Doublet Group distance statistics: 53404

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.016, 0.025, 0.035, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.015, 0.025, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.024 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.026, 0.041, 0.056, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.041 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.037, 0.062, 0.087, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.062 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.037, 0.075, 0.114, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.075 std_dev=0.038
O2'	A	0, 0.120, 0.245, 0.371, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.245 std_dev=0.125
O4'	A	0, 0.048, 0.176, 0.304, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.176 std_dev=0.128
C2'	A	0, 0.064, 0.203, 0.342, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.203 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.052, 0.260, 0.468, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.260 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.089, 0.308, 0.527, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.308 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.263, 0.513, 0.762, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.513 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.378, 0.637, 0.897, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.637 std_dev=0.260
O3'	A	0, 0.163, 0.490, 0.817, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.490 std_dev=0.327
O5'	A	0, 0.202, 0.535, 0.869, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.535 std_dev=0.334
C5'	A	0, 0.120, 0.454, 0.788, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.454 std_dev=0.334
OP2	A	0, 0.253, 0.651, 1.049, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.651 std_dev=0.398
P	A	0, 0.219, 0.623, 1.026, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.623 std_dev=0.403
C1'	B	0, 0.257, 0.660, 1.064, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.660 std_dev=0.404
C4	B	0, 0.236, 0.695, 1.154, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.695 std_dev=0.459
OP1	A	0, 0.282, 0.748, 1.215, 1.706 max_d=1.706 avg_d=0.748 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.300, 0.815, 1.330, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.815 std_dev=0.515
N1	B	0, 0.357, 0.890, 1.424, 1.843 max_d=1.843 avg_d=0.890 std_dev=0.534
N9	B	0, 0.215, 0.750, 1.285, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.750 std_dev=0.535
C2'	B	0, 0.283, 0.824, 1.364, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.824 std_dev=0.541
O4'	B	0, 0.277, 0.842, 1.407, 1.953 max_d=1.953 avg_d=0.842 std_dev=0.565
C4'	B	0, 0.331, 1.041, 1.750, 2.210 max_d=2.210 avg_d=1.041 std_dev=0.709
C5	B	0, 0.276, 1.010, 1.743, 2.356 max_d=2.356 avg_d=1.010 std_dev=0.733
C6	B	0, 0.312, 1.091, 1.870, 2.430 max_d=2.430 avg_d=1.091 std_dev=0.779
C3'	B	0, 0.312, 1.115, 1.917, 2.432 max_d=2.432 avg_d=1.115 std_dev=0.803
C8	B	0, 0.246, 1.059, 1.872, 2.755 max_d=2.755 avg_d=1.059 std_dev=0.813
O3'	B	0, 0.393, 1.353, 2.313, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.353 std_dev=0.960
N7	B	0, 0.271, 1.236, 2.201, 3.023 max_d=3.023 avg_d=1.236 std_dev=0.965
C5'	B	0, 0.306, 1.280, 2.255, 3.023 max_d=3.023 avg_d=1.280 std_dev=0.975
N6	B	0, 0.336, 1.410, 2.485, 3.333 max_d=3.333 avg_d=1.410 std_dev=1.075
O5'	B	0, 0.178, 1.553, 2.927, 4.483 max_d=4.483 avg_d=1.553 std_dev=1.374
OP2	B	0, 0.210, 1.626, 3.041, 4.949 max_d=4.949 avg_d=1.626 std_dev=1.416
P	B	0, 0.085, 1.512, 2.940, 4.637 max_d=4.637 avg_d=1.512 std_dev=1.427
OP1	B	0, -0.037, 1.879, 3.794, 6.270 max_d=6.270 avg_d=1.879 std_dev=1.915

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.11	0.07
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.10	0.05	0.06	0.06	0.16	0.10
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.06	0.05	0.16	0.01	0.02	0.01	0.05	0.11	0.09	0.07
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.12	0.06	0.09	0.10	0.13	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.09	0.08
C4	0.02	0.02	0.04	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.02	0.09	0.13	0.21	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.00	0.02	0.08	0.04	0.03
C5	0.01	0.02	0.09	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.17	0.04	0.11	0.15	0.21	0.16
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.08	0.04	0.04	0.08	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.12	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.15	0.05	0.09	0.10	0.17	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.06	0.14	0.10
N3	0.03	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.11	0.04	0.07	0.09	0.19	0.11
N4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.14	0.02	0.10	0.16	0.24	0.16
O2	0.04	0.01	0.16	0.13	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.14	0.16	0.08	0.05	0.06	0.15	0.09
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04	0.08	0.02	0.05	0.04	0.14	0.00	0.04	0.03	0.04	0.13	0.07	0.05
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.13	0.03	0.17	0.03	0.15	0.06	0.11	0.14	0.16	0.04	0.00	0.02	0.07	0.20	0.14	0.12
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.11	0.08
O5'	0.05	0.06	0.05	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.09	0.06	0.07	0.10	0.05	0.04	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.06	0.06	0.11	0.13	0.13	0.08	0.15	0.05	0.10	0.06	0.09	0.16	0.06	0.13	0.20	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.16	0.09	0.09	0.21	0.04	0.21	0.02	0.17	0.14	0.19	0.24	0.15	0.07	0.14	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.07	0.08	0.14	0.03	0.16	0.01	0.13	0.10	0.11	0.16	0.09	0.05	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.22	0.17	0.18	0.24	0.19	0.25	0.19	0.25	0.26	0.22	0.23	0.26	0.27	0.24	0.19	0.24	0.27	0.25	0.20	0.44	0.28
C2	0.26	0.22	0.14	0.14	0.23	0.21	0.22	0.24	0.21	0.23	0.20	0.24	0.21	0.22	0.24	0.18	0.23	0.34	0.27	0.27	0.56	0.31
C2'	0.18	0.16	0.12	0.13	0.09	0.21	0.10	0.22	0.15	0.09	0.18	0.11	0.16	0.07	0.10	0.15	0.14	0.26	0.19	0.23	0.40	0.20
C3'	0.12	0.16	0.14	0.16	0.11	0.16	0.12	0.17	0.16	0.08	0.17	0.12	0.17	0.09	0.08	0.18	0.19	0.19	0.19	0.29	0.38	0.22
C4	0.29	0.21	0.14	0.13	0.23	0.26	0.21	0.31	0.19	0.24	0.19	0.24	0.19	0.22	0.25	0.18	0.20	0.40	0.29	0.30	0.53	0.31
C4'	0.15	0.16	0.26	0.28	0.15	0.19	0.18	0.20	0.18	0.21	0.17	0.13	0.20	0.22	0.17	0.24	0.33	0.14	0.19	0.12	0.30	0.20
C5	0.28	0.19	0.17	0.17	0.22	0.26	0.19	0.29	0.17	0.22	0.17	0.22	0.17	0.20	0.24	0.21	0.23	0.38	0.28	0.28	0.48	0.30
C5'	0.15	0.18	0.30	0.34	0.14	0.23	0.18	0.24	0.19	0.21	0.19	0.14	0.21	0.23	0.16	0.27	0.43	0.14	0.22	0.20	0.35	0.24
C6	0.26	0.19	0.19	0.19	0.21	0.24	0.20	0.26	0.18	0.22	0.18	0.22	0.18	0.21	0.23	0.22	0.25	0.34	0.26	0.23	0.45	0.28
N1	0.25	0.21	0.15	0.15	0.22	0.21	0.21	0.22	0.20	0.23	0.19	0.23	0.21	0.22	0.23	0.19	0.23	0.32	0.25	0.21	0.47	0.28
N3	0.27	0.22	0.13	0.13	0.24	0.24	0.22	0.28	0.21	0.24	0.20	0.24	0.20	0.23	0.25	0.18	0.22	0.38	0.29	0.30	0.58	0.31
N4	0.30	0.20	0.13	0.13	0.24	0.29	0.22	0.34	0.20	0.26	0.19	0.23	0.20	0.23	0.26	0.18	0.19	0.43	0.33	0.35	0.55	0.33
O2	0.24	0.25	0.16	0.16	0.24	0.19	0.24	0.22	0.24	0.24	0.23	0.25	0.24	0.24	0.24	0.20	0.26	0.31	0.28	0.31	0.62	0.34
O2'	0.19	0.17	0.13	0.13	0.09	0.21	0.11	0.22	0.15	0.10	0.18	0.11	0.16	0.10	0.10	0.17	0.16	0.26	0.24	0.24	0.41	0.26
O3'	0.18	0.29	0.17	0.21	0.26	0.21	0.29	0.21	0.33	0.24	0.32	0.25	0.35	0.27	0.21	0.23	0.27	0.21	0.32	0.47	0.50	0.34
O4'	0.22	0.30	0.27	0.29	0.28	0.21	0.34	0.21	0.35	0.33	0.33	0.27	0.38	0.37	0.28	0.25	0.36	0.20	0.28	0.17	0.35	0.27
O5'	0.13	0.15	0.22	0.26	0.11	0.14	0.11	0.15	0.12	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.11	0.22	0.34	0.16	0.21	0.33	0.42	0.28
OP1	0.17	0.17	0.31	0.37	0.13	0.23	0.13	0.24	0.14	0.16	0.16	0.15	0.13	0.15	0.15	0.31	0.49	0.20	0.32	0.47	0.56	0.41
OP2	0.15	0.19	0.19	0.23	0.14	0.15	0.14	0.16	0.16	0.12	0.18	0.17	0.16	0.12	0.13	0.20	0.34	0.23	0.27	0.46	0.46	0.34
P	0.14	0.16	0.26	0.31	0.12	0.17	0.12	0.18	0.13	0.14	0.15	0.14	0.13	0.14	0.12	0.25	0.41	0.17	0.25	0.38	0.46	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.19	0.35	0.35	0.23
C2	0.02	0.00	0.15	0.16	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.21	0.07	0.34	0.53	0.85	0.47
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.11	0.11	0.16	0.08	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.21	0.25	0.21	0.16
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.17	0.12	0.15	0.13	0.14	0.05	0.02	0.01	0.01	0.26	0.29	0.21	0.15
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.09	0.04	0.35	0.55	0.85	0.48
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.05	0.03	0.12	0.09	0.04	0.03	0.03	0.00	0.01	0.16	0.25	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.09	0.03	0.42	0.67	1.12	0.59
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.10	0.05	0.18	0.16	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.25	0.33	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.02	0.08	0.01	0.14	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.11	0.04	0.42	0.68	1.17	0.61
C8	0.02	0.02	0.11	0.17	0.01	0.10	0.01	0.15	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.19	0.06	0.45	0.66	1.05	0.58
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.16	0.05	0.39	0.62	1.04	0.56
N3	0.02	0.01	0.16	0.15	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.20	0.07	0.30	0.47	0.71	0.41
N6	0.06	0.02	0.08	0.13	0.04	0.12	0.04	0.18	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.05	0.06	0.14	0.07	0.43	0.74	1.31	0.65
N7	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.48	0.75	1.27	0.67
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.34	0.52	0.74	0.43
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.11	0.15	0.06	0.05	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.12	0.30	0.08
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.09	0.03	0.09	0.04	0.11	0.19	0.16	0.20	0.14	0.17	0.05	0.03	0.00	0.02	0.19	0.29	0.52	0.13
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.07	0.07	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.11	0.35	0.22	0.17
O5'	0.19	0.34	0.21	0.26	0.35	0.01	0.42	0.01	0.42	0.45	0.39	0.30	0.43	0.48	0.34	0.04	0.19	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.35	0.53	0.25	0.29	0.55	0.16	0.67	0.25	0.68	0.66	0.62	0.47	0.74	0.75	0.52	0.12	0.29	0.35	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.35	0.85	0.21	0.21	0.85	0.25	1.12	0.33	1.17	1.05	1.04	0.71	1.31	1.27	0.74	0.30	0.52	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.47	0.16	0.15	0.48	0.05	0.59	0.01	0.61	0.58	0.56	0.41	0.65	0.67	0.43	0.08	0.13	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00