Doublet Group distance statistics: 53431

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 0, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.020, 0.042, 0.065, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.042 std_dev=0.023
C2'	A	0, 0.015, 0.073, 0.132, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.073 std_dev=0.058
O3'	A	0, 0.028, 0.088, 0.148, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.088 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.015, 0.082, 0.149, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.082 std_dev=0.067
C3'	A	0, 0.024, 0.093, 0.163, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.093 std_dev=0.069
C4'	A	0, 0.019, 0.107, 0.196, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.107 std_dev=0.089
O2'	A	0, 0.029, 0.121, 0.214, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.121 std_dev=0.093
OP1	B	0, 0.114, 0.237, 0.360, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.237 std_dev=0.123
O5'	A	0, 0.126, 0.251, 0.377, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.251 std_dev=0.125
C5'	A	0, 0.042, 0.180, 0.317, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.180 std_dev=0.137
P	B	0, 0.115, 0.254, 0.393, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.254 std_dev=0.139
P	A	0, 0.198, 0.341, 0.483, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.341 std_dev=0.142
C5'	B	0, 0.104, 0.251, 0.397, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.251 std_dev=0.147
OP2	B	0, 0.128, 0.290, 0.451, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.290 std_dev=0.162
O3'	B	0, 0.039, 0.210, 0.380, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.210 std_dev=0.170
O5'	B	0, 0.119, 0.293, 0.468, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.293 std_dev=0.174
C4'	B	0, 0.102, 0.277, 0.453, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.277 std_dev=0.176
C3'	B	0, 0.077, 0.266, 0.455, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.266 std_dev=0.189
OP2	A	0, 0.268, 0.471, 0.675, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.471 std_dev=0.204
OP1	A	0, 0.137, 0.341, 0.545, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.341 std_dev=0.204
C6	B	0, 0.177, 0.386, 0.594, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.386 std_dev=0.209
O4'	B	0, 0.134, 0.352, 0.570, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.352 std_dev=0.218
O2'	B	0, 0.067, 0.295, 0.522, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.295 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.203, 0.433, 0.664, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.433 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.053, 0.292, 0.530, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.292 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.095, 0.341, 0.588, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.341 std_dev=0.246
N1	B	0, 0.119, 0.385, 0.650, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.385 std_dev=0.265
C4	B	0, 0.189, 0.487, 0.785, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.487 std_dev=0.298
N4	B	0, 0.225, 0.542, 0.858, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.542 std_dev=0.317
C2	B	0, 0.133, 0.480, 0.828, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.480 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.165, 0.523, 0.881, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.523 std_dev=0.358
O2	B	0, 0.167, 0.570, 0.974, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.570 std_dev=0.404

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.10	0.17	0.09
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.10	0.10	0.25	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.15	0.18	0.11
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.14	0.11	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.13	0.11	0.31	0.16
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.14	0.12	0.31	0.16
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.05	0.06	0.04	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.07	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.12	0.11	0.28	0.14
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.10	0.10	0.24	0.12
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.12	0.11	0.28	0.14
O2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.00	0.02	0.08	0.11	0.23	0.11
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.03	0.06	0.01	0.07	0.18	0.20	0.13
O3'	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.13	0.09	0.06
O4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.02	0.00	0.02	0.14	0.12	0.32	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.07	0.13	0.06
O5'	0.06	0.10	0.07	0.03	0.13	0.01	0.14	0.01	0.12	0.10	0.12	0.08	0.07	0.03	0.14	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.10	0.15	0.14	0.11	0.07	0.12	0.07	0.11	0.10	0.11	0.11	0.18	0.13	0.12	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.25	0.18	0.11	0.31	0.07	0.31	0.04	0.28	0.24	0.28	0.23	0.20	0.09	0.32	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.11	0.07	0.16	0.03	0.16	0.02	0.14	0.12	0.14	0.11	0.13	0.06	0.17	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.08	0.10	0.09	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.13	0.10	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06
C2	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.13	0.08	0.06	0.06	0.10	0.08	0.07
C2'	0.12	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.17	0.13	0.11	0.10	0.08	0.07	0.07
C3'	0.14	0.14	0.15	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.18	0.14	0.14	0.13	0.13	0.11	0.12
C4	0.06	0.07	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.10	0.05	0.06	0.08	0.11	0.09	0.09
C4'	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.11	0.13	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.11	0.15	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11
C5	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.10	0.05	0.07	0.08	0.10	0.08	0.08
C5'	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.13	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.11
C6	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.10	0.05	0.06	0.06	0.09	0.07	0.07
N1	0.06	0.06	0.08	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.12	0.07	0.05	0.05	0.08	0.07	0.07
N3	0.06	0.07	0.08	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.12	0.05	0.06	0.07	0.11	0.09	0.09
O2	0.10	0.10	0.12	0.11	0.09	0.10	0.08	0.07	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.15	0.12	0.09	0.07	0.10	0.08	0.08
O2'	0.15	0.14	0.17	0.17	0.13	0.16	0.13	0.15	0.13	0.14	0.14	0.13	0.15	0.20	0.17	0.14	0.12	0.06	0.06	0.07
O3'	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.15	0.18	0.13	0.15	0.15	0.15	0.14	0.14
O4	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.09	0.10	0.06	0.07	0.09	0.11	0.09	0.09
O4'	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08	0.13	0.09	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07
O5'	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.15	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12
OP1	0.21	0.21	0.20	0.19	0.21	0.20	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.21	0.22	0.16	0.21	0.21	0.19	0.20	0.21
OP2	0.31	0.30	0.31	0.30	0.29	0.30	0.29	0.28	0.29	0.30	0.30	0.29	0.31	0.34	0.30	0.30	0.26	0.21	0.22	0.23
P	0.19	0.19	0.19	0.18	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.19	0.18	0.19	0.22	0.17	0.19	0.18	0.16	0.16	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02
C2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.04	0.04
C4	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.06
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.07	0.06
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.04
N1	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03
N3	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.05
N4	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.07	0.09	0.07
O2	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03
O5'	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.02	0.04	0.04	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.06	0.05	0.04	0.08	0.02	0.07	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.06	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00