Doublet Group distance statistics: 53402

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 10, 1, 3, 3, 1, 0, 3, 1, 1, 9, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N1	A	0, -0.001, 0.009, 0.020, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.022, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.011 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.029 std_dev=0.018
C2'	A	0, 0.030, 0.104, 0.178, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.104 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.053, 0.135, 0.217, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.135 std_dev=0.082
O2'	A	0, 0.064, 0.148, 0.231, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.148 std_dev=0.084
C3'	A	0, 0.089, 0.234, 0.378, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.234 std_dev=0.145
C4'	A	0, 0.097, 0.250, 0.404, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.250 std_dev=0.154
O3'	A	0, 0.132, 0.338, 0.543, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.338 std_dev=0.205
C6	B	0, 0.192, 0.408, 0.623, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.408 std_dev=0.215
C2	B	0, 0.151, 0.379, 0.606, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.379 std_dev=0.227
C5'	A	0, 0.161, 0.401, 0.640, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.401 std_dev=0.240
N1	B	0, 0.176, 0.428, 0.679, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.428 std_dev=0.251
O5'	A	0, 0.160, 0.421, 0.681, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.421 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.163, 0.427, 0.691, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.427 std_dev=0.264
N6	B	0, 0.200, 0.487, 0.773, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.487 std_dev=0.286
N3	B	0, 0.121, 0.423, 0.724, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.423 std_dev=0.302
C4	B	0, 0.144, 0.481, 0.817, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.481 std_dev=0.336
N7	B	0, 0.195, 0.545, 0.896, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.545 std_dev=0.350
P	A	0, 0.178, 0.531, 0.885, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.531 std_dev=0.353
OP1	A	0, 0.212, 0.687, 1.163, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.687 std_dev=0.476
C8	B	0, 0.200, 0.702, 1.204, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.702 std_dev=0.502
N9	B	0, 0.175, 0.690, 1.206, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.690 std_dev=0.515
OP2	A	0, 0.224, 0.741, 1.257, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.741 std_dev=0.516
C1'	B	0, 0.175, 0.918, 1.661, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.918 std_dev=0.743
C2'	B	0, 0.177, 0.945, 1.713, 1.908 max_d=1.908 avg_d=0.945 std_dev=0.768
O2'	B	0, 0.168, 1.101, 2.033, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.101 std_dev=0.932
O4'	B	0, 0.193, 1.185, 2.176, 2.454 max_d=2.454 avg_d=1.185 std_dev=0.991
C3'	B	0, 0.198, 1.215, 2.232, 2.760 max_d=2.760 avg_d=1.215 std_dev=1.017
C4'	B	0, 0.211, 1.400, 2.589, 3.227 max_d=3.227 avg_d=1.400 std_dev=1.189
OP1	B	0, 0.309, 1.517, 2.725, 4.323 max_d=4.323 avg_d=1.517 std_dev=1.208
O3'	B	0, 0.210, 1.482, 2.755, 3.570 max_d=3.570 avg_d=1.482 std_dev=1.273
C5'	B	0, 0.252, 1.545, 2.837, 3.828 max_d=3.828 avg_d=1.545 std_dev=1.292
O5'	B	0, 0.256, 1.881, 3.506, 4.063 max_d=4.063 avg_d=1.881 std_dev=1.625
P	B	0, 0.288, 2.046, 3.804, 4.672 max_d=4.672 avg_d=2.046 std_dev=1.758
OP2	B	0, 0.236, 2.728, 5.220, 6.938 max_d=6.938 avg_d=2.728 std_dev=2.492

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.11	0.14	0.10
C2	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.08	0.02	0.19	0.22	0.31	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.16	0.16	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.02	0.08	0.06	0.10	0.11	0.10	0.02	0.01	0.01	0.07	0.18	0.18	0.10
C4	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.11	0.04	0.28	0.37	0.48	0.37
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.06	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.11	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.05	0.30	0.38	0.48	0.38
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.12	0.18	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.09	0.05	0.25	0.29	0.34	0.29
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.17	0.20	0.26	0.21
N3	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.24	0.30	0.41	0.31
N4	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.12	0.04	0.30	0.43	0.55	0.42
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.03	0.15	0.17	0.26	0.19
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.07	0.06	0.11	0.00	0.05	0.03	0.04	0.17	0.15	0.08
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.03	0.09	0.05	0.11	0.12	0.11	0.05	0.00	0.02	0.11	0.23	0.25	0.15
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.02	0.00	0.08	0.09	0.11	0.09
O5'	0.08	0.19	0.04	0.07	0.28	0.02	0.30	0.01	0.25	0.17	0.24	0.30	0.15	0.04	0.11	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.22	0.16	0.18	0.37	0.11	0.38	0.07	0.29	0.20	0.30	0.43	0.17	0.17	0.23	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02
OP2	0.14	0.31	0.16	0.18	0.48	0.07	0.48	0.03	0.34	0.26	0.41	0.55	0.26	0.15	0.25	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.09	0.10	0.37	0.04	0.38	0.01	0.29	0.21	0.31	0.42	0.19	0.08	0.15	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.18	0.10	0.11	0.13	0.11	0.14	0.11	0.16	0.12	0.18	0.14	0.17	0.13	0.12	0.12	0.16	0.12	0.30	0.41	0.44	0.24
C2	0.10	0.08	0.08	0.12	0.08	0.08	0.09	0.10	0.11	0.09	0.11	0.08	0.13	0.09	0.09	0.10	0.14	0.10	0.36	0.39	0.62	0.26
C2'	0.20	0.22	0.28	0.30	0.09	0.32	0.12	0.28	0.19	0.10	0.24	0.12	0.21	0.09	0.11	0.40	0.40	0.23	0.56	0.56	0.70	0.49
C3'	0.29	0.23	0.42	0.49	0.10	0.50	0.13	0.48	0.20	0.16	0.26	0.12	0.22	0.12	0.17	0.57	0.63	0.35	0.63	0.68	0.69	0.58
C4	0.12	0.10	0.08	0.13	0.10	0.08	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.11	0.13	0.10	0.10	0.10	0.17	0.13	0.32	0.38	0.55	0.23
C4'	0.14	0.20	0.28	0.39	0.10	0.34	0.11	0.35	0.15	0.11	0.20	0.14	0.16	0.09	0.10	0.34	0.55	0.18	0.40	0.61	0.41	0.38
C5	0.12	0.09	0.10	0.11	0.08	0.11	0.09	0.10	0.11	0.09	0.11	0.08	0.13	0.09	0.10	0.11	0.14	0.13	0.29	0.38	0.44	0.20
C5'	0.16	0.21	0.31	0.44	0.10	0.40	0.11	0.43	0.16	0.12	0.22	0.14	0.17	0.09	0.11	0.36	0.62	0.21	0.38	0.68	0.33	0.39
C6	0.12	0.11	0.10	0.11	0.09	0.12	0.10	0.11	0.13	0.10	0.14	0.09	0.14	0.10	0.10	0.12	0.13	0.13	0.28	0.39	0.41	0.21
N1	0.11	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.14	0.08	0.14	0.10	0.09	0.11	0.11	0.11	0.31	0.39	0.49	0.23
N3	0.11	0.12	0.08	0.14	0.10	0.08	0.10	0.11	0.11	0.10	0.12	0.12	0.13	0.10	0.10	0.10	0.19	0.11	0.36	0.39	0.64	0.26
N4	0.13	0.14	0.09	0.15	0.12	0.09	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.14	0.15	0.11	0.12	0.10	0.21	0.14	0.33	0.38	0.58	0.23
O2	0.10	0.09	0.09	0.13	0.09	0.09	0.09	0.12	0.11	0.10	0.10	0.10	0.13	0.10	0.10	0.12	0.15	0.10	0.41	0.41	0.72	0.31
O2'	0.18	0.20	0.34	0.36	0.08	0.31	0.09	0.28	0.14	0.10	0.19	0.12	0.14	0.07	0.10	0.42	0.46	0.20	0.59	0.56	0.75	0.53
O3'	0.46	0.24	0.65	0.75	0.14	0.77	0.15	0.74	0.21	0.26	0.28	0.11	0.24	0.18	0.28	0.86	0.92	0.55	0.85	0.85	0.91	0.82
O4'	0.15	0.19	0.14	0.16	0.16	0.14	0.16	0.15	0.17	0.15	0.19	0.17	0.17	0.15	0.15	0.12	0.24	0.15	0.21	0.43	0.28	0.19
O5'	0.20	0.23	0.29	0.38	0.11	0.41	0.13	0.42	0.20	0.13	0.26	0.13	0.22	0.11	0.13	0.38	0.53	0.26	0.41	0.65	0.37	0.39
OP1	0.41	0.23	0.54	0.68	0.19	0.72	0.18	0.76	0.20	0.30	0.26	0.18	0.22	0.22	0.30	0.64	0.87	0.52	0.65	0.94	0.53	0.66
OP2	0.36	0.23	0.36	0.42	0.20	0.52	0.19	0.53	0.23	0.26	0.27	0.18	0.26	0.20	0.26	0.47	0.51	0.44	0.50	0.71	0.42	0.46
P	0.26	0.22	0.33	0.43	0.13	0.48	0.14	0.50	0.20	0.18	0.26	0.14	0.23	0.14	0.18	0.42	0.57	0.34	0.43	0.71	0.34	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.45	0.24	0.63	0.35
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.64	0.50	1.12	0.54
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.07	0.06	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.25	0.30	0.31	0.17
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.14	0.10	0.12	0.08	0.16	0.12	0.06	0.02	0.01	0.02	0.14	0.33	0.11	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.70	0.46	1.16	0.58
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.11	0.08	0.04	0.13	0.12	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.81	0.55	1.45	0.71
C5'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.19	0.16	0.09	0.23	0.22	0.11	0.04	0.04	0.02	0.01	0.19	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.14	0.02	0.79	0.59	1.50	0.71
C8	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.86	0.47	1.38	0.73
N1	0.02	0.00	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.72	0.56	1.34	0.63
N3	0.03	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.08	0.03	0.60	0.44	0.99	0.50
N6	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.17	0.03	0.84	0.65	1.67	0.77
N7	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.13	0.03	0.89	0.57	1.61	0.80
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.69	0.39	1.05	0.56
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.04	0.04	0.22	0.09	0.04
O3'	0.03	0.11	0.03	0.01	0.07	0.02	0.11	0.04	0.14	0.11	0.13	0.08	0.17	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.26	0.38	0.47	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.39	0.13	0.52	0.31
O5'	0.45	0.64	0.25	0.14	0.70	0.02	0.81	0.01	0.79	0.86	0.72	0.60	0.84	0.89	0.69	0.04	0.26	0.39	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.24	0.50	0.30	0.33	0.46	0.13	0.55	0.19	0.59	0.47	0.56	0.44	0.65	0.57	0.39	0.22	0.38	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.63	1.12	0.31	0.11	1.16	0.12	1.45	0.20	1.50	1.38	1.34	0.99	1.67	1.61	1.05	0.09	0.47	0.52	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.35	0.54	0.17	0.06	0.58	0.02	0.71	0.01	0.71	0.73	0.63	0.50	0.77	0.80	0.56	0.04	0.26	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00