Doublet Group distance statistics: 53412

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 5, 6, 12, 15, 8, 4, 2, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.002, 0.006, 0.014, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.006 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C1'	A	0, -0.001, 0.012, 0.026, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C6	A	0, -0.002, 0.011, 0.025, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.011 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.004, 0.011, 0.026, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.011 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.004, 0.027, 0.050, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.027 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.102, 0.213, 0.324, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.213 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.078, 0.205, 0.333, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.205 std_dev=0.128
O2'	A	0, 0.137, 0.318, 0.499, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.318 std_dev=0.181
C3'	A	0, 0.187, 0.377, 0.566, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.377 std_dev=0.190
C4'	A	0, 0.162, 0.364, 0.567, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.364 std_dev=0.203
C2'	B	0, 0.602, 0.812, 1.023, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.812 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.245, 0.503, 0.761, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.503 std_dev=0.258
N3	B	0, 0.193, 0.461, 0.729, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.461 std_dev=0.268
O3'	A	0, 0.266, 0.542, 0.818, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.542 std_dev=0.276
N9	B	0, 0.120, 0.410, 0.699, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.410 std_dev=0.289
C8	B	0, 0.215, 0.507, 0.798, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.507 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.335, 0.631, 0.927, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.631 std_dev=0.296
C5	B	0, 0.419, 0.718, 1.017, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.718 std_dev=0.299
N7	B	0, 0.404, 0.715, 1.026, 2.377 max_d=2.377 avg_d=0.715 std_dev=0.311
N2	B	0, 0.312, 0.631, 0.949, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.631 std_dev=0.319
C1'	B	0, 0.163, 0.489, 0.814, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.489 std_dev=0.325
C5'	A	0, 0.301, 0.654, 1.007, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.654 std_dev=0.353
N1	B	0, 0.483, 0.861, 1.238, 2.621 max_d=2.621 avg_d=0.861 std_dev=0.378
C6	B	0, 0.541, 0.931, 1.321, 2.952 max_d=2.952 avg_d=0.931 std_dev=0.390
C5'	B	0, 1.088, 1.485, 1.883, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.485 std_dev=0.397
O4'	B	0, 0.306, 0.743, 1.180, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.743 std_dev=0.437
O5'	A	0, 0.387, 0.826, 1.265, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.826 std_dev=0.439
C3'	B	0, 0.453, 0.910, 1.368, 2.715 max_d=2.715 avg_d=0.910 std_dev=0.457
C4'	B	0, 0.375, 0.838, 1.301, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.838 std_dev=0.463
O6	B	0, 0.682, 1.175, 1.669, 3.733 max_d=3.733 avg_d=1.175 std_dev=0.493
O2'	B	0, 0.848, 1.344, 1.840, 2.648 max_d=2.648 avg_d=1.344 std_dev=0.496
OP2	A	0, 0.113, 0.799, 1.485, 2.779 max_d=2.779 avg_d=0.799 std_dev=0.686
O3'	B	0, 0.451, 1.160, 1.869, 4.079 max_d=4.079 avg_d=1.160 std_dev=0.709
P	A	0, 0.266, 0.980, 1.694, 3.102 max_d=3.102 avg_d=0.980 std_dev=0.714
O5'	B	0, 0.353, 1.108, 1.863, 4.601 max_d=4.601 avg_d=1.108 std_dev=0.755
OP1	A	0, 0.403, 1.416, 2.428, 4.125 max_d=4.125 avg_d=1.416 std_dev=1.013
P	B	0, -0.181, 1.012, 2.205, 6.625 max_d=6.625 avg_d=1.012 std_dev=1.193
OP1	B	0, 0.293, 1.490, 2.688, 6.590 max_d=6.590 avg_d=1.490 std_dev=1.198
OP2	B	0, 0.175, 1.552, 2.930, 9.003 max_d=9.003 avg_d=1.552 std_dev=1.377

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.16	0.15	0.22	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.13	0.02	0.27	0.17	0.19	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.09	0.00	0.02	0.01	0.22	0.37	0.11	0.14
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.02	0.09	0.08	0.14	0.14	0.13	0.02	0.01	0.01	0.29	0.52	0.12	0.25
C4	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.14	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.33	0.16	0.23	0.17
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.13	0.07	0.11	0.15	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.19	0.26	0.07
C5	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.06	0.33	0.16	0.25	0.19
C5'	0.04	0.17	0.02	0.02	0.29	0.00	0.30	0.00	0.24	0.15	0.24	0.32	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.25	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.06	0.31	0.14	0.23	0.15
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.26	0.15	0.20	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.14	0.00	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02	0.30	0.16	0.21	0.14
N4	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.15	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.34	0.18	0.26	0.20
O2	0.05	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.14	0.05	0.25	0.21	0.17	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.08	0.05	0.14	0.00	0.03	0.06	0.04	0.25	0.16	0.06
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.15	0.02	0.13	0.03	0.10	0.08	0.15	0.17	0.14	0.03	0.00	0.01	0.21	0.65	0.19	0.32
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.06	0.01	0.00	0.05	0.09	0.34	0.20
O5'	0.16	0.27	0.22	0.29	0.33	0.01	0.33	0.01	0.31	0.26	0.30	0.34	0.25	0.04	0.21	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.17	0.37	0.52	0.16	0.19	0.16	0.25	0.14	0.15	0.16	0.18	0.21	0.25	0.65	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.19	0.11	0.12	0.23	0.26	0.25	0.34	0.23	0.20	0.21	0.26	0.17	0.16	0.19	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.14	0.25	0.17	0.07	0.19	0.01	0.15	0.11	0.14	0.20	0.11	0.06	0.32	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.12	0.54	0.33	0.11	0.59	0.11	0.77	0.12	0.13	0.14	0.15	0.11	0.11	0.14	0.95	0.67	0.61	0.67	0.14	0.91	0.22	0.56
C2	0.20	0.13	0.54	0.29	0.11	0.51	0.11	0.68	0.13	0.13	0.14	0.16	0.11	0.11	0.14	0.88	0.61	0.56	0.63	0.15	0.73	0.16	0.46
C2'	0.20	0.14	0.53	0.33	0.11	0.57	0.11	0.73	0.15	0.12	0.16	0.17	0.12	0.11	0.13	0.87	0.66	0.61	0.68	0.17	0.85	0.19	0.53
C3'	0.27	0.22	0.43	0.38	0.19	0.67	0.18	0.79	0.20	0.19	0.22	0.26	0.21	0.17	0.21	0.75	0.73	0.73	0.78	0.22	0.98	0.34	0.65
C4	0.21	0.15	0.53	0.29	0.11	0.50	0.10	0.60	0.11	0.13	0.14	0.20	0.13	0.10	0.15	0.82	0.58	0.61	0.63	0.12	0.70	0.14	0.44
C4'	0.27	0.20	0.42	0.43	0.19	0.72	0.18	0.86	0.18	0.20	0.20	0.22	0.20	0.17	0.22	0.80	0.78	0.75	0.80	0.19	1.09	0.45	0.72
C5	0.24	0.15	0.52	0.33	0.13	0.57	0.11	0.66	0.12	0.15	0.15	0.20	0.15	0.11	0.16	0.88	0.64	0.67	0.68	0.13	0.83	0.24	0.53
C5'	0.43	0.36	0.29	0.55	0.36	0.86	0.34	0.98	0.33	0.36	0.34	0.37	0.37	0.33	0.38	0.62	0.90	0.91	0.95	0.32	1.27	0.67	0.91
C6	0.22	0.14	0.53	0.34	0.12	0.60	0.11	0.72	0.12	0.14	0.14	0.18	0.13	0.11	0.15	0.92	0.66	0.66	0.69	0.13	0.90	0.27	0.57
N1	0.20	0.13	0.54	0.32	0.11	0.57	0.10	0.73	0.12	0.13	0.14	0.16	0.11	0.11	0.14	0.93	0.65	0.62	0.66	0.13	0.85	0.19	0.53
N3	0.20	0.13	0.52	0.28	0.11	0.47	0.11	0.61	0.12	0.13	0.14	0.17	0.11	0.11	0.14	0.81	0.57	0.55	0.61	0.13	0.66	0.19	0.42
N4	0.23	0.18	0.51	0.27	0.12	0.43	0.11	0.49	0.13	0.13	0.16	0.22	0.16	0.11	0.15	0.72	0.51	0.59	0.60	0.13	0.60	0.16	0.38
O2	0.20	0.14	0.52	0.28	0.13	0.49	0.14	0.68	0.16	0.14	0.17	0.16	0.13	0.13	0.14	0.86	0.59	0.52	0.61	0.18	0.70	0.22	0.46
O2'	0.20	0.17	0.57	0.32	0.14	0.54	0.15	0.72	0.18	0.14	0.20	0.19	0.14	0.14	0.15	0.93	0.66	0.55	0.62	0.21	0.82	0.18	0.49
O3'	0.30	0.24	0.41	0.39	0.21	0.68	0.19	0.79	0.22	0.21	0.24	0.27	0.23	0.18	0.23	0.69	0.75	0.75	0.80	0.24	0.98	0.35	0.66
O4'	0.22	0.14	0.51	0.39	0.13	0.66	0.13	0.82	0.13	0.16	0.15	0.16	0.13	0.13	0.16	0.96	0.73	0.66	0.72	0.14	1.03	0.38	0.65
O5'	0.40	0.29	0.76	0.55	0.31	0.63	0.33	0.71	0.34	0.36	0.32	0.29	0.29	0.35	0.35	1.13	0.76	0.61	0.76	0.36	1.10	0.70	0.76
OP1	0.50	0.20	0.45	0.72	0.24	0.99	0.21	1.09	0.23	0.32	0.24	0.24	0.22	0.25	0.34	0.72	1.01	0.95	1.16	0.27	1.57	1.04	1.19
OP2	0.59	0.27	0.46	0.72	0.34	1.00	0.27	1.06	0.22	0.39	0.23	0.30	0.34	0.30	0.43	0.68	0.98	1.03	1.18	0.21	1.49	0.98	1.17
P	0.48	0.18	0.51	0.66	0.25	0.92	0.22	1.02	0.18	0.33	0.18	0.20	0.24	0.26	0.35	0.82	0.93	0.91	1.08	0.19	1.46	0.95	1.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.25	0.00	0.29	0.02	0.21	0.45	0.21
C2	0.04	0.00	0.27	0.16	0.01	0.19	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.29	0.29	0.55	0.01	0.36	0.66	0.46
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.13	0.01	0.03	0.17	0.08	0.20	0.19	0.34	0.27	0.13	0.02	0.00	0.03	0.01	0.58	0.05	0.61	0.30	0.45
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.17	0.00	0.23	0.02	0.22	0.25	0.19	0.16	0.14	0.27	0.17	0.01	0.00	0.01	0.33	0.24	0.45	0.20	0.20
C4	0.02	0.01	0.13	0.17	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.11	0.16	0.15	0.51	0.01	0.31	0.71	0.44
C4'	0.01	0.19	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.05	0.22	0.13	0.26	0.18	0.17	0.06	0.24	0.02	0.00	0.01	0.04	0.23	0.40	0.08
C5	0.02	0.01	0.03	0.23	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.10	0.05	0.53	0.01	0.37	0.88	0.55
C5'	0.07	0.33	0.17	0.02	0.17	0.00	0.12	0.00	0.17	0.21	0.27	0.40	0.30	0.16	0.07	0.07	0.20	0.01	0.01	0.14	0.21	0.38	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.05	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.11	0.57	0.00	0.41	0.91	0.59
C8	0.01	0.01	0.20	0.25	0.01	0.22	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.42	0.11	0.19	0.42	0.02	0.34	0.88	0.50
N1	0.03	0.00	0.19	0.19	0.01	0.13	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.21	0.22	0.58	0.01	0.38	0.80	0.54
N2	0.06	0.00	0.34	0.16	0.02	0.26	0.01	0.40	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.41	0.37	0.36	0.55	0.02	0.40	0.57	0.42
N3	0.04	0.01	0.27	0.14	0.00	0.18	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.28	0.29	0.30	0.51	0.01	0.33	0.59	0.39
N7	0.01	0.01	0.13	0.27	0.00	0.17	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.13	0.11	0.49	0.02	0.42	0.98	0.58
N9	0.00	0.02	0.02	0.17	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.17	0.09	0.01	0.43	0.02	0.25	0.68	0.38
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.11	0.24	0.22	0.07	0.18	0.42	0.16	0.41	0.28	0.40	0.17	0.00	0.07	0.18	0.34	0.25	0.47	0.33	0.33
O3'	0.25	0.29	0.03	0.00	0.16	0.02	0.10	0.20	0.13	0.11	0.21	0.37	0.29	0.13	0.09	0.07	0.00	0.18	0.13	0.13	0.32	0.30	0.13
O4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.15	0.00	0.05	0.01	0.11	0.19	0.22	0.36	0.30	0.11	0.01	0.18	0.18	0.00	0.16	0.07	0.08	0.64	0.31
O5'	0.29	0.55	0.58	0.33	0.51	0.01	0.53	0.01	0.57	0.42	0.58	0.55	0.51	0.49	0.43	0.34	0.13	0.16	0.00	0.57	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.24	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.25	0.13	0.07	0.57	0.00	0.46	0.99	0.64
OP1	0.21	0.36	0.61	0.45	0.31	0.23	0.37	0.21	0.41	0.34	0.38	0.40	0.33	0.42	0.25	0.47	0.32	0.08	0.01	0.46	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.66	0.30	0.20	0.71	0.40	0.88	0.38	0.91	0.88	0.80	0.57	0.59	0.98	0.68	0.33	0.30	0.64	0.01	0.99	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.46	0.45	0.20	0.44	0.08	0.55	0.01	0.59	0.50	0.54	0.42	0.39	0.58	0.38	0.33	0.13	0.31	0.00	0.64	0.01	0.01	0.00