Doublet Group distance statistics: 53427

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C6	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C1'	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N1	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O4	A	0, 0.000, 0.054, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.054 std_dev=0.054
O2	A	0, 0.000, 0.078, 0.156, 0.156 max_d=0.156 avg_d=0.078 std_dev=0.078
O3'	A	0, 0.000, 0.368, 0.736, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.368 std_dev=0.368
C2'	B	0, 0.000, 0.407, 0.814, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.407 std_dev=0.407
O2	B	0, 0.000, 0.607, 1.214, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C3'	A	0, 0.000, 0.607, 1.215, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.607 std_dev=0.607
C1'	B	0, 0.000, 0.691, 1.382, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.691 std_dev=0.691
O2'	B	0, 0.000, 0.695, 1.390, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.695 std_dev=0.695
C2	B	0, 0.000, 0.742, 1.484, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.742 std_dev=0.742
C2'	A	0, 0.000, 0.772, 1.544, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.772 std_dev=0.772
N1	B	0, 0.000, 0.782, 1.564, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.782 std_dev=0.782
O4'	A	0, 0.000, 0.805, 1.611, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.805 std_dev=0.805
C4'	A	0, 0.000, 0.893, 1.786, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.893 std_dev=0.893
N3	B	0, 0.000, 1.022, 2.043, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.022 std_dev=1.022
C3'	B	0, 0.000, 1.035, 2.070, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.035 std_dev=1.035
C6	B	0, 0.000, 1.071, 2.141, 2.141 max_d=2.141 avg_d=1.071 std_dev=1.071
O4'	B	0, 0.000, 1.139, 2.277, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.139 std_dev=1.139
C4'	B	0, 0.000, 1.149, 2.298, 2.298 max_d=2.298 avg_d=1.149 std_dev=1.149
C5'	B	0, 0.000, 1.270, 2.540, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.270 std_dev=1.270
O5'	A	0, 0.000, 1.280, 2.560, 2.560 max_d=2.560 avg_d=1.280 std_dev=1.280
C4	B	0, 0.000, 1.333, 2.666, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.333 std_dev=1.333
C5	B	0, 0.000, 1.334, 2.668, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.334 std_dev=1.334
O2'	A	0, 0.000, 1.335, 2.671, 2.671 max_d=2.671 avg_d=1.335 std_dev=1.335
O3'	B	0, 0.000, 1.503, 3.005, 3.005 max_d=3.005 avg_d=1.503 std_dev=1.503
O4	B	0, 0.000, 1.636, 3.272, 3.272 max_d=3.272 avg_d=1.636 std_dev=1.636
OP2	A	0, 0.000, 1.728, 3.456, 3.456 max_d=3.456 avg_d=1.728 std_dev=1.728
C5'	A	0, 0.000, 1.769, 3.539, 3.539 max_d=3.539 avg_d=1.769 std_dev=1.769
P	A	0, 0.000, 2.106, 4.212, 4.212 max_d=4.212 avg_d=2.106 std_dev=2.106
O5'	B	0, 0.000, 2.277, 4.553, 4.553 max_d=4.553 avg_d=2.277 std_dev=2.277
OP1	A	0, 0.000, 2.814, 5.629, 5.629 max_d=5.629 avg_d=2.814 std_dev=2.814
P	B	0, 0.000, 3.224, 6.449, 6.449 max_d=6.449 avg_d=3.224 std_dev=3.224
OP2	B	0, 0.000, 3.807, 7.614, 7.614 max_d=7.614 avg_d=3.807 std_dev=3.807
OP1	B	0, 0.000, 3.967, 7.934, 7.934 max_d=7.934 avg_d=3.967 std_dev=3.967

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.05	0.01	0.00	0.09	0.60	0.12	0.24
C2	0.03	0.00	0.13	0.07	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00	0.04	0.01	1.18	0.08	0.55
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.18	0.01	0.19	0.02	0.06	0.27	0.00	0.02	0.05	0.00	0.35	0.14	0.48	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.05	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00	0.30	0.24	0.40	0.16
C4	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.06	0.02	1.48	0.08	0.57
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08
C5	0.02	0.01	0.18	0.11	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.07	0.01	0.10	0.07	1.34	0.08	0.40
C5'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.10	0.14	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.25	0.09	0.00
C6	0.03	0.01	0.19	0.12	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.18	0.07	0.02	0.11	0.13	1.08	0.18	0.29
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.01	0.07	0.99	0.07	0.38
N3	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	1.40	0.14	0.63
O2	0.07	0.00	0.27	0.14	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.07	0.01	0.11	0.03	1.08	0.12	0.56
O2'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.18	0.05	0.00	0.25	0.00	0.01	0.11	0.01	0.37	0.10	0.59	0.11
O3'	0.05	0.06	0.02	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.07	0.06	0.06	0.07	0.01	0.00	0.06	0.05	0.22	0.31	0.37	0.17
O4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.06	0.05	1.58	0.14	0.62
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.11	0.01	0.00	0.11	0.01	0.05	0.06	0.00	0.12	0.60	0.13	0.35
O5'	0.09	0.01	0.35	0.30	0.02	0.01	0.07	0.00	0.13	0.07	0.04	0.03	0.37	0.22	0.05	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.60	1.18	0.14	0.24	1.48	0.00	1.34	0.25	1.08	0.99	1.40	1.08	0.10	0.31	1.58	0.60	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.08	0.48	0.40	0.08	0.02	0.08	0.09	0.18	0.07	0.14	0.12	0.59	0.37	0.14	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.55	0.06	0.16	0.57	0.08	0.40	0.00	0.29	0.38	0.63	0.56	0.11	0.17	0.62	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.13	0.05	0.26	0.47	0.24	0.32	0.24	0.14	0.02	0.38	0.02	0.26	0.60	0.63	0.23	0.06	0.39	0.40	0.09
C2	0.16	0.21	0.06	0.26	0.45	0.22	0.29	0.24	0.13	0.05	0.43	0.12	0.30	0.56	0.56	0.19	0.08	0.32	0.33	0.10
C2'	0.33	0.09	0.21	0.36	0.17	0.34	0.04	0.37	0.11	0.19	0.11	0.19	0.43	0.60	0.32	0.35	0.04	0.42	0.28	0.00
C3'	0.25	0.03	0.15	0.33	0.37	0.30	0.22	0.31	0.04	0.06	0.27	0.09	0.39	0.63	0.55	0.28	0.04	0.38	0.40	0.08
C4	0.27	0.11	0.09	0.47	0.21	0.41	0.06	0.42	0.06	0.08	0.25	0.15	0.01	0.82	0.29	0.39	0.25	0.82	0.26	0.38
C4'	0.12	0.26	0.06	0.32	0.65	0.25	0.48	0.24	0.25	0.13	0.55	0.11	0.28	0.72	0.86	0.17	0.07	0.43	0.41	0.10
C5	0.31	0.03	0.11	0.49	0.18	0.46	0.04	0.47	0.10	0.13	0.20	0.03	0.00	0.86	0.28	0.45	0.34	0.97	0.32	0.47
C5'	0.15	0.29	0.15	0.47	0.65	0.33	0.44	0.34	0.21	0.11	0.58	0.19	0.34	0.88	0.87	0.21	0.04	0.58	0.19	0.05
C6	0.30	0.03	0.11	0.44	0.24	0.42	0.10	0.42	0.05	0.11	0.23	0.03	0.12	0.80	0.37	0.41	0.23	0.82	0.10	0.32
N1	0.22	0.11	0.09	0.33	0.38	0.30	0.23	0.31	0.06	0.03	0.34	0.01	0.24	0.67	0.51	0.29	0.04	0.52	0.20	0.05
N3	0.18	0.22	0.06	0.33	0.35	0.27	0.20	0.30	0.06	0.03	0.38	0.21	0.20	0.63	0.44	0.24	0.02	0.47	0.09	0.07
O2	0.09	0.28	0.05	0.16	0.58	0.12	0.42	0.15	0.23	0.13	0.54	0.14	0.43	0.42	0.71	0.08	0.26	0.05	0.60	0.33
O2'	0.38	0.28	0.19	0.25	0.06	0.30	0.13	0.35	0.23	0.31	0.13	0.37	0.45	0.40	0.05	0.38	0.02	0.28	0.41	0.09
O3'	0.15	0.07	0.01	0.15	0.45	0.16	0.35	0.15	0.16	0.03	0.31	0.10	0.30	0.44	0.63	0.17	0.21	0.16	0.70	0.31
O4	0.26	0.11	0.08	0.53	0.14	0.46	0.00	0.48	0.11	0.09	0.20	0.20	0.20	0.91	0.20	0.42	0.36	0.96	0.49	0.54
O4'	0.07	0.33	0.01	0.29	0.72	0.22	0.54	0.20	0.31	0.19	0.63	0.18	0.20	0.71	0.92	0.14	0.09	0.45	0.40	0.10
O5'	0.18	0.25	0.11	0.48	0.58	0.38	0.38	0.38	0.16	0.07	0.52	0.17	0.22	0.88	0.77	0.28	0.13	0.75	0.00	0.21
OP1	1.61	0.98	1.58	2.04	0.54	1.94	0.84	1.94	1.15	1.25	0.60	1.05	1.63	2.47	0.24	1.76	1.68	2.37	1.61	1.80
OP2	0.33	0.15	0.27	0.71	0.43	0.60	0.21	0.62	0.01	0.07	0.41	0.12	0.30	1.07	0.63	0.47	0.38	1.08	0.45	0.55
P	0.76	0.24	0.75	1.16	0.08	1.03	0.17	1.05	0.41	0.48	0.05	0.29	0.81	1.56	0.31	0.88	0.79	1.45	0.77	0.91

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.21	0.00	0.00	0.09	0.19	0.23	0.12
C2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.01	0.03	0.10	0.15	0.56	0.23
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.16	0.06	0.02	0.11	0.19	0.00	0.02	0.05	0.02	0.14	0.09	0.09	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.01	0.13	0.10	0.14	0.07	0.00	0.00	0.17	0.01	0.31	0.00	0.03	0.16
C4	0.01	0.00	0.05	0.16	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.01	0.03	0.13	0.09	0.91	0.42
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.04	0.01	0.00	0.00	0.27	0.25	0.11
C5	0.00	0.00	0.03	0.16	0.01	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.03	0.01	0.00	0.17	0.23	0.97	0.51
C5'	0.05	0.06	0.16	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.09	0.07	0.08	0.03	0.03	0.11	0.12	0.01	0.01	0.10	0.32	0.02
C6	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.01	0.02	0.19	0.17	0.79	0.45
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.01	0.14	0.05	0.54	0.28
N3	0.02	0.00	0.11	0.14	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.11	0.07	0.74	0.31
O2	0.04	0.00	0.19	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.20	0.01	0.03	0.08	0.28	0.42	0.14
O2'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.12	0.14	0.18	0.03	0.18	0.08	0.03	0.15	0.00	0.06	0.12	0.08	0.19	0.05	0.07	0.13
O3'	0.21	0.13	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.11	0.00	0.10	0.07	0.20	0.06	0.00	0.01	0.18	0.29	0.09	0.04	0.09
O4	0.00	0.01	0.05	0.17	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.12	0.12	1.00	0.44
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.18	0.04	0.00	0.01	0.27	0.08	0.03
O5'	0.09	0.10	0.14	0.31	0.13	0.00	0.17	0.01	0.19	0.14	0.11	0.08	0.19	0.29	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.19	0.15	0.09	0.00	0.09	0.27	0.23	0.10	0.17	0.05	0.07	0.28	0.05	0.09	0.12	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.56	0.09	0.03	0.91	0.25	0.97	0.32	0.79	0.54	0.74	0.42	0.07	0.04	1.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.23	0.09	0.16	0.42	0.11	0.51	0.02	0.45	0.28	0.31	0.14	0.13	0.09	0.44	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00