Doublet Group distance statistics: 53437

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 7, 1, 0, 2, 5, 2, 3, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.014, 0.028, 0.041, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.018, 0.041, 0.065, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.041 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.018, 0.050, 0.083, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.050 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.026, 0.060, 0.093, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.060 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.023, 0.072, 0.122, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.072 std_dev=0.050
C8	A	0, 0.027, 0.088, 0.148, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.088 std_dev=0.060
N3	B	0, 0.204, 0.432, 0.661, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.432 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.210, 0.476, 0.741, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.476 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.162, 0.472, 0.782, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.472 std_dev=0.310
N9	B	0, 0.203, 0.513, 0.823, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.513 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.169, 0.485, 0.800, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.485 std_dev=0.315
C2	B	0, 0.264, 0.584, 0.904, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.584 std_dev=0.320
C5	B	0, 0.240, 0.588, 0.936, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.588 std_dev=0.348
C1'	B	0, 0.196, 0.562, 0.928, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.562 std_dev=0.366
O3'	B	0, 0.193, 0.571, 0.950, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.571 std_dev=0.378
N2	B	0, 0.285, 0.665, 1.045, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.665 std_dev=0.380
C8	B	0, 0.225, 0.606, 0.986, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.606 std_dev=0.380
N7	B	0, 0.244, 0.631, 1.017, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.631 std_dev=0.386
O2'	B	0, 0.198, 0.608, 1.018, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.608 std_dev=0.410
N1	B	0, 0.302, 0.729, 1.156, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.729 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.292, 0.727, 1.162, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.727 std_dev=0.435
C4'	B	0, 0.243, 0.689, 1.135, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.689 std_dev=0.446
O5'	B	0, 0.266, 0.713, 1.160, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.713 std_dev=0.447
C5'	B	0, 0.295, 0.776, 1.257, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.776 std_dev=0.481
O4'	B	0, 0.235, 0.716, 1.197, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.716 std_dev=0.481
O6	B	0, 0.340, 0.883, 1.426, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.883 std_dev=0.543
OP1	B	0, 0.234, 0.797, 1.360, 3.540 max_d=3.540 avg_d=0.797 std_dev=0.563
P	B	0, 0.244, 0.831, 1.419, 3.557 max_d=3.557 avg_d=0.831 std_dev=0.587
O2'	A	0, 0.139, 0.757, 1.375, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.757 std_dev=0.618
C2'	A	0, 0.098, 0.725, 1.351, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.725 std_dev=0.627
O4'	A	0, 0.090, 0.735, 1.381, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.735 std_dev=0.645
OP2	B	0, 0.193, 0.894, 1.594, 4.345 max_d=4.345 avg_d=0.894 std_dev=0.701
C4'	A	0, 0.131, 1.114, 2.096, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.114 std_dev=0.982
C3'	A	0, 0.162, 1.183, 2.205, 2.338 max_d=2.338 avg_d=1.183 std_dev=1.022
O3'	A	0, 0.254, 1.749, 3.244, 3.431 max_d=3.431 avg_d=1.749 std_dev=1.495
OP1	A	0, 0.402, 1.965, 3.528, 3.851 max_d=3.851 avg_d=1.965 std_dev=1.563
C5'	A	0, 0.211, 1.807, 3.403, 3.638 max_d=3.638 avg_d=1.807 std_dev=1.596
O5'	A	0, 0.210, 1.858, 3.507, 3.744 max_d=3.744 avg_d=1.858 std_dev=1.649
P	A	0, 0.384, 2.041, 3.699, 3.976 max_d=3.976 avg_d=2.041 std_dev=1.657
OP2	A	0, 0.615, 2.338, 4.061, 4.367 max_d=4.367 avg_d=2.338 std_dev=1.723

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.33	0.17	0.09
C2	0.03	0.00	0.36	0.18	0.01	0.22	0.01	0.43	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.36	0.29	0.39	0.46	0.53	0.48	0.40
C2'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.21	0.01	0.15	0.01	0.23	0.11	0.31	0.34	0.20	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.58	0.26	0.23
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.13	0.00	0.13	0.01	0.16	0.06	0.18	0.16	0.15	0.09	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.62	0.22	0.26
C4	0.01	0.01	0.21	0.13	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.19	0.21	0.28	0.43	0.34	0.25
C4'	0.01	0.22	0.01	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.13	0.12	0.19	0.19	0.12	0.07	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.24	0.08	0.06
C5	0.01	0.01	0.15	0.13	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.19	0.13	0.26	0.41	0.35	0.24
C5'	0.02	0.43	0.01	0.01	0.23	0.01	0.19	0.00	0.30	0.17	0.40	0.36	0.29	0.10	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.23	0.16	0.01	0.13	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.23	0.36	0.47	0.44	0.34
C8	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.12	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.18	0.17	0.27	0.17	0.16
N1	0.02	0.01	0.31	0.18	0.01	0.19	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.29	0.33	0.45	0.52	0.49	0.40
N3	0.02	0.01	0.34	0.16	0.00	0.19	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.24	0.36	0.39	0.48	0.41	0.33
N6	0.02	0.01	0.20	0.15	0.01	0.12	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.26	0.19	0.35	0.46	0.45	0.34
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.06	0.14	0.32	0.24	0.17
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.12	0.35	0.22	0.13
O2'	0.03	0.36	0.00	0.02	0.18	0.04	0.12	0.05	0.21	0.12	0.31	0.33	0.18	0.04	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.51	0.21	0.18
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.19	0.03	0.19	0.02	0.25	0.06	0.29	0.24	0.26	0.12	0.08	0.05	0.00	0.03	0.07	0.71	0.20	0.31
O4'	0.00	0.39	0.01	0.02	0.21	0.00	0.13	0.01	0.23	0.18	0.33	0.36	0.19	0.06	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.11	0.08	0.10
O5'	0.07	0.46	0.05	0.03	0.28	0.01	0.26	0.01	0.36	0.17	0.45	0.39	0.35	0.14	0.12	0.03	0.07	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.33	0.53	0.58	0.62	0.43	0.24	0.41	0.05	0.47	0.27	0.52	0.48	0.46	0.32	0.35	0.51	0.71	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.48	0.26	0.22	0.34	0.08	0.35	0.02	0.44	0.17	0.49	0.41	0.45	0.24	0.22	0.21	0.20	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.40	0.23	0.26	0.25	0.06	0.24	0.02	0.34	0.16	0.40	0.33	0.34	0.17	0.13	0.18	0.31	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.13	0.09	0.06	0.16	0.14	0.15	0.13	0.13	0.19	0.13	0.16	0.14	0.17	0.19	0.08	0.10	0.24	0.10	0.13	0.08	0.11	0.08
C2	0.12	0.12	0.07	0.07	0.12	0.09	0.13	0.09	0.14	0.12	0.14	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.10	0.13	0.16	0.16	0.15	0.10	0.13
C2'	0.15	0.36	0.11	0.10	0.23	0.15	0.25	0.15	0.31	0.16	0.36	0.43	0.29	0.20	0.16	0.11	0.08	0.17	0.10	0.31	0.10	0.10	0.08
C3'	0.18	0.18	0.20	0.20	0.15	0.19	0.14	0.18	0.14	0.17	0.16	0.23	0.16	0.16	0.17	0.19	0.21	0.20	0.12	0.13	0.12	0.11	0.11
C4	0.15	0.13	0.06	0.05	0.12	0.10	0.12	0.10	0.13	0.13	0.14	0.15	0.12	0.12	0.14	0.08	0.10	0.18	0.10	0.14	0.09	0.08	0.07
C4'	0.24	0.27	0.23	0.17	0.30	0.14	0.34	0.13	0.35	0.33	0.31	0.21	0.26	0.35	0.29	0.15	0.11	0.19	0.11	0.37	0.11	0.18	0.10
C5	0.16	0.13	0.06	0.05	0.12	0.11	0.12	0.11	0.13	0.13	0.14	0.14	0.12	0.12	0.14	0.08	0.10	0.19	0.10	0.15	0.09	0.09	0.07
C5'	0.24	0.41	0.25	0.19	0.39	0.17	0.47	0.16	0.52	0.39	0.49	0.36	0.35	0.46	0.34	0.17	0.14	0.19	0.09	0.57	0.15	0.20	0.10
C6	0.14	0.12	0.06	0.05	0.12	0.10	0.12	0.09	0.14	0.12	0.15	0.13	0.12	0.12	0.12	0.09	0.09	0.16	0.12	0.16	0.10	0.08	0.08
C8	0.22	0.13	0.09	0.07	0.14	0.16	0.13	0.16	0.13	0.18	0.14	0.16	0.13	0.15	0.18	0.09	0.10	0.26	0.10	0.13	0.09	0.14	0.10
N1	0.12	0.12	0.06	0.06	0.12	0.09	0.13	0.09	0.15	0.12	0.15	0.12	0.11	0.13	0.12	0.11	0.09	0.14	0.15	0.17	0.13	0.10	0.11
N3	0.12	0.12	0.06	0.06	0.12	0.09	0.12	0.08	0.13	0.12	0.14	0.13	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.14	0.14	0.14	0.13	0.08	0.10
N6	0.14	0.12	0.06	0.05	0.12	0.10	0.12	0.10	0.15	0.12	0.15	0.13	0.12	0.12	0.12	0.08	0.09	0.16	0.11	0.17	0.09	0.08	0.07
N7	0.19	0.13	0.08	0.06	0.13	0.14	0.12	0.14	0.13	0.16	0.14	0.15	0.13	0.13	0.16	0.08	0.10	0.23	0.09	0.14	0.09	0.12	0.08
N9	0.20	0.13	0.08	0.06	0.14	0.14	0.13	0.13	0.13	0.17	0.14	0.16	0.13	0.14	0.17	0.08	0.10	0.23	0.10	0.13	0.08	0.11	0.08
O2'	0.16	0.46	0.14	0.10	0.33	0.14	0.34	0.15	0.39	0.22	0.44	0.50	0.41	0.27	0.23	0.09	0.08	0.17	0.10	0.39	0.10	0.12	0.09
O3'	0.20	0.20	0.29	0.34	0.16	0.26	0.15	0.27	0.15	0.19	0.17	0.26	0.19	0.17	0.18	0.30	0.45	0.23	0.19	0.14	0.24	0.16	0.19
O4'	0.32	0.39	0.20	0.11	0.41	0.14	0.43	0.12	0.44	0.40	0.42	0.34	0.39	0.43	0.38	0.10	0.09	0.27	0.15	0.46	0.11	0.21	0.14
O5'	0.23	0.39	0.23	0.17	0.36	0.16	0.42	0.15	0.47	0.35	0.45	0.36	0.33	0.41	0.31	0.16	0.12	0.18	0.09	0.52	0.14	0.21	0.10
OP1	0.47	0.47	0.47	0.40	0.51	0.36	0.55	0.32	0.55	0.54	0.51	0.41	0.46	0.57	0.51	0.42	0.33	0.41	0.29	0.58	0.18	0.32	0.25
OP2	0.30	0.36	0.29	0.24	0.36	0.21	0.40	0.19	0.43	0.38	0.41	0.34	0.33	0.41	0.34	0.23	0.18	0.26	0.17	0.46	0.13	0.24	0.15
P	0.29	0.33	0.29	0.23	0.35	0.20	0.40	0.18	0.42	0.38	0.38	0.28	0.31	0.42	0.34	0.22	0.18	0.25	0.15	0.46	0.13	0.23	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.01	0.15	0.08	0.11
C2	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.14	0.02	0.21	0.01	0.22	0.17	0.19
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.15	0.12	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.12	0.12	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.12	0.06	0.14	0.10	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.12	0.17	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.01	0.26	0.01	0.25	0.20	0.23
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.02	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.09	0.12	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.34	0.01	0.34	0.32	0.33
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.10	0.04	0.06	0.04	0.11	0.04	0.05	0.03	0.01	0.01	0.09	0.14	0.12	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.34	0.01	0.34	0.33	0.33
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.14	0.02	0.38	0.02	0.38	0.33	0.36
N1	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02	0.27	0.01	0.28	0.25	0.26
N2	0.03	0.01	0.15	0.14	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.03	0.18	0.02	0.20	0.15	0.15
N3	0.02	0.00	0.12	0.10	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.13	0.02	0.19	0.01	0.20	0.14	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.41	0.02	0.42	0.41	0.41
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.26	0.01	0.25	0.19	0.23
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.12	0.21	0.16	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.06	0.08	0.17	0.07
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.14	0.08	0.20	0.13	0.14	0.04	0.05	0.00	0.02	0.12	0.07	0.13	0.30	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.03	0.16	0.07	0.11
O5'	0.14	0.21	0.06	0.04	0.26	0.02	0.34	0.01	0.34	0.38	0.27	0.18	0.19	0.41	0.26	0.05	0.12	0.13	0.00	0.38	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.03	0.38	0.00	0.40	0.40	0.39
OP1	0.15	0.22	0.12	0.12	0.25	0.09	0.34	0.14	0.34	0.38	0.28	0.20	0.20	0.42	0.25	0.08	0.13	0.16	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.17	0.12	0.17	0.20	0.12	0.32	0.12	0.33	0.33	0.25	0.15	0.14	0.41	0.19	0.17	0.30	0.07	0.02	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.19	0.05	0.05	0.23	0.02	0.33	0.01	0.33	0.36	0.26	0.15	0.16	0.41	0.23	0.07	0.16	0.11	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00