Doublet Group distance statistics: 53439

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 8, 5, 3, 4, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.011, 0.028, 0.046, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N2	B	0, 0.096, 0.202, 0.309, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.202 std_dev=0.106
C2	B	0, 0.087, 0.219, 0.351, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.219 std_dev=0.132
N3	B	0, 0.094, 0.227, 0.360, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.227 std_dev=0.133
N1	B	0, 0.114, 0.262, 0.410, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.262 std_dev=0.148
C4	B	0, 0.103, 0.256, 0.409, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.256 std_dev=0.153
N9	B	0, 0.123, 0.277, 0.431, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.277 std_dev=0.154
C1'	B	0, 0.116, 0.281, 0.446, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.281 std_dev=0.165
C2'	B	0, 0.113, 0.282, 0.451, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.282 std_dev=0.169
C6	B	0, 0.134, 0.307, 0.479, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.307 std_dev=0.172
C5	B	0, 0.110, 0.291, 0.471, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.291 std_dev=0.180
C8	B	0, 0.135, 0.319, 0.503, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.319 std_dev=0.184
O6	B	0, 0.180, 0.370, 0.559, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.370 std_dev=0.190
N7	B	0, 0.130, 0.330, 0.531, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.330 std_dev=0.200
O4'	B	0, 0.157, 0.364, 0.571, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.364 std_dev=0.207
C3'	B	0, 0.139, 0.360, 0.582, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.360 std_dev=0.222
O3'	B	0, 0.167, 0.407, 0.648, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.407 std_dev=0.241
C4'	B	0, 0.133, 0.378, 0.623, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.378 std_dev=0.245
O2'	B	0, 0.037, 0.288, 0.539, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.288 std_dev=0.251
C5'	B	0, 0.189, 0.495, 0.800, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.495 std_dev=0.305
O4'	A	0, -0.164, 0.160, 0.484, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.160 std_dev=0.324
C2'	A	0, -0.161, 0.192, 0.544, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.192 std_dev=0.353
O2'	A	0, -0.186, 0.237, 0.659, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.237 std_dev=0.422
C4'	A	0, -0.212, 0.261, 0.733, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.261 std_dev=0.472
C3'	A	0, -0.252, 0.289, 0.829, 2.130 max_d=2.130 avg_d=0.289 std_dev=0.541
O5'	A	0, -0.263, 0.397, 1.057, 2.600 max_d=2.600 avg_d=0.397 std_dev=0.660
O5'	B	0, -0.039, 0.685, 1.409, 2.612 max_d=2.612 avg_d=0.685 std_dev=0.724
O3'	A	0, -0.354, 0.398, 1.150, 2.985 max_d=2.985 avg_d=0.398 std_dev=0.752
C5'	A	0, -0.377, 0.436, 1.249, 3.154 max_d=3.154 avg_d=0.436 std_dev=0.813
P	B	0, -0.224, 0.859, 1.942, 3.856 max_d=3.856 avg_d=0.859 std_dev=1.083
P	A	0, -0.513, 0.630, 1.772, 4.503 max_d=4.503 avg_d=0.630 std_dev=1.143
OP1	B	0, -0.291, 0.945, 2.182, 4.433 max_d=4.433 avg_d=0.945 std_dev=1.236
OP2	B	0, -0.299, 1.048, 2.394, 4.745 max_d=4.745 avg_d=1.048 std_dev=1.347
OP2	A	0, -0.631, 0.846, 2.322, 5.600 max_d=5.600 avg_d=0.846 std_dev=1.477
OP1	A	0, -0.641, 0.860, 2.361, 5.596 max_d=5.596 avg_d=0.860 std_dev=1.501

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.27	0.24	0.15
C2	0.03	0.00	0.23	0.20	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.28	0.11	0.28	0.22	0.73	0.39
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.12	0.17	0.23	0.07	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.32	0.28	0.13
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.10	0.00	0.06	0.01	0.10	0.13	0.16	0.19	0.08	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.25	0.22	0.29	0.11
C4	0.02	0.01	0.12	0.10	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.07	0.28	0.21	0.70	0.39
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.35	0.06	0.18
C5	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.35	0.36	0.92	0.56
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.07	0.08	0.06	0.10	0.09	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.06	0.36	0.40	1.00	0.60
C8	0.01	0.01	0.12	0.13	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.06	0.33	0.32	0.79	0.49
N1	0.03	0.00	0.17	0.16	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.10	0.33	0.31	0.90	0.52
N3	0.03	0.00	0.23	0.19	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.25	0.11	0.24	0.19	0.61	0.30
N6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.05	0.40	0.51	1.13	0.70
N7	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.38	0.45	1.00	0.62
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.24	0.17	0.57	0.32
O2'	0.01	0.23	0.01	0.02	0.11	0.03	0.06	0.03	0.11	0.08	0.18	0.22	0.08	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.57	0.10	0.27
O3'	0.02	0.28	0.02	0.01	0.13	0.02	0.07	0.03	0.13	0.15	0.22	0.25	0.10	0.10	0.03	0.05	0.00	0.02	0.22	0.35	0.17	0.08
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.10	0.11	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.27	0.08	0.17
O5'	0.10	0.28	0.19	0.25	0.28	0.02	0.35	0.01	0.36	0.33	0.33	0.24	0.40	0.38	0.24	0.07	0.22	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.27	0.22	0.32	0.22	0.21	0.35	0.36	0.07	0.40	0.32	0.31	0.19	0.51	0.45	0.17	0.57	0.35	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.73	0.28	0.29	0.70	0.06	0.92	0.02	1.00	0.79	0.90	0.61	1.13	1.00	0.57	0.10	0.17	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.39	0.13	0.11	0.39	0.18	0.56	0.02	0.60	0.49	0.52	0.30	0.70	0.62	0.32	0.27	0.08	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.06	0.08	0.10	0.07	0.08	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.09	0.11	0.14	0.12	0.10	0.07	0.26	0.17	0.11
C2	0.09	0.10	0.13	0.16	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.09	0.17	0.20	0.09	0.33	0.11	0.22	0.59	0.30
C2'	0.19	0.36	0.19	0.15	0.28	0.11	0.28	0.12	0.31	0.21	0.35	0.39	0.33	0.24	0.22	0.10	0.12	0.17	0.09	0.31	0.28	0.13	0.18
C3'	0.33	0.44	0.25	0.18	0.41	0.20	0.42	0.21	0.44	0.37	0.45	0.43	0.43	0.40	0.37	0.16	0.11	0.31	0.23	0.44	0.46	0.29	0.39
C4	0.08	0.06	0.10	0.12	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.07	0.14	0.17	0.09	0.19	0.07	0.17	0.35	0.12
C4'	0.18	0.18	0.09	0.07	0.18	0.10	0.18	0.11	0.19	0.18	0.19	0.18	0.18	0.18	0.18	0.07	0.16	0.21	0.21	0.19	0.50	0.25	0.40
C5	0.08	0.07	0.09	0.12	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.13	0.17	0.09	0.18	0.09	0.19	0.33	0.10
C5'	0.23	0.20	0.10	0.09	0.22	0.15	0.23	0.16	0.22	0.24	0.21	0.17	0.20	0.24	0.23	0.10	0.22	0.28	0.33	0.23	0.66	0.43	0.57
C6	0.07	0.08	0.11	0.13	0.08	0.08	0.09	0.09	0.10	0.08	0.10	0.08	0.08	0.09	0.07	0.14	0.19	0.08	0.24	0.11	0.16	0.44	0.17
C8	0.09	0.06	0.07	0.10	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.10	0.15	0.12	0.08	0.07	0.33	0.14	0.15
N1	0.08	0.10	0.12	0.15	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.09	0.11	0.10	0.09	0.10	0.09	0.16	0.20	0.08	0.31	0.12	0.19	0.56	0.27
N3	0.09	0.07	0.12	0.15	0.08	0.10	0.08	0.11	0.08	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.16	0.19	0.09	0.28	0.08	0.18	0.49	0.23
N6	0.07	0.09	0.10	0.13	0.08	0.08	0.09	0.08	0.11	0.08	0.10	0.09	0.08	0.09	0.07	0.13	0.19	0.08	0.23	0.12	0.16	0.43	0.15
N7	0.08	0.06	0.08	0.11	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.07	0.06	0.11	0.16	0.11	0.11	0.08	0.28	0.21	0.11
N9	0.09	0.05	0.08	0.11	0.06	0.08	0.06	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.07	0.11	0.15	0.11	0.12	0.06	0.25	0.22	0.09
O2'	0.14	0.34	0.24	0.20	0.24	0.09	0.23	0.09	0.27	0.15	0.31	0.36	0.32	0.18	0.17	0.16	0.20	0.11	0.10	0.26	0.21	0.18	0.12
O3'	0.54	0.63	0.43	0.35	0.64	0.36	0.65	0.38	0.66	0.60	0.65	0.58	0.63	0.63	0.60	0.33	0.22	0.51	0.40	0.67	0.55	0.49	0.55
O4'	0.11	0.08	0.11	0.15	0.09	0.10	0.09	0.10	0.08	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09	0.14	0.22	0.13	0.10	0.08	0.40	0.10	0.24
O5'	0.25	0.09	0.22	0.22	0.15	0.30	0.14	0.32	0.11	0.22	0.09	0.10	0.11	0.18	0.20	0.22	0.23	0.33	0.54	0.11	0.94	0.62	0.79
OP1	1.08	0.64	1.00	1.03	0.88	1.20	0.89	1.24	0.79	1.07	0.68	0.48	0.75	1.01	1.02	0.99	0.93	1.22	1.63	0.79	2.08	1.80	1.94
OP2	0.47	0.13	0.48	0.59	0.19	0.72	0.17	0.80	0.08	0.40	0.13	0.27	0.09	0.29	0.35	0.50	0.63	0.64	1.12	0.08	1.70	1.25	1.45
P	0.64	0.24	0.60	0.64	0.43	0.78	0.43	0.82	0.33	0.60	0.25	0.15	0.34	0.52	0.56	0.61	0.61	0.76	1.14	0.33	1.61	1.25	1.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.31	0.02	0.23	0.33	0.23
C2	0.05	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.05	0.46	0.02	0.39	0.74	0.48
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.15	0.03	0.15	0.22	0.10
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.07	0.12	0.07	0.08	0.07	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.16	0.11	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.51	0.01	0.46	0.73	0.52
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04	0.04	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.13	0.10	0.07
C5	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.62	0.01	0.63	0.93	0.70
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.07	0.11	0.06	0.04	0.04	0.11	0.06	0.05	0.05	0.02	0.01	0.08	0.29	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.63	0.00	0.66	1.00	0.73
C8	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.64	0.02	0.63	0.83	0.69
N1	0.04	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.04	0.55	0.01	0.53	0.89	0.62
N2	0.05	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.05	0.40	0.03	0.32	0.67	0.40
N3	0.04	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.05	0.41	0.02	0.33	0.63	0.40
N7	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.68	0.02	0.74	1.00	0.80
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.50	0.01	0.44	0.63	0.49
O2'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.02	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.10	0.04	0.29	0.07	0.20
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.05	0.09	0.12	0.08	0.11	0.08	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.29	0.09	0.25	0.17	0.23
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.30	0.03	0.23	0.20	0.19
O5'	0.31	0.46	0.15	0.12	0.51	0.02	0.62	0.01	0.63	0.64	0.55	0.40	0.41	0.68	0.50	0.10	0.29	0.30	0.00	0.68	0.04	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.09	0.03	0.68	0.00	0.76	1.12	0.84
OP1	0.23	0.39	0.15	0.16	0.46	0.13	0.63	0.29	0.66	0.63	0.53	0.32	0.33	0.74	0.44	0.29	0.25	0.23	0.04	0.76	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.74	0.22	0.11	0.73	0.10	0.93	0.21	1.00	0.83	0.89	0.67	0.63	1.00	0.63	0.07	0.17	0.20	0.02	1.12	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.48	0.10	0.08	0.52	0.07	0.70	0.02	0.73	0.69	0.62	0.40	0.40	0.80	0.49	0.20	0.23	0.19	0.01	0.84	0.01	0.01	0.00