Doublet Group distance statistics: 53413

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 8, 9, 4, 6, 3, 2, 4, 1, 3, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.001, 0.008, 0.016, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.028, 0.053, 0.078, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.053 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.007, 0.044, 0.081, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.044 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.042, 0.117, 0.193, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.117 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.076, 0.153, 0.230, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.153 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.120, 0.211, 0.301, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.211 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.066, 0.175, 0.284, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.175 std_dev=0.109
C3'	A	0, 0.101, 0.218, 0.335, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.218 std_dev=0.117
O3'	A	0, 0.150, 0.315, 0.481, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.315 std_dev=0.165
C5'	A	0, 0.145, 0.346, 0.547, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.346 std_dev=0.201
N2	B	0, 0.335, 0.551, 0.768, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.551 std_dev=0.216
C2	B	0, 0.306, 0.549, 0.793, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.549 std_dev=0.243
N3	B	0, 0.211, 0.466, 0.721, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.466 std_dev=0.255
O5'	A	0, 0.184, 0.443, 0.702, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.443 std_dev=0.259
N1	B	0, 0.372, 0.669, 0.966, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.669 std_dev=0.297
C4	B	0, 0.190, 0.511, 0.831, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.511 std_dev=0.321
C2'	B	0, 0.049, 0.377, 0.705, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.377 std_dev=0.328
P	A	0, 0.326, 0.672, 1.019, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.672 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.015, 0.365, 0.714, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.365 std_dev=0.349
OP2	A	0, 0.391, 0.746, 1.102, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.746 std_dev=0.355
C6	B	0, 0.371, 0.732, 1.093, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.732 std_dev=0.361
C5	B	0, 0.278, 0.646, 1.015, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.646 std_dev=0.369
N9	B	0, 0.078, 0.458, 0.838, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.458 std_dev=0.380
OP1	A	0, 0.364, 0.777, 1.191, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.777 std_dev=0.413
O6	B	0, 0.436, 0.857, 1.279, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.857 std_dev=0.421
C8	B	0, 0.141, 0.578, 1.015, 2.008 max_d=2.008 avg_d=0.578 std_dev=0.437
N7	B	0, 0.250, 0.695, 1.139, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.695 std_dev=0.445
C3'	B	0, 0.094, 0.567, 1.039, 2.263 max_d=2.263 avg_d=0.567 std_dev=0.473
O4'	B	0, 0.008, 0.578, 1.147, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.578 std_dev=0.570
C4'	B	0, 0.029, 0.626, 1.223, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.626 std_dev=0.597
O2'	B	0, -0.010, 0.591, 1.192, 2.454 max_d=2.454 avg_d=0.591 std_dev=0.601
O3'	B	0, 0.073, 0.682, 1.291, 3.297 max_d=3.297 avg_d=0.682 std_dev=0.609
C5'	B	0, -0.082, 0.887, 1.856, 4.097 max_d=4.097 avg_d=0.887 std_dev=0.969
OP1	B	0, -0.028, 1.032, 2.093, 4.850 max_d=4.850 avg_d=1.032 std_dev=1.061
O5'	B	0, -0.050, 1.027, 2.104, 4.743 max_d=4.743 avg_d=1.027 std_dev=1.077
P	B	0, -0.149, 1.091, 2.332, 5.650 max_d=5.650 avg_d=1.091 std_dev=1.241
OP2	B	0, -0.361, 1.329, 3.019, 7.669 max_d=7.669 avg_d=1.329 std_dev=1.690

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.05
C2	0.03	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.07	0.03	0.09	0.10	0.16	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.09	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.06	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.12	0.16	0.23	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.11	0.02	0.12	0.16	0.20	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.09	0.06	0.06	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.10	0.02	0.11	0.12	0.14	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.08	0.08	0.13	0.09
N3	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.03	0.11	0.14	0.21	0.15
N4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.10	0.02	0.13	0.19	0.25	0.20
O2	0.05	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.02	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.06	0.08	0.09	0.15	0.10
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.00	0.04	0.04	0.03	0.09	0.06	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.10	0.05	0.08	0.10	0.09	0.04	0.00	0.02	0.06	0.10	0.09	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.05	0.04
O5'	0.05	0.09	0.05	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.11	0.13	0.08	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.10	0.07	0.08	0.16	0.06	0.16	0.06	0.12	0.08	0.14	0.19	0.09	0.09	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.16	0.09	0.07	0.23	0.03	0.20	0.02	0.14	0.13	0.21	0.25	0.15	0.06	0.09	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.11	0.05	0.05	0.17	0.02	0.17	0.02	0.13	0.09	0.15	0.20	0.10	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.18	0.23	0.25	0.18	0.57	0.18	0.77	0.18	0.18	0.18	0.17	0.18	0.18	0.18	0.64	0.41	0.62	0.70	0.18	0.66	0.97	0.72
C2	0.15	0.16	0.23	0.22	0.17	0.56	0.17	0.78	0.16	0.17	0.16	0.16	0.17	0.17	0.17	0.62	0.35	0.62	0.63	0.16	0.66	0.90	0.67
C2'	0.19	0.20	0.25	0.21	0.22	0.55	0.22	0.75	0.22	0.22	0.21	0.19	0.21	0.22	0.21	0.64	0.35	0.63	0.63	0.22	0.63	0.90	0.66
C3'	0.22	0.21	0.27	0.21	0.23	0.53	0.23	0.68	0.23	0.24	0.21	0.18	0.22	0.24	0.24	0.66	0.36	0.64	0.58	0.23	0.57	0.81	0.60
C4	0.19	0.13	0.24	0.21	0.18	0.52	0.17	0.64	0.15	0.20	0.13	0.13	0.16	0.18	0.20	0.63	0.36	0.65	0.50	0.15	0.56	0.67	0.52
C4'	0.19	0.18	0.23	0.25	0.20	0.54	0.20	0.69	0.19	0.20	0.19	0.17	0.19	0.20	0.20	0.65	0.42	0.62	0.66	0.20	0.60	0.89	0.67
C5	0.20	0.13	0.24	0.23	0.18	0.50	0.17	0.59	0.15	0.20	0.13	0.13	0.16	0.19	0.20	0.65	0.40	0.63	0.53	0.15	0.54	0.66	0.53
C5'	0.21	0.18	0.20	0.27	0.21	0.53	0.21	0.64	0.20	0.22	0.18	0.16	0.20	0.22	0.22	0.61	0.45	0.63	0.64	0.20	0.57	0.82	0.64
C6	0.19	0.14	0.24	0.25	0.18	0.53	0.17	0.65	0.16	0.19	0.15	0.13	0.17	0.18	0.19	0.65	0.41	0.63	0.60	0.16	0.58	0.77	0.60
N1	0.17	0.16	0.23	0.24	0.18	0.56	0.17	0.74	0.17	0.18	0.16	0.15	0.18	0.18	0.18	0.64	0.39	0.62	0.65	0.17	0.63	0.88	0.67
N3	0.16	0.15	0.23	0.20	0.17	0.54	0.16	0.74	0.15	0.17	0.14	0.14	0.17	0.17	0.18	0.60	0.33	0.63	0.56	0.15	0.62	0.80	0.60
N4	0.23	0.12	0.24	0.19	0.19	0.47	0.17	0.57	0.15	0.22	0.12	0.14	0.16	0.20	0.22	0.62	0.33	0.66	0.41	0.15	0.51	0.54	0.43
O2	0.13	0.17	0.22	0.22	0.16	0.58	0.16	0.84	0.17	0.15	0.17	0.17	0.17	0.16	0.15	0.59	0.34	0.60	0.67	0.18	0.72	1.00	0.73
O2'	0.18	0.21	0.23	0.23	0.21	0.58	0.22	0.81	0.22	0.21	0.22	0.21	0.21	0.22	0.20	0.62	0.36	0.64	0.69	0.23	0.70	1.00	0.74
O3'	0.25	0.23	0.29	0.21	0.26	0.52	0.27	0.67	0.26	0.28	0.25	0.20	0.24	0.28	0.27	0.67	0.35	0.64	0.55	0.27	0.55	0.78	0.58
O4'	0.17	0.17	0.22	0.27	0.18	0.56	0.17	0.73	0.17	0.18	0.17	0.16	0.18	0.18	0.18	0.65	0.44	0.60	0.71	0.17	0.64	0.95	0.72
O5'	0.24	0.20	0.20	0.27	0.24	0.50	0.23	0.57	0.22	0.25	0.20	0.17	0.22	0.25	0.25	0.60	0.44	0.64	0.57	0.22	0.52	0.71	0.56
OP1	0.31	0.23	0.19	0.32	0.28	0.49	0.28	0.52	0.26	0.31	0.23	0.20	0.26	0.30	0.31	0.53	0.49	0.66	0.56	0.26	0.51	0.64	0.53
OP2	0.37	0.29	0.20	0.33	0.35	0.48	0.34	0.48	0.32	0.38	0.29	0.25	0.32	0.37	0.37	0.50	0.49	0.69	0.51	0.33	0.50	0.55	0.47
P	0.30	0.23	0.18	0.32	0.28	0.50	0.27	0.53	0.25	0.31	0.23	0.19	0.26	0.30	0.30	0.53	0.50	0.66	0.57	0.26	0.52	0.65	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.29	0.03	0.32	0.24	0.17
C2	0.05	0.00	0.26	0.14	0.01	0.34	0.01	0.64	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.40	0.13	0.38	0.27	0.01	0.54	0.51	0.35
C2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.14	0.03	0.09	0.18	0.14	0.11	0.22	0.31	0.25	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.20	0.12	0.58	0.20	0.24
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.16	0.15	0.16	0.16	0.13	0.16	0.10	0.02	0.01	0.02	0.08	0.18	0.41	0.14	0.14
C4	0.02	0.01	0.14	0.12	0.00	0.19	0.01	0.46	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.20	0.25	0.01	0.45	0.31	0.23
C4'	0.01	0.34	0.03	0.01	0.19	0.00	0.14	0.01	0.19	0.14	0.28	0.40	0.31	0.10	0.07	0.18	0.03	0.01	0.01	0.16	0.24	0.13	0.04
C5	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.14	0.00	0.44	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.11	0.10	0.34	0.01	0.47	0.33	0.28
C5'	0.14	0.64	0.18	0.02	0.46	0.01	0.44	0.00	0.52	0.27	0.61	0.69	0.57	0.34	0.29	0.12	0.16	0.01	0.01	0.50	0.24	0.19	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.16	0.01	0.19	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.15	0.13	0.17	0.29	0.00	0.51	0.37	0.29
C8	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.14	0.01	0.27	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.29	0.10	0.18	0.57	0.02	0.37	0.47	0.41
N1	0.04	0.01	0.22	0.16	0.01	0.28	0.01	0.61	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.29	0.12	0.29	0.25	0.01	0.54	0.46	0.32
N2	0.06	0.00	0.31	0.16	0.02	0.40	0.01	0.69	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.53	0.15	0.44	0.34	0.02	0.57	0.63	0.43
N3	0.04	0.01	0.25	0.13	0.01	0.31	0.02	0.57	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.38	0.13	0.37	0.23	0.02	0.49	0.43	0.30
N7	0.01	0.02	0.06	0.16	0.01	0.10	0.01	0.34	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.23	0.13	0.09	0.51	0.02	0.43	0.45	0.40
N9	0.00	0.02	0.03	0.10	0.01	0.07	0.01	0.29	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.36	0.02	0.38	0.28	0.23
O2'	0.02	0.40	0.00	0.02	0.16	0.18	0.10	0.12	0.15	0.29	0.29	0.53	0.38	0.23	0.08	0.00	0.05	0.10	0.16	0.13	0.61	0.22	0.23
O3'	0.16	0.13	0.02	0.01	0.10	0.03	0.11	0.16	0.13	0.10	0.12	0.15	0.13	0.13	0.09	0.05	0.00	0.18	0.13	0.15	0.40	0.25	0.18
O4'	0.00	0.38	0.02	0.02	0.20	0.01	0.10	0.01	0.17	0.18	0.29	0.44	0.37	0.09	0.02	0.10	0.18	0.00	0.34	0.12	0.18	0.35	0.28
O5'	0.29	0.27	0.20	0.08	0.25	0.01	0.34	0.01	0.29	0.57	0.25	0.34	0.23	0.51	0.36	0.16	0.13	0.34	0.00	0.33	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.12	0.18	0.01	0.16	0.01	0.50	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.13	0.15	0.12	0.33	0.00	0.52	0.38	0.32
OP1	0.32	0.54	0.58	0.41	0.45	0.24	0.47	0.24	0.51	0.37	0.54	0.57	0.49	0.43	0.38	0.61	0.40	0.18	0.02	0.52	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.51	0.20	0.14	0.31	0.13	0.33	0.19	0.37	0.47	0.46	0.63	0.43	0.45	0.28	0.22	0.25	0.35	0.01	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.35	0.24	0.14	0.23	0.04	0.28	0.01	0.29	0.41	0.32	0.43	0.30	0.40	0.23	0.23	0.18	0.28	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00