Doublet Group distance statistics: 53421

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 3, 9, 2, 5, 8, 3, 0, 3, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.004, 0.022, 0.039, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.022 std_dev=0.017
O4	A	0, 0.009, 0.045, 0.082, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.045 std_dev=0.036
O2'	B	0, 0.170, 0.437, 0.705, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.437 std_dev=0.267
C2'	B	0, 0.190, 0.503, 0.815, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.503 std_dev=0.313
O4'	A	0, -0.136, 0.220, 0.575, 2.350 max_d=2.350 avg_d=0.220 std_dev=0.355
C2'	A	0, -0.144, 0.224, 0.591, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.224 std_dev=0.368
C3'	B	0, 0.139, 0.514, 0.890, 2.083 max_d=2.083 avg_d=0.514 std_dev=0.376
O3'	A	0, -0.074, 0.344, 0.762, 2.788 max_d=2.788 avg_d=0.344 std_dev=0.418
C1'	B	0, 0.164, 0.587, 1.009, 2.211 max_d=2.211 avg_d=0.587 std_dev=0.423
C3'	A	0, -0.154, 0.293, 0.741, 3.030 max_d=3.030 avg_d=0.293 std_dev=0.448
C4'	A	0, -0.225, 0.249, 0.724, 3.231 max_d=3.231 avg_d=0.249 std_dev=0.474
C4'	B	0, 0.000, 0.486, 0.972, 3.176 max_d=3.176 avg_d=0.486 std_dev=0.486
O3'	B	0, 0.010, 0.499, 0.988, 3.132 max_d=3.132 avg_d=0.499 std_dev=0.489
O4'	B	0, 0.037, 0.554, 1.072, 3.294 max_d=3.294 avg_d=0.554 std_dev=0.518
N1	B	0, 0.172, 0.694, 1.216, 2.793 max_d=2.793 avg_d=0.694 std_dev=0.522
O2'	A	0, -0.169, 0.374, 0.917, 3.621 max_d=3.621 avg_d=0.374 std_dev=0.543
O2	B	0, 0.196, 0.774, 1.352, 3.117 max_d=3.117 avg_d=0.774 std_dev=0.578
C2	B	0, 0.195, 0.775, 1.355, 3.077 max_d=3.077 avg_d=0.775 std_dev=0.580
C6	B	0, 0.132, 0.732, 1.332, 3.397 max_d=3.397 avg_d=0.732 std_dev=0.600
N3	B	0, 0.195, 0.875, 1.554, 3.683 max_d=3.683 avg_d=0.875 std_dev=0.679
C5	B	0, 0.140, 0.831, 1.521, 3.893 max_d=3.893 avg_d=0.831 std_dev=0.691
C4	B	0, 0.178, 0.903, 1.627, 3.978 max_d=3.978 avg_d=0.903 std_dev=0.725
C5'	B	0, -0.219, 0.522, 1.263, 5.030 max_d=5.030 avg_d=0.522 std_dev=0.741
C5'	A	0, -0.328, 0.480, 1.288, 5.495 max_d=5.495 avg_d=0.480 std_dev=0.808
O4	B	0, 0.183, 0.997, 1.812, 4.537 max_d=4.537 avg_d=0.997 std_dev=0.814
O5'	A	0, -0.405, 0.450, 1.304, 5.700 max_d=5.700 avg_d=0.450 std_dev=0.854
O5'	B	0, -0.343, 0.645, 1.633, 6.711 max_d=6.711 avg_d=0.645 std_dev=0.988
P	A	0, -0.601, 0.636, 1.873, 8.275 max_d=8.275 avg_d=0.636 std_dev=1.237
OP1	B	0, -0.545, 0.701, 1.947, 8.490 max_d=8.490 avg_d=0.701 std_dev=1.246
P	B	0, -0.591, 0.738, 2.066, 9.039 max_d=9.039 avg_d=0.738 std_dev=1.328
OP1	A	0, -0.613, 0.757, 2.127, 9.094 max_d=9.094 avg_d=0.757 std_dev=1.370
OP2	A	0, -0.655, 0.720, 2.095, 9.209 max_d=9.209 avg_d=0.720 std_dev=1.375
OP2	B	0, -0.614, 0.857, 2.328, 10.018 max_d=10.018 avg_d=0.857 std_dev=1.471

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.18	0.10	0.08
C2	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.10	0.14	0.22	0.16	0.15
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.03	0.01	0.11	0.07	0.13	0.02	0.09	0.24	0.00	0.01	0.04	0.02	0.16	0.26	0.17	0.18
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.00	0.07	0.02	0.05	0.07	0.15	0.17	0.01	0.01	0.13	0.01	0.09	0.25	0.07	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.00	0.02	0.20	0.21	0.25	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.09	0.02	0.06	0.00	0.02	0.17	0.12	0.04
C5	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.04	0.01	0.07	0.18	0.15	0.24	0.18
C5'	0.03	0.09	0.07	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.10	0.11	0.05	0.06	0.12	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.05	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.06	0.01	0.10	0.14	0.14	0.17	0.13
N1	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.11	0.17	0.11	0.10
N3	0.01	0.00	0.09	0.15	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.07	0.18	0.25	0.21	0.20
O2	0.02	0.00	0.24	0.17	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.13	0.01	0.17	0.13	0.26	0.16	0.14
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.14	0.09	0.23	0.05	0.23	0.08	0.06	0.21	0.00	0.04	0.15	0.06	0.15	0.31	0.18	0.19
O3'	0.11	0.08	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.06	0.05	0.08	0.13	0.04	0.00	0.06	0.07	0.08	0.34	0.07	0.13
O4	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.06	0.00	0.02	0.22	0.25	0.30	0.25
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.17	0.06	0.07	0.02	0.00	0.08	0.16	0.15	0.08
O5'	0.06	0.14	0.16	0.09	0.20	0.02	0.18	0.01	0.14	0.11	0.18	0.13	0.15	0.08	0.22	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.22	0.26	0.25	0.21	0.17	0.15	0.10	0.14	0.17	0.25	0.26	0.31	0.34	0.25	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.16	0.17	0.07	0.25	0.12	0.24	0.16	0.17	0.11	0.21	0.16	0.18	0.07	0.30	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.15	0.18	0.10	0.21	0.04	0.18	0.01	0.13	0.10	0.20	0.14	0.19	0.13	0.25	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.07	0.07	0.12	0.08	0.25	0.13	0.35	0.15	0.09	0.07	0.11	0.12	0.10	0.08	0.23	0.61	0.50	1.02	0.75
C2	0.10	0.08	0.06	0.11	0.08	0.23	0.11	0.30	0.13	0.09	0.08	0.11	0.11	0.11	0.08	0.22	0.49	0.37	0.77	0.56
C2'	0.28	0.23	0.21	0.34	0.30	0.46	0.36	0.58	0.37	0.29	0.24	0.17	0.11	0.31	0.30	0.42	0.89	0.77	1.33	1.05
C3'	0.34	0.25	0.23	0.39	0.37	0.56	0.47	0.74	0.47	0.36	0.28	0.16	0.11	0.33	0.36	0.53	1.04	1.01	1.59	1.26
C4	0.11	0.11	0.10	0.13	0.11	0.10	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.21	0.11	0.12	0.14	0.16	0.38	0.16
C4'	0.13	0.10	0.09	0.19	0.12	0.35	0.22	0.53	0.24	0.13	0.09	0.18	0.16	0.15	0.12	0.31	0.80	0.80	1.36	1.03
C5	0.11	0.10	0.10	0.11	0.12	0.09	0.13	0.10	0.13	0.11	0.11	0.10	0.12	0.18	0.12	0.13	0.18	0.12	0.50	0.22
C5'	0.14	0.11	0.09	0.18	0.16	0.35	0.27	0.55	0.27	0.15	0.11	0.21	0.18	0.14	0.16	0.32	0.81	0.85	1.42	1.05
C6	0.10	0.08	0.08	0.07	0.10	0.12	0.13	0.15	0.13	0.10	0.09	0.08	0.11	0.11	0.10	0.17	0.34	0.20	0.71	0.41
N1	0.10	0.07	0.07	0.09	0.09	0.20	0.13	0.27	0.14	0.09	0.07	0.09	0.11	0.08	0.08	0.21	0.48	0.36	0.84	0.57
N3	0.10	0.09	0.07	0.09	0.08	0.14	0.10	0.17	0.11	0.09	0.08	0.11	0.11	0.15	0.08	0.17	0.30	0.21	0.52	0.33
O2	0.12	0.10	0.08	0.19	0.08	0.32	0.12	0.42	0.14	0.10	0.09	0.15	0.13	0.21	0.08	0.25	0.63	0.53	0.87	0.71
O2'	0.20	0.17	0.15	0.24	0.21	0.33	0.25	0.43	0.25	0.21	0.18	0.14	0.09	0.23	0.21	0.30	0.75	0.61	1.16	0.91
O3'	0.29	0.20	0.18	0.35	0.32	0.53	0.43	0.74	0.43	0.31	0.22	0.13	0.11	0.29	0.32	0.49	1.05	1.08	1.64	1.33
O4	0.12	0.15	0.13	0.21	0.13	0.20	0.12	0.26	0.12	0.13	0.14	0.17	0.14	0.29	0.13	0.10	0.18	0.31	0.17	0.19
O4'	0.09	0.18	0.16	0.09	0.10	0.20	0.08	0.33	0.09	0.09	0.17	0.26	0.25	0.09	0.11	0.17	0.58	0.54	1.06	0.75
O5'	0.30	0.22	0.17	0.30	0.36	0.47	0.47	0.65	0.46	0.33	0.25	0.15	0.10	0.23	0.36	0.48	0.89	0.90	1.48	1.10
OP1	0.48	0.44	0.34	0.49	0.65	0.64	0.77	0.85	0.74	0.56	0.50	0.29	0.18	0.39	0.67	0.66	1.09	1.19	1.77	1.35
OP2	0.32	0.27	0.20	0.30	0.44	0.46	0.56	0.64	0.53	0.37	0.31	0.22	0.16	0.21	0.45	0.49	0.82	0.90	1.42	1.03
P	0.35	0.27	0.21	0.35	0.46	0.52	0.59	0.72	0.57	0.40	0.32	0.17	0.09	0.26	0.48	0.54	0.94	1.01	1.58	1.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.04	0.14	0.13
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.18	0.04	0.33	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.04	0.09	0.07
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.05	0.09	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.00	0.01	0.29	0.07	0.55	0.33
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.01	0.02	0.33	0.09	0.58	0.37
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.02	0.31	0.08	0.45	0.32
N1	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.21	0.05	0.31	0.22
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.23	0.05	0.44	0.26
O2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.02	0.12	0.05	0.25	0.14
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.08	0.00	0.03	0.05	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.10	0.03	0.05	0.11	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.07	0.08
O4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.30	0.08	0.61	0.35
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.12	0.05	0.07	0.12
O5'	0.13	0.18	0.07	0.04	0.29	0.01	0.33	0.00	0.31	0.21	0.23	0.12	0.03	0.09	0.30	0.12	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.04	0.04	0.04	0.04	0.07	0.03	0.09	0.04	0.08	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.33	0.09	0.06	0.55	0.06	0.58	0.08	0.45	0.31	0.44	0.25	0.05	0.07	0.61	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.20	0.07	0.04	0.33	0.01	0.37	0.01	0.32	0.22	0.26	0.14	0.03	0.08	0.35	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00