0.23
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.12	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.09	0.13	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.03	0.16	0.18	0.19	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.13	0.16	0.16	0.13
N3	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.03	0.17	0.23	0.26	0.20
N4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.13	0.03	0.20	0.29	0.33	0.26
O2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.16	0.04	0.13	0.18	0.19	0.14
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.00	0.04	0.05	0.03	0.11	0.06	0.04
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.12	0.02	0.09	0.03	0.08	0.06	0.14	0.13	0.16	0.04	0.00	0.02	0.07	0.18	0.11	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06
O5'	0.07	0.14	0.04	0.04	0.19	0.01	0.19	0.01	0.16	0.13	0.17	0.20	0.13	0.03	0.07	0.06	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.19	0.13	0.15	0.25	0.08	0.24	0.06	0.18	0.16	0.23	0.29	0.18	0.11	0.18	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.21	0.08	0.08	0.29	0.03	0.27	0.02	0.19	0.16	0.26	0.33	0.19	0.06	0.11	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.16	0.06	0.06	0.23	0.02	0.23	0.01	0.17	0.13	0.20	0.26	0.14	0.04	0.09	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.26	0.18	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.23	0.14	0.27	0.20	0.24	0.16	0.14	0.17	0.22	0.17	0.20	0.31	0.32	0.17
C2	0.18	0.31	0.20	0.20	0.23	0.17	0.26	0.16	0.32	0.20	0.35	0.24	0.35	0.24	0.19	0.18	0.22	0.18	0.22	0.35	0.39	0.19
C2'	0.17	0.19	0.20	0.19	0.15	0.16	0.16	0.16	0.17	0.15	0.19	0.16	0.18	0.15	0.15	0.20	0.23	0.19	0.17	0.26	0.26	0.12
C3'	0.16	0.15	0.15	0.14	0.09	0.17	0.09	0.18	0.12	0.12	0.15	0.11	0.12	0.10	0.12	0.16	0.21	0.22	0.16	0.21	0.22	0.11
C4	0.17	0.31	0.18	0.18	0.22	0.16	0.26	0.15	0.33	0.19	0.36	0.24	0.37	0.24	0.18	0.16	0.21	0.17	0.20	0.33	0.36	0.17
C4'	0.17	0.19	0.12	0.12	0.08	0.18	0.09	0.17	0.14	0.12	0.19	0.13	0.14	0.09	0.11	0.16	0.20	0.22	0.16	0.28	0.26	0.14
C5	0.16	0.30	0.16	0.16	0.20	0.15	0.23	0.14	0.30	0.16	0.34	0.22	0.33	0.20	0.15	0.15	0.21	0.17	0.19	0.32	0.32	0.15
C5'	0.21	0.20	0.14	0.16	0.10	0.23	0.10	0.23	0.15	0.15	0.20	0.13	0.16	0.11	0.14	0.21	0.23	0.27	0.20	0.36	0.29	0.20
C6	0.15	0.29	0.16	0.16	0.18	0.15	0.21	0.14	0.27	0.15	0.32	0.21	0.30	0.18	0.14	0.15	0.21	0.17	0.18	0.31	0.30	0.15
N1	0.16	0.30	0.18	0.18	0.20	0.16	0.22	0.15	0.28	0.17	0.32	0.22	0.30	0.20	0.16	0.17	0.21	0.17	0.20	0.32	0.34	0.16
N3	0.18	0.32	0.20	0.20	0.24	0.17	0.28	0.16	0.34	0.21	0.37	0.24	0.38	0.26	0.20	0.18	0.22	0.18	0.22	0.36	0.40	0.19
N4	0.17	0.32	0.18	0.18	0.23	0.16	0.28	0.15	0.35	0.20	0.37	0.24	0.39	0.25	0.19	0.17	0.21	0.18	0.21	0.34	0.37	0.17
O2	0.19	0.32	0.21	0.22	0.24	0.18	0.28	0.18	0.33	0.23	0.36	0.24	0.36	0.26	0.21	0.19	0.23	0.18	0.24	0.39	0.43	0.22
O2'	0.18	0.12	0.26	0.24	0.13	0.19	0.13	0.18	0.12	0.15	0.12	0.11	0.12	0.14	0.15	0.27	0.28	0.18	0.19	0.28	0.28	0.14
O3'	0.20	0.11	0.21	0.19	0.11	0.22	0.11	0.24	0.10	0.17	0.11	0.09	0.10	0.14	0.16	0.25	0.27	0.27	0.21	0.22	0.23	0.21
O4'	0.15	0.27	0.14	0.15	0.13	0.16	0.15	0.15	0.22	0.12	0.27	0.19	0.23	0.13	0.11	0.18	0.21	0.18	0.20	0.33	0.32	0.19
O5'	0.19	0.21	0.13	0.14	0.09	0.22	0.10	0.22	0.16	0.13	0.22	0.13	0.18	0.10	0.11	0.18	0.23	0.25	0.18	0.34	0.26	0.18
OP1	0.28	0.16	0.22	0.25	0.12	0.35	0.12	0.36	0.12	0.24	0.17	0.10	0.14	0.18	0.21	0.26	0.33	0.37	0.28	0.48	0.32	0.31
OP2	0.20	0.24	0.13	0.16	0.10	0.25	0.12	0.26	0.21	0.13	0.27	0.15	0.23	0.10	0.12	0.19	0.25	0.28	0.20	0.37	0.26	0.20
P	0.21	0.22	0.15	0.18	0.08	0.26	0.10	0.27	0.17	0.14	0.24	0.13	0.19	0.10	0.13	0.21	0.27	0.29	0.21	0.41	0.29	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.29	0.20	0.10
C2	0.03	0.00	0.15	0.14	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.18	0.05	0.16	0.47	0.48	0.24
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.08	0.12	0.15	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.21	0.19	0.10
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.09	0.14	0.12	0.13	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.14	0.23	0.21	0.14
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.09	0.03	0.16	0.46	0.46	0.24
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.04	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.16	0.09	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.21	0.56	0.59	0.32
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.09	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.21	0.58	0.63	0.34
C8	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.05	0.22	0.53	0.52	0.32
N1	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.05	0.19	0.54	0.57	0.30
N3	0.03	0.00	0.15	0.13	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.17	0.05	0.14	0.42	0.41	0.20
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.14	0.04	0.22	0.64	0.70	0.38
N7	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.16	0.04	0.24	0.62	0.64	0.38
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.15	0.42	0.39	0.21
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.05	0.06	0.06	0.09	0.06	0.14	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.23	0.12	0.07
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.09	0.02	0.11	0.03	0.12	0.16	0.15	0.17	0.14	0.16	0.06	0.06	0.00	0.02	0.14	0.39	0.29	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.28	0.15	0.12
O5'	0.07	0.16	0.11	0.14	0.16	0.02	0.21	0.01	0.21	0.22	0.19	0.14	0.22	0.24	0.15	0.07	0.14	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.29	0.47	0.21	0.23	0.46	0.16	0.56	0.09	0.58	0.53	0.54	0.42	0.64	0.62	0.42	0.23	0.39	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.48	0.19	0.21	0.46	0.09	0.59	0.19	0.63	0.52	0.57	0.41	0.70	0.64	0.39	0.12	0.29	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.10	0.14	0.24	0.05	0.32	0.02	0.34	0.32	0.30	0.20	0.38	0.38	0.21	0.07	0.20	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00