Doublet Group distance statistics: 53438

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 8, 4, 8, 6, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.005, 0.032, 0.058, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.032 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.008, 0.036, 0.063, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.036 std_dev=0.027
O2'	B	0, 0.094, 0.206, 0.318, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.206 std_dev=0.112
N3	B	0, 0.177, 0.290, 0.403, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.290 std_dev=0.113
C2'	B	0, 0.110, 0.238, 0.365, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.238 std_dev=0.128
N2	B	0, 0.200, 0.329, 0.457, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.329 std_dev=0.129
C2	B	0, 0.182, 0.316, 0.450, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.316 std_dev=0.134
C4	B	0, 0.183, 0.330, 0.477, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.330 std_dev=0.147
N9	B	0, 0.184, 0.345, 0.506, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.345 std_dev=0.161
N1	B	0, 0.222, 0.388, 0.555, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.388 std_dev=0.167
C1'	B	0, 0.148, 0.318, 0.488, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.318 std_dev=0.170
C5	B	0, 0.246, 0.423, 0.600, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.423 std_dev=0.177
C6	B	0, 0.281, 0.465, 0.650, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.465 std_dev=0.185
C8	B	0, 0.249, 0.436, 0.622, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.436 std_dev=0.187
C3'	B	0, 0.177, 0.371, 0.564, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.371 std_dev=0.194
N7	B	0, 0.292, 0.490, 0.689, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.490 std_dev=0.198
O6	B	0, 0.370, 0.582, 0.794, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.582 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.227, 0.451, 0.674, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.451 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.196, 0.424, 0.651, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.424 std_dev=0.227
O3'	B	0, 0.148, 0.390, 0.631, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.390 std_dev=0.242
OP2	B	0, 0.342, 0.649, 0.955, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.649 std_dev=0.307
C5'	B	0, 0.274, 0.582, 0.890, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.582 std_dev=0.308
O5'	B	0, 0.305, 0.647, 0.990, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.647 std_dev=0.342
P	B	0, 0.292, 0.688, 1.085, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.688 std_dev=0.397
O4'	A	0, 0.124, 0.612, 1.100, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.612 std_dev=0.488
OP1	B	0, 0.311, 0.810, 1.309, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.810 std_dev=0.499
C2'	A	0, 0.145, 0.671, 1.197, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.671 std_dev=0.526
O5'	A	0, 0.544, 1.200, 1.856, 2.108 max_d=2.108 avg_d=1.200 std_dev=0.656
OP1	A	0, 0.612, 1.325, 2.039, 2.324 max_d=2.324 avg_d=1.325 std_dev=0.714
C4'	A	0, 0.201, 1.008, 1.814, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.008 std_dev=0.807
O2'	A	0, 0.240, 1.056, 1.872, 2.003 max_d=2.003 avg_d=1.056 std_dev=0.816
C3'	A	0, 0.230, 1.070, 1.910, 2.001 max_d=2.001 avg_d=1.070 std_dev=0.840
P	A	0, 0.459, 1.349, 2.238, 2.566 max_d=2.566 avg_d=1.349 std_dev=0.889
C5'	A	0, 0.335, 1.324, 2.312, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.324 std_dev=0.988
O3'	A	0, 0.258, 1.559, 2.860, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.559 std_dev=1.301
OP2	A	0, 0.279, 1.757, 3.236, 3.583 max_d=3.583 avg_d=1.757 std_dev=1.478

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.36	0.00	0.10	0.57	0.18	0.29
C2	0.02	0.00	0.36	0.33	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.13	0.20	0.60	0.09	0.16
C2'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.19	0.01	0.10	0.20	0.18	0.14	0.28	0.35	0.13	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.46	0.83	0.38	0.60
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.32	0.00	0.41	0.02	0.44	0.34	0.40	0.27	0.48	0.42	0.26	0.02	0.01	0.02	0.04	0.25	0.13	0.05
C4	0.01	0.01	0.19	0.32	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.11	0.07	0.20	0.61	0.13	0.19
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.14	0.19	0.09	0.05	0.17	0.20	0.10	0.34	0.02	0.00	0.01	0.24	0.07	0.06
C5	0.01	0.01	0.10	0.41	0.00	0.14	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.34	0.08	0.03	0.32	0.58	0.17	0.19
C5'	0.06	0.06	0.20	0.02	0.08	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.11	0.03	0.21	0.21	0.08	0.13	0.24	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01
C6	0.02	0.00	0.18	0.44	0.01	0.14	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.09	0.05	0.35	0.56	0.16	0.19
C8	0.01	0.01	0.14	0.34	0.00	0.19	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.36	0.13	0.09	0.31	0.58	0.20	0.22
N1	0.02	0.00	0.28	0.40	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.11	0.10	0.29	0.58	0.12	0.16
N3	0.02	0.00	0.35	0.27	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.26	0.13	0.14	0.61	0.10	0.18
N6	0.02	0.01	0.13	0.48	0.01	0.17	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.39	0.16	0.04	0.42	0.52	0.21	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.42	0.00	0.20	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.41	0.18	0.05	0.39	0.55	0.21	0.22
N9	0.00	0.01	0.02	0.26	0.00	0.10	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.23	0.10	0.01	0.16	0.60	0.16	0.22
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.22	0.34	0.34	0.13	0.33	0.36	0.24	0.11	0.39	0.41	0.23	0.00	0.04	0.23	0.32	0.71	0.16	0.48
O3'	0.36	0.21	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.24	0.09	0.13	0.11	0.26	0.16	0.18	0.10	0.04	0.00	0.24	0.22	0.12	0.56	0.28
O4'	0.00	0.13	0.02	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.10	0.13	0.04	0.05	0.01	0.23	0.24	0.00	0.08	0.36	0.08	0.12
O5'	0.10	0.20	0.46	0.04	0.20	0.01	0.32	0.01	0.35	0.31	0.29	0.14	0.42	0.39	0.16	0.32	0.22	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.57	0.60	0.83	0.25	0.61	0.24	0.58	0.09	0.56	0.58	0.58	0.61	0.52	0.55	0.60	0.71	0.12	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.09	0.38	0.13	0.13	0.07	0.17	0.08	0.16	0.20	0.12	0.10	0.21	0.21	0.16	0.16	0.56	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.16	0.60	0.05	0.19	0.06	0.19	0.01	0.19	0.22	0.16	0.18	0.23	0.22	0.22	0.48	0.28	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.13	0.11	0.13	0.11	0.12	0.10	0.14	0.11	0.09	0.12	0.14	0.13	0.09	0.10	0.11	0.16	0.11	0.13	0.11	0.11	0.17	0.12
C2	0.11	0.08	0.10	0.10	0.06	0.09	0.06	0.09	0.07	0.08	0.08	0.11	0.06	0.07	0.08	0.06	0.10	0.13	0.13	0.07	0.15	0.09	0.10
C2'	0.48	0.43	0.38	0.34	0.46	0.40	0.45	0.39	0.43	0.45	0.42	0.40	0.45	0.45	0.47	0.41	0.28	0.46	0.41	0.42	0.28	0.41	0.38
C3'	0.11	0.26	0.17	0.27	0.12	0.30	0.10	0.35	0.15	0.13	0.23	0.36	0.21	0.10	0.09	0.15	0.35	0.21	0.44	0.14	0.61	0.49	0.47
C4	0.06	0.11	0.08	0.10	0.07	0.06	0.08	0.06	0.09	0.06	0.10	0.13	0.09	0.07	0.06	0.07	0.13	0.07	0.05	0.09	0.10	0.11	0.05
C4'	0.26	0.13	0.34	0.45	0.22	0.41	0.27	0.45	0.24	0.35	0.17	0.13	0.14	0.34	0.28	0.28	0.52	0.33	0.47	0.26	0.58	0.59	0.50
C5	0.07	0.10	0.08	0.12	0.08	0.06	0.10	0.07	0.11	0.08	0.12	0.13	0.08	0.10	0.07	0.08	0.15	0.07	0.07	0.12	0.12	0.11	0.07
C5'	0.28	0.15	0.36	0.48	0.25	0.43	0.31	0.49	0.28	0.39	0.21	0.13	0.16	0.39	0.31	0.28	0.56	0.34	0.49	0.32	0.61	0.64	0.53
C6	0.10	0.10	0.09	0.12	0.09	0.07	0.11	0.08	0.12	0.10	0.12	0.12	0.09	0.11	0.10	0.08	0.15	0.09	0.10	0.13	0.13	0.10	0.08
C8	0.06	0.12	0.09	0.14	0.09	0.10	0.10	0.12	0.12	0.08	0.12	0.14	0.10	0.09	0.07	0.10	0.18	0.07	0.10	0.13	0.13	0.15	0.10
N1	0.13	0.09	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.11	0.07	0.12	0.13	0.14	0.09	0.15	0.10	0.11
N3	0.07	0.10	0.09	0.08	0.07	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.10	0.13	0.09	0.06	0.06	0.06	0.10	0.09	0.07	0.09	0.12	0.10	0.06
N6	0.11	0.13	0.09	0.13	0.12	0.08	0.14	0.10	0.16	0.13	0.15	0.13	0.11	0.14	0.11	0.08	0.17	0.10	0.11	0.17	0.14	0.10	0.09
N7	0.06	0.12	0.09	0.14	0.09	0.09	0.11	0.11	0.13	0.09	0.13	0.13	0.09	0.11	0.08	0.09	0.18	0.06	0.08	0.15	0.13	0.13	0.08
N9	0.07	0.12	0.09	0.12	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.07	0.11	0.14	0.11	0.08	0.07	0.09	0.16	0.07	0.09	0.10	0.10	0.14	0.09
O2'	0.61	0.23	0.54	0.66	0.43	0.79	0.45	0.85	0.36	0.61	0.26	0.16	0.31	0.55	0.55	0.55	0.66	0.74	0.87	0.37	0.82	0.86	0.88
O3'	0.77	0.38	0.82	0.96	0.60	1.03	0.63	1.08	0.54	0.81	0.43	0.26	0.45	0.75	0.73	0.80	0.98	0.93	1.18	0.56	1.35	1.21	1.21
O4'	0.26	0.21	0.32	0.34	0.27	0.28	0.31	0.29	0.30	0.34	0.25	0.18	0.21	0.35	0.29	0.26	0.35	0.27	0.28	0.31	0.31	0.38	0.29
O5'	0.13	0.19	0.17	0.26	0.12	0.24	0.14	0.28	0.14	0.19	0.17	0.26	0.15	0.18	0.14	0.13	0.31	0.18	0.29	0.15	0.42	0.39	0.33
OP1	0.67	0.68	0.69	0.66	0.72	0.60	0.77	0.58	0.78	0.77	0.73	0.62	0.66	0.80	0.72	0.62	0.62	0.62	0.54	0.81	0.53	0.65	0.55
OP2	0.35	0.30	0.45	0.57	0.39	0.48	0.47	0.55	0.47	0.52	0.39	0.23	0.29	0.55	0.42	0.33	0.65	0.38	0.48	0.52	0.60	0.69	0.54
P	0.34	0.27	0.40	0.46	0.34	0.41	0.40	0.44	0.39	0.45	0.33	0.21	0.27	0.46	0.38	0.33	0.49	0.36	0.40	0.42	0.49	0.53	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.14	0.05
C2	0.01	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.19	0.01	0.19	0.19	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.10	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.04	0.18	0.07	0.12
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.10	0.10	0.12	0.15	0.13	0.10	0.06	0.02	0.01	0.01	0.21	0.10	0.25	0.04	0.17
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.19	0.01	0.17	0.17	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.07	0.06	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.06	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.25	0.01	0.22	0.21	0.20
C5'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.11	0.09	0.08	0.14	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.13	0.09	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.26	0.00	0.25	0.24	0.22
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.24	0.01	0.18	0.16	0.17
N1	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.23	0.01	0.23	0.22	0.19
N2	0.02	0.00	0.10	0.15	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.19	0.02	0.17	0.01	0.17	0.18	0.14
N3	0.01	0.00	0.10	0.13	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.27	0.01	0.23	0.21	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.17	0.01	0.14	0.14	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.12	0.10	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.05	0.12	0.09	0.05
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.10	0.01	0.10	0.03	0.12	0.12	0.14	0.19	0.15	0.12	0.06	0.05	0.00	0.01	0.18	0.12	0.27	0.08	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.02	0.05	0.20	0.08
O5'	0.07	0.19	0.14	0.21	0.19	0.02	0.25	0.01	0.26	0.24	0.23	0.17	0.16	0.27	0.17	0.05	0.18	0.06	0.00	0.29	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.29	0.00	0.28	0.28	0.25
OP1	0.08	0.19	0.18	0.25	0.17	0.06	0.22	0.09	0.25	0.18	0.23	0.17	0.16	0.23	0.14	0.12	0.27	0.05	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.19	0.07	0.04	0.17	0.16	0.21	0.23	0.24	0.16	0.22	0.18	0.16	0.21	0.14	0.09	0.08	0.20	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.15	0.12	0.17	0.14	0.02	0.20	0.01	0.22	0.17	0.19	0.14	0.12	0.21	0.12	0.05	0.17	0.08	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00