Doublet Group distance statistics: 53403

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 7, 2, 4, 8, 4, 4, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.012, 0.048, 0.083, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.048 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.021, 0.059, 0.097, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.059 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.063, 0.147, 0.231, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.147 std_dev=0.084
O4'	A	0, 0.038, 0.154, 0.269, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.154 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.044, 0.183, 0.322, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.183 std_dev=0.139
N3	B	0, 0.193, 0.350, 0.507, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.350 std_dev=0.157
C2	B	0, 0.217, 0.404, 0.592, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.404 std_dev=0.187
C2'	B	0, 0.104, 0.293, 0.483, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.293 std_dev=0.190
C3'	A	0, 0.131, 0.335, 0.540, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.335 std_dev=0.204
C4'	A	0, 0.120, 0.336, 0.552, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.336 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.171, 0.408, 0.645, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.408 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.173, 0.433, 0.692, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.433 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.147, 0.408, 0.668, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.408 std_dev=0.261
N1	B	0, 0.215, 0.481, 0.747, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.481 std_dev=0.266
O2'	B	0, 0.091, 0.360, 0.628, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.360 std_dev=0.269
C4'	B	0, 0.181, 0.470, 0.759, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.470 std_dev=0.289
N9	B	0, 0.207, 0.500, 0.793, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.500 std_dev=0.293
O4'	B	0, 0.224, 0.523, 0.823, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.523 std_dev=0.299
O3'	A	0, 0.205, 0.512, 0.820, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.512 std_dev=0.307
O3'	B	0, 0.174, 0.482, 0.789, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.482 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.274, 0.627, 0.980, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.627 std_dev=0.353
C5'	A	0, 0.186, 0.541, 0.896, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.541 std_dev=0.355
C6	B	0, 0.225, 0.593, 0.961, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.593 std_dev=0.368
C5	B	0, 0.235, 0.605, 0.975, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.605 std_dev=0.370
C5'	B	0, 0.224, 0.622, 1.020, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.622 std_dev=0.398
C8	B	0, 0.316, 0.742, 1.168, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.742 std_dev=0.426
N6	B	0, 0.272, 0.744, 1.216, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.744 std_dev=0.472
N7	B	0, 0.333, 0.810, 1.288, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.810 std_dev=0.478
O5'	B	0, 0.312, 0.811, 1.311, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.811 std_dev=0.500
P	A	0, 0.368, 0.869, 1.370, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.869 std_dev=0.501
OP1	A	0, 0.426, 1.005, 1.585, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.005 std_dev=0.579
OP2	A	0, 0.423, 1.005, 1.587, 2.045 max_d=2.045 avg_d=1.005 std_dev=0.582
P	B	0, 0.346, 1.031, 1.716, 2.818 max_d=2.818 avg_d=1.031 std_dev=0.685
OP1	B	0, 0.730, 2.149, 3.568, 4.335 max_d=4.335 avg_d=2.149 std_dev=1.419
OP2	B	0, 0.727, 2.205, 3.683, 4.360 max_d=4.360 avg_d=2.205 std_dev=1.478

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.00	0.11	0.09	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.03	0.21	0.21	0.30	0.24
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.09	0.00	0.03	0.02	0.07	0.13	0.13	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.03	0.09	0.07	0.12	0.15	0.10	0.03	0.01	0.02	0.05	0.17	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.16	0.03	0.29	0.34	0.43	0.37
C4'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.08	0.05	0.08	0.03	0.01	0.04	0.08	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.14	0.04	0.29	0.34	0.40	0.37
C5'	0.03	0.09	0.01	0.03	0.16	0.01	0.18	0.00	0.15	0.09	0.13	0.18	0.07	0.07	0.06	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.04	0.25	0.25	0.28	0.28
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02	0.20	0.18	0.23	0.20
N3	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.02	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.15	0.03	0.26	0.28	0.39	0.31
N4	0.02	0.02	0.07	0.15	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.19	0.03	0.31	0.40	0.50	0.42
O2	0.04	0.01	0.09	0.10	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.13	0.11	0.05	0.19	0.16	0.26	0.19
O2'	0.03	0.08	0.00	0.03	0.05	0.08	0.04	0.07	0.04	0.04	0.07	0.06	0.13	0.00	0.08	0.06	0.03	0.11	0.11	0.06
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.16	0.03	0.14	0.06	0.10	0.07	0.15	0.19	0.11	0.08	0.00	0.02	0.08	0.25	0.14	0.13
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.02	0.00	0.09	0.07	0.07	0.07
O5'	0.11	0.21	0.07	0.05	0.29	0.04	0.29	0.02	0.25	0.20	0.26	0.31	0.19	0.03	0.08	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.21	0.13	0.17	0.34	0.08	0.34	0.06	0.25	0.18	0.28	0.40	0.16	0.11	0.25	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.30	0.13	0.11	0.43	0.05	0.40	0.03	0.28	0.23	0.39	0.50	0.26	0.11	0.14	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.24	0.07	0.07	0.37	0.02	0.37	0.01	0.28	0.20	0.31	0.42	0.19	0.06	0.13	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.17	0.10	0.11	0.12	0.12	0.14	0.11	0.17	0.11	0.18	0.13	0.18	0.13	0.10	0.20	0.18	0.11	0.13	0.24	0.46	0.13
C2	0.08	0.14	0.10	0.10	0.12	0.09	0.16	0.08	0.20	0.13	0.20	0.09	0.23	0.17	0.10	0.20	0.15	0.08	0.15	0.47	0.64	0.18
C2'	0.13	0.21	0.15	0.16	0.15	0.17	0.18	0.15	0.21	0.14	0.22	0.16	0.22	0.16	0.13	0.26	0.22	0.14	0.16	0.36	0.31	0.16
C3'	0.18	0.23	0.22	0.26	0.17	0.27	0.21	0.27	0.25	0.18	0.26	0.17	0.27	0.20	0.17	0.35	0.36	0.22	0.21	0.29	0.27	0.20
C4	0.08	0.16	0.10	0.10	0.13	0.10	0.18	0.08	0.23	0.13	0.22	0.11	0.27	0.18	0.10	0.20	0.16	0.08	0.14	0.48	0.62	0.17
C4'	0.12	0.19	0.17	0.24	0.13	0.22	0.14	0.23	0.17	0.10	0.19	0.15	0.18	0.11	0.11	0.24	0.36	0.15	0.19	0.27	0.31	0.19
C5	0.10	0.17	0.10	0.11	0.13	0.12	0.17	0.10	0.22	0.12	0.23	0.12	0.26	0.16	0.10	0.22	0.17	0.11	0.13	0.36	0.52	0.14
C5'	0.14	0.19	0.19	0.29	0.13	0.26	0.14	0.29	0.18	0.12	0.21	0.15	0.20	0.12	0.12	0.25	0.44	0.17	0.23	0.39	0.31	0.25
C6	0.10	0.18	0.10	0.11	0.13	0.13	0.16	0.11	0.21	0.12	0.22	0.12	0.23	0.15	0.10	0.21	0.18	0.11	0.13	0.29	0.47	0.12
N1	0.09	0.16	0.10	0.10	0.12	0.11	0.15	0.09	0.19	0.11	0.20	0.11	0.21	0.14	0.09	0.20	0.17	0.09	0.13	0.33	0.52	0.14
N3	0.08	0.14	0.10	0.11	0.12	0.09	0.18	0.09	0.22	0.14	0.21	0.09	0.26	0.18	0.10	0.20	0.15	0.08	0.16	0.54	0.69	0.20
N4	0.09	0.16	0.10	0.11	0.14	0.10	0.19	0.09	0.24	0.15	0.23	0.11	0.29	0.19	0.11	0.20	0.16	0.09	0.14	0.54	0.66	0.18
O2	0.09	0.14	0.11	0.11	0.12	0.09	0.17	0.09	0.19	0.15	0.18	0.10	0.22	0.18	0.12	0.20	0.14	0.09	0.18	0.54	0.71	0.22
O2'	0.12	0.13	0.17	0.18	0.11	0.16	0.11	0.15	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.24	0.22	0.13	0.17	0.33	0.32	0.16
O3'	0.25	0.27	0.31	0.37	0.22	0.38	0.26	0.37	0.29	0.26	0.30	0.20	0.32	0.27	0.22	0.46	0.49	0.29	0.29	0.36	0.29	0.27
O4'	0.12	0.17	0.12	0.16	0.13	0.15	0.14	0.16	0.16	0.11	0.17	0.14	0.17	0.13	0.11	0.20	0.24	0.13	0.15	0.19	0.40	0.15
O5'	0.15	0.23	0.20	0.27	0.16	0.27	0.20	0.28	0.24	0.15	0.27	0.17	0.27	0.18	0.14	0.29	0.40	0.19	0.21	0.29	0.29	0.21
OP1	0.22	0.20	0.29	0.40	0.16	0.41	0.18	0.45	0.22	0.19	0.24	0.15	0.25	0.19	0.17	0.37	0.55	0.29	0.35	0.52	0.35	0.36
OP2	0.19	0.29	0.20	0.27	0.22	0.30	0.28	0.31	0.34	0.22	0.35	0.21	0.39	0.26	0.19	0.31	0.40	0.24	0.23	0.29	0.28	0.22
P	0.16	0.24	0.21	0.30	0.16	0.30	0.20	0.33	0.26	0.15	0.28	0.16	0.29	0.18	0.13	0.29	0.44	0.21	0.25	0.36	0.30	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.29	0.16	0.07
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.02	0.18	0.89	0.57	0.25
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.12	0.23	0.06
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.10	0.10	0.11	0.11	0.10	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.13	0.16	0.20	0.10
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.03	0.17	0.82	0.49	0.22
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.30	0.20	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.04	0.19	1.07	0.63	0.28
C5'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.11	0.08	0.15	0.14	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.45	0.41	0.05
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.04	0.20	1.17	0.71	0.30
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.05	0.18	0.88	0.47	0.23
N1	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.20	1.07	0.67	0.29
N3	0.02	0.01	0.10	0.11	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02	0.16	0.74	0.46	0.21
N6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.12	0.06	0.20	1.31	0.80	0.32
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.05	0.20	1.14	0.65	0.29
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.14	0.65	0.36	0.17
O2'	0.01	0.14	0.01	0.03	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.03	0.12	0.13	0.07	0.03	0.02	0.00	0.11	0.04	0.04	0.25	0.12	0.08
O3'	0.04	0.15	0.05	0.01	0.09	0.03	0.09	0.04	0.11	0.11	0.13	0.13	0.12	0.10	0.06	0.11	0.00	0.04	0.17	0.45	0.20	0.13
O4'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.05	0.03	0.04	0.04	0.00	0.09	0.19	0.15	0.09
O5'	0.08	0.18	0.08	0.13	0.17	0.01	0.19	0.01	0.20	0.18	0.20	0.16	0.20	0.20	0.14	0.04	0.17	0.09	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.29	0.89	0.12	0.16	0.82	0.30	1.07	0.45	1.17	0.88	1.07	0.74	1.31	1.14	0.65	0.25	0.45	0.19	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.16	0.57	0.23	0.20	0.49	0.20	0.63	0.41	0.71	0.47	0.67	0.46	0.80	0.65	0.36	0.12	0.20	0.15	0.03	0.03	0.00	0.01
P	0.07	0.25	0.06	0.10	0.22	0.05	0.28	0.05	0.30	0.23	0.29	0.21	0.32	0.29	0.17	0.08	0.13	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00